Information report for BnaC05G0465300ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G04080
- Brassica oleracea: Bo5g132080, Bo5g004290, Bo8g002740
- Brassica rapa: Bra015287, Bra030554
- Capsicum annuum: T459_23621
- Glycine max: Glyma.03G167000, Glyma.19G168100
- Gossypium hirsutum: Gohir.D11G139400
- Saccharum spontaneum: Sspon.01G0035810-1B
- Solanum lycopersicum: Solyc09g064590.3
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A078GE65
- EMBL: HG994369 , LK032145
- AlphaFoldDB: A0A078GE65
- OMA: ERCIVAC
- InterPro: IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF5
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- SMR: A0A078GE65
- STRING: 3708.A0A078GE65
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC05G0465300ZS
CACATCCAACATGCTTGTGGTTGTGGATGAATATACCCATAGCGAGCCTGTGGTGGACGACATGGCTGAGCAAGAGGAATATAACCAGAAGGAGCCTGAGTATATGAAGGAATTGTAGGTGTTTGGGAAGGATTATAGCCAGCGTGTGTGTTGGATAAGCCGCTGCAGCTAGAGGTGCATAAAAAGTATGTGGTAGGTATGCCTAATGATGGCCATAAGCAGTGTTCCACTGATGTGCTTGTGCATGAACGGCTTGCAAAGTTTGAGGCCCGTAACCAGGTGTTAATGCTTCCGCTGATGATGCTTGTGCTTATGACGAAGCCTGAAGCTGTGCGACGTCATTGTTAGTTTTTGCCCTTTTCATCCTATCTGAAGCGAGAAGTTCATCTGCCCCATACTTTTTAGCTCTGAACTGATCCGGGGATCAAGAAAGAGTTTCGTATGCTGAATTTCAGCATTTATAATGGAAGCAAAATATCCAAAACGGTGCAGGAACCCTATGTATATCAATGATAGATATTCTCTCTCATCTGAACTTGCAGAAGAGTTATGCATCTCTGCTGCACTTGGATTTATACAATTTTCGATAAGTGGTTTAAACTGATCAATGTTTCTTGGAAGTGGCAGAATAGACTCCAAATACAACAGTTCATCGATCAACTCTTTTGACGGTTTCACGTGGTCAAGTGCTTCCACTACAATACTCATAGCTTTCTCAGCATCATTCAACACTAAGTATGAAAACTTCGAATACTAAGCATACAGCTGCGGCAGTAATATAGAGTCCTTTTTGCTCTTTTCAACAGCAATCACATCATCATACACAGAGCAAGCACCATCCGAATCTCCTATCATGCGATGTTGCATGTTCGCATGTCTCATTACTGCTTCAACATGTCCTGGAGATATTTCAGAATACAGTAGTTTGAAAGAGGCTCTAGCTAACTATGGGACGGATCGGGTATCCGGGTAATTTTTAGGTATCCGGATCCGAATCATTATTCGGCGGATCCATAATTTTACTATTCTTATCCGGATCCGGTGTTATCGGATATCCGGGTGTCGGATATCCTTCTAAAATTGTAATATCCGGCGGATATCCGGATCCGGATTTGGATCCTTAAATAAATAAAAATAATATTATTATATATATAAAATATTAACAATAATTTAAAAATAAAATTATATATAATGTCTTTAATTATTTCTATGTATAATATTACAAAATTTACATAAAATTTATATATACCATTATAAAAATGAAAATATATTAAATAAAATTAATTTTTATATATAGATATTACTATTTTTGAAATATTTATTAATAAAAATTACGGATCCAGATATCCGGACTTAAAAATTAAGATAACCGGATCCGGCTTTGACGGATCCAACATTTTACTATCCAGATCCGGATTCGGCCCCTCTGGATATCCAGATTTTTGGATCGAATCCGGATCTTGGATAAAAGTCCCAGGCCTAGCTCTAGCACCAGCTATATCCTCATTCTTCTCTAAATTCAGTTGTGAAGAGATGAATTTCTGGTTGTCTCTTCAGATATATTTTAGTTGCTCGAACAAGGGCTTGGTTTGCAATATCCATTCTTCCCCTTGCTTTCATGGATAATACATATTGAATCCAATATTCAGGGTAACTTGCACAAGCAACTATGCATCTTTCATAGAGATGGAAGACCTTAGACCAGTCTCCATCACTCTCTATGAAATCCAGATAGTTATGCCAATTTTCCCGCTCTTCAACACTGAGTGGCTGCACATTAAAACTGGGCCTTCTTCCTATAGTTGTTTCAAAACCAATGATCTTAGATTCAAACTCTTTGGCTTTTGTATACTTTGCTTCTATGTATTTTATCAACTCCTCTGGATCAGTTTGAGATTTTCCTTCAGCGTTGGTAGTACCAGCAACTGCCACAACACTCCTTAGTTCCGACAAAGGCAATGCTTGAGCTCAT
CDS Sequence
- >BnaC05G0465300ZS
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Protein Sequence
- >BnaC05G0465300ZS
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