Information report for scaffold_303735.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a RING‐finger ubiquitin ligase
Homologous
- Brassica napus: BnaA09G0107300ZS, BnaC09G0108300ZS
- Brassica oleracea: Bo7g021550, Bo9g023850
- Brassica rapa: Bra015221
- Lactuca sativa: gene-LSAT_0X4280, gene-LSAT_1X21720
- Nicotiana attenuata: A4A49_24395
- Populus trichocarpa: POPTR_002G124300v3
- Prunus avium: Pav_sc0001944.1_g080.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_8G127800
- Solanum lycopersicum: Solyc01g107940.3, Solyc01g107930.3
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400025779
Gene Resources
- Pfam: PF00097
- UniProt: D7L4D1
- EMBL: GL348715
- AlphaFoldDB: D7L4D1
- KEGG: aly:9319967
- InterPro: IPR001841 , IPR013083 , IPR045191
- PANTHER: PTHR22937 , PTHR22937:SF224
- SUPFAM: SSF57850
- PROSITE: PS50089
- Gene3D: 3.30.40.10
- OrthoDB: D7L4D1
- CDD: cd23113
- eggNOG: KOG0800
- STRING: 81972.D7L4D1
- HOGENOM: CLU_024479_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >scaffold_303735.1
TTGTGTTCTAGTCAAAGGTATGAATCCAATGCAAGGGCCACGAGCTACTGGTGGTTCATCTGCTGACGTGAATCAGGCAGATGGTGAATCGATTTATTGCACAGAAACCGCTATGAATAACATGTTGAATCCAGCAGACACTGTATTTCCAAACAATAGTACACCTTCAGGACGACCAACTTATGCAAGTTCGAGTTCTCATGCTGCTCAAGATCATAACTGGTGGAGGTTTGGGGAATCCAGCTCCATATCAGGTCCTTCTGATCAGGTCAATTCCATTGGAATGAAGACAAGTCACCAGCTGCCTCAAGATGGTGCTCATCACTTTGTTGGCTATGGATCTGAGGGAAGGGAATTAGGTCTGAATGGTATGATGGTAGATGGAGGGGTTCATGCTGGCAGTCACATCAGGAATGGGCCTTCTTTCTTGCGCGGTTCAAGCTCTAATCCTATGCAACAGCATGTAGATATGAGCATGGACATGGACAGCGATAATTGTAGTGCACAGACTTCCGGGGTAGTTATCCGTCATAATAGCTATGGGAGTTCATTAGGAAGCTCAATTCAGGCCGCAGGGGAGAGCAGCAGTGGTCCTGCTTCTCCGTTTGGTGGTTGGGGTTCGTCCTGCAAAAGAAAGGCTCTTGAAGGATCCCCTGGTCATTATTTTTCTGGTGAAACTCCTAACCGCATTGTTCAGACTGAAAATAGTGCTTCGCATGCAAGTCTTTCTCAGTATGGTGCTTCAAGTAGCTTAAGTTTGGCTACACCCTCACAAAGTTCTCCAAATGTTACTAATCATTTTGGCCGGACAGAACAAATGTTTGGATCTGGTGGTGGAAGAGCAGTTGCAGCCAGTGCTTTTCATTCTGCAAGAAACACTGACACCTTATCTAGAGCTGGCAGACGATTAAATCCCAGGCAGCCTCAGGAGTCTGTAGCATTCAGCGTATCACACGCTGGAACTTCTGTGCGTCCCACTGATTCTTTGCAACAGAATTTACCATTGAACTCTCCCTTTGTAGATCCTCTAGATGTGAGATCAACTAGTGGCTCAAGCACTGGTGAGAATCAGACAAATATAGTCCACCTCCCTGCTTTGACCAGGAATATACACCAATTTGCTTGGGATGCTTCTTTCAGTTCCAGAGCCAGTAATTCTTCGGGTATTGGGATGCCTGCAGAGCGATTAGGGCCACAGTGGGAAACACCGAGAAGCAACCCAGAGCAGCCCATGTTTGCACCCGCAACTGACATGAGACAGCCGGTGCATGATCTTTGGAATTTCACACATGGAAACCCTGGTTCATCTATAGATTCTCCCTTTGTTCCTCGAGCAGGGCCAAGTTCAGCTATTCATGCGCCACAGCCTAATCCCACATGGATTCCTCCTCAGAGTGCCCCAATACATAATCCATCGAGAACATCAGAACTTTCTCCTTGGTCTTTATTTCCTAATATTGAATCTCAATCTGCTAGTCACGGTGCCTCTCTTCCATTATTACCCGCAGGCCCCTCTGTTTCCTCAAATGAGGTGGCAATGCCATCTGGTTCTAATAGTCGGAGCCATCGCTCACGGCAAAGAAGATCAGGGTTGTTATTGGAGAGACAAAATGAACTTCTCCACTTGCGTCACATAGGGAGGAGCTTAGCTGCTGACGGTAATGGAAGGAATCAAATCATCTCCGAGGTATGGGTTCCATACATACTTGCTCTTGTATGATAATTTGGGTTGATGCTATATATGAATCTTTATAGCATCTTTCACTATCTTTTACTATCGAATGGTTTGATAGGAGAATCCTTCCCACATAAGCATCTCATGTTATGAATAAGTGGGGGTTAAGAGCGTGCATTTATGGGTTGTTTTCATGGTTTTTAGTTTGTTATGTTCGTCTGATTGAAACTCAGGGTTTTTAGTTAAGTTTGTCTTCCTTTTGTTATGAGGTTTTCTTGTAATTTTCTCTGTAAAATCTTGATATGCTTGAGTATGGTACCTGCGGGTTGTGAAATTATCTGGTTTTGTACTTTTTGTGGTCTAGCTTCATATAGATAGAGTTAAAAAAATTGATTCATGCATGGTCGGTAACTATTCTCTTTTGAAGTAAGGCTATGTAGGACAGTGTATTGATCAAAATTTGAAGACTTGCATATATGCCATAATTTGGTTGAAACCTGATTTTTGTGGATGCCAGTGACAACGCCATATCACTTTTTGTTAAATAAAAATCTTAAAGGCTCTGCTATAAAGCTTTTTTTGCCAATTATTTCTAGTATATGTCTCTTCTGAAAGGTATAACTTTATCCATATGAGAACTAGAGTAGTTTGATGCACTCTGATATGACTTCGATCTGCAAACCATATTGATGTCTTACGTTTTGGGATTGCTCTTTTTCTAAATCTAGTTTATAAACCTCCTTAGCAACTGCTACATGTATTTAGTTTTGATGCAGTTCGATAAGTATTTTAATAGTGAGTTGCACTGATTCCTCTATTTGTTGTTAGCAGATACGTCAGGTGTTGCATGCCATGAGAAGAGGAGAAAATTTACGGGTTGAGGTATAATTTTGACACGAGTGATTTTCGACAATCCTGCCTGTTAATATCATTTAATGGATAGAACACATTCCATTTCTTGGTGAATCTGTTGTCCTGATGTGTGATCTTCCTTTTTTCCAATTTGATAAGGATTACATGGTGTTCGATCCACTTATCTACCAGGGTATGACTGACATGAATGATAGGCATCGGGAAATGCGGCTTGATGTTGACAACATGTCGTATGAGGTAGTATTCCTTTTTTTGACAGTTAAATCGCAATCTTCCCATTTTCCAACAATGTGTGGGAATGAATGTAGGAGCTATTGGCACTTGGGGAACGCATAGGTGATGTGAGCACTGGCCTAAGTGAAGAGGTCATTTTGAAAGCATTGAAACAGCACAAACATACAATTTCTTCTGCTTCTTCTGCTGAGTTGCATCAGAACATAGAGCCATGCTGCATTTGTCAGGTATTTGATTAAGTATGAACTAGAAGGGTTTTGCTCGTGTAATACTTACCGACTAACTGATAAGCATAAGATAAAGAAATTGGCGTTGCTGAGCTTGCTTCCATTATTTCTCGTTACATATGGAATGAAATAGGATACTATATAAATAAGATAGGTTGGACTAGAGTTTTGGGTGTTTGGTTTGTTTGGGAAACTTTTGGGCTTTTAGAGAGTTTGGGGACTTTATAACAAAATCCTATCACTTGGTTCTCGTTATCAAATCTGCATTTCTGTACTTTGTTCTTACTACTACTCCCTGAGCCGGTTTGTTTCATCTAACAATAGTCCTCCGCAATAAGTTTTGTGAATTGATTCTGTTTGTTTTCGTTTAGTCTCACTTCCTTGATCAAGCCTAAAAGTGGTATGCTTTGATATGTAATCATCATAGAGGATGATGATGTGCCATAATGAAACTAACAGATTTATTAGCTGAACTGATATTGTAAGCTTTGATATGTAATCTTTGATCAGCAATGAAAATGTTGATTTTGGGGTAACATTGGTTGATTGAATGAGTCTCTTCTGTGTCTCTTTTTAAGCTGACATAGCACTCAGCCTCAACACATGAACTGATGTTTAAAAGCCTGTTGCTGCTGTTTTGACAGGAAGAGTATGTAGAAGGTGATAATCTTGGAACCTTGAAATGTGGACATGAATTCCACAAGGACTGTATCAAGCAATGGGTCATGATCAAGAATCTCTGCCCCATTTGTAAGACCGAGGCATTAAAGACGCCATAGTACGTATGCTTGCCTCCATC
CDS Sequence
- >scaffold_303735.1
ATGAATCCAATGCAAGGGCCACGAGCTACTGGTGGTTCATCTGCTGACGTGAATCAGGCAGATGGTGAATCGATTTATTGCACAGAAACCGCTATGAATAACATGTTGAATCCAGCAGACACTGTATTTCCAAACAATAGTACACCTTCAGGACGACCAACTTATGCAAGTTCGAGTTCTCATGCTGCTCAAGATCATAACTGGTGGAGGTTTGGGGAATCCAGCTCCATATCAGGTCCTTCTGATCAGGTCAATTCCATTGGAATGAAGACAAGTCACCAGCTGCCTCAAGATGGTGCTCATCACTTTGTTGGCTATGGATCTGAGGGAAGGGAATTAGGTCTGAATGGTATGATGGTAGATGGAGGGGTTCATGCTGGCAGTCACATCAGGAATGGGCCTTCTTTCTTGCGCGGTTCAAGCTCTAATCCTATGCAACAGCATGTAGATATGAGCATGGACATGGACAGCGATAATTGTAGTGCACAGACTTCCGGGGTAGTTATCCGTCATAATAGCTATGGGAGTTCATTAGGAAGCTCAATTCAGGCCGCAGGGGAGAGCAGCAGTGGTCCTGCTTCTCCGTTTGGTGGTTGGGGTTCGTCCTGCAAAAGAAAGGCTCTTGAAGGATCCCCTGGTCATTATTTTTCTGGTGAAACTCCTAACCGCATTGTTCAGACTGAAAATAGTGCTTCGCATGCAAGTCTTTCTCAGTATGGTGCTTCAAGTAGCTTAAGTTTGGCTACACCCTCACAAAGTTCTCCAAATGTTACTAATCATTTTGGCCGGACAGAACAAATGTTTGGATCTGGTGGTGGAAGAGCAGTTGCAGCCAGTGCTTTTCATTCTGCAAGAAACACTGACACCTTATCTAGAGCTGGCAGACGATTAAATCCCAGGCAGCCTCAGGAGTCTGTAGCATTCAGCGTATCACACGCTGGAACTTCTGTGCGTCCCACTGATTCTTTGCAACAGAATTTACCATTGAACTCTCCCTTTGTAGATCCTCTAGATGTGAGATCAACTAGTGGCTCAAGCACTGGTGAGAATCAGACAAATATAGTCCACCTCCCTGCTTTGACCAGGAATATACACCAATTTGCTTGGGATGCTTCTTTCAGTTCCAGAGCCAGTAATTCTTCGGGTATTGGGATGCCTGCAGAGCGATTAGGGCCACAGTGGGAAACACCGAGAAGCAACCCAGAGCAGCCCATGTTTGCACCCGCAACTGACATGAGACAGCCGGTGCATGATCTTTGGAATTTCACACATGGAAACCCTGGTTCATCTATAGATTCTCCCTTTGTTCCTCGAGCAGGGCCAAGTTCAGCTATTCATGCGCCACAGCCTAATCCCACATGGATTCCTCCTCAGAGTGCCCCAATACATAATCCATCGAGAACATCAGAACTTTCTCCTTGGTCTTTATTTCCTAATATTGAATCTCAATCTGCTAGTCACGGTGCCTCTCTTCCATTATTACCCGCAGGCCCCTCTGTTTCCTCAAATGAGGTGGCAATGCCATCTGGTTCTAATAGTCGGAGCCATCGCTCACGGCAAAGAAGATCAGGGTTGTTATTGGAGAGACAAAATGAACTTCTCCACTTGCGTCACATAGGGAGGAGCTTAGCTGCTGACGGTAATGGAAGGAATCAAATCATCTCCGAGATACGTCAGGTGTTGCATGCCATGAGAAGAGGAGAAAATTTACGGGTTGAGGATTACATGGTGTTCGATCCACTTATCTACCAGGGTATGACTGACATGAATGATAGGCATCGGGAAATGCGGCTTGATGTTGACAACATGTCGTATGAGGAGCTATTGGCACTTGGGGAACGCATAGGTGATGTGAGCACTGGCCTAAGTGAAGAGGTCATTTTGAAAGCATTGAAACAGCACAAACATACAATTTCTTCTGCTTCTTCTGCTGAGTTGCATCAGAACATAGAGCCATGCTGCATTTGTCAGGAAGAGTATGTAGAAGGTGATAATCTTGGAACCTTGAAATGTGGACATGAATTCCACAAGGACTGTATCAAGCAATGGGTCATGATCAAGAATCTCTGCCCCATTTGTAAGACCGAGGCATTAAAGACGCCATAG
Protein Sequence
- >scaffold_303735.1
MNPMQGPRATGGSSADVNQADGESIYCTETAMNNMLNPADTVFPNNSTPSGRPTYASSSSHAAQDHNWWRFGESSSISGPSDQVNSIGMKTSHQLPQDGAHHFVGYGSEGRELGLNGMMVDGGVHAGSHIRNGPSFLRGSSSNPMQQHVDMSMDMDSDNCSAQTSGVVIRHNSYGSSLGSSIQAAGESSSGPASPFGGWGSSCKRKALEGSPGHYFSGETPNRIVQTENSASHASLSQYGASSSLSLATPSQSSPNVTNHFGRTEQMFGSGGGRAVAASAFHSARNTDTLSRAGRRLNPRQPQESVAFSVSHAGTSVRPTDSLQQNLPLNSPFVDPLDVRSTSGSSTGENQTNIVHLPALTRNIHQFAWDASFSSRASNSSGIGMPAERLGPQWETPRSNPEQPMFAPATDMRQPVHDLWNFTHGNPGSSIDSPFVPRAGPSSAIHAPQPNPTWIPPQSAPIHNPSRTSELSPWSLFPNIESQSASHGASLPLLPAGPSVSSNEVAMPSGSNSRSHRSRQRRSGLLLERQNELLHLRHIGRSLAADGNGRNQIISEIRQVLHAMRRGENLRVEDYMVFDPLIYQGMTDMNDRHREMRLDVDNMSYEELLALGERIGDVSTGLSEEVILKALKQHKHTISSASSAELHQNIEPCCICQEEYVEGDNLGTLKCGHEFHKDCIKQWVMIKNLCPICKTEALKTP