Information report for LeCCD1A
Gene Details
|
|
Functional Descriptions
- The tomato carotenoid cleavage dioxygenase 1 genes contribute to the formation of the flavor volatiles β-ionone, pseudoionone, and geranylacetone.
- The tomato genome contains two closely related genes potentially encoding carotenoid cleavage dioxygenases, LeCCD1A and LeCCD1B.
- This over-expression of the antisense transcript led to 87–93% reductions in mRNA levels of both LeCCD1A and LeCCD1B in the leaves and fruits of selected lines.
- Demonstrated that LeCCD1A and LeCCD1B cleave multiple linear and cyclic carotenoids resulting in the formation of a C14 dialdehyde and a variety of C13 products, depending on the substrate.
Functional Keywords
Literature and News
Gene Resources
- NCBI ID: 543935
- UniProt accessions: Q6E4P5
- EMBL: AY576001
- EnsemblPlants: Solyc01g087250.3.1
- Gramene: Solyc01g087250.3.1
- KEGG: sly:543935
- GO: GO:0009570 , GO:0010436 , GO:0016121 , GO:0046872
- OMA: TVGWYNG
- InterPro: IPR004294
- PANTHER: PTHR10543 , PTHR10543:SF89
- OrthoDB: Q6E4P5
- Pfam: PF03055
- SMR: Q6E4P5
- STRING: 4081.Q6E4P5
- HOGENOM: CLU_016472_0_0_1
Sequences
cDNA Sequence
- >Solyc01g087250.3.1
TGTAGCGTTTTTTGTTAAAATTAAGCCCGCTAATGGAGAAGATGCCCCGCGAATACAAACAAACAAACAAGAGTACCGTGTCCATGGCATCTCCGTCAATGGTGAATGGTGGAATCTCCAATGTTCAATCAATTTAGTATATTCAAAGCGAGAGAGAAAAAGTTGGTTATCAAAAAAAAATGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAACCCAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTCAAATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACCGATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAATGGTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGGTTTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTCTCACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTTATGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTCAGAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTAGTATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAAGTTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACGCATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGATATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAGGACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAAAATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAGAATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGATATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCACAATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAACCCAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAGCTATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAGTCTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTGTATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCATGCTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTTGATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACAGAACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAGTCAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAATTACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAAGAACAAGCCAAACTGTGAGAGCAATAGCTACTGGCTATTTGGTTATTTAGTTACGCATAGCTTGAAACGTAATAAATGTCCTGTGGATTGTATAGTTTGTAACTTTCAGCATCTTCTTTCAGTTATATCAGAAACAAAATTAAATCTGTGAACCTTTGCTTTGTCAGGGAAAATGTATTGAGAGAGCAAACATGCAATGTATATCATATGTTCTTGCTCACTTGATATGTAATACAATCCCAGAAATATACATAAATTTTCTTTGTTAGGATGGCT
CDS Sequence
- >Solyc01g087250.3.1
ATGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAACCCAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTCAAATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACCGATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAATGGTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGGTTTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTCTCACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTTATGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTCAGAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTAGTATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAAGTTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACGCATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGATATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAGGACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAAAATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAGAATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGATATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCACAATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAACCCAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAGCTATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAGTCTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTGTATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCATGCTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTTGATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACAGAACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAGTCAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAATTACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAAGAACAAGCCAAACTGTGA
Protein Sequence
- >Solyc01g087250.3.1
MGRKEDDGVERIEGGVVVVNPKPRRGITAKAIDLLEWGIVKLMHDSSKPLHYLQGNFAPTDETPPLNDLVVQGHLPECLNGEFVRVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYVSRYVRTSRLKQEEFFGGAKFMKVGDLKGLFGLFTVYMQMLRTKLKVLDISYGNSTANTALVYHHGKLLALSEADKPYALKVLEDGDLQTLGMLDYDKRLTHSFTAHPKVDAVTGEMFTFGYAHTPPYITYRVISKDGIMQDPVPITIPEPIMMHDFAITENYAIMMDLPLCFRPKEMVKKNKLAFTFDATKKARFGVLPRYANNEALIRWFELPNCFIFHNANAWEEGDEVVLITCRLVNPDLDMVNGAVKEKLENFCNELYEMRFNMKSGAASQKKLSESAVDFPRINENYTGRKQRYVYGTTLNSIAKVTGVIKFDLHAEPETGKSQLEVGGNVQGIFDLGPGRFGSEAVFVPSRPGTEREEDDGYLIFFVHDENTGKSAVNVIDAKTMSAEPVAVVELPKRVPYGFHAFFVTEEQIQEQAKL*