Information report for scaffold_103992.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a bHLH transcription factor involved in CFL1-mediated regulation of cuticle development. Overexpression leads to abnormal cuticle development.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G35460.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00153299001, GSBRNA2T00073811001, BnaA08G0068000ZS, BnaC08G0095400ZS, BnaA09G0374300ZS, GSBRNA2T00033633001
- Brassica oleracea: XP_013599939.1, Bo8g026850, XP_013588513.1
- Brassica rapa: XP_009107915.1, Bra036760
- Raphanus raphanistrum: RrC7798_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00010
- UniProt: D7KL86
- EMBL: GL348713
- AlphaFoldDB: D7KL86
- KEGG: aly:9329940
- InterPro: IPR011598 , IPR036638 , IPR045239 , IPR045843
- PANTHER: PTHR16223 , PTHR16223:SF225
- SUPFAM: SSF47459
- PROSITE: PS50888
- Gene3D: 4.10.280.10
- OrthoDB: D7KL86
- CDD: cd11393
- eggNOG: ENOG502RY1W
- STRING: 81972.D7KL86
- HOGENOM: CLU_063812_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >scaffold_103992.1
ATTCTCCGGTGAACAACTCGATGCAATCCACTCATATCAGCGGCGGAAGTAGCGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGAGGAGAGGTGAGTCGAAGTGGTTTATCTCGGATCCGTTCAGCTCCAGCTACTTGGATTGAAACCCTACTCGAAGAAGATGAAGAAGAAGGCTTAAAACCTAACCTCTGTTTAACAGAGCTTCTTACTGGTAATAACTCTGGAGGAGTGATAACGAGTCACGAGTTCCCGAGTTCTGTTGAGCAGGGATTGTATAATTATAATCACCAAGGTGGTGGCTTTCACCGCCAGAATAGTTCTCCGGCGGATTTTCTTAGTGGGTCTGGTGTTGGGACTGATGGGTATTTCTCAAGTTTTGGTATTCCGGCGAATTATGACTATTTGTCGACTAACGTTGACATTTCTCCGACTAAACGGTCTAGAGATATGGAAACACAGTTTTCTTCTCAGCTGGTAAGAATCTGTTTCATTGAATTCAGATAAAAATGGAAACTTTAATTGAAAGATAACTTCTTTTGCTTACTTTATTGTCAAGTTGTGTGAATTTATGGTCAAAATGCTGAGTGTTTAGGTTCTGACTTGAGTTCTGTTATAGGGATTGATACGGTTATTGTTTAATTGGGTGTTTGAATTCTTCAGTTGTGGAGACAATAAAGATGTAAAAGAGTAGTCTTGTCTAATTTGACAACTTGCATTTGTTTGTAACAAATTCCCAGCAAGTTGCAGTTTTTTTTTTTTTCTTTGTTTTCCTGTGGCTGTGAAAGTGAATGTTGCATAAAGCTTCTATTAGTAGTTGGGCAAACTAAATTAGTCACTGCACATAGTCCATCTTTGATGAGTATCACTTACTTGTGTTAACTATGTATCGATCGTGTAACGTTAGTAGTTATCATGGCTTTTGTGAGATAAAACATGTTTTGATGTTCATGGTTAAGTCTCTGTGTGTATATGGATACTTAACTAATAACTCTTCCCTTCTGGTTTGTTGAGTAGAAAGAAGAGCAAATGAGTGGTGGGGTGTCAGGAATGATGGATATGAACATGGACAAGCTTATTGAAGGTTCAGTTCCTTGTAGGGTTCGTGCTAAACGTGGTTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAGCGGGTATTTACTTAAAAGTTTGTGCTAGATATTTTGCAGTACCAGTTCTGTTTCTGTCTCATTCTTGGTTTTGTCATTAAGCTTTTCTTCATTCATTATGTTAGGTGAGAAGAACGCGAATAAGTGATCGGATCAGGAGGCTGCAAGAACTTGTTCCTAACATGGATAAGGTAAATTTTCTTTTACAGGGCAGATTGATTTTAAGTTTTCTTGGAAGTTTTTAATAAAGAATTACGAAATGGGTCCAAGATTGTATATGCTTAAAGCTTAAGGTAAGAGTTAGTGCTTAGCCGTAAAGTAAAGGAATTTGGATGCTAACTGTTGATTATTGTCAAGGCATTAATGGTACTCCTTAGTCCATAAACTATGGTTCTGCAGTCTTTGATTCGAAGATTCTGTGTATGATATGTCATTAGTTGCTGTATTATATTATGACAACAAACGTTTGAGGTTTCTGAAACTCTGTGGGAACGATAAAAGTCCGGGAGAGTTATAACGCGAAGATTCGGGTTTTTGTATTTTCTCTGTTGCAGCAAACCAACACTGCAGACATGTTGGAAGAAGCTGTGGAGTACGTGAAGGCTCTTCAAGGCCAGATTCAGGTTTATCTGCATATTACTAATTGATTAGAAACACAAATTTATATTAAAAAAAAAGCATTTTTTTGATCATTTGATTTGGTTTTGATGGATTCAGGAATTGACAGAGCAGCAGAAGAGATGCAAATGCAAACCTAAAGAAGAACAATAATGTTTCCTTTAGGATTGATA
CDS Sequence
- >scaffold_103992.1
ATGCAATCCACTCATATCAGCGGCGGAAGTAGCGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGAGGAGAGGTGAGTCGAAGTGGTTTATCTCGGATCCGTTCAGCTCCAGCTACTTGGATTGAAACCCTACTCGAAGAAGATGAAGAAGAAGGCTTAAAACCTAACCTCTGTTTAACAGAGCTTCTTACTGGTAATAACTCTGGAGGAGTGATAACGAGTCACGAGTTCCCGAGTTCTGTTGAGCAGGGATTGTATAATTATAATCACCAAGGTGGTGGCTTTCACCGCCAGAATAGTTCTCCGGCGGATTTTCTTAGTGGGTCTGGTGTTGGGACTGATGGGTATTTCTCAAGTTTTGGTATTCCGGCGAATTATGACTATTTGTCGACTAACGTTGACATTTCTCCGACTAAACGGTCTAGAGATATGGAAACACAGTTTTCTTCTCAGCTGAAAGAAGAGCAAATGAGTGGTGGGGTGTCAGGAATGATGGATATGAACATGGACAAGCTTATTGAAGGTTCAGTTCCTTGTAGGGTTCGTGCTAAACGTGGTTGTGCAACTCATCCTCGTAGCATTGCTGAGCGGGTGAGAAGAACGCGAATAAGTGATCGGATCAGGAGGCTGCAAGAACTTGTTCCTAACATGGATAAGCAAACCAACACTGCAGACATGTTGGAAGAAGCTGTGGAGTACGTGAAGGCTCTTCAAGGCCAGATTCAGGAATTGACAGAGCAGCAGAAGAGATGCAAATGCAAACCTAAAGAAGAACAATAA
Protein Sequence
- >scaffold_103992.1
MQSTHISGGSSGGGGGGGGGEVSRSGLSRIRSAPATWIETLLEEDEEEGLKPNLCLTELLTGNNSGGVITSHEFPSSVEQGLYNYNHQGGGFHRQNSSPADFLSGSGVGTDGYFSSFGIPANYDYLSTNVDISPTKRSRDMETQFSSQLKEEQMSGGVSGMMDMNMDKLIEGSVPCRVRAKRGCATHPRSIAERVRRTRISDRIRRLQELVPNMDKQTNTADMLEEAVEYVKALQGQIQELTEQQKRCKCKPKEEQ