Information report for SlCel2
Gene Details
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Functional Descriptions
- Expansin SlExp1 and endoglucanase SlCel2 synergistically promote fruit softening and cell wall disassembly in tomato.
- Single knockouts of either SlExp1 or SlCel2 did not substantially change fruit firmness, while simultaneous overexpression of SlExp1 and SlCel2 promoted early fruit softening.
- SlExp1 and SlCel2 synergistically regulate cell wall disassembly and fruit softening in tomato.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 543996
- UniProt accessions: Q42872
- EMBL: U13055
- EnsemblPlants: Solyc09g010210.3.1
- Gramene: Solyc09g010210.3.1
- KEGG: sly:543996
- GO: GO:0008810 , GO:0030245
- OMA: AFSDHNC
- InterPro: IPR001701 , IPR008928 , IPR012341 , IPR018221 , IPR033126
- PANTHER: PTHR22298
- SUPFAM: SSF48208
- PROSITE: PS00592 , PS00698
- Gene3D: 1.50.10.10
- OrthoDB: Q42872
- Pfam: PF00759
- SMR: Q42872
- STRING: 4081.Q42872
- HOGENOM: CLU_008926_1_2_1
Sequences
cDNA Sequence
- >Solyc09g010210.3.1
AGTCTTATAATTCTCTTTTTACTCCTAACTTGTGTGAGCTCTATTTTTTTTTCCCTCAGTTCACAACCAAATAATGGCGCCAAAATATACCTCCATCATTTTCCTCTTCCTTCTCTTCAACTCCTTTTCATGTTCATTCGGAGGGGGTCATGATTATCATGACGCCCTCCGAAAAAGCATCCTGTTCTACGAAGGACAACGATCCGGAAAATTACCGCCGGATCAACGTATCAAATGGCGTAGAGACTCCGCATTACACGACGGTGCTTCCGCCGGAGTTGATTTGACAGGAGGCTATTACGATGCCGGAGATAATGTGAAATTTGTTTTTCCGATGGCGTTTACGACGACATTGTTATCGTGGAGTATAATTGATTTTAAAAGGAATATAGGGAATGAATTGGGTAATGCAGTGAAGGCGGTGAAATGGGGAACTGATTTTCTGTTGAAAGCTACGGCGAGAGATGGAGTGATATATGTACAAGTTGGTGATGCGTTTTCAGATCACAGTTGTTGGGAGAGACCAGAAGATATGGATACATTAAGAACTGTTTATAAAATTGATGCGAATAATCCCGGTTCCGATGTCGCCGGTGAAATCGCTGCTGCATTAGCTGCTGCATCCATTGTTTTCCGTTCACTGGATTCTTCCTACTCAAATCTACTGCTTGATCGCGCTGTTAAAGTTTTCGATTTTGCCAATAGACATAGAGGTGCATACAGCTCCAGCCTACACTCTGCTGTTTGCCCTTTCTATTGTGACTTTAATGGTTATCAGGATGAATTGCTTTGGGGTGCAGCATGGTTACATAAAGCAACAAGAAGAAGGCAATATAGAGAGTACATAGTGAAAAATGAAGTAATTTTAAGAGCAGGAGATACAATTAATGAATTTGGTTGGGACAACAAACATGCTGGTATTAATGTCCTTATTTCCAAGGAAGTGTTAATGGGAAAAGCACCAGATCTAAAATCATTTCAAGTAAATGCAGATGCATTCATTTGTTCAATATTACCTGGAATTTCTCATCCCCAAGTCCAATATTCTCCAGGTGGACTCATTGTCAAACCTGGGGTTTGTAACATGCAGCATGTGACATCTTTGTCCTTCTTACTCTTAACTTATTCTAATTATCTTAGTCATGCCAATCATGTTGTGCCATGTGGTTCCATGACAGCCACCCCTGCCCTCCTCAAACACATTGCCAAACGTCAGGTGGATTATATTCTGGGAGATAATCCTCAAAGAATGTCATATATGGTAGGGTATGGTCCACATTACCCACAAAGGATTCACCATAGGGGTAGCTCTGTGCCATCTGTGGCCACACATTCAGCACGTATTGGTTGCAAAGAGGGATCTCGATACTTTTTTTCACCAAACCCAAACCCAAATCGATTAATTGGTGCTGTTGTTGGAGGGCCAAATTTAACAGACTCGTTCCCAGACGCCAGACCCTATTTTCAAGAATCTGAGCCCACAACATATGTTAATGCACCATTAGTGGGCCTATTGGCTTACTTTGCAGCCCATTCTAATTGATATAAACATGTGTAAAGAGAGAATGTAGTGGTGTGCAAAGGCCACCCTCTCTATTATTGTGTTGTTGTTGTCTAATAGGACTAATGTTGTTGTTTTTTAATCCCACTATATATATATATATTATATTAATACAAAAAAAGAATATCTTATCCCATCTTTTGTCTAAGAAAAAGAAAGATATCTAATGAACAAGGGATTTGTACTTTTGAAATTGTAGTGGAAGTTGTTTTTATCTTATTATACATGAAAATTGTTTTGAATA
CDS Sequence
- >Solyc09g010210.3.1
ATGGCGCCAAAATATACCTCCATCATTTTCCTCTTCCTTCTCTTCAACTCCTTTTCATGTTCATTCGGAGGGGGTCATGATTATCATGACGCCCTCCGAAAAAGCATCCTGTTCTACGAAGGACAACGATCCGGAAAATTACCGCCGGATCAACGTATCAAATGGCGTAGAGACTCCGCATTACACGACGGTGCTTCCGCCGGAGTTGATTTGACAGGAGGCTATTACGATGCCGGAGATAATGTGAAATTTGTTTTTCCGATGGCGTTTACGACGACATTGTTATCGTGGAGTATAATTGATTTTAAAAGGAATATAGGGAATGAATTGGGTAATGCAGTGAAGGCGGTGAAATGGGGAACTGATTTTCTGTTGAAAGCTACGGCGAGAGATGGAGTGATATATGTACAAGTTGGTGATGCGTTTTCAGATCACAGTTGTTGGGAGAGACCAGAAGATATGGATACATTAAGAACTGTTTATAAAATTGATGCGAATAATCCCGGTTCCGATGTCGCCGGTGAAATCGCTGCTGCATTAGCTGCTGCATCCATTGTTTTCCGTTCACTGGATTCTTCCTACTCAAATCTACTGCTTGATCGCGCTGTTAAAGTTTTCGATTTTGCCAATAGACATAGAGGTGCATACAGCTCCAGCCTACACTCTGCTGTTTGCCCTTTCTATTGTGACTTTAATGGTTATCAGGATGAATTGCTTTGGGGTGCAGCATGGTTACATAAAGCAACAAGAAGAAGGCAATATAGAGAGTACATAGTGAAAAATGAAGTAATTTTAAGAGCAGGAGATACAATTAATGAATTTGGTTGGGACAACAAACATGCTGGTATTAATGTCCTTATTTCCAAGGAAGTGTTAATGGGAAAAGCACCAGATCTAAAATCATTTCAAGTAAATGCAGATGCATTCATTTGTTCAATATTACCTGGAATTTCTCATCCCCAAGTCCAATATTCTCCAGGTGGACTCATTGTCAAACCTGGGGTTTGTAACATGCAGCATGTGACATCTTTGTCCTTCTTACTCTTAACTTATTCTAATTATCTTAGTCATGCCAATCATGTTGTGCCATGTGGTTCCATGACAGCCACCCCTGCCCTCCTCAAACACATTGCCAAACGTCAGGTGGATTATATTCTGGGAGATAATCCTCAAAGAATGTCATATATGGTAGGGTATGGTCCACATTACCCACAAAGGATTCACCATAGGGGTAGCTCTGTGCCATCTGTGGCCACACATTCAGCACGTATTGGTTGCAAAGAGGGATCTCGATACTTTTTTTCACCAAACCCAAACCCAAATCGATTAATTGGTGCTGTTGTTGGAGGGCCAAATTTAACAGACTCGTTCCCAGACGCCAGACCCTATTTTCAAGAATCTGAGCCCACAACATATGTTAATGCACCATTAGTGGGCCTATTGGCTTACTTTGCAGCCCATTCTAATTGA
Protein Sequence
- >Solyc09g010210.3.1
MAPKYTSIIFLFLLFNSFSCSFGGGHDYHDALRKSILFYEGQRSGKLPPDQRIKWRRDSALHDGASAGVDLTGGYYDAGDNVKFVFPMAFTTTLLSWSIIDFKRNIGNELGNAVKAVKWGTDFLLKATARDGVIYVQVGDAFSDHSCWERPEDMDTLRTVYKIDANNPGSDVAGEIAAALAAASIVFRSLDSSYSNLLLDRAVKVFDFANRHRGAYSSSLHSAVCPFYCDFNGYQDELLWGAAWLHKATRRRQYREYIVKNEVILRAGDTINEFGWDNKHAGINVLISKEVLMGKAPDLKSFQVNADAFICSILPGISHPQVQYSPGGLIVKPGVCNMQHVTSLSFLLLTYSNYLSHANHVVPCGSMTATPALLKHIAKRQVDYILGDNPQRMSYMVGYGPHYPQRIHHRGSSVPSVATHSARIGCKEGSRYFFSPNPNPNRLIGAVVGGPNLTDSFPDARPYFQESEPTTYVNAPLVGLLAYFAAHSN*