Gene Details:

Functional Descriptions:

  • The tomato carotenoid cleavage dioxygenase 1 genes contribute to the formation of the flavor volatiles β-ionone, pseudoionone, and geranylacetone.
  • The tomato genome contains two closely related genes potentially encoding carotenoid cleavage dioxygenases, LeCCD1A and LeCCD1B.
  • This over-expression of the antisense transcript led to 87–93% reductions in mRNA levels of both LeCCD1A and LeCCD1B in the leaves and fruits of selected lines.
  • Demonstrated that LeCCD1A and LeCCD1B cleave multiple linear and cyclic carotenoids resulting in the formation of a C14 dialdehyde and a variety of C13 products, depending on the substrate.

Literature:

Gene Resources:

Orthologs:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >Solyc01g087250.3.1
    TGTAGCGTTTTTTGTTAAAATTAAGCCCGCTAATGGAGAAGATGCCCCGCGAATACAAACAAACAAACAAGAGTACCGTGTCCATGGCATCTCCGTCAATGGTGAATGGTGGAATCTCCAATGTTCAATCAATTTAGTATATTCAAAGCGAGAGAGAAAAAGTTGGTTATCAAAAAAAAATGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAACCCAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTCAAATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACCGATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAATGGTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGGTTTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTCTCACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTTATGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTCAGAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTAGTATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAAGTTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACGCATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGATATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAGGACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAAAATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAGAATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGATATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCACAATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAACCCAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAGCTATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAGTCTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTGTATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCATGCTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTTGATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACAGAACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAGTCAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAATTACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAAGAACAAGCCAAACTGTGAGAGCAATAGCTACTGGCTATTTGGTTATTTAGTTACGCATAGCTTGAAACGTAATAAATGTCCTGTGGATTGTATAGTTTGTAACTTTCAGCATCTTCTTTCAGTTATATCAGAAACAAAATTAAATCTGTGAACCTTTGCTTTGTCAGGGAAAATGTATTGAGAGAGCAAACATGCAATGTATATCATATGTTCTTGCTCACTTGATATGTAATACAATCCCAGAAATATACATAAATTTTCTTTGTTAGGATGGCT
CDS Sequence
  • >Solyc01g087250.3.1
    ATGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAACCCAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTCAAATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACCGATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAATGGTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGGTTTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTCTCACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTTATGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTCAGAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTAGTATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAAGTTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACGCATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGATATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAGGACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAAAATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAGAATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGATATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCACAATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAACCCAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAGCTATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAGTCTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTGTATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCATGCTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTTGATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACAGAACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAGTCAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAATTACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAAGAACAAGCCAAACTGTGA
Protein Sequence
  • >Solyc01g087250.3.1
    MGRKEDDGVERIEGGVVVVNPKPRRGITAKAIDLLEWGIVKLMHDSSKPLHYLQGNFAPTDETPPLNDLVVQGHLPECLNGEFVRVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYVSRYVRTSRLKQEEFFGGAKFMKVGDLKGLFGLFTVYMQMLRTKLKVLDISYGNSTANTALVYHHGKLLALSEADKPYALKVLEDGDLQTLGMLDYDKRLTHSFTAHPKVDAVTGEMFTFGYAHTPPYITYRVISKDGIMQDPVPITIPEPIMMHDFAITENYAIMMDLPLCFRPKEMVKKNKLAFTFDATKKARFGVLPRYANNEALIRWFELPNCFIFHNANAWEEGDEVVLITCRLVNPDLDMVNGAVKEKLENFCNELYEMRFNMKSGAASQKKLSESAVDFPRINENYTGRKQRYVYGTTLNSIAKVTGVIKFDLHAEPETGKSQLEVGGNVQGIFDLGPGRFGSEAVFVPSRPGTEREEDDGYLIFFVHDENTGKSAVNVIDAKTMSAEPVAVVELPKRVPYGFHAFFVTEEQIQEQAKL*