Information report for g27235
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes HTA11, a histone H2A protein. Loss of all H2A.Z (triple mutant with HTA8 and HTA9) results in a reduction in DNA methylation of transposons but not that of genes. Loss of H2A.Z causes misregulation of many genes involved in the response to developmental and environmental cues, and that these genes tend to have high levels of gene-body H2A.Z.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G38810
- Brassica napus: BnaC03G0220900ZS, BnaC06G0189900ZS, BnaA09G0504600ZS, BnaC04G0323800ZS, BnaC08G0345800ZS
- Brassica oleracea: Bo6g068090, Bo3g032830, Bo4g119860, Bo8g083750
- Brassica rapa: Bra003188, Bra014808, Bra000097, Bra007080
- Vitis vinifera: VIT_00s0179g00340
Sequences
gDNA Sequence
- >g27235
GCAAGTGGGTGTTGGTTAAGCAAAGCTTGGCATGCTCATTCAACGCAAGATGAACGGATCTCTCAAGGATCCCCTTTTTGACTCTACGTTTTCTCAGCCACAGTTTTGGGTGTATCAAGGCTGGTATGTGTATCAGAATCTCAAGAACTCGTTCTTATTCCGAACTCCGTAGGTGACGCAAAATAAATTTCATGGACATGTTTTGAACATTAGTTCCATTTTTCATCGCTTTATTTCAGTTGTCTACCATCATGTATCGCGTGTTGCCAATATTTTAACAGATTCTTTGGTGGATTCTGTTCTTTTAATTTATTTCGTAATGCTTGCTCATTAAATGGAGTTTGAGGCGCTTTGACCAATAAAAAAAAGAAAAATATCTGTGTCTGCTCAAACAATCAAATAATTAAGTATAGATACATGCTTTTCTTTTAATTAAGTGGACAAGAGAGAGATTGATCTTTTCAGATTTTTACCATTTTCTTCTACACACCTAATTACTTATCTGATTATTATTTTTGTTAGCGCTTACACAAAATAAAGTGAAAATGGAGAGGATGAAGAGGACGAAGTGAAAATGGAGAGCACGAAGAGATGGGAAAAGAATTTGGGGATGAAAATTATTGTTTTGTAGTTTAATGTGAAAATGGAGAGGACGAAGAGGTTGGGAAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAGAGAAAATGATAAAGTGAACTTGGGATGGAGTTGCAGATGACAATGTAAGAAGAAAAAAATTTGAGAGACATGATGACGAAGGAAGATACTCGAGAAGAGAAGAAGATTTTTTTTAACGTCCATGATAACAGATAAGTTAACCGTGATAAACTAATTATCTTGATAAATAAATATGCTAATGCATTAGTTAACGATAATTATAAATTATCGAAATAAATAAACATATTATTATATAAGTTACTTGATAACAATGATATAATAAATATTTATCACGATAAATATAATTTTACCATATAACATGTAAAGTTATCATGATATAATATAATTTATATTTCTAATTAAATAAATAATTACCAAAATCACTATTTTAATTACATCTCGTGATGAATAGGGTAACGCCCCGACCGCCACCTCTCATAATGGGCCCCACGTCCTCTCTCGGGCATGTGGGCCCATCCCTGTCCGACGGCCGATTCACTACGTCCAGGAGGCTTTAAAGACTTGATACCGACCCTACAAATCACCACATGATCTTTTTATGTGTTTTGTCCTCATTCACACAGTTCCGACAATCACTTCCTGGAAGATCACCCATCCTGAAATTGCTCCAGCTCAAGCACCCTTAACTGTGGAGTTCTCTGAAGACGTTTGACCGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGATATAGTTGGCCAAATCAATTCTTTTAAACCTTCCGCACGCACCATCATATTTCTGAAACTGGGGTGTTACAAATAGAGTTTTTGATGTTTGGCTGAACAGTGTTTTTACTTTTTAGTTATCGCAATACAATTTGATTTATATTGTTAATCAAATAGATAACCACAAAAACCATTATTTCTTTATTTTTTCCGATGATGAATAGTGTTTTCAACTACAAAACAATGTTATTTTTAATATTAGAACTAAACTATTTATTTGGTTATTATTTTTGTTAGCGCTTACACAAAATAAAGGGTAGTTTTGGTATTAATTGAGTTAGAGGAAATAGAACTAATAAAAAAATAAGCAGGGTTAGATTTTTAATTTTTCAATCTTCTATGCATATCAATTAATATAGCCCACAAAAAAAAAAAAAAACCCTCAAAAGTTTGTGAAAAAATTAGGTTATCGTCAGAATTTAACACTTATCGTATTAAGGTATGATATATTTTTATATTTTAAAAGGGTACATATTATCTACAAACCCTAAAAATAACGTCCGTTAAAGCAAAAAAAATATCTTCATCCGATGTAATTAGTTAATGTAACACTCATATTCATATAGTTGCATTTATATAAGATATAGTCATAAGTTTGATCATGAAACCATATAGTAAGTCGGATTATTATGAGTAACTCACAGTCTTTGTTTCTTTGAAAATCTACAACATGAATTAACCTCACATAATTTTTCCAATTAACTATTTTATTAAAATTAAATATCACAAAATTGTTTTAAAAAGTATGATGATCTGTCGCCACATCACGTTATAGTGTTTTCGATCATTAATATTTGTTGGTTTAGATGTTTATATCTTTCGTATAAGAACTGGATAATATTAGAACAGTAGCTTGTCTGCATGAGTAATGTACTACTCTCTTAGAAACAAGAGATTTTGGTTGACATAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAGATTTTGATCTTTCTTCGCCATAACCTAATCAACAATTTATGTCAAAACCTAAACCACCAAAATCGGATTAAGTCCAAAGAAATTAATATACTAGTGATCATTTTTAAAAAAGAAAACATAAAGAGAACAAGGCCATAATAACCTCCCCATTACTATATGGTTACATACTTTAACAAGAAAATTAATTTTGTTAGTCCGTATATTTCCTTTTTTGCTTCTCCAACAAGGCATTTGTGCTGTCCGTAAATTTTGAATATGACAGAAGTTTGAACTTTAAGAAGATATATCTTTGTAGAAAGATTTGACTAATTTTTAAAAATTAGTCAAATCTTTCTACAAAGATATATCTTCTTAAAACGCAAACTTCTGAAGTCATATTCAAAATAGACTACAAAAAAAAAAAAGATTTCTTTGCATAGTTTACGAAATGTCATATATCTATTGCTAAAGAATATTTTTTTTTTTTTGCAGTCTTAATTTTATGAAATTTTAAACTGATATTGTTTCTTTGTTTATTTCAATTTCCAATAGGTCGTATTCACAGGCAATTCAAGACAATAGTTTATGCACATGGTCAAGTTGGTGCCACTGCTTCTGTCTACACGGATTCAATCCTAGAATACCTAACTACAGAAGTTCTTGAGGTAGCTGGAAATGTGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGGTAACTCCAAGGTATTTGAAGTTGGCGATCAGAGGAGATGAGGAGCTTGTGACACTCATTAAAAGAACAATTGCTGGAGGAGGTGTACTGCCTCACATCCACAAGTCTCATCAACAAACCCACCAAGGAGTGATTTGTTTCTTAAGTCAAATGATATGATGATGTGATTTGTTAGGTAAGTATCTTATGATTTAAAATAAGTGCTAATCTCCATTGACACCTCTAAATCTGTAATTGCAATACTACGATACTAAATTACATTCTACGAATTAAATCTAAAAACATCAAAAGTTTAAATCATATAATTTTAATGGTAAAAATTTATAAAAATTTAATGTTAATAAGTAAAGAAATAAAATAGGATCCCGCGGTGTATCGCTGGTTAAATCCTAGTGTGCTAGTAAAATGAGATCTTCATTTCCATCATTCTCGCCTTCGAATTCTGCTTCATCTTCAACAAGACGAAACAAACACAAATACCATAAGCTACTTAACTAGAAAATAACATCATCATATCATTTAACTTAAGAAACAAATCACTTCTTGCTGGTTTTGTTGATGAGAGACTTGTGGATGTGATGGACTACACCTCATCCACCAATTGTTCCTTTGATGATTGTGACAAGCTCCTTATCCCATTTGATCGACAAATACAAATGCCTTGGAGTAATCCTCTACACTTTCAGATCTTTGCTCGCGTTTCCAGCTAACTCAAGAACCTATGCAGTTAGGCACTCTAGGATTGAAGCCGTGTAGACAGCAACAGTAGCACCAAGTCGACCATGTGTAGATACTCTGGTCCTAAGTTGCATGTGAATACGACCCATCAAAAACTGAAGTAAACAAAGAAATTTCATGTTTCTTTGCAGTCTAATTTTAGGAAATTCCACACTGATAATGTTTCTTTGTTTATTTTAGTTTCCAGTGGGTCGTATTCACAAGCAACTCAAGACTAGAGTGTCTGCACATGGTAGAGTTCGTGCCACTGCTGATGTCTACACAGCTTCAATCCTTGAATACCTAACTACAAAGGTTCTTGAGTTGGCTGGAAACGCGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATTTGCAGTTGGCGATCAGAGGAGATGAGGAGCTTGACACACTCATCAAAGGAACAATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACTAGTCTCTCATCAGCAAAACCACCAATGAGTGATTTGTTTCTTAGACAAATGATATGGTGTGACTTGCTAGTTAAGTAGCTTATGGTGTTTGTGTTTCTTTAGTCTTGGATCAAAAAAGTAGTTTAAGTGCT
CDS Sequence
- >g27235
ATGCTCATTCAACGCAAGATGAACGGATCTCTCAAGGATCCCCTTTTTGACTCTACGTTTTCTCAGCCACAGTTTTGGGTGTATCAAGGCTGGCAATTCAAGACAATAGTTTATGCACATGGTCAAGTTGGTGCCACTGCTTCTGTCTACACGGATTCAATCCTAGAATACCTAACTACAGAAGTTCTTGAGGTAGCTGGAAATGTGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGGTAACTCCAAGGTATTTGAAGTTGGCGATCAGAGGAGATGAGGAGCTTGTGACACTCATTAAAAGAACAATTGCTGGAGGAGTGGGTCGTATTCACAAGCAACTCAAGACTAGAGTGTCTGCACATGGTAGAGTTCGTGCCACTGCTGATGTCTACACAGCTTCAATCCTTGAATACCTAACTACAAAGGTTCTTGAGTTGGCTGGAAACGCGAGCAAAGATCTGAAAGTGAAGAGGATAACTCCAAGGCATTTGCAGTTGGCGATCAGAGGAGATGAGGAGCTTGACACACTCATCAAAGGAACAATTGCTGGAGGAGGTGTGATCCCTCACATCCACTAG
Protein Sequence
- >g27235
MLIQRKMNGSLKDPLFDSTFSQPQFWVYQGWQFKTIVYAHGQVGATASVYTDSILEYLTTEVLEVAGNVSKDLKVKRVTPRYLKLAIRGDEELVTLIKRTIAGGVGRIHKQLKTRVSAHGRVRATADVYTASILEYLTTKVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIH