Information report for BRADI_1g70450v3
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G04080
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: I1H8A0
- RefSeq: XP_003558524.1
- EMBL: CM000880
- KEGG: bdi:100842484
- OMA: IISWANL
- InterPro: IPR003107 , IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF5
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- OrthoDB: I1H8A0
- eggNOG: KOG1258
- STRING: 15368.I1H8A0
- HOGENOM: CLU_007434_1_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_1g70450v3
TGCCGCGCCCCTCCCTCCTTCTGGCCCATCTCGCTGCCGAGCGGCGCCCTAGACCCTTCCCCATCGCTCGTCTTCCTCCTCGCGCGAGCGCCGCCACCCCTCACTCCTTCCGGTCCATCCAGCTGCCGAGCGCCGCCCCAGCCCCCGCTCGTCTTCCTCCTCGCGCGAACGCTCCCACCGCCGGTTGGTCTCCCCTTCGAACCTCTCGCTCCTGACCGTTTCTCCTCGCATCACCCCACGAACAAATTCCGCCCTTTAGCTCCCCGTTTCATCTCCAAATTTCTCTGATTCGTGACTGAGGCAAAAAATCAAGGCATGGAGGCCTCCCAACCGTGCCCTACTGGGTCCTCCCCCGGTGGTGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCGTACGAGAATGGTAATGCTGTGTCAAAAATATCTTTATTCAGTGTCGTGCGTGCTATTTGTTAACACATCGTCTTATTTTCCAGGCGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCATATGAGGATGGTAATGCTGTGTAATTTTTTTTTCTCTTTATTCAGTGTCGTGTGTGCTATTTGTTGACAGTTCATCTTGTTTTCCACAGCTGTAGTTTCAGCAGAAGAGGCCAGGTTGTGGAGTGTTGTTACCGCTGATTGCTTAGATTTCAATGCTTGGACTGCACTTATTGATGAGACGGAGAGAATTGCTGAGGTGAAATTTGAATTTGTGCCTTCCCATACAATCTATGATTATTCTCTTTTTGTGCAACTTGCTGTATGTATAGGGCAATTTTTCTTGAACGTAGCCTTTATTTTCTTTCATTGTTTGTTCACATGTGCAATAGATATTTTTTCCGTTATCAAAGTTGCCTGAGTATTTGTTGTGGCACTGATAGTCATTTGTTCCCTTGTTTTGAATTAGCAAGTTTAGACCAATAGTCAATCTAATAAAATGTGGTTTATGTTACACATAATTGATGCCATTAAATTCGTCGGCAAAAGCACTCTCTCAAGATTGTGATTTTGTAACCATTAAGAAAATATTGTGCAAGAAATTTACAGTCAAAGCTTGTATTTGGACAATAAAAAGTACGCTTTACATTTCGAAACTGATAGAATATTTTGATTCCATATTTTCCCCTTTTCGGTATTGTATCTCAGTATATGAATGCTAGTAATTTCATAATTCTTGTTCCCTGCAGTTTTATTTATGGTTTTAGTAGTGTCCTTGAACCCTATGTTTGTGCTACCGTGGTCTTTTCAGTCTTTGCATTTTTCTGTGTTTTAGTGAAGTGCACTAAATAGAAATATAATCCTGTTAAGTAATAAACAAATGGATTTCTACTGAAGAACAAAAATGGAATATTTGTATGATAAAAACCGTATACTGATGGTGTGTCTGTATTTATTCCTGCTCAGAGCAATATTTTGAAAATGCGGAAAGTGTATGATGCATTCCTCGCGGAGTTCCCTCTTTGCTTTGGGTATTGGAAGAAATATGCAGACCATGAAGGCCGTCTTGATGGTGTCAGCAAAGTTATAGAGGTGTTTGAAAGGGCGGTTCTTGCAGTTACTTATTCAGTGGACATTTGGTTGAACTATTGCCAATTTGCTATCTCAACATATGATGACCCAGATATTATCAGAAGGTAGCAAATACACAAACTATGTCAATTTCTGATAAATTTTGTGTTTTGACTTTATTCTTAATGAGTGGCTGTTTGGAGCATCTACAATGCAGGTGCTAAAGTCAGGTGCTTAGAAAAAAAAACGGTTTATTATTAAGTACCAGTGCTTATTTCTACACCAAAGGTGCTTTAATTAAGCACCAGTCCGATAGAAATAGGCACCAGTGCTTAAACAAAAACTGGTTTATTTTCTGTAAGCATCTCACTAAGCACCTTGCATTGTACATGCTCTTAGAATATCTTTGCAATTTATTTCTGCAATCCATTTGGTAGTGCAATCCATGTAACCAATGCATGTAACGATTCCATATACATACATATATATTCATATTTGGACTAGGGCAATATGTTATTAGTATATATTTATGTCCCTCAATTGCAATAACCAATTCTCTCTCTAACGTGTGACCCTATGTGGGTTTGAGATTGCTATAATCTATTCCCTCCGTTTGGGTATATCAGGCTTCTATTGAAGTTTGTGCCACACTTTGACCAACAATTATTCAAATTATATTTAGTATATGTATATAAAAGTTATACCATTAGAAAGAGTTTTTCAATACGAATCAAACAATATATATTTTTGCCGCAATTATCTCATATTACCAATGTAATTTTTGGTCAAAGTTTGGCATAAAATTCCGTGTGGGCCTTATAAACCCAAACGGCGGGAGTATATAGTTTTCTTATAGCTAGTCTTGTTGGATTTAATGCATTAGCTCGTTAGCTAGTTTTGAGATAACATGCTTGTGTGATACAAAGAAATTAAGTTGGAATATGTCTATAAAATAATGGGCCTCTATGTGGATTCAAATATAGCTACCAATGTTTGATCCTGCACGCCATCAGACATTGAGTGTCTTGAATATCTAATGTATCTTTTATCTGCGGATCTGTTTTTCCATTTTTGCATCAGTAACTTCACTCCTTTTTTTGTTTTTCCAGACTGTTTGAACGGGGTTTAGCATATGTTGGAACAGACTACCGCTCCAATACTTTATGGGACGAGTACATCAAGTATGAAGAATCACTCCAGGCATGGAGTCATTTAGCTGTGATATATACAAGAATATTAGAGCATCCTATACAACAACTTGATCGGTACTTTAATTGGTGAGTTAGTTGGCATTTTTTCTGTTCTGTATTCAAGTACTGGAGTGCCATTTTTTAGTATATCTATATTTTGGTTGACTGCCCTACAAGTTGTTGATGTTGCTTATTATTGGATTGAATGACCACATCCATCGGTATTACAAATTTATTAGTATTTCTTAATCTTCCTATGATTTAGTGTTGCAATGTTAGATAAGCAGTTAACGCTTAACGGCGTAATGCCATTATTATCTCATTTGTGCTGGAGTATTTAATATGTGATTTCTTGTGATTCTAATTTTTTATGGTTAATTTTGTCAGCTTGAAGGAGCTGACTACAACACGGAACCTATCGGAAATACTAACTGCCGAGGAAACTTCAATGTATGGTGCTACTGTTGAGACCAGTACTCAGGCTGTTGATGGGGAGGCACATCCTAATGACGTAGAGGAAAGTGCAGAACCTGAAATTCCCCGTCCAACAGAAGCAGAGAACCAGGCACGTTATATTTCCATTAGAGAAGAGATGTACAAGAAGGCTAAAGAGTACGAGTCTAAGATTATCAGTTTTGAGCTAGCTATTAGAAGACCATACTTTCATGTCAAACCTCTTGACAAACCAGAGCTTGAAAATTGGCACAACTATCTTGATTTTATCGAGGCGGAAGACGACATTAACAAGGTAAGCTATAGCACTTCCAACAGTTTCGTCACCTTTTCGTTTAGTAGATTTCATGCAACGATTGGAATCTTATAACTTACAATCTAGTCTTATTGGCTCCATTATATGCTGTAACGGCTAGTATTTGGACGAAGCTTCCTTTGTAATGGGATATTGAACTGAGGATAGAGCGTGGACATAATGTTTGGTTTCGATGAGGCTAAGTACTCCAAACTTTCATTTGTCAGTGGCCGTTCTGGGTTAATGATATTTGGTACCAGATATCAGTTGTTTGAATTTTGAATCTCATATATGCAGGTATTTGCATAATGCTCACCTTCTTAACCATCTATCTATCAAGCAAGGATGGTCCCTCCTTTTGGAGGGGCCACCCTAATCAGCTAATGGAGTAACCTGTGTGAACTTCTCTTTTTTGTTGTCAATATCATAATTCTTATTCGCTTTATATTCCTTCTATCTATTTATTTTTGTCTGTTTTCTGATTGTATGCAATACTGTTTCAGGTTATCAAGTTGTACGAAAGATGTGTTATTGCGTGTGCTAGCTATTCAGAGTTCTGGATCCGCTATGTGCAATGCATGGAGCATAGGCAAAGCCTAGAATTAGCGAACAATGCTCTTGCTCGTGCCACCCATGTGTTTGTGAAGGTATTATCTGATAATATCATATATATATATATCACATTTTAAACTCAGTAACATTGCATTGTGACGTTTAACAGCCACAAATATGCTCATATGTGCATCAGTCAGGAAGGTTGTGAACAACTGAACATGAATACAATGAAAATCTTGTCTGCCTATTCTTGGAATTATTTTTCACCGCCCAATTAACACCTTTTGCCCATATAAGATTGAAGCCTCTATGATTTGGGTTAACTTATTTTCCATGTAGGCTTGCGGAGAAAAATAAAGAGAAATTGTTAGAATAGCCTAATTAGTTTGTAGGTTGTTCCAATATATATTTACTAATGATGTACTTAATTTAGCAGATGTGTTGGTAACACAAAATGCAAAATTGTCATCTTTTAGTATCACTGCCAATTTGCCATTGATACCCTTTTTTTAGATCCGATACAGAAGTTCATTTTAGTTTGCATCGGAATCTGTAAAAATGTTACAATTTGATGATCATTAGCTTATTAATGTTCTTACTTACTGCTGCATAACATTGTGTAGCATATAATATATTTCTTGTATTTAATGTTCTGGCTACATGCTATTTTCCTTAACAGAAGCAGCCAGAGATGCATCTGTTTAGTGCAAGATTCAAGGAGCTTAACGGTGATGCTGCTGGAGCACGTGTAGAATATCAGCATCTTTACTCAGAGTTATATCCTGGCTTTCTTGAAGCCATTGTGAAGCATGCCAATATGGAGCACCGACTGGTATCTCTTCAAAGAAACAATGGTCTTGTTTCTTTTTTTTGGTCAGCGTTCAAGTTTTCATTTTTGTTGTTATTTCATTGCAGGGTGATAAAGAATCTGCTTGTTTAGTTTATGAGAAGGCCATTGGTGCTGAAAAGGAAAAGG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CDS Sequence
- >BRADI_1g70450v3
ATGGAGGCCTCCCAACCGTGCCCTACTGGGTCCTCCCCCGGTGGTGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCGTACGAGAATGGCGCCACCAACGAGATGAGTGAACCGGCTCCGGAGCAATCATATGAGGATGCTGTAGTTTCAGCAGAAGAGGCCAGGTTGTGGAGTGTTGTTACCGCTGATTGCTTAGATTTCAATGCTTGGACTGCACTTATTGATGAGACGGAGAGAATTGCTGAGAGCAATATTTTGAAAATGCGGAAAGTGTATGATGCATTCCTCGCGGAGTTCCCTCTTTGCTTTGGGTATTGGAAGAAATATGCAGACCATGAAGGCCGTCTTGATGGTGTCAGCAAAGTTATAGAGGTGTTTGAAAGGGCGGTTCTTGCAGTTACTTATTCAGTGGACATTTGGTTGAACTATTGCCAATTTGCTATCTCAACATATGATGACCCAGATATTATCAGAAGACTGTTTGAACGGGGTTTAGCATATGTTGGAACAGACTACCGCTCCAATACTTTATGGGACGAGTACATCAAGTATGAAGAATCACTCCAGGCATGGAGTCATTTAGCTGTGATATATACAAGAATATTAGAGCATCCTATACAACAACTTGATCGGTACTTTAATTGCTTGAAGGAGCTGACTACAACACGGAACCTATCGGAAATACTAACTGCCGAGGAAACTTCAATGTATGGTGCTACTGTTGAGACCAGTACTCAGGCTGTTGATGGGGAGGCACATCCTAATGACGTAGAGGAAAGTGCAGAACCTGAAATTCCCCGTCCAACAGAAGCAGAGAACCAGGCACGTTATATTTCCATTAGAGAAGAGATGTACAAGAAGGCTAAAGAGTACGAGTCTAAGATTATCAGTTTTGAGCTAGCTATTAGAAGACCATACTTTCATGTCAAACCTCTTGACAAACCAGAGCTTGAAAATTGGCACAACTATCTTGATTTTATCGAGGCGGAAGACGACATTAACAAGGTTATCAAGTTGTACGAAAGATGTGTTATTGCGTGTGCTAGCTATTCAGAGTTCTGGATCCGCTATGTGCAATGCATGGAGCATAGGCAAAGCCTAGAATTAGCGAACAATGCTCTTGCTCGTGCCACCCATGTGTTTGTGAAGAAGCAGCCAGAGATGCATCTGTTTAGTGCAAGATTCAAGGAGCTTAACGGTGATGCTGCTGGAGCACGTGTAGAATATCAGCATCTTTACTCAGAGTTATATCCTGGCTTTCTTGAAGCCATTGTGAAGCATGCCAATATGGAGCACCGACTGGGTGATAAAGAATCTGCTTGTTTAGTTTATGAGAAGGCCATTGGTGCTGAAAAGGAAAAGGAACAGAGCCAGCTTTTGCCAACATTACTGATTCAATACTCACGTTTCTTATATATGGTCCGTGACTTGGAAAAGGCAAGGGAGATCTTAACTGGACTGCATGATCAAGCTAATATGACTAAATCAATTCTTGAGGCTGTCATTTTTCTCGAGTCGATCTTTCCGTCGGAGAAGCGTATTGAAGTTTTAGATTCCCTGGTGGAGAAGTTTCTTACACCTGAACCAACTCACGGGGAGTTGGCAAGTGCAAGTGACAAAGAAGAAATATCTTCCATATTTTTAGAGTTTTTGGATATCTTTGGGGATGCACAGTCGATCAAGAAGGCTACAACTCGGCATACAATTCTGTTTTCGCGTAAAAGGAGTGTTCTGCCGTCAAAGAAACGAAGAGCAGATGATGCTGTCATGTCCGACAGAGATAAAATCGCTAAAACTGGAGATGGCACCCAACCAGTCCTGGGAACCGAACCAAATGTTCATAATCCTTCAGTTTGGCCTGCGACTTCTGAAGCGTCAGGGCAACAATGGGGAGCTGCTTATGCGCCACAGGCTGCTTACCCTGCATATGGAACTTATGACTACAGTCATCAAATGCCTCAATCTGCTCCTCAAGCACCAGCTTATGGTGCCTATCCTCCTTCATACCCGGCCCAGGCCTACACGCAGCAAAGCTATGCACAACCTGCAGCAGTGCCAGTGGTAGCACCAGCAGCAGCCCCACCGGCACCGGTGCCAACAGCAGCGTCTTACCCTCAGCAACCTGCGGCTGCTCCTCAACCTTACTATGGCACCGCTACATACTTCTGA
Protein Sequence
- >BRADI_1g70450v3
MEASQPCPTGSSPGGATNEMSEPAPEQSYENGATNEMSEPAPEQSYEDAVVSAEEARLWSVVTADCLDFNAWTALIDETERIAESNILKMRKVYDAFLAEFPLCFGYWKKYADHEGRLDGVSKVIEVFERAVLAVTYSVDIWLNYCQFAISTYDDPDIIRRLFERGLAYVGTDYRSNTLWDEYIKYEESLQAWSHLAVIYTRILEHPIQQLDRYFNCLKELTTTRNLSEILTAEETSMYGATVETSTQAVDGEAHPNDVEESAEPEIPRPTEAENQARYISIREEMYKKAKEYESKIISFELAIRRPYFHVKPLDKPELENWHNYLDFIEAEDDINKVIKLYERCVIACASYSEFWIRYVQCMEHRQSLELANNALARATHVFVKKQPEMHLFSARFKELNGDAAGARVEYQHLYSELYPGFLEAIVKHANMEHRLGDKESACLVYEKAIGAEKEKEQSQLLPTLLIQYSRFLYMVRDLEKAREILTGLHDQANMTKSILEAVIFLESIFPSEKRIEVLDSLVEKFLTPEPTHGELASASDKEEISSIFLEFLDIFGDAQSIKKATTRHTILFSRKRSVLPSKKRRADDAVMSDRDKIAKTGDGTQPVLGTEPNVHNPSVWPATSEASGQQWGAAYAPQAAYPAYGTYDYSHQMPQSAPQAPAYGAYPPSYPAQAYTQQSYAQPAAVPVVAPAAAPPAPVPTAASYPQQPAAAPQPYYGTATYF