Information report for Bo5g132080
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc29940
- Arabidopsis thaliana: AT1G04080
- Brassica napus: BnaC05G0465300ZS, BnaC05G0024700ZS, BnaA10G0023400ZS, BnaC08G0008000ZS, BnaA08G0316900ZS
- Brassica rapa: Bra015287, Bra030554
- Capsicum annuum: T459_23621
- Glycine max: Glyma.03G167000, Glyma.19G168100
- Gossypium hirsutum: Gohir.D11G139400, Gohir.A11G133300
- Saccharum spontaneum: Sspon.01G0035810-1B
- Solanum lycopersicum: Solyc09g064590.3
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A3P6F2B0
- EMBL: LR031877
- AlphaFoldDB: A0A3P6F2B0
- OMA: ERCIVAC
- InterPro: IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF5
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo5g132080
CACATCCAACATGCTTGTGGTTGTGGATGAATATACCCATAGCGAGCCTGTGGTGGACGACATGGCTGAGCAAGAGGAATATAACCAGAAGGAGCCTGAGTATATGAAGGAATTGTAGGTGTTTGGGAAGGATTATAGCCAGCGTGTGTGTTGGATAAGCCGCTGCAGCTAGAGGTGCATAAAAAGTATGTGGTAGGTATGCCTAATGATGGCCATAAGCAGTGTTCCACTGATGTGCTTGTGCATGAACGGCTTGCAAAGTTTGAGGCCCGTAACCAGGTGTTAATGCTTCCGCTGATGATGCTTGTGCTTATGACGAAGCCTGAAGCTGTGCGACGTCATTGTTAGTTTTTGCCCTTTTCATCCTATCTGAAGCGAGAAGTTCATCTGCCCCATACTTTTTAGCTCTGAACTGATCCGGGGATCAAGAAAGAGTTTCGTATGCTGAATTTCAGCATTTATAATGGAAGCAAAATATCCAAAACGGTGCAGGAACCCTATGTATATCAATGATAGATATTCTCTCTCATCTGAACTTGCAGAAGAGTTATGCATCTCTGCTGCACTTGGATTTATACAATTTTCGATAAGTGGTTTAAACTGATCAATGTTTCTTGGAAGTGGCAGAATAGACTCCAAATACAACAGTTCATCGATCAACTCTTTTGACGGTTTCACGTGGTCAAGTGCTTCCACTACAATACTCATAGCTTTCTCAGCATCATTCAACACTAAGTATGAAAACTTCGAATACTAAGCATACAGCTGCGGCAGTAATATAGAGTCCTTTTTGCTCTTTTCAACAGCAATCACATCATCATACACAGAGCAAGCACCATCCGAATCTCCTATCATGCGATGTTGCATGTTCGCATGTCTCATTACTGCTTCAACATGTCCTGGAGATATTTCAGAATACAGTAGTTTGAAAGAGGCTCTAGCTAACTATGGGACGGATCGGGTATCCGGGTAATTTTTAGGTATCCGGATCCGAATCATTATTCGGCGGATCCATAATTTTACTATTCTTATCCGGATCCGGTGTTATCGGATATCCGGGTGTCGGATATCCTTCTAAAATTGTAATATCCGGCGGATATCCGGATCCGGATTTGGATCCTTAAAATAAATAAAAAATAATATTATTATATATATAAAATATTAACAATAATTTAAAAATAAAATTATATATAATGTCTTTAATTATTTCTATGTATAATATTACAAAATTTACATAAAATTTATATATACCATTATAAAAATGAAAATATATTAAATAAAATTAATTTTTATATATAGATATTACTATTTTTGAAATATTTATTAATAAAAATTACGGATCCAGATATCCGGACTTAAAAATTAAGATAACCGGATCCGGCTTTGACGGATCCAACATTTTACTATCCAGATCCGGATTCGGCCCCTCTGGATATCCAGATTTTTGGATCGAATCCGGATCTTGGATAAAAGTCCCAGGCCTAGCTCTAGCACCAGCTATATCCTCATTCTTCTCTAAATTCAGTTGTGAAGAGATGAATTTCTGGTTGTCTCTTCAGATATATTTTAGTTGCTCGAACAAGGGCTTGGTTTGCAATATCCATTCTTCCCCTTGCTTTCATGGATAATACATATTGAATCCAATATTCAGGGTAACTTGCACAAGCAACTATGCATCTTTCATAGAGATGGAAGACCTTAGACCAGTCTCCATCACTCTCTATGAAATCCAGATAGTTATGCCAATTTTCCCGCTCTTCAACACTGAGTGGCTGCACATTAAAACTGGGCCTTCTTCCTATAGTTGTTTCAAAACCAATGATCTTAGATTCAAACTCTTTGGCTTTTGTATACTTTGCTTCTATGTATTTTATCAACTCCTCTGGATCAGTTTGAGATTTTCCTTCAGCGTTGGTAGTACCAGCAACTGCCACAACACT
CDS Sequence
- >Bo5g132080
AGTGTTGTGGCAGTTGCTGGTACTACCAACGCTGAAGGAAAATCTCAAACTGATCCAGAGGAGTTGATAAAATACATAGAAGCAAAGTATACAAAAGCCAAAGAGTTTGAATCTAAGATCATTGGTTTTGAAACAACTATAGGAAGAAGGCCCAGTTTTAATGTGCAGCCACTCAGTGTTGAAGAGCGGGAAAATTGGCATAACTATCTGGATTTCATAGAGAGTGATGGAGACTGGTCTAAGGTCTTCCATCTCTATGAAAGATGCATAGTTGCTTGTGCAAGACATGTTGAAGCAGTAATGAGACATGCGAACATGCAACATCGCATGATAGGAGATTCGGATGGTGCTTGCTCTGTGTATGATGATGTGATTGCTAAAGCTATGAGTATTGTAGTGGAAGCACTTGACCACGTGAAACCGTCAAAAGAGTTGATCGATGAACTGTTGTATTTGGAGTCTATTCTGCCACTTCCAAGAAACATTGATCAGTTTAAACCACTTATCGAAAATTGTATAAATCCAAGTGCAGCAGAGATGCATAACTCTTCTGCAAGTTCAGATGAGAGAGAATATCTATCATTGATATACATAGGGTTCCTGCACCGTTTTGGATATTTTGCTTCCATTATAAATGCTGAAATTCAGCATACGAAACTCTTTCTTGATCCCCGGATCAGTTCAGAGCTAAAAAGCTTCGTCATAAGCACAAGCATCATCAGCGGAAGCATTAACACCTGGTTACGGGCCTCAAACTTTGCAAGCCGTTCATGCACAAGCACATCAGTGGAACACTGCTTATGGCCATCATTAGGCATACCTACCACATACTTTTTATGCACCTCTAGCTGCAGCGGCTTATCCAACACACACGCTGGCTATAATCCTTCCCAAACACCTACAATTCCTTCATATACTCAGGCTCCTTCTGGTTATATTCCTCTTGCTCAGCCATGTCGTCCACCACAGGCTCGCTATGGGTATATTCATCCACAACCACAAGCATGTTGGATGTGA
Protein Sequence
- >Bo5g132080
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