AOX1a;OsAOX1a

LOC_Os04g51150 ; Os04g0600200 ; Oryza sativa

AP59;OsBIERF3

LOC_Os02g43790 ; Os02g0654700 ; Oryza sativa

APG;OsPIL16

LOC_Os05g04740 ; Os05g0139100 ; Oryza sativa

ASR5;OsAsr1

LOC_Os11g06720 ; Os11g0167800 ; Oryza sativa

bZIP68;ABI5

bZIP-transcription factor 68 ; Zm00001eb176680 ; Zea mays

CaM6

CALMODULIN6 ; Solyc03g098050 ; Solanum lycopersicum

CDS1;OsCNGC9

LOC_Os09g38580 ; Os09g0558300 ; Oryza sativa

CsBPC2

BASIC PENTACYSTEINE 2 ; Cucumis sativus

CsCBF1

Cs5g10240 ; Citrus sinensis

CsCOR413PM2

cold-regulated 413 plasma membrane protein 2 ; Csa_2G238250.1 ; Cucumis sativus

CsGPA1

Guanine nucleotide-binding protein alpha subunit ; Csa_4G648550 ; Cucumis sativus

CsHSFA1d

heat-shock transcription factor HSFA1d ; Csa_3G008920 ; Cucumis sativus

Ctb1

LOC_Os04g52830 ; Os04g0619300 ; Oryza sativa

CTB4a

LOC_Os04g04330 ; Os04g0132500 ; Oryza sativa

CYC-B

chromoplast-specific lycopene β-cyclase ; Solyc06g074240 ; Solanum lycopersicum

EFA27;OsClo5

LOC_Os04g43200 ; Os04g0511200 ; Oryza sativa

GmDREB3

dehydration-responsive element binding protein 3 ; Glyma.17G047300 ; Glycine max

GmERF3

EREBP/AP2 transcription factor ; Glycine max

GS2;OsGRF4

LOC_Os02g47280 ; Os02g0701300 ; Oryza sativa

Hd5;DTH8

LOC_Os08g07740 ; Os08g0174500 ; Oryza sativa

ICE1

INDUCER of CBF EXPRESSION 1 ; Solyc03g118310 ; Solanum lycopersicum

LTG5

LOC_Os05g45110 ; Os05g0527100 ; Oryza sativa

LTT1

LOC_Os10g34110 ; Os10g0482200 ; Oryza sativa

MdABI4

MD07G1224400 ; Malus domestica

MdbHLH33

Malus domestica basic helix-loop-helix 33 ; Malus domestica

MdBIM1

BES1-INTERACTING MYC-LIKE PROTEIN1 ; MDP0000143208 ; Malus domestica

MdCIbHLH1

Malus domestica Cold-induced bHLH1 ; MDP0000662999 ; Malus domestica

MdHYL1

HYPONASTIC LEAVES1 ; Malus domestica

MdICE1

MYC-type bHLH transcription factor ICE1 ; MDP0000662999 ; Malus domestica

MdJAZ1

jasmonate-ZIM domain (JAZ) protein 1 ; MDP0000452772 ; Malus domestica

MdJAZ18 ；MdJAZ2

jasmonate ZIM-domain protein 18 ; MDP0000757701 ; Malus domestica

MdMIEL1

Malus domestica MYB30-INTERACTING E3 LIGASE 1 ; Malus domestica

MdMYB23

R2R3-MYB transcription factor 23 ; MDP0000230141 ; Malus domestica

MdMYB308L

MDP0000950559 ; Malus domestica

MdNAC104

MD15G1415700 ; Malus domestica

MdPUB23

U-box-type E3 ubiquitin ligase ; MD14G1040300 ; Malus domestica

MdTCP15

MD13G1073500 ; Malus domestica

MdWRKY40is

MD15G1039500 ; Malus domestica

MhDREB2A

Malus domestica

MhZAT10

MD08G1086500 ; Malus domestica

MYBS3;OsMYBS3

LOC_Os10g41200 ; Os10g0561400 ; Oryza sativa

NOG1

LOC_Os01g54860 ; Os01g0752200 ; Oryza sativa

Osa-miR1320

Oryza sativa

OsbHLH001;OsICE2

LOC_Os01g70310 ; Os01g0928000 ; Oryza sativa

OsBIRH1;TCD33

LOC_Os03g01830 ; Os03g0108600 ; Oryza sativa

OsCAF1B

LOC_Os04g58810 ; Os04g0684900 ; Oryza sativa

OsCPK17

LOC_Os07g06740 ; Os07g0161600 ; Oryza sativa

OsCPK24;OsCDPK14

LOC_Os11g07040 ; Os11g0171500 ; Oryza sativa

OsCRP1

LOC_Os09g39180 ; Os09g0565200 ; Oryza sativa

OsCTZFP8

LOC_Os08g20580 ; Os08g0300366 ; Oryza sativa

OsCYP19-4

LOC_Os06g49470 ; Os06g0708400 ; Oryza sativa

OsDof1

LOC_Os01g09720 ; NONE ; Oryza sativa

OsDREB1A;OsDREBL

LOC_Os09g35030 ; Os09g0522200 ; Oryza sativa

OsERF096

LOC_Os10g41330 ; Os10g0562900 ; Oryza sativa

OsFAD2;OsFAD2-1

LOC_Os02g48560 ; Os02g0716500 ; Oryza sativa

OsGATA16

LOC_Os06g37450 ; Os06g0571800 ; Oryza sativa

OsGH3-2;OsGH3.2

LOC_Os01g55940 ; Os01g0764800 ; Oryza sativa

OsGSTZ2

LOC_Os12g10730 ; Os12g0210300 ; Oryza sativa

OsHGGT;HGGT

LOC_Os06g44840 ; Os06g0658900 ; Oryza sativa

OsICE1;OsbHLH002

LOC_Os11g32100 ; Os11g0523700 ; Oryza sativa

OsIMP

LOC_Os03g39000 ; Os03g0587000 ; Oryza sativa

OsLEA9

LOC_Os01g21250 ; Os01g0314800 ; Oryza sativa

OsLPXC

LOC_Os03g12320 ; Os03g0223900 ; Oryza sativa

OsLti6b;ddOs32

LOC_Os05g04700 ; Os05g0138300 ; Oryza sativa

OsLTPL159

LOC_Os10g36160 ; Os10g0505500 ; Oryza sativa

OsLUX;OsPCL1

LOC_Os01g74020 ; Os01g0971800 ; Oryza sativa

OsMKKK70

LOC_Os01g50410 ; Os01g0699500 ; Oryza sativa

OsMSRMK2;OsMAP1

LOC_Os03g17700 ; Os03g0285800 ; Oryza sativa

OsMYB30;OsMYB5P

LOC_Os02g41510 ; Os02g0624300 ; Oryza sativa

OsMYB3R-2

LOC_Os01g62410 ; Os01g0841500 ; Oryza sativa

Osmyb4

LOC_Os04g43680 ; Os04g0517100 ; Oryza sativa

OsOAT

LOC_Os03g44150 ; Os03g0643300 ; Oryza sativa