Information report for BRADI_1g70450v3
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc14670, CEY00_Acc25644, CEY00_Acc29940
- Citrullus lanatus: Cla97C06G110750
- Cucumis melo: MELO3C022388
- Cucumis sativus: CsGy6G007040
- Gossypium hirsutum: Gohir.A11G133300, Gohir.D11G139400
- Juglans regia: Jr01_32860, Jr10_24680
- Medicago truncatula: Medtr7g098430
- Musa acuminata: Ma08_g12470
- Saccharum spontaneum: Sspon.01G0035810-1B
- Setaria italica: SETIT_034339mg
- Setaria viridis: SEVIR_9G500000v2
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: I1H8A0
- RefSeq: XP_003558524.1
- EMBL: CM000880
- KEGG: bdi:100842484
- OMA: IISWANL
- InterPro: IPR003107 , IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF5
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- OrthoDB: I1H8A0
- eggNOG: KOG1258
- STRING: 15368.I1H8A0
- HOGENOM: CLU_007434_1_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_1g70450v3
TGCCGCGCCCCTCCCTCCTTCTGGCCCATCTCGCTGCCGAGCGGCGCCCTAGACCCTTCCCCATCGCTCGTCTTCCTCCTCGCGCGAGCGCCGCCACCCCTCACTCCTTCCGGTCCATCCAGCTGCCGAGCGCCGCCCCAGCCCCCGCTCGTCTTCCTCCTCGCGCGAACGCTCCCACCGCCGGTTGGTCTCCCCTTCGAACCTCTCGCTCCTGACCGTTTCTCCTCGCATCACCCCACGAACAAATTCCGCCCTTTAGCTCCCCGTTTCATCTCCAAATTTCTCTGATTCGTGACTGAGGCAAAAAATCAAGGCATGGAGGCCTCCCAACCGTGCCCTACTGGGTCCTCCCCCGGTGGTGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCGTACGAGAATGGTAATGCTGTGTCAAAAATATCTTTATTCAGTGTCGTGCGTGCTATTTGTTAACACATCGTCTTATTTTCCAGGCGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCATATGAGGATGGTAATGCTGTGTAATTTTTTTTTCTCTTTATTCAGTGTCGTGTGTGCTATTTGTTGACAGTTCATCTTGTTTTCCACAGCTGTAGTTTCAGCAGAAGAGGCCAGGTTGTGGAGTGTTGTTACCGCTGATTGCTTAGATTTCAATGCTTGGACTGCACTTATTGATGAGACGGAGAGAATTGCTGAGGTGAAATTTGAATTTGTGCCTTCCCATACAATCTATGATTATTCTCTTTTTGTGCAACTTGCTGTATGTATAGGGCAATTTTTCTTGAACGTAGCCTTTATTTTCTTTCATTGTTTGTTCACATGTGCAATAGATATTTTTTCCGTTATCAAAGTTGCCTGAGTATTTGTTGTGGCACTGATAGTCATTTGTTCCCTTGTTTTGAATTAGCAAGTTTAGACCAATAGTCAATCTAATAAAATGTGGTTTATGTTACACATAATTGATGCCATTAAATTCGTCGGCAAAAGCACTCTCTCAAGATTGTGATTTTGTAACCATTAAGAAAATATTGTGCAAGAAATTTACAGTCAAAGCTTGTATTTGGACAATAAAAAGTACGCTTTACATTTCGAAACTGATAGAATATTTTGATTCCATATTTTCCCCTTTTCGGTATTGTATCTCAGTATATGAATGCTAGTAATTTCATAATTCTTGTTCCCTGCAGTTTTATTTATGGTTTTAGTAGTGTCCTTGAACCCTATGTTTGTGCTACCGTGGTCTTTTCAGTCTTTGCATTTTTCTGTGTTTTAGTGAAGTGCACTAAATAGAAATATAATCCTGTTAAGTAATAAACAAATGGATTTCTACTGAAGAACAAAAATGGAATATTTGTATGATAAAAACCGTATACTGATGGTGTGTCTGTATTTATTCCTGCTCAGAGCAATATTTTGAAAATGCGGAAAGTGTATGATGCATTCCTCGCGGAGTTCCCTCTTTGCTTTGGGTATTGGAAGAAATATGCAGACCATGAAGGCCGTCTTGATGGTGTCAGCAAAGTTATAGAGGTGTTTGAAAGGGCGGTTCTTGCAGTTACTTATTCAGTGGACATTTGGTTGAACTATTGCCAATTTGCTATCTCAACATATGATGACCCAGATATTATCAGAAGGTAGCAAATACACAAACTATGTCAATTTCTGATAAATTTTGTGTTTTGACTTTATTCTTAATGAGTGGCTGTTTGGAGCATCTACAATGCAGGTGCTAAAGTCAGGTGCTTAGAAAAAAAAACGGTTTATTATTAAGTACCAGTGCTTATTTCTACACCAAAGGTGCTTTAATTAAGCACCAGTCCGATAGAAATAGGCACCAGTGCTTAAACAAAAACTGGTTTATTTTCTGTAAGCATCTCACTAAGCACCTTGCATTGTACATGCTCTTAGAATATCTTTGCAATTTATTTCTGCAATCCATTTGGTAGTGCAATCCATGTAACCAATGCATGTAACGATTCCATATACATACATATATATTCATATTTGGACTAGGGCAATATGTTATTAGTATATATTTATGTCCCTCAATTGCAATAACCAATTCTCTCTCTAACGTGTGACCCTATGTGGGTTTGAGATTGCTATAATCTATTCCCTCCGTTTGGGTATATCAGGCTTCTATTGAAGTTTGTGCCACACTTTGACCAACAATTATTCAAATTATATTTAGTATATGTATATAAAAGTTATACCATTAGAAAGAGTTTTTCAATACGAATCAAACAATATATATTTTTGCCGCAATTATCTCATATTACCAATGTAATTTTTGGTCAAAGTTTGGCATAAAATTCCGTGTGGGCCTTATAAACCCAAACGGCGGGAGTATATAGTTTTCTTATAGCTAGTCTTGTTGGATTTAATGCATTAGCTCGTTAGCTAGTTTTGAGATAACATGCTTGTGTGATACAAAGAAATTAAGTTGGAATATGTCTATAAAATAATGGGCCTCTATGTGGATTCAAATATAGCTACCAATGTTTGATCCTGCACGCCATCAGACATTGAGTGTCTTGAATATCTAATGTATCTTTTATCTGCGGATCTGTTTTTCCATTTTTGCATCAGTAACTTCACTCCTTTTTTTGTTTTTCCAGACTGTTTGAACGGGGTTTAGCATATGTTGGAACAGACTACCGCTCCAATACTTTATGGGACGAGTACATCAAGTATGAAGAATCACTCCAGGCATGGAGTCATTTAGCTGTGATATATACAAGAATATTAGAGCATCCTATACAACAACTTGATCGGTACTTTAATTGGTGAGTTAGTTGGCATTTTTTCTGTTCTGTATTCAAGTACTGGAGTGCCATTTTTTAGTATATCTATATTTTGGTTGACTGCCCTACAAGTTGTTGATGTTGCTTATTATTGGATTGAATGACCACATCCATCGGTATTACAAATTTATTAGTATTTCTTAATCTTCCTATGATTTAGTGTTGCAATGTTAGATAAGCAGTTAACGCTTAACGGCGTAATGCCATTATTATCTCATTTGTGCTGGAGTATTTAATATGTGATTTCTTGTGATTCTAATTTTTTATGGTTAATTTTGTCAGCTTGAAGGAGCTGACTACAACACGGAACCTATCGGAAATACTAACTGCCGAGGAAACTTCAATGTATGGTGCTACTGTTGAGACCAGTACTCAGGCTGTTGATGGGGAGGCACATCCTAATGACGTAGAGGAAAGTGCAGAACCTGAAATTCCCCGTCCAACAGAAGCAGAGAACCAGGCACGTTATATTTCCATTAGAGAAGAGATGTACAAGAAGGCTAAAGAGTACGAGTCTAAGATTATCAGTTTTGAGCTAGCTATTAGAAGACCATACTTTCATGTCAAACCTCTTGACAAACCAGAGCTTGAAAATTGGCACAACTATCTTGATTTTATCGAGGCGGAAGACGACATTAACAAGGTAAGCTATAGCACTTCCAACAGTTTCGTCACCTTTTCGTTTAGTAGATTTCATGCAACGATTGGAATCTTATAACTTACAATCTAGTCTTATTGGCTCCATTATATGCTGTAACGGCTAGTATTTGGACGAAGCTTCCTTTGTAATGGGATATTGAACTGAGGATAGAGCGTGGACATAATGTTTGGTTTCGATGAGGCTAAGTACTCCAAACTTTCATTTGTCAGTGGCCGTTCTGGGTTAATGATATTTGGTACCAGATATCAGTTGTTTGAATTTTGAATCTCATATATGCAGGTATTTGCATAATGCTCACCTTCTTAACCATCTATCTATCAAGCAAGGATGGTCCCTCCTTTTGGAGGGGCCACCCTAATCAGCTAATGGAGTAACCTGTGTGAACTTCTCTTTTTTGTTGTCAATATCATAATTCTTATTCGCTTTATATTCCTTCTATCTATTTATTTTTGTCTGTTTTCTGATTGTATGCAATACTGTTTCAGGTTATCAAGTTGTACGAAAGATGTGTTATTGCGTGTGCTAGCTATTCAGAGTTCTGGATCCGCTATGTGCAATGCATGGAGCATAGGCAAAGCCTAGAATTAGCGAACAATGCTCTTGCTCGTGCCACCCATGTGTTTGTGAAGGTATTATCTGATAATATCATATATATATATATCACATTTTAAACTCAGTAACATTGCATTGTGACGTTTAACAGCCACAAATATGCTCATATGTGCATCAGTCAGGAAGGTTGTGAACAACTGAACATGAATACAATGAAAATCTTGTCTGCCTATTCTTGGAATTATTTTTCACCGCCCAATTAACACCTTTTGCCCATATAAGATTGAAGCCTCTATGATTTGGGTTAACTTATTTTCCATGTAGGCTTGCGGAGAAAAATAAAGAGAAATTGTTAGAATAGCCTAATTAGTTTGTAGGTTGTTCCAATATATATTTACTAATGATGTACTTAATTTAGCAGATGTGTTGGTAACACAAAATGCAAAATTGTCATCTTTTAGTATCACTGCCAATTTGCCATTGATACCCTTTTTTTAGATCCGATACAGAAGTTCATTTTAGTTTGCATCGGAATCTGTAAAAATGTTACAATTTGATGATCATTAGCTTATTAATGTTCTTACTTACTGCTGCATAACATTGTGTAGCATATAATATATTTCTTGTATTTAATGTTCTGGCTACATGCTATTTTCCTTAACAGAAGCAGCCAGAGATGCATCTGTTTAGTGCAAGATTCAAGGAGCTTAACGGTGATGCTGCTGGAGCACGTGTAGAATATCAGCATCTTTACTCAGAGTTATATCCTGGCTTTCTTGAAGCCATTGTGAAGCATGCCAATATGGAGCACCGACTGGTATCTCTTCAAAGAAACAATGGTCTTGTTTCTTTTTTTTGGTCAGCGTTCAAGTTTTCATTTTTGTTGTTATTTCATTGCAGGGTGATAAAGAATCTGCTTGTTTAGTTTATGAGAAGGCCATTGGTGCTGAAAAGGAAAAGG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CDS Sequence
- >BRADI_1g70450v3
ATGGAGGCCTCCCAACCGTGCCCTACTGGGTCCTCCCCCGGTGGTGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCGTACGAGAATGGCGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCATATGAGGATGCTGTAGTTTCAGCAGAAGAGGCCAGGTTGTGGAGTGTTGTTACCGCTGATTGCTTAGATTTCAATGCTTGGACTGCACTTATTGATGAGACGGAGAGAATTGCTGAGAGCAATATTTTGAAAATGCGGAAAGTGTATGATGCATTCCTCGCGGAGTTCCCTCTTTGCTTTGGGTATTGGAAGAAATATGCAGACCATGAAGGCCGTCTTGATGGTGTCAGCAAAGTTATAGAGGTGTTTGAAAGGGCGGTTCTTGCAGTTACTTATTCAGTGGACATTTGGTTGAACTATTGCCAATTTGCTATCTCAACATATGATGACCCAGATATTATCAGAAGACTGTTTGAACGGGGTTTAGCATATGTTGGAACAGACTACCGCTCCAATACTTTATGGGACGAGTACATCAAGTATGAAGAATCACTCCAGGCATGGAGTCATTTAGCTGTGATATATACAAGAATATTAGAGCATCCTATACAACAACTTGATCGGTACTTTAATTGCTTGAAGGAGCTGACTACAACACGGAACCTATCGGAAATACTAACTGCCGAGGAAACTTCAATGTATGGTGCTACTGTTGAGACCAGTACTCAGGCTGTTGATGGGGAGGCACATCCTAATGACGTAGAGGAAAGTGCAGAACCTGAAATTCCCCGTCCAACAGAAGCAGAGAACCAGGCACGTTATATTTCCATTAGAGAAGAGATGTACAAGAAGGCTAAAGAGTACGAGTCTAAGATTATCAGTTTTGAGCTAGCTATTAGAAGACCATACTTTCATGTCAAACCTCTTGACAAACCAGAGCTTGAAAATTGGCACAACTATCTTGATTTTATCGAGGCGGAAGACGACATTAACAAGGTTATCAAGTTGTACGAAAGATGTGTTATTGCGTGTGCTAGCTATTCAGAGTTCTGGATCCGCTATGTGCAATGCATGGAGCATAGGCAAAGCCTAGAATTAGCGAACAATGCTCTTGCTCGTGCCACCCATGTGTTTGTGAAGAAGCAGCCAGAGATGCATCTGTTTAGTGCAAGATTCAAGGAGCTTAACGGTGATGCTGCTGGAGCACGTGTAGAATATCAGCATCTTTACTCAGAGTTATATCCTGGCTTTCTTGAAGCCATTGTGAAGCATGCCAATATGGAGCACCGACTGGGTGATAAAGAATCTGCTTGTTTAGTTTATGAGAAGGCCATTGGTGCTGAAAAGGAAAAGGAACAGAGCCAGCTTTTGCCAACATTACTGATTCAATACTCACGTTTCTTATATATGGTCCGTGACTTGGAAAAGGCAAGGGAGATCTTAACTGGACTGCATGATCAAGCTAATATGACTAAATCAATTCTTGAGGCTGTCATTTTTCTCGAGTCGATCTTTCCGTCGGAGAAGCGTATTGAAGTTTTAGATTCCCTGGTGGAGAAGTTTCTTACACCTGAACCAACTCACGGGGAGTTGGCAAGTGCAAGTGACAAAGAAGAAATATCTTCCATATTTTTAGAGTTTTTGGATATCTTTGGGGATGCACAGTCGATCAAGAAGGCTACAACTCGGCATACAATTCTGTTTTCGCGTAAAAGGAGTGTTCTGCCGTCAAAGAAACGAAGAGCAGATGATGCTGTCATGTCCGACAGAGATAAAATCGCTAAAACTGGAGATGGCACCCAACCAGTCCTGGGAACCGAACCAAATGTTCATAATCCTTCAGTTTGGCCTGCGACTTCTGAAGCGTCAGGGCAACAATGGGGAGCTGCTTATGCGCCACAGGCTGCTTACCCTGCATATGGAACTTATGACTACAGTCATCAAATGCCTCAATCTGCTCCTCAAGCACCAGCTTATGGTGCCTATCCTCCTTCATACCCGGCCCAGGCCTACACGCAGCAAAGCTATGCACAACCTGCAGCAGTGCCAGTGGTAGCACCAGCAGCAGCCCCACCGGCACCGGTGCCAACAGCAGCGTCTTACCCTCAGCAACCTGCGGCTGCTCCTCAACCTTACTATGGCACCGCTACATACTTCTGA
Protein Sequence
- >BRADI_1g70450v3
MEASQPCPTGSSPGGATNEMSEPAPEQSYENGATNEMSEPAPEQSYEDAVVSAEEARLWSVVTADCLDFNAWTALIDETERIAESNILKMRKVYDAFLAEFPLCFGYWKKYADHEGRLDGVSKVIEVFERAVLAVTYSVDIWLNYCQFAISTYDDPDIIRRLFERGLAYVGTDYRSNTLWDEYIKYEESLQAWSHLAVIYTRILEHPIQQLDRYFNCLKELTTTRNLSEILTAEETSMYGATVETSTQAVDGEAHPNDVEESAEPEIPRPTEAENQARYISIREEMYKKAKEYESKIISFELAIRRPYFHVKPLDKPELENWHNYLDFIEAEDDINKVIKLYERCVIACASYSEFWIRYVQCMEHRQSLELANNALARATHVFVKKQPEMHLFSARFKELNGDAAGARVEYQHLYSELYPGFLEAIVKHANMEHRLGDKESACLVYEKAIGAEKEKEQSQLLPTLLIQYSRFLYMVRDLEKAREILTGLHDQANMTKSILEAVIFLESIFPSEKRIEVLDSLVEKFLTPEPTHGELASASDKEEISSIFLEFLDIFGDAQSIKKATTRHTILFSRKRSVLPSKKRRADDAVMSDRDKIAKTGDGTQPVLGTEPNVHNPSVWPATSEASGQQWGAAYAPQAAYPAYGTYDYSHQMPQSAPQAPAYGAYPPSYPAQAYTQQSYAQPAAVPVVAPAAAPPAPVPTAASYPQQPAAAPQPYYGTATYF