Information report for Bra026507
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a MADS box protein. Regulates proanthocyanidin biosynthesis in the inner-most cell layer of the seed coat. Also controls cell shape of the inner-most cell layer of the seed coat. Also shown to be necessary for determining the identity of the endothelial layer within the ovule. Paralogous to GOA. Plays a maternal role in fertilization and seed development.
Homologous
- Brassica napus: BnaA09G0073100ZS, GSBRNA2T00094727001, BnaC09G0063100ZS, GSBRNA2T00146106001, BnaC07G0373800ZS, GSBRNA2T00082681001
- Brassica oleracea: XP_013610043.1, XP_013610042.1, XP_013610041.1, Bo9g014270, XP_013610044.1, XP_013596701.1, XP_013596700.1, XP_013596702.1, Bo7g097810
- Raphanus raphanistrum: RrC5510_p4
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra026507
TGAACTCCTTGCAAGGCTACTATGGACTGAAACCAACAAACAGAAGAGCTTCTAAAGGTTTAGAGATGACAGCTTACAATGCATCAGTACCTCACACCCTTCCCATCCACCAATACTCGCTTAAACCTGCATAGAATCCAGAAGCTTGGTAGATGCAGTTATCTCCGGGTTCAACCAATCATCCAAACCGTCCAAGGAAGTGAGATGTGATAAGCCAATGAGAGACGCCAATAATCTTAAGCTGGATTTCAGTTTGAGGGAGAACAGAAACAGCAGTAGCAGGTATGCTCATCATGTAGCCGGGAAAGGTTTAGCACTGAGACCAAAAGCAGCGAGCAGAACTAACCTGTCAGCAGGTACAGAGAGACCTGTAATTCTAATCCCCTACCAAAGAGTTTGATGGATGCTCCTGTGGCCAGGGTGAGAAAATCGATTAGCGCTTCTAATATGCAATAACCATAACATTTATCATTTAATTAGGCATGTTAATTACTTGATAAAAACTCAATAGTTACTTACATACATCTCTTATATACGTATTTGTATGTAGTCAACAGGGTGCAGAAGAGTGGGATAGCTGGAATGATGAAAACAGCCTTGGACCCAACTGTTCCTCTCTAATAATTAGTTACCTAATTTAGAAACCATAACATGTTTCCTGTGAGTCCTCTGAGAGAACAAAATTCTCTCTCGACCTCCTTAAAATCTGTGACACAAAATTCAAAGGAAAAGACTACTTCACAATTTAAATGGATTGATATTGTGATACTATCGTATATATATATTCAATTACCAAGTTAGTGTCTATTGCTATGAATAGAAGCCAAAATGTATTAGATAATCTAGCTTATCGAAATAAGAAGATATCAACAGGGCGCTTAGGAGGTAGGTAAGAAAAATATAAAAAGTCACTTTCAAGTATTGTTACACTTTGTCCTTTGGCTTACTCTCTCTCTCTTTGCCTTTTGCCATTTGTGGTAACTTTGTTTTCCTTATAACATATTTTCATGAAATTTCCATTTTGGATTCATTATACGTGTTGCGTCATGCATGGCAGATCAAATAATATAGTGGTCCAAATTTAATTATAAAGGGATTTCTCTGCTAAAGAAATTACCAAAAGTGTCATTACATGTCTAATTACAATTTAATACTTAACTTGTTTAATTTTTTATAGCTTAACTTATTTTCTATATTACTTGCTAGTTAAGTGCTGGGTATATAGCTTGGTTAATTCACTTTGCTGTACATATATAAAGTTTATGTTTAGGATATATATTTTTTTGGAACAAAGGTTTTCATTCATGTTTACGATATTAGCGCGCACACATTAGTTTGAAGGTACAAATTAAGATATATCACGAGACGAGCATAATGCTGAGCATAAATGGTTACTGCATAACGCAACAACACTAATTGGCCCTAAGAAATTGTTGATGTTGAAATACGTAAGCTTTATATATAAACATTAATTGCACTCTCAAATTAGAAAAACTTATGTACTAAGAATGGAGAAAAGAGAGAGAAATGAAATTAGAAAATGGTGAGCTGAAACCATACGCTACACACAGAATTTATATAAAGAGAAACGAGAAAGTCTGATTAAGCATATTATTCCCCATTAACCCTCTCTCCACTTTGTGTCATCCTACTGATCTGCGTTTCCAGATCATCCCCAAGAACACAGCTCAACAAGTACTTTAAAAAAGACTCTCTCTTCTCCTGTTTCTTTCTTTTCTCTTTCTCTAGATCTATATATATCTACCACTAACTCACTCACACGTACTCTCGCTTCTCTCTAATCACACATCAAGATTCAAACTATTTTTGAAATGAATCCTGTGATTACCTCTAGGGCTTTAGATTCTTATTTTTGTTAGTTTTGTAGTTTTTTTTTTGTTGCAAACACTTAGTTTAATTTGTAGTTGACTAGAGATTTCTTCTTAGTTGATCTAACTTCCACATCACATATATATTTTGAATCAGGAGGAAGAGGAAAGAGATGGGAAGGGGGAAGATCGAGATAAAGAAGATAGAGAATAAGACATCGAGGCAAGTGACCTTCTCCAAGAGAAGAAATGGTCTTATCAAGAAGACTCGTGAGCTCTCTGTTCTTTGTGATGCTCACATCGGTCTCATCGTCTTCTCCACCACCGGAAAGCTTACCCAGTACTGCTCCGAACACTCTAAGTTAGCTCCTTCTCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCAAATTAGGGCTTCAGAGATCTATACATACATGTGTATCTATTAAAATCTTTTTCTGTCAACTGTACTGAACTAATTAAATGAGCACGGGAGACACATATATAGCTCCTCGTGCTTGTGAAGTGAACAAACAGTTTTCATCATTAGTTTCTGAAGTAGCAGGTACCATGAATATGTTTTAAGAATTTAGTTTTCATCATTAGTTTCTGAAGTTTCTGAATTTTATTCTTTATTTTATTTGTATATATAATATAATTATTATTGGGTTATAACTATATATGGGTTATAATCTATATTTTCCACACCAGTGAGCAAAGAGATCTACAAAGATTTGACATTTGTTGAACAACTTTCTCATAAAAAGATCACAAGTTGTGTTTGTAGAACACGGCGTATAACCTTTAGGTCCTTTACAACCTATATATGTCTTTTCTTTAGCAATATATAAGTCTTTTTTAATTATTCGATTTAAGAACATTAAATTTTAATGCTGTGTTAATTAGATCGTTGTAGATCTAAGTCAAACGAGAAGACAAAATTATTCACATACATCCTTATAATATGAGAATAAAGGTATGCTATATTATTAGTTCTAAGTTTTCTAACAAAACAAAGAAGGGAAAACCACCTTTTCATTTTTTGTTTGGTATCAGTTCTTTTGGACATCCTGTTATTTGTCAAAGTTTATATAGATCATAATCTAGAGAACTAGATTCGTTTTTTTTTTGAATTTTGTTTTCCTCCATTGATTATCGAATTAGTCTTGACGTTGTGAGGTTGAGGATACTAATTTGATCACATTTCATTATTACCAATATTGAACAGTATGCCTCAGCTCATTGACAGATATTTGACAAAAGAAGGATTGCAACTTCCTGACCTTAATGACGACCGGGTACAATATATATACGCATACTTAATACTTTGGTCTTACCAATTCAAAACAACAACAAAATAGTTTTCGTTTATATATATAGGATGACCTGCGCCATGAGATTGAAATATTAAGAAGGGAGACATGTAAGCTTGAGCTCCGTCTGCGTCCATACCATGGACATGACTTAGCCTCCATTCCTCCACACGAGCTCGAGGGGCTAGAGCAACAGCTCGAACATTCTGTCCGTAAAGTCCGTGAGCGTAAGGTAACGTCATATATGCTTATATCAATGTATTCTCTTTAAACTATATATCGTTACAACTTTGTTTGATTTCTCCCTTTTTCTATCTCTAATGCTAATTTATTGAAGAAGGAGTTGCTGCAGCAACAGTTGGGGAATCTTAGCAGAAAGGTCTCTTCTCGATTCACTTTTTTTTTCCTCATATTTCTTCTATAAATGATAGTCACATGGCGGGTTTAATTAATAATTAATATCATGTTTATGCATATTGTAGAAGCGGATGCTAGAAGACGATAACAACAATATGTACCGTTGGGTAAGCTTGGTTACTAGCTAGAGAATGTTTATTTGTTTGCACATTTTGGATTAAATCACATATTTTACTATCCATGCCGGTGTGGCTATACTGCAGCTTCATGATGAGCATCGTACGGGGGTTGAGTTTCAGCAAGCTGGGATAGAGACCAAACCAATGGAGTATCAACAGTTTCTAGAGCAGGTTCAGTACTATAATGATCATCATCAGCAACAAAGCAGTGTTCTTCAGCTCCCTACGCTTCCTTCAGAGATTGATCTTAGTTACCATCTCCAGCTTGCTCAGCCTAATCTTCAAAACGATCCAACGACCAAGGTTGATTAA
CDS Sequence
- >Bra026507
ATGAACTCCTTGCAAGGCTACTATGGACTGAAACCAACAAACAGAAGAGCTTCTAAAGAATCCAGAAGCTTGGTAGATGCAGTTATCTCCGGGTTCAACCAATCATCCAAACCGTCCAAGGAAGTGAGATGTGATAAGCCAATGAGAGACGCCAATAATCTTAAGCTGGATTTCAGTTTGAGGGAGAACAGAAACAGCAGTAGCAGGAGGAAGAGGAAAGAGATGGGAAGGGGGAAGATCGAGATAAAGAAGATAGAGAATAAGACATCGAGGCAAGTGACCTTCTCCAAGAGAAGAAATGGTCTTATCAAGAAGACTCGTGAGCTCTCTGTTCTTTGTGATGCTCACATCGGTCTCATCGTCTTCTCCACCACCGGAAAGCTTACCCAGTACTGCTCCGAACACTCTAATATGCCTCAGCTCATTGACAGATATTTGACAAAAGAAGGATTGCAACTTCCTGACCTTAATGACGACCGGGATGACCTGCGCCATGAGATTGAAATATTAAGAAGGGAGACATGTAAGCTTGAGCTCCGTCTGCGTCCATACCATGGACATGACTTAGCCTCCATTCCTCCACACGAGCTCGAGGGGCTAGAGCAACAGCTCGAACATTCTGTCCGTAAAGTCCGTGAGCGTAAGCAACAGTTGGGGAATCTTAGCAGAAAGAAGCGGATGCTAGAAGACGATAACAACAATATGTACCGTTGGCTTCATGATGAGCATCGTACGGGGGTTGAGTTTCAGCAAGCTGGGATAGAGACCAAACCAATGGAGTATCAACAGTTTCTAGAGCAGGTTCAGTACTATAATGATCATCATCAGCAACAAAGCAGTGTTCTTCAGCTCCCTACGCTTCCTTCAGAGATTGATCTTAGTTACCATCTCCAGCTTGCTCAGCCTAATCTTCAAAACGATCCAACGACCAAGGTTGATTAA
Protein Sequence
- >Bra026507
MNSLQGYYGLKPTNRRASKESRSLVDAVISGFNQSSKPSKEVRCDKPMRDANNLKLDFSLRENRNSSSRRKRKEMGRGKIEIKKIENKTSRQVTFSKRRNGLIKKTRELSVLCDAHIGLIVFSTTGKLTQYCSEHSNMPQLIDRYLTKEGLQLPDLNDDRDDLRHEIEILRRETCKLELRLRPYHGHDLASIPPHELEGLEQQLEHSVRKVRERKQQLGNLSRKKRMLEDDNNNMYRWLHDEHRTGVEFQQAGIETKPMEYQQFLEQVQYYNDHHQQQSSVLQLPTLPSEIDLSYHLQLAQPNLQNDPTTKVD