Information report for VAT
Gene Details
Domain Class Descriptions
- Contains a central nucleotide-binding (NB) subdomain as part of a larger entity called the NB-ARC domain. C-terminal to the NB-ARC domain lies a leucine-rich repeat (LRR) domain, which is sometimes followed by an extension of variable length. Hence, this group of R proteins is collectively referred to as NB-LRR proteins. If N-terminal region contain a predicted coiled-coil structures (CC), non-TIR NB-LRR proteins are collectively referred to as CC-NB-LRR or CNL.
Domain Features
- Domain Class: CNL
- Domain types: CC NBS LRR TM
Gene Resources
Homologs
- Arachis hypogaea: arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.LSW4XK
- Citrullus lanatus: Cla97C02G042010, Cla97C02G042050
- Cucumis sativus: Csa_2G403680, Csa_2G014830, Csa_2G096930
- Medicago truncatula: Medtr1g037130, Medtr2g072110
- Vitis vinifera: VIT_214s0036g00100
Sequences
DNA Sequence
- >VAT
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CTTCCCTGTAGCCAAAGAAATATACATTGTAACAATGGTTTGATGAAATGATAATGAAGTGGTATGGTGTGTTTCAATTGCAAAA
Protein Sequence
- >VAT
MDILISVTAKIAEYTVEPVGRQLGYVFFIRSNFQKLKTQVEKLKITRESVQHKIHSARRNAEDIKPAVEEWLKKVDDFVRESDEILANEGGHGGLCSTYLVQRHKLSRKASKMVDEVLEMKNEGESFDMVSYKSVIPSVDCSLPKVPDFLDFESRKSIMEQIMDALSDGNVHRIGVYGMGGVGKTMLVKDILRKIVESKKPFDEVVTSTISQTPDFRSIQGQLADKLGLKFEQETIEGRATILRKRLKMERSILVVLDDVWEYIDLETIGIPSVEDHTGCKILFTTRIKHLISNQMCANKIFEIKVLGKDESWNLFKAMAGDIVDASDLKPIAIRIVRECAGLPIAITTVAKALRNKPSDIWNDALDQLKTVDVGMANIGEMEKKVYLSLKLSYDCLGYEEVKLLFLLCSMFPEDFSIDVEGLHVYAMGMGFLHGVDTVVKGRRRIKKLVDDLISSSLLQQYSEYGCNYVKMHDMVRDVALLIASKNEHVRTLSYVKRSNEEWEEEKLLGNHTAVFIDGLHYPLPKLTLPKVQLLRLVAKYCWEHNKRVSVVETFFEEMKELKGLVVENVNISLMQRPSDVYSLANIRVLRLERCQLLGSIDWIGELKKLEILDFSESNITQIPTTMSQLTQLKVLNLSSCEQLEVIPPNILSKLTKLEELDLETFDGWEGEEWYEGRKNASLSELKCLRHLYALNLTIQDEEIMPENLFLVGKLKLQKFNICIGCESKLKYTFAYKNRIKNFIGIKMESGRCLDDWIKNLLKRSDNVLLEGSVCSKVLHSELVGANNFVSLPNLEKLEIVNAKSLKMIWSNNVPILNSFSKLEEIKIYSCNNLQKVLFPPNMMDILTCLKVLEIKNCDLLEGIFEAQEPISVVESNNLPILNSFSKLEEIRIWSCNNLQKVLFPSNMMGILPCLKVLDIRGCELLEGIFEVQEPISVVESNSVPILNSFSKLEKIRIWSCNNLQKILFPSNMMGILTCLKVLEIRDCELLEGIFEVQEPISVVESNNLPILNSFSKLEEIRIGSCNNLQKVLFPPNMMGILTCLKVLEIRHCNLLEGIFEVQEPISIVEASPILLQNLSSLMLCNLPNLEYVWSKNPYELLSLENIKSLTIDKCPRLRREYSVKILKQLEDVSIDIKQLMKVIEKEKSAHHNMLESKQWETSSSSKDGVLRLGDGSKLFPNLKSLKLYGFVDYNSTHLPMEMLQILFQLVVFELEGAFLEEIFPSNILIPSYMVLRRLALSKLPKLKHLWSEECSQNNITSVLQHLISLRISECGRLSSLLSSIVCFTNLKHLRVYKCDGLTHLLNPSVATTLVQLESLTIEECKRMSSVIEGGSTEEDGNDEMVVFNNLQHLYIFNCSNLTSFYCGRCIIKFPCLRQVDIWNCSEMKVFSLGIVSTPRLKYENFSLKNDYDDERCHPKYPKDMLVEDMNVITREYWEDNVDTGIPNLFAEQSLEENRSENSSSSKNNVEKE