Information report for ZmATM
Gene Details
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Functional Descriptions
- ZmATM is not involved in the stabilization of stalled forks, as both the ZmATM mutant lines did not display any inhibition of growth under treatment nor under control conditions.
- ZmATM is required for a proper cell cycle arrest in response to DSBs generated by zeocin.
- Maize ATM deficiency does not trigger meiotic defects, whereas the ATR kinase appears to be crucial for the maternal fertility.
- ZmATM play a key role in DNA repair and cell cycle checkpoint activation.
- ZmATR plays a predominant role in the response to DSBs, whereas ZmATM shows a minor role.
Functional Keywords
- growth , kinase , fertility , cell-cycle , dna-repair , meiotic
Literature and News
- Maize ATR safeguards genome stability during kernel development to prevent early endosperm endocycle onset and cell death. DOI: 10.1093/plcell/koab158 ; PMID: 34086963
- Exploring key developmental phases and phase-specific genes across the entirety of anther development in maize. DOI: 10.1111/jipb.13276 ; PMID: 35607822
Gene Resources
- NCBI ID: 103651852
- UniProt accessions: A0A1D6MNJ5 , A0A1D6MNJ8 , A0A1D6MNK8 , A0A1D6MNP8
- EMBL: CM007649
- InterPro: IPR016024 , IPR038980
- PANTHER: PTHR37079 , PTHR37079:SF4
- SUPFAM: SSF48371
Homologs
- Arabidopsis thaliana: AT3G48190
- Arachis hypogaea: arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.VRLT2G
- Oryza sativa: OsATM
Sequences
cDNA Sequence
- >Zm00001eb126710_T002
CAAACCCCTCGGGCCTCGTCCCCTCCGCCTCTCGCCGCGCGGCTTCCCTGATGCGCTCGCCCCCCGCCGCGGCCTCCCAGCCGAAACCCTAGCTCCGATTCCCATACCGATGGCGGCCGTGGCCACTGCGCGCGACGTGGAGGAGGTCGTCCAGAAGCTTCAGTCTGATCGGGCCAGAGTCCGCGACGAGGGGGTGAAGCTGCTGGGGACATGGCTGCAGGGTGACCGCGCTGCGTCCTTCTGCCGCCTCCTCGGCCGCAACACCGTCAGGTTCAAGCCCGGCCACGGGAACCTTACCGGAGCCACCACGTGGCCACTCCTCGTCCTGGCGCTCCTCAACTGCGTCAAGGAGGACATCTCGGGTAAGAAGCGTGGCGCCACCAAGAGCGCTGCCGCCCGGATGTTCCGCGTTGCTGTCCAGTGTGCCGAAGATGTCAAGTTATCAGGGCATTCACTACATTTGCTCTCAGTTGCTAAGCAACTTTTTGTTCATATTTGGGAGGTCATAAAAGATGGCCCTAGCCTTCAGTTAGAGTACAGCATAATCCTTAGACAGCTTCTAAATGTGAAGGAGTACCGCTATCAGATGAAACCTCGAACATATAGCAATTTTGTATCACTCTACATGAAGAAGGTTGCTAGTGCTTTTGATGCAAAATTCAGCAATCAGGCGAGCTCCAAGGATGAATCCTTCCGCTGTACATTGACACTTCATGTTCTACTTGAAAACCCACCAAGTGATTACCCTGATATTATGCGGGAGGAGGTTCTTAATGGATTTAGTGCAATCTTCTTACATATTAGGGAGGAGGGAAAGCTGACTCGCAAACTTATGGAATGCATTAACACCTTTTTACTGAAGGATGGGCCAAATCTGGGATACAAATCTGTGAAGATCCATAATGCAGTTCAAGAGTTTATATTCCGTTGTTGGATGACAACTCATGATCAGGCCTTGAAGAGTTTGTTCATAACCTACGTGAAAGTTCAGCTGAAGATTGCCAGGAATATTCCAGAGATTTTGGAAAAACTTATTGATGTCATCATTAAGGAACTAGACAAAAATGTTAACACTGGACCTGGACTTCTATGGTGTGAGGCACCAAGAGATGAGAAAGCTGTGTCCTTAAGGTGTTTCCAAGAGGAATGGATGGATCTCTCTGCTACTGTTTTTTATCTGGCCTGCAAATGCACAACAAAGACAGCAAACAGGGAGAAAAGGATGAAGAAAGAACACATTATGAACCTTATCGTTGATGGCCTTTTTAGAGGATCTTTGTTTTGGTTTGAAATCCTCTTCCGAGGAGTGGTTCTGTTTGTTTTCTGATTCACAAGTATGGATATCATCTAGAGAAATCTTTGCTAATTAGTTGGTTTGAAGCAAGTTGCAAAGCTTTGAGAAGTATCTTGATCCATGCAAATGCCATACGTTTTCAGGATTCACTACTCTGGCTTCTCAGGACATTCAAGGAGTTCTCCACAGTGCTCATGCTTGACACTAGGGATAAAGTGCAATTTTGTTTAACAAAAGGCGAGATGTCAATTGTTGAAGATTGTTGGCAAGCCATATGGAATTCCCTTGTTCACGCATTTCCGTTGTTAAGCAGCATAGATCTAGTTGCTGATTCAGCTCTGATTTTGCTGGGTGGAATGATCATGCGGGACCAAGTTCATACATCATTTCTATCAGAAGATACATGGAACCTGCAAATATTTAAAAAATTTCCATCGCCGTCTGCTCTGTATTTTGTTGCCTGTTACTTCTCGAGGATAGGCTTTCAGGGTGACTTATCCAATTCTATCTTTGTTCGGAAGACTCTGCTAAGGTCAACTTTGGAGTTAATTCATTCAAAGGAATTCTCTCTTTTGAATGAACAAAATGTTGTTATCATTCCTGAAGCTATTTTCTCGCTGTGTGCTGGCTTTTCATCACCAGTAATTAATTCATCGGATATATTGCAACTGTTTGGTCATTGTAAAATTCATTCCAAGATGTCTCTTGAGGATGATAACTGGGTTCTTAAAGATGAACTACCCTACTCTGTGGAAGCTTTGTCAGAAATCACTCTGGATACTTGTACCAAGGTTATGTCTCATAAATGCCACCTTATACATCTTCCGGGGACTATCCAGCAACCAATGCTCCTAGAGCTCATGGAATTCATGAAAGGATTTGTGGCTTCAAATGAGCAGTTTGAGAAAGTGGACTTGAATAATCTTGTTCTTGTTTGTTCTCTTCTCTGCAATCTGATTCATTGTGCATTGTTGTCAAGGACCATGGAAGAAAAATCTTCACTTTTGCAAGAAACAGTAGATTATGTCACCAATATTTTAAAACATATTGTGTCATTTGTTGTGAAGAAGAATGATGAACTTTCTCATGGTCTTACTAACATAAGTTCAGCATTGGATACAATGGGCTCTGCTTTCTCCTCAATCAAGAGCTTACTGTCTTCTCCAATATTTAATCTGTCAAGAGTTGATAATGGAGTTTGTTCTGTTGTTATCAAAAGCATTACTGAATTACTTGATGAACTCTTGGTGGCAATTTCTCAGCTGTTTTGTCAGATCTCTAGTTTAGTGAGCAATTTTGATGCAGAGAGTACTGGTAAAATGCTACCAACATCTAGTATCAATTTAGAGGACCTAAATCCTGTTTTGGACTGTAAAAGTAGTGTTGCTGATATGGATCTTGATGTGATGGACTCTAGTGAAGTAGATTCTGTCACAGCTAGTGCGAGTGGAAGTATGGGTAGCTTCTTACGACCTTTGGAATGGAAGCTAGATCTAGTTTGCATTATTTCAACTTTTTTCTCAGTTTCATCACTTCATACATGGGAAATTTTGTACAGCTTGGTGGATAAAGAAGGTGACGTGAAGGTTCGCCAGGCCATCTTGCTTAACCTTTGCAGAAACATCTCCGCGTCATCTAAAACTGTATCTTTAGTGGTCCATTTTATAGTTGATATGAGGGACAGAGGTGCAAGTTCATTACTTGGACCTGCAGAGTGCTTAACTCACATACATGCTTTATTAAAAGCGTTGATAGCTATCCATGGTGGACAGAATGCTGATGGAAAGCAACCAGGACGCGAAGTATTTTTCAGTGAGAACCAGGATATCTTATTTGACTTGTTAAATAGGGCTACAGACATAAGTTCTGTAGATTGGTTTTCTCGCATCAAGTTCATTGATTGTGTCTCCTCCTTTGTTTGCCTGTTCCCTGATGTTGCCCAGGATTTGATCGGATGTTTGCTTGACATGCTGCATGATGCTGATTACCGTGTCAGGTTGTATTTGGCTAGGCAAATCGTCGTGTTATTCCAAACATGGGAAGGGCACAATGAATTATTTAATGATGTTTGCTCAAGCATTGGTGCCAAGATGGTGAAGTTCTCAAATATTTCTCCAGTTACAGCTAGAGAAGTCTTAGCTGTTGGTCCACAATCTGTTCTCGTAATTGAAACTGCTCTCATTACACTAGCTCATTTGGCTGTGCATAGCGAGGATGTTGAAGTTGAGTGTTTGTTCATGATTTCTGCTGCGGCTGCTATAGAGCCTTCTCAGCGAGAATTAGCTTTTGCGTTATTTGATTCCATTTCAAGGAGGCTTGGTTATGCTTCAAGAAGCAAGTATCTGGACCAAGTGATGGGCCCGATTCTTTTTCGATGGGTTGCTTGTGAGATGAATCTAATTTCACTTGTTGAGGTGCAAGAAATGTTTGGTTATGGATCTGCTGAGCCAAACAACTTTGTTGAACATTGTAGTTCATGGCTTCTCCCTTTCCTCATTCTCAGGGGTGATGGTGCTGATATGAATTGGATATCGAAGATTTTATCTCAACCTTTGTCAATCATTATCAAGAGATACTTCGTTCCAATCTTTGGAATGTGCATTGCTGTCAGATGTGGCACAGGGCCAGAGAAGGACTTAGCTGAAACTGTCTTATGTGAATCAGTTTTGCAGCTTGGTGAAATTTCTGAACTTGAGCGTGATGATCTCATTAAAAAACACATGGTTGCGATCGTTGCCTTTTTGCTCTCTGTTTCTTCATCTGCTCATGGGCCACAAATTCCATATTTTTCCAAGAAGAATGTTGCACTTTCAGTCAGAATGGTTGTTGATGGATTTGTGGACACAATGGATGATAACTTGGCTGATACAGTTGTTAGTGATAAAGTTAATATATTTCGTGCTGACAGAGTTTTTAAGTTCCTGTTGTCGATACATCAGCAAGTTGCAGATGCCAGCCATTCCAGGCACATGGGTCATCGTCTTTGTGCAATTGAGGTTTTAATAGATGTACTTGGGCACAGAGTGGTTCTTGAGAGCACTTGCTTCTATATTATTTCTATAGTGGGGAACTATATTCAGCAAAAACCACTGCAAGGCCAGTGCTGTAATATTTTGTCTAAATTGTTGGCTGCTTTTGATGGAAACACCTCTGCTGAAACCCTGCAAGTGCTTGGCAGACAGCTTCAGGTAGTAGTTCCAAAATTAATTTTTTCCTGCCTAATTAATGAGAAAGAAGAAAGAAGTGGTACTGAAGATTCATCAAGAGTTCTTTCTTTACTCCATCAATTGACAGTGGAGATTGATCCTCTGCTTTATGATTACATAAGAGAGTTAGAACCACTTCCTGATCTTGATTGCTTGAAAGATGTACAGGAGTTTCATGCTTCACTTTCTGCCTCACATTCTTCAAGGAATCAGTTCTTAAAGTTTGTTAATAAGGCTCCTTATTTACCACCAGAACTATTTTTGTTGAGTCTTCGTGCGTATCACAAAAAGTTATTTTTGGGAGAAATCATTCGTAGAAGTGACCTATCTGCGGCTGATACAAACATGGTTAGCTGCTGGCATAGTGACCCAGATGTCATTTCTGCTGTATGGGCTCTTGTTGACATTTGTAGCTCATCATCTGTAGCAAATGAAGCTTCTTGGGTGCTTGCTGATTTTATCTCTAGGGCTGGTATATCTGATGCACATCAAGTAATATT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