Information report for Gohir.D11G139400
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G04080
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A5D2IP23
- EMBL: CM017633
- AlphaFoldDB: A0A5D2IP23
- InterPro: IPR003107 , IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF5
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- SMR: A0A5D2IP23
Sequences
CDS Sequence
- >Gohir.D11G139400
ATGGGAGACAGTGAAGCAGTAGTTACTGGTTCGTCAACAGTTATGGACTATACGTCTGCAGCTTATAATTCTACTGGCTCTGGTGCTTACCCTTCAGAAGTTACTGGAGATCTTACTGCTTCTGGAACAGCAGCAGATGGAAATTACGCAGCATCTGGTATTGACCTAAAACCTGCTGGCCAAGAGGGTCAAATCAGTTCAGCCTATTACAGTATGCCAGCTGGTGTATCAACTGATGAGAGTGCTGCTAATGTTGGAAATGTAACAGCTGAAGCTCCTAAGGCTGCTGGTTACAGTTATTTAAATGGAAATGTTGTCAATGAAGCAGGAAATGCCACAACAGTTGAGAATGGAAACGCTGTTGATAATGTGGGTGGAGCTTCTGCTGCACCTGAGTTTGTGGATGGTTCCGCACCGCCTATGACTGGTGAAGAGGATCGGTTGTGGAGTATTTTGAGAGCTAATTCGTTGGATTTTAATGCTTGGACGGCATTAATTGAAGAGACAGAGAAGGTTGCAGAGAACAATATACTGAAAATTCGAAAAGTTTATGATGCTTTCTTGGCTGAGTTCCCTTTGTGTTATGGTTACTGGAAAAAGTATGCGGATCACGAAGCACGCATAGGCTCCATGGACAAAGTTGTGGAGGTTTATGAAAGAGCAGTTCAGGGGGTGACTTATTCCGTGGACATTTGGGTGCTATATTGTTCATTTGCCATAGAAACATACGGAGATCCGGAAACTATCCGAAGGCTTTTTGAACGTGGATTAGCATATGTTGGAACTGATTATCTATCTTTCCCTCTGTGGGATAAATATATTGAATATGAGTACATGCACCAGGAGTGGAGTCGCCTTGCTGCTATTTATACTAGAATATTAGAAAACCCTAATCAACAGCTAGATAGGTATTTCAACAGTTTTAAAGAGTTGGCTGCAAGTCGGCCTTTGTCAGAATTAAGAACTGTTGAGGAAGCTGCTGCTCCTGCATCTGATATGGTTTCGGGGGCTGATGGACAAGTAAATGAAGTAGTGGTTCATTCCGATGCTGAAGAGCAAACTCCTAAGCCTATAAGTGCTGGCTCAACCGATGCAGAAGAGTTGGAGAAGTATGTTGCCATTAGAGAGGAGCTATACAAGAAAGCTAAAGAGTTCAATTCTAAGATCCTTGGTTTTGAAACAGCTATTAGGAGACCTTATTTTCATGCGCGTCCTCTCAATGTTGCTGAGCTTGAAAATTGGCATAACTACCTGGACTTTATAGAAAGTGAGGGTGACTTGAATAAGGTGGTGAAATTATATGAAAGGTGCCTGATAGCTTGTGCTAGTTATCCTGAGTACTGGATACGATATGTTTTATGTATGGAAGCCAGTGGAAGCATGGACCTTGCTGATAATGCGCTTGCACGTGCTATGCAAGTCTTTGTCAAGAGGCAACCTGAGATCCATCTTTTTGCCGCTCGATTCAAAGAGCAGAATGGGGACATACCAGGTGCTCGAGCTGCATATCAACTTGTTCACAATGAAATTTCACCTGGTTTTCTTGAAGCAATTATTAAGCATGCAAATATGGAACGCCGTCTGGGGAAACTTGAAGATGCCTTCTCTTTATATGAGCAAGCTATTGCCATTGAAAAAGGAAAAGAGCATTCTCAGACACTACCGATGATGTATGCACAGTACTCTAGATTTTCATACTTGGTTTCTGGAAATGCAGAGAAGGCTAGGGAAATTCTTATTGGAGCACTTGACCAAGTCCAACTGTCTAAACCATTCCTTGAGGCCATAATATATTTTGAAACAATTTTGCCACCACCAAAGCAGATTGGTTATTTAGAATCATCGGTTGACAAATTTATAGCCCCAAACTCAGATGGCAGTGCTGCAGACAGGGAAGATGTATCCAGCATATTTTTGGAGTTCTTGAGTCTCTTTGGAGACGCACAGTCTATTAAAAAAGCAGAAGATCGGCATGCTAAGCACTTTTTACCTCGTAGACCAATGTCAGATTCAAGGAAGCGTTATGCTGAAGATTTTTTGTCTTCAGATAAGATGAAGTTGGCAAGGTCTTACTCTAGTGACCCTTCACCTGGCCAGTCCTTAATGAGTGCCTATCCAAATGCACAAAACCAGTGGCCAGCTGGTTATGGTGCACAACCTCAAACTTGGCCTTCCACTACACAGGCACAAACATGGACCCCTGGCTACAGCCAACAGGCTGCATATGGTGCGTATAGTAGTTATGGTAGCAACTATGCTACTCCACAAGTACCCACATCAGTTCCACAAAGTGCTGGGTATGGTGCTTATCCGACTACGTATCCTGTTCAGACCTTTCCTCAACAAAGTTTTGCTGTACCAACTGCGGGCACGATGTTAACCCCAGCCCAGCAACCTGCTGCAGCAGTTCCTCAAACTACTTATTATGGGACCTACTGA
Protein Sequence
- >Gohir.D11G139400
MGDSEAVVTGSSTVMDYTSAAYNSTGSGAYPSEVTGDLTASGTAADGNYAASGIDLKPAGQEGQISSAYYSMPAGVSTDESAANVGNVTAEAPKAAGYSYLNGNVVNEAGNATTVENGNAVDNVGGASAAPEFVDGSAPPMTGEEDRLWSILRANSLDFNAWTALIEETEKVAENNILKIRKVYDAFLAEFPLCYGYWKKYADHEARIGSMDKVVEVYERAVQGVTYSVDIWVLYCSFAIETYGDPETIRRLFERGLAYVGTDYLSFPLWDKYIEYEYMHQEWSRLAAIYTRILENPNQQLDRYFNSFKELAASRPLSELRTVEEAAAPASDMVSGADGQVNEVVVHSDAEEQTPKPISAGSTDAEELEKYVAIREELYKKAKEFNSKILGFETAIRRPYFHARPLNVAELENWHNYLDFIESEGDLNKVVKLYERCLIACASYPEYWIRYVLCMEASGSMDLADNALARAMQVFVKRQPEIHLFAARFKEQNGDIPGARAAYQLVHNEISPGFLEAIIKHANMERRLGKLEDAFSLYEQAIAIEKGKEHSQTLPMMYAQYSRFSYLVSGNAEKAREILIGALDQVQLSKPFLEAIIYFETILPPPKQIGYLESSVDKFIAPNSDGSAADREDVSSIFLEFLSLFGDAQSIKKAEDRHAKHFLPRRPMSDSRKRYAEDFLSSDKMKLARSYSSDPSPGQSLMSAYPNAQNQWPAGYGAQPQTWPSTTQAQTWTPGYSQQAAYGAYSSYGSNYATPQVPTSVPQSAGYGAYPTTYPVQTFPQQSFAVPTAGTMLTPAQQPAAAVPQTTYYGTY*