Information report for BnaC08G0008000ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G04080
- Brassica oleracea: Bo8g002740, Bo5g004290
- Brassica rapa: Bra030554, Bra015287
- Gossypium hirsutum: Gohir.D07G158300, Gohir.A11G133300, Gohir.D11G139400, Gohir.D07G210300, Gohir.A07G204300
- Juglans regia: Jr10_24680
- Prunus avium: Pav_sc0002181.1_g210.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_8G215900
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A0D3DIR7
- AlphaFoldDB: A0A0D3DIR7
- OMA: HEQFNAV
- InterPro: IPR003107 , IPR011990
- PANTHER: PTHR17204 , PTHR17204:SF31
- SUPFAM: SSF48452
- Gene3D: 1.25.40.10
- eggNOG: KOG1258
- STRING: 109376.A0A0D3DIR7
- HOGENOM: CLU_007434_1_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC08G0008000ZS
CGCGTCGTCGTCTCTAACCCTACGAACCCTCTCTTCCTGTAACCGAGAAAAAAACTTGGGAGCTCCTCCAACGAAGTCACTTGCGAGCTTCCTCTTCACTATCCGAGGTTCGTATCCTTCCATCTCCCTTTGTATTTCACGAATTGGGAATACAGCTAAGGTTTTGTTTCTGGTAGATCATGCTCACAGGGTTTATGATTAGGGTTTGCTTGTCCTGCTAGAAAATTACGCATCAAGCTTTACGTATTGTGATTCGTATGAAGATAATATTGAGTTTTGTGTTAAACAGCTCTTCTCTATCTGTGTGGTTTTGGTTTGTATACGATTAGGTGATAATCTTAATGGCATCCATCGATTGAGTGTAGACTAGTCTTATATGTGCTTTCTAATGATTCCATTCTCATGTATTTTGTTGCAGTTATAGTTATGGGAGAAAGCCAGGCCATGGTTGCTGAGGGCTATAACGCTTCTGCTGCTACTGTGGAATCGAATGTTGATTCATCTCAATCGGTCACTAATGTTTCTTTGGTCAATGGGACTAGTGGACCTGAAGGTGGTTCAACTGCGCCAGCTGAGAATGGAACTGCAACAGATAATGTGCCTGTAACAGTTCCAGGAGCAGGACATGTAGACAATGCTGGTAATTCCTTCTTCTATTCAATAGACACATCACTGAGAATTGAATTTGTCATGTTAACTTCAATGATATAATTATTTACTTATTCCATCTCTGTTGTGAAAGGTTCTACTCTTTCACCGGAAGAGGAGCGCTTATGGAGTATTGTAAAGGCTAATTCTTCAGAGTTCAATGCTTGGACTGCCCTGATTGAAGAGACAGAGAGGATATCTCAGGTATCTGTGGATTCTCATAATTAATTTAGTTTTTGTCCTCTATTTACTAAGCTTTGACCTGTGAAAAATTCTATGTGGATTTCATGGTTTAAGTATCTGAATCATGTTTCCATTAACTTATTTGCTAGTATCTGAATCTTATAAGTCGCTTTCATCTTTGTATAATGTTAGGTACTTCATTTTCTTTAAACAAGATTGGTAATGTTTTCTTGTTTCCCTAATTACAGGACAATATAGCAAAGATCCGGAAGGTGTATGATGCTTTCCTAGCTGAATTCCCTCTGTGTTATGGCTATTGGAAAAAATATGCGGATCATGAGGCTCGGGTGGGGGCAATGGACAAAGTCGTGGAGGTTTATGAAAGAGCAGTGCAGGGGGTGACGTATTCTGTGGACATATGGCTACATTATTGCGTTTTTGCCATCAATACATATGGAGATCCAGACACGATCAGAAGGTAAAGAGTGCTTATACTTGTATTTGTATGTGTATTAATAGTTTGATTGGTTTTTCAGTTACCTAGAAAAAATGATTTTTTTGCCATCTAACCCTTTTCTTAGATTGCTACAGAAAGTTCTCTCATTTGTGGCGGAAAGATCTGATGGAATTTGTTTAGAAATATTTATTTTTCATACAACTCACTTGTTTTTTCTGGTGAACCTGCTCCATTTTTGTGGTGGTTTATACTTCTTTTGCTTGAAAATTTTGAAGTTAAAAAATACTTGTTTTTATTGTTACCCTCCCATCGAAGTGTATCCATATGCAAAATGCTGCTGGGAAGATCTCAACCAGTTTTGGGCTTTAGGTAGCCTCTGACTACTCGATTTTGGCCACGGTATGCTTTTACCAGGAAGGTAAATGCAGTGTTTGGCAGTATTCTGCATTCAAAGAGTGAATCCTTTTTTTCTCCATAGAACTTCGCGTCTTTATTGATTGGACGTGTCTGTGTATCTATCAGCGTATATGACAATTCTTTTTTCTCTTTTGCTTCTGCAGCCTTTTTGAACGAGCTGTGGTTTACGTTGGAACTGATTTTCTGTCCTCTCCATTGTGGGACAAATACATCGAGTATGAGCACATGCAGCAGGACTGGAGCCGCCTTGCCATGATCTACACCAGAATATTGGAGAATCCTATTCAAAACCTTGATAGATACTTCAGCAAGTAAGTTCAAGTGAATTCATCAATCATTTCCCTCTGCACTCTGAATTGGATATTTCACGTGGATTACAATTGTTATGTTGAAAATAATTTATATGTTGATTTAGCTTAATCGAAGTGAGCCATATGGCAAATGAGCTATTGTCATGCATATGATCGACTGATTTTAAGTGCCAGGTTTCTTAGTTTATGCTCAGAATTTTAGTGTCTTTCTGTTGTTGATAAATGCTATTCTTGCTACAGCTTTAAGGAGCTAGCTGAAACACGTCCTCTGTCCGAACTTAGGAGTGCTGAGGAATCTGCAACAGTTACTGTTGCTAGTGATGCTTCTGAAACTGCACCATCTGAGTCTGATGGAAAGGCAGATGAAGGAAAATCTCAAGCTGATGGTACCTCTGAACCATCTAAGTTGGAAACTGCTGGTTCAACTGATCCTGAGGAACTGAAGAAATACATTGGCATCAGAGAAGCCTTGTATATCAAAGCCAAAGAGTTTGAATCTAAAATCATTGGTTTTGAAATGGCTATAAGAAGGCCTTATTTCCATGTGCGGCCTCTCAATGTAGCAGAGCTGGAGAATTGGCATAGTTATCTGGACTTCATAGAGAGCGATGGAGACTTCAATAAGGTACTTGGGTGCTTAACTCTCTTTTATGTGAAGATACAAGTGCTTTTGTAGATTAAGTCGTACCTCTGTAATATTATTGACCTACAGTTAAGTAGTATCTGGTGCATCATATGCTTTATTGGGTTTCCATTGGATCAAAGCATGGGCCTATATTTGGTAACTTTAAGGCTTAAGTAGAAAGTATTTCACACTCTATTTGTCAATAGTTTTTATGGTACGTGAGTTATGCTGTTTTTGAAAGTTCCAACGTTATTAATGAAGGGGTCTTCATAACAATCTGTCTGTCACTCTTTGTTCTACTTGTGGAGTGTTTGTTCTTTTTATGTTTACATATTTTTTTGGTTTTTAGCAGTGATCATCATGTATGCTTTACATTAGATTCTTTTCCAACAGGTGGTCAAGCTGTATGAAAGATGTCTAGTAGCGTGCGCAAACTACCCTGAATACTGGATTCGTTATGTATTAAGCATGGGATCAAGTGGAAGTATGGACCTTGCAGACAACGCCCTTACTCGAGCAACTCAAGTCTTTGTCAAGGTATGAAACATGATCTTATCTCATTACTTTTGATTGGCTTTGTAGAAAAATTAATATATTGGCATTCTTGGTTATTTATTTGCTTTCTTTTCTGTGGCAGAGACAACCAGAAATCCACCTTTTTGCTGCTCGCTTGAAAGAGCAGAATGGGGATATAGCTGGTGCTAGAGCTGCATTCCAATTACTGCACTCTGAAATTTCTCCCGGGCTTCTTGAAGCAGTAATTAAACATGCCAACATGGAACAACGACTAGTAAGTTTTCATGAACAAGTAGTAACTGAAGAGCTAGCTTAGCCTATTATCACCACTCTAATTTTCCTTTACTCGTCTCCTAATCTTATTTGTAGGGAAATGTGGATGATGCTTTCTCTGTGTATGAGCAAGTGATTGCTGTTGAAAAAGGCAAAGAGAACTCCATATTACTGCCGCTGCTGTATGCGCAGTATTCAAGGTTTTCCTACTTGGTATGTCTACTAACTGTATAAAACCGAACTCCTTTTGTTAAGCTTTGTTGAAAGAGTATTAATAGGTTTGGCTTCTTTCTTTTTTTTTTCCGATAATACTTTCAGGTTTTACGTGACGCTGAGAAGGCTAGGAAGATTATAGTTGAAGCACTTGATCACGTGCAGCCGTCAAAGCATTTCATGGAAGCACTGATCTTTTTCGAGACCATTCTGCCACCACCAAGGAAGATTGAATACCTCGACCCACTCGTTGAGAATTTGATAAAGCCAAATGTAGTCACCCAGAACACTGCAAGTTCCACAGAGAGGGAAGAGCTTTCTTTGATATATATAGAGGTAACGGAGCAAGAAGAGACCTATCTGTTCTTCTAAACTTAAAGTCTTCTCAGTATCTAAATTATTGTTTTTAATATCAAATGTGTGTATGGCTTTTGCAGTTCCTGGGTCTTTTCGGAGATGTTGAGTCCATTAAAAAGGCGGAAGATCGACATTGTAAGCTCTTTTTACCTCACCGGAGCAGGTCAGAATTGAAAAAGCGTAGCGCGGATGAGTTTCTCTCTTCAGATAGGACGAAACTGGCCAAAACTTACAATGAAACTGCGCCTGCTCAGCCAGTGTCTAATGCATATCCAAATGCACCGGCTCAATGGTCGGGTGGTTATGCTGCACAGCCTCAAGCTTGGCCACAACCACAAGCGGCTCCTGCACAACCACAGCAGTGGAACCCTGCTTATGGCCAGCAGCAGGTAATTGAAACCGAATTCGTTTACTTCATAGCTTAGCTTTTACTCTTATTAACGTTTTCATCATTCACGTTAGGCTGCGTATGGTGCATATGGTGGCTATCCCGCTGGCTATACTGCTCCACAAGCACCAACACCCGTGCCACAAGCCGCTGCTTATGGGGCATATCCTCCTCAGGTAACCGATTATGTTTAAAGAGTGATTAGGCTAAAAGTTGTTTAACTAAGAATTGTTTAACTTGATCAACTAATGAAATGATTGTTTATTTGTGAAAACTTCAGGCATACCCAGCTGCAGCTACAGCACCAGTGGCTGCCCCGGTCCAGCAACCCGCTGCTCCTCCTCCTCAAGCTTACTACAACACTTACTACTGAGTCTGTTGGTGTTGCTTGTCCTTAGCCATTTTCTCTTTAGCTACTCAAGTTTAGTGTATGACTCTTGTCTTGATGTTTTTACATGTCTCTTTTCTCGATCAGTGACATTAGTTTTACTTTCAAGTTGCTTGGATTTCCGCCGGTTATGATACAGATTGTAAGAGACAAGTTTGAATTGATGGGCCGGTTAGTGCGGTTTAATAGACAGTCAGAATTTGCTT
CDS Sequence
- >BnaC08G0008000ZS
ATGGGAGAAAGCCAGGCCATGGTTGCTGAGGGCTATAACGCTTCTGCTGCTACTGTGGAATCGAATGTTGATTCATCTCAATCGGTCACTAATGTTTCTTTGGTCAATGGGACTAGTGGACCTGAAGGTGGTTCAACTGCGCCAGCTGAGAATGGAACTGCAACAGATAATGTGCCTGTAACAGTTCCAGGAGCAGGACATGTAGACAATGCTGGTTCTACTCTTTCACCGGAAGAGGAGCGCTTATGGAGTATTGTAAAGGCTAATTCTTCAGAGTTCAATGCTTGGACTGCCCTGATTGAAGAGACAGAGAGGATATCTCAGGACAATATAGCAAAGATCCGGAAGGTGTATGATGCTTTCCTAGCTGAATTCCCTCTGTGTTATGGCTATTGGAAAAAATATGCGGATCATGAGGCTCGGGTGGGGGCAATGGACAAAGTCGTGGAGGTTTATGAAAGAGCAGTGCAGGGGGTGACGTATTCTGTGGACATATGGCTACATTATTGCGTTTTTGCCATCAATACATATGGAGATCCAGACACGATCAGAAGCCTTTTTGAACGAGCTGTGGTTTACGTTGGAACTGATTTTCTGTCCTCTCCATTGTGGGACAAATACATCGAGTATGAGCACATGCAGCAGGACTGGAGCCGCCTTGCCATGATCTACACCAGAATATTGGAGAATCCTATTCAAAACCTTGATAGATACTTCAGCAACTTTAAGGAGCTAGCTGAAACACGTCCTCTGTCCGAACTTAGGAGTGCTGAGGAATCTGCAACAGTTACTGTTGCTAGTGATGCTTCTGAAACTGCACCATCTGAGTCTGATGGAAAGGCAGATGAAGGAAAATCTCAAGCTGATGGTACCTCTGAACCATCTAAGTTGGAAACTGCTGGTTCAACTGATCCTGAGGAACTGAAGAAATACATTGGCATCAGAGAAGCCTTGTATATCAAAGCCAAAGAGTTTGAATCTAAAATCATTGGTTTTGAAATGGCTATAAGAAGGCCTTATTTCCATGTGCGGCCTCTCAATGTAGCAGAGCTGGAGAATTGGCATAGTTATCTGGACTTCATAGAGAGCGATGGAGACTTCAATAAGGTGGTCAAGCTGTATGAAAGATGTCTAGTAGCGTGCGCAAACTACCCTGAATACTGGATTCGTTATGTATTAAGCATGGGATCAAGTGGAAGTATGGACCTTGCAGACAACGCCCTTACTCGAGCAACTCAAGTCTTTGTCAAGAGACAACCAGAAATCCACCTTTTTGCTGCTCGCTTGAAAGAGCAGAATGGGGATATAGCTGGTGCTAGAGCTGCATTCCAATTACTGCACTCTGAAATTTCTCCCGGGCTTCTTGAAGCAGTAATTAAACATGCCAACATGGAACAACGACTAGGAAATGTGGATGATGCTTTCTCTGTGTATGAGCAAGTGATTGCTGTTGAAAAAGGCAAAGAGAACTCCATATTACTGCCGCTGCTGTATGCGCAGTATTCAAGGTTTTCCTACTTGGTTTTACGTGACGCTGAGAAGGCTAGGAAGATTATAGTTGAAGCACTTGATCACGTGCAGCCGTCAAAGCATTTCATGGAAGCACTGATCTTTTTCGAGACCATTCTGCCACCACCAAGGAAGATTGAATACCTCGACCCACTCGTTGAGAATTTGATAAAGCCAAATGTAGTCACCCAGAACACTGCAAGTTCCACAGAGAGGGAAGAGCTTTCTTTGATATATATAGAGTTCCTGGGTCTTTTCGGAGATGTTGAGTCCATTAAAAAGGCGGAAGATCGACATTGTAAGCTCTTTTTACCTCACCGGAGCAGGTCAGAATTGAAAAAGCGTAGCGCGGATGAGTTTCTCTCTTCAGATAGGACGAAACTGGCCAAAACTTACAATGAAACTGCGCCTGCTCAGCCAGTGTCTAATGCATATCCAAATGCACCGGCTCAATGGTCGGGTGGTTATGCTGCACAGCCTCAAGCTTGGCCACAACCACAAGCGGCTCCTGCACAACCACAGCAGTGGAACCCTGCTTATGGCCAGCAGCAGGCTGCGTATGGTGCATATGGTGGCTATCCCGCTGGCTATACTGCTCCACAAGCACCAACACCCGTGCCACAAGCCGCTGCTTATGGGGCATATCCTCCTCAGGCATACCCAGCTGCAGCTACAGCACCAGTGGCTGCCCCGGTCCAGCAACCCGCTGCTCCTCCTCCTCAAGCTTACTACAACACTTACTACTGA
Protein Sequence
- >BnaC08G0008000ZS
MGESQAMVAEGYNASAATVESNVDSSQSVTNVSLVNGTSGPEGGSTAPAENGTATDNVPVTVPGAGHVDNAGSTLSPEEERLWSIVKANSSEFNAWTALIEETERISQDNIAKIRKVYDAFLAEFPLCYGYWKKYADHEARVGAMDKVVEVYERAVQGVTYSVDIWLHYCVFAINTYGDPDTIRSLFERAVVYVGTDFLSSPLWDKYIEYEHMQQDWSRLAMIYTRILENPIQNLDRYFSNFKELAETRPLSELRSAEESATVTVASDASETAPSESDGKADEGKSQADGTSEPSKLETAGSTDPEELKKYIGIREALYIKAKEFESKIIGFEMAIRRPYFHVRPLNVAELENWHSYLDFIESDGDFNKVVKLYERCLVACANYPEYWIRYVLSMGSSGSMDLADNALTRATQVFVKRQPEIHLFAARLKEQNGDIAGARAAFQLLHSEISPGLLEAVIKHANMEQRLGNVDDAFSVYEQVIAVEKGKENSILLPLLYAQYSRFSYLVLRDAEKARKIIVEALDHVQPSKHFMEALIFFETILPPPRKIEYLDPLVENLIKPNVVTQNTASSTEREELSLIYIEFLGLFGDVESIKKAEDRHCKLFLPHRSRSELKKRSADEFLSSDRTKLAKTYNETAPAQPVSNAYPNAPAQWSGGYAAQPQAWPQPQAAPAQPQQWNPAYGQQQAAYGAYGGYPAGYTAPQAPTPVPQAAAYGAYPPQAYPAAATAPVAAPVQQPAAPPPQAYYNTYY