Information report for Bo8g002740
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G04080
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A0D3DIR7
- AlphaFoldDB: A0A0D3DIR7
- OMA: HEQFNAV
- InterPro: IPR003107 , IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF31
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- eggNOG: KOG1258
- STRING: 109376.A0A0D3DIR7
- HOGENOM: CLU_007434_1_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo8g002740
AAACACATCACGCGTCGTCGTCTCTAACCCTACGAACCCTCTCTTCCTGTAACCGAGAAAAAAACTTGGGAGCTCCTCCAACGAAGTCACTTGCGAGCTTCCTCTTCACTATCCGAGGTTCGTATCCTTCCATCTCCCTTTGTATTTCACGAATTGGGAATACAGCTAAGGTTTTGTTTCTGGTAGATCATGCTCACAGGGTTTATGATTAGGGTTTGCTTGTCCTGCTAGAAAATTACGCATCAAGCTTTACGTATTGTGATTCGTATGAAGATAATATTGAGTTTTGTGTTAAACAGCTCTTCTCTATCTGTGTGGTTTTGGTTTGTATACGATTAGGTGATAATCTTAATGGCATCCATCGATTGAGTGTAGACTAGTCTTATATGTGCTTTCTAATGATTCCATTCTCATGTATTTTGTTGCAGTTATAGTTATGGGAGAAAGCCAGGCCATGGTTGCTGAGGGCTATAACGCTTCTGCTGCTACTGTGGAATCGAATGTTGATTCATCTCAATCGGTCACTAATGTTTCTTTGGTCAATGGGACTAGTGGACCTGAAGGTGGTTCAACTGCGCCAGCTGAGAATGGAACTGCAACAGATAATGTGCCTGTAACAGTTCCAGGAGCAGGACATGTAGACAATGCTGGTAATTCCTTCTTCTATTCAATAGACACATCACTGAGAATTGAATTTGTCATGTTAACTTCAATGATATAATTATTTACTTATTCCATCTCTGTTGTGAAAGGTTCTACTCTTTCACCGGAAGAGGAGCGCTTATGGAGTATTGTAAAGGCTAATTCTTCAGAGTTCAATGCTTGGACTGCCCTGATTGAAGAGACAGAGAGGATATCTCAGGTATCTGTGGATTCTCATAATTAATTTAGTTTTTGTCCTCTATTTACTAAGCTTTGACCTGTGAAAAATTCTATGTGGATTTCATGGTTTAAGTATCTGAATCATGTTTCCATTAACTTATTTGCTAGTATCTGAATCTTATAAGTCGCTTTCATCTTTGTATAATGTTAGGTACTTCATTTTCTTTAAACAAGATTGGTAATGTTTTCTTGTTTCCCTAATTACAGGACAATATAGCAAAGATCCGGAAGGTGTATGATGCTTTCCTAGCTGAATTCCCTCTGTGTTATGGCTATTGGAAAAAATATGCGGATCATGAGGCTCGGGTGGGGGCAATGGACAAAGTCGTGGAGGTTTATGAAAGAGCAGTGCAGGGGGTGACGTATTCTGTGGACATATGGCTACATTATTGCGTTTTTGCCATCAATACATATGGAGATCCAGACACGATCAGAAGGTAAAGAGTGCTTATACTTGTATTTGTATGTGTATTAATAGTTTGATTGGTTTTTCAGTTACCTAGAAAAAATGATTTTTTTGCCATCTAACCCTTTTCTTAGATTGCTACAGAAAGTTCTCTCATTTGTGGCGGAAAGATCTGATGGAATTTGTTTAGAAATATTTATTTTTCATACAACTCACTTGTTTTTTCTGGTGAACCTGCTCCATTTTTGTGGTGGTTTATACTTCTTTTGCTTGAAAATTTTGAAGTTAAAAAATACTTGTTTTTATTGTTACCCTCCCATCGAAGTGTATCCATATGCAAAATGCTGCTGGGAAGATCTCAACCAGTTTTGGGCTTTAGGTAGCCTCTGACTACTCGATTTTGGCCACGGTATGCTTTTACCAGGAAGGTAAATGCAGTGTTTGGCAGTATTCTGCATTCAAAGAGTGAATCCTTTTTTTCTCCATAGAACTTCGCGTCTTTATTGATTGGACGTGTCTGTGTATCTATCAGCGTATATGACAATTCTTTTTTCTCTTTTGCTTCTGCAGCCTTTTTGAACGAGCTGTGGTTTACGTTGGAACTGATTTTCTGTCCTCTCCATTGTGGGACAAATACATCGAGTATGAGCACATGCAGCAGGACTGGAGCCGCCTTGCCATGATCTACACCAGAATATTGGAGAATCCTATTCAAAACCTTGATAGATACTTCAGCAAGTAAGTTCAAGTGAATTCATCAATCATTTCCCTCTGCACTCTGAATTGGATATTTCACGTGGATTACAATTGTTATGTTGAAAATAATTTATATGTTGATTTAGCTTAATCGAAGTGAGCCATATGGCAAATGAGCTATTGTCATGCATATGATCGACTGATTTTAAGTGCCAGGTTTCTTAGTTTATGCTCAGAATTTTAGTGTCTTTCTGTTGTTGATAAATGCTATTCTTGCTACAGCTTTAAGGAGCTAGCTGAAACACGTCCTCTGTCCGAACTTAGGAGTGCTGAGGAATCTGCAACAGTTACTGTTGCTAGTGATGCTTCTGAAACTGCACCATCTGAGTCTGATGGAAAGGCAGATGAAGGAAAATCTCAAGCTGATGGTACCTCTGAACCATCTAAGTTGGAAACTGCTGGTTCAACTGATCCTGAGGAACTGAAGAAATACATTGGCATCAGAGAAGCCTTGTATATCAAAGCCAAAGAGTTTGAATCTAAAATCATTGGTTTTGAAATGGCTATAAGAAGGCCTTATTTCCATGTGCGGCCTCTCAATGTAGCAGAGCTGGAGAATTGGCATAGTTATCTGGACTTCATAGAGAGCGATGGAGACTTCAATAAGGTACTTGGGTGCTTAACTCTCTTTTATGTGAAGATACAAGTGCTTTTGTAGATTAAGTCGTACCTCTGTAATATTATTGACCTACAGTTAAGTAGTATCTGGTGCATCATATGCTTTATTGGGTTTCCATTGGATCAAAGCATGGGCCTATATTTGGTAACTTTAAGGCTTAAGTAGAAAGTATTTCACACTCTATTTGTCAATAGTTTTTATGGTACGTGAGTTATGCTGTTTTTGAAAGTTCCAACGTTATTAATGAAGGGGTCTTCATAACAATCTGTCTGTCACTCTTTGTTCTACTTGTGGAGTGTTTGTTCTTTTTATGTTTACATATTTTTTTGGTTTTTAGCAGTGATCATCATGTATGCTTTACATTAGATTCTTTTCCAACAGGTGGTCAAGCTGTATGAAAGATGTCTAGTAGCGTGCGCAAACTACCCTGAATACTGGATTCGTTATGTATTAAGCATGGGATCAAGTGGAAGTATGGACCTTGCAGACAACGCCCTTACTCGAGCAACTCAAGTCTTTGTCAAGGTATGAAACATGATCTTATCTCATTACTTTTGATTGGCTTTGTAGAAAAATTAATATATTGGCATTCTTGGTTATTTATTTGCTTTCTTTTCTGTGGCAGAGACAACCAGAAATCCACCTTTTTGCTGCTCGCTTGAAAGAGCAGAATGGGGATATAGCTGGTGCTAGAGCTGCATTCCAATTACTGCACTCTGAAATTTCTCCCGGGCTTCTTGAAGCAGTAATTAAACATGCCAACATGGAACAACGACTAGTAAGTTTTCATGAACAAGTAGTAACTGAAGAGCTAGCTTAGCCTATTATCACCACTCTAATTTTCCTTTACTCGTCTCCTAATCTTATTTGTAGGGAAATGTGGATGATGCTTTCTCTGTGTATGAGCAAGTGATTGCTGTTGAAAAAGGCAAAGAGAACTCCATATTACTGCCGCTGCTGTATGCGCAGTATTCAAGGTTTTCCTACTTGGTATGTCTACTAACTGTATAAAACCGAACTCCTTTTGTTAAGCTTTGTTGAAAGAGTATTAATAGGTTTGGCTTCTTTCTTTTTTTTTTCCGATAATACTTTCAGGTTTTACGTGACGCTGAGAAGGCTAGGAAGATTATAGTTGAAGCACTTGATCACGTGCAGCCGTCAAAGCATTTCATGGAAGCACTGATCTTTTTCGAGACCATTCTGCCACCACCAAGGAAGATTGAATACCTCGACCCACTCGTTGAGAATTTGATAAAGCCAAATGTAGTCACCCAGAACACTGCAAGTTCCACAGAGAGGGAAGAGCTTTCTTTGATATATATAGAGGTAACGGAGCAAGAAGAGACCTATCTGTTCTTCTAAACTTAAAGTCTTCTCAGTATCTAAATTATTGTTTTTAATATCAAATGTGTGTATGGCTTTTGCAGTTCCTGGGTCTTTTCGGAGATGTTGAGTCCATTAAAAAGGCGGAAGATCGACATTGTAAGCTCTTTTTACCTCACCGGAGCAGGTCAGAATTGAAAAAGCGTAGCGCGGATGAGTTTCTCTCTTCAGATAGGACGAAACTGGCCAAAACTTACAATGAAACTGCGCCTGCTCAGCCAGTGTCTAATGCATATCCAAATGCACCGGCTCAATGGTCGGGTGGTTATGCTGCACAGCCTCAAGCTTGGCCACAACCACAAGCGGCTCCTGCACAACCACAGCAGTGGAACCCTGCTTATGGCCAGCAGCAGGTAATTGAAACCGAATTCGTTTACTTCATAGCTTAGCTTTTACTCTTATTAACGTTTTCATCATTCACGTTAGGCTGCGTATGGTGCATATGGTGGCTATCCCGCTGGCTATACTGCTCCACAAGCACCAACACCCGTGCCACAAGCCGCTGCTTATGGGGCATATCCTCCTCAGGTAACCGATTATGTTTAAAGAGTGATTAGGCTAAAAGTTGTTTAACTAAGAATTGTTTAACTTGATCAACTAATGAAATGATTGTTTATTTGTGAAAACTTCAGGCATACCCAGCTGCAGCTACAGCACCAGTGGCTGCCCCGGTCCAGCAACCCGCTGCTCCTCCTCCTCAAGCTTACTACAACACTTACTACTGA
CDS Sequence
- >Bo8g002740
CAAACACATCACGCGTCGTCGTCTCTAACCCTACGAACCCTCTCTTCCTGTAACCGAGAAAAAAACTTGGGAGCTCCTCCAACGAAGTCACTTGCGAGCTTCCTCTTCACTATCCGAGTTATAGTTATGGGAGAAAGCCAGGCCATGGTTGCTGAGGGCTATAACGCTTCTGCTGCTACTGTGGAATCGAATGTTGATTCATCTCAATCGGTCACTAATGTTTCTTTGGTCAATGGGACTAGTGGACCTGAAGGTGGTTCAACTGCGCCAGCTGAGAATGGAACTGCAACAGATAATGTGCCTGTAACAGTTCCAGGAGCAGGACATGTAGACAATGCTGGTTCTACTCTTTCACCGGAAGAGGAGCGCTTATGGAGTATTGTAAAGGCTAATTCTTCAGAGTTCAATGCTTGGACTGCCCTGATTGAAGAGACAGAGAGGATATCTCAGGACAATATAGCAAAGATCCGGAAGGTGTATGATGCTTTCCTAGCTGAATTCCCTCTGTGTTATGGCTATTGGAAAAAATATGCGGATCATGAGGCTCGGGTGGGGGCAATGGACAAAGTCGTGGAGGTTTATGAAAGAGCAGTGCAGGGGGTGACGTATTCTGTGGACATATGGCTACATTATTGCGTTTTTGCCATCAATACATATGGAGATCCAGACACGATCAGAAGCCTTTTTGAACGAGCTGTGGTTTACGTTGGAACTGATTTTCTGTCCTCTCCATTGTGGGACAAATACATCGAGTATGAGCACATGCAGCAGGACTGGAGCCGCCTTGCCATGATCTACACCAGAATATTGGAGAATCCTATTCAAAACCTTGATAGATACTTCAGCAACTTTAAGGAGCTAGCTGAAACACGTCCTCTGTCCGAACTTAGGAGTGCTGAGGAATCTGCAACAGTTACTGTTGCTAGTGATGCTTCTGAAACTGCACCATCTGAGTCTGATGGAAAGGCAGATGAAGGAAAATCTCAAGCTGATGGTACCTCTGAACCATCTAAGTTGGAAACTGCTGGTTCAACTGATCCTGAGGAACTGAAGAAATACATTGGCATCAGAGAAGCCTTGTATATCAAAGCCAAAGAGTTTGAATCTAAAATCATTGGTTTTGAAATGGCTATAAGAAGGCCTTATTTCCATGTGCGGCCTCTCAATGTAGCAGAGCTGGAGAATTGGCATAGTTATCTGGACTTCATAGAGAGCGATGGAGACTTCAATAAGGTGGTCAAGCTGTATGAAAGATGTCTAGTAGCGTGCGCAAACTACCCTGAATACTGGATTCGTTATGTATTAAGCATGGGATCAAGTGGAAGTATGGACCTTGCAGACAACGCCCTTACTCGAGCAACTCAAGTCTTTGTCAAGAGACAACCAGAAATCCACCTTTTTGCTGCTCGCTTGAAAGAGCAGAATGGGGATATAGCTGGTGCTAGAGCTGCATTCCAATTACTGCACTCTGAAATTTCTCCCGGGCTTCTTGAAGCAGTAATTAAACATGCCAACATGGAACAACGACTAGGAAATGTGGATGATGCTTTCTCTGTGTATGAGCAAGTGATTGCTGTTGAAAAAGGCAAAGAGAACTCCATATTACTGCCGCTGCTGTATGCGCAGTATTCAAGGTTTTCCTACTTGGTTTTACGTGACGCTGAGAAGGCTAGGAAGATTATAGTTGAAGCACTTGATCACGTGCAGCCGTCAAAGCATTTCATGGAAGCACTGATCTTTTTCGAGACCATTCTGCCACCACCAAGGAAGATTGAATACCTCGACCCACTCGTTGAGAATTTGATAAAGCCAAATGTAGTCACCCAGAACACTGCAAGTTCCACAGAGAGGGAAGAGCTTTCTTTGATATATATAGAGTTCCTGGGTCTTTTCGGAGATGTTGAGTCCATTAAAAAGGCGGAAGATCGACATTGTAAGCTCTTTTTACCTCACCGGAGCAGGTCAGAATTGAAAAAGCGTAGCGCGGATGAGTTTCTCTCTTCAGATAGGACGAAACTGGCCAAAACTTACAATGAAACTGCGCCTGCTCAGCCAGTGTCTAATGCATATCCAAATGCACCGGCTCAATGGTCGGGTGGTTATGCTGCACAGCCTCAAGCTTGGCCACAACCACAAGCGGCTCCTGCACAACCACAGCAGTGGAACCCTGCTTATGGCCAGCAGCAGGCTGCGTATGGTGCATATGGTGGCTATCCCGCTGGCTATACTGCTCCACAAGCACCAACACCCGTGCCACAAGCCGCTGCTTATGGGGCATATCCTCCTCAGGCATACCCAGCTGCAGCTACAGCACCAGTGGCTGCCCCGGTCCAGCAACCCGCTGCTCCTCCTCCTCAAGCTTACTACAACACTTACTACTGA
Protein Sequence
- >Bo8g002740
QTHHASSSLTLRTLSSCNREKNLGAPPTKSLASFLFTIRVIVMGESQAMVAEGYNASAATVESNVDSSQSVTNVSLVNGTSGPEGGSTAPAENGTATDNVPVTVPGAGHVDNAGSTLSPEEERLWSIVKANSSEFNAWTALIEETERISQDNIAKIRKVYDAFLAEFPLCYGYWKKYADHEARVGAMDKVVEVYERAVQGVTYSVDIWLHYCVFAINTYGDPDTIRSLFERAVVYVGTDFLSSPLWDKYIEYEHMQQDWSRLAMIYTRILENPIQNLDRYFSNFKELAETRPLSELRSAEESATVTVASDASETAPSESDGKADEGKSQADGTSEPSKLETAGSTDPEELKKYIGIREALYIKAKEFESKIIGFEMAIRRPYFHVRPLNVAELENWHSYLDFIESDGDFNKVVKLYERCLVACANYPEYWIRYVLSMGSSGSMDLADNALTRATQVFVKRQPEIHLFAARLKEQNGDIAGARAAFQLLHSEISPGLLEAVIKHANMEQRLGNVDDAFSVYEQVIAVEKGKENSILLPLLYAQYSRFSYLVLRDAEKARKIIVEALDHVQPSKHFMEALIFFETILPPPRKIEYLDPLVENLIKPNVVTQNTASSTEREELSLIYIEFLGLFGDVESIKKAEDRHCKLFLPHRSRSELKKRSADEFLSSDRTKLAKTYNETAPAQPVSNAYPNAPAQWSGGYAAQPQAWPQPQAAPAQPQQWNPAYGQQQAAYGAYGGYPAGYTAPQAPTPVPQAAAYGAYPPQAYPAAATAPVAAPVQQPAAPPPQAYYNTYY