NSG;NSG1

LOC_Os04g36650 ; Os04g0444100 ; Oryza sativa

osa-miR171c

Os04g0623901 ; Oryza sativa

osa-miR5506

Oryza sativa

OsAO3

LOC_Os07g18120 ; Os07g0281700 ; Oryza sativa

OsASHL1

LOC_Os12g04930 ; Os12g0143200 ; Oryza sativa

OsASHL2

LOC_Os11g04930 ; Os11g0146500 ; Oryza sativa

OsBBX14

LOC_Os05g11510 ; Os05g0204600 ; Oryza sativa

OsBOR4

LOC_Os05g08430 ; Os05g0176800 ; Oryza sativa

OsCCA1;Nhd1

LOC_Os08g06110 ; Os08g0157600 ; Oryza sativa

OsCOL15

LOC_Os08g42440 ; Os08g0536300 ; Oryza sativa

OsCOL16

LOC_Os06g15330 ; Os06g0264200 ; Oryza sativa

OsEMF2b

LOC_Os09g13630 ; Os09g0306800 ; Oryza sativa

OsEPF1

LOC_Os04g54490 ; Os04g0637300 ; Oryza sativa

OsFBK1

LOC_Os01g47050 ; Os01g0659900 ; Oryza sativa

OsFD4

LOC_Os08g43600 ; Os08g0549600 ; Oryza sativa

OsFDML1

LOC_Os02g19130 ; Os02g0293300 ; Oryza sativa

OsFIE1;Epi-df

LOC_Os08g04290 ; Os08g0137250 ; Oryza sativa

OsFLZ2

LOC_Os01g41010 ; Os01g0593200 ; Oryza sativa

OsFOR1;PGIP

LOC_Os07g38130 ; Os07g0568700 ; Oryza sativa

OsGSK1

LOC_Os01g10840 ; Os01g0205700 ; Oryza sativa

OsHAP3E;LEC1

LOC_Os02g49370 ; Os02g0725700 ; Oryza sativa

OSHB1;LF1

LOC_Os03g01890 ; Os03g0109400 ; Oryza sativa

OsHDT1;HDT701

LOC_Os05g51830 ; Os05g0597100 ; Oryza sativa

Oshox4

LOC_Os09g29460 ; Os09g0470500 ; Oryza sativa

OsIDS1

LOC_Os03g60430 ; Os03g0818800 ; Oryza sativa

OsIG1

LOC_Os01g66590 ; Os01g0889400 ; Oryza sativa

OsJAZ11

LOC_Os03g08320 ; Os03g0180900 ; Oryza sativa

OsLF

LOC_Os05g46370 ; Os05g0541400 ; Oryza sativa

OsLG3b;OsMADS1

LOC_Os03g11614 ; Os03g0215400 ; Oryza sativa

OsLUGL

LOC_Os01g42260 ; Os01g0607400 ; Oryza sativa

OsMADS13

LOC_Os12g10540 ; Os12g0207000 ; Oryza sativa

OsMADS14

LOC_Os03g54160 ; Os03g0752800 ; Oryza sativa

OsMADS15;DEP

LOC_Os07g01820 ; Os07g0108900 ; Oryza sativa

OsMADS16;SPW1

LOC_Os06g49840 ; Os06g0712700 ; Oryza sativa

OsMADS2

LOC_Os01g66030 ; Os01g0883100 ; Oryza sativa

OsMADS22

LOC_Os02g52340 ; Os02g0761000 ; Oryza sativa

OSMADS3

LOC_Os01g10504 ; Os01g0201700 ; Oryza sativa

OsMADS34;PAP2

LOC_Os03g54170 ; Os03g0753100 ; Oryza sativa

OsMADS4

LOC_Os05g34940 ; Os05g0423400 ; Oryza sativa

OsMADS5

LOC_Os06g06750 ; Os06g0162800 ; Oryza sativa

OsMADS50;OsSOC1

LOC_Os03g03070 ; LOC_Os03g03100 ; Os03g0122600 ; Oryza sativa

OSMADS58

LOC_Os05g11414 ; Os05g0203800 ; Oryza sativa

OsMADS6;MFO1

LOC_Os02g45770 ; Os02g0682200 ; Oryza sativa

OsMADS7;OsMADS45

LOC_Os08g41950 ; Os08g0531700 ; Oryza sativa

OsMADS8;OsMADS24

LOC_Os09g32948 ; Os09g0507200 ; Oryza sativa

OsMSI1

LOC_Os03g43890 ; Os03g0640100 ; Oryza sativa

OsMYBGA;OsGAMYB

LOC_Os01g59660 ; Os01g0812000 ; Oryza sativa

OsNF-YB9

LOC_Os06g17480 ; Os06g0285200 ; Oryza sativa

OsOAT

LOC_Os03g44150 ; Os03g0643300 ; Oryza sativa

OsPID;OsPINOID

LOC_Os12g42020 ; Os12g0614600 ; Oryza sativa

OsPIPK1

LOC_Os03g49510 ; Os03g0701800 ; Oryza sativa

OsPRP3

LOC_Os10g05750 ; Os10g0148100 ; Oryza sativa

OsRacGEF1;OsRopGEF7B

LOC_Os01g62990 ; Os01g0849100 ; Oryza sativa

OsRACK1A

LOC_Os01g49290 ; Os01g0686800 ; Oryza sativa

OsRAV11

LOC_Os01g49830 ; Os01g0693400 ; Oryza sativa

OsRAV12

LOC_Os05g47650 ; Os05g0549800 ; Oryza sativa

OsrbohB;Osrboh7

LOC_Os09g26660 ; Os09g0438000 ; Oryza sativa

OsRBR2

LOC_Os11g32900 ; Os11g0533500 ; Oryza sativa

OsYABBY1;OsYAB1

LOC_Os07g06620 ; Os07g0160100 ; Oryza sativa

OsYSL16

LOC_Os04g45900 ; Os04g0542800 ; Oryza sativa

OsZHD1

LOC_Os09g29130 ; Os09g0466400 ; Oryza sativa

OsZHD2

LOC_Os08g37400 ; Os08g0479400 ; Oryza sativa

P1

pericarp color1 ; Zm00001eb014260 ; Zea mays

P450 CYP78A5

P450 CYP78A5 ; Vitvi15g04324 ; Vitis vinifera

PHYA;OsPhyA

LOC_Os03g51030 ; Os03g0719800 ; Oryza sativa

PHYB;OsphyB

LOC_Os03g19590 ; Os03g0309200 ; Oryza sativa

PhyB1;pge(phyB1)

phytochromeB1 ; Zm00001eb014850 ; Zea mays

PhyB2;pge(phyB2)

phytochromeB2 ; Zm00001eb396030 ; Zea mays

pyp1

PALE YELLOW PETAL 1 ; Solyc01g098110 ; Solanum lycopersicum

Q

Q ; TraesCS5B02G486900 ; Triticum aestivum

RA3

RAMOSA3 ; Zm00001eb327910 ; Zea mays

Rap2.7

rap2.7 orthologue ; Zm00001eb355240 ; Zea mays