Information report for scaffold_102909.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Floral homeotic gene encoding a MADS domain protein homologous to AP1. Enhances the flower to shoot transformation in ap1 mutants.;MADS-box transcription factor;MADS-box gene
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G26310.1
- Brassica napus: BnaA08G0229400ZS, GSBRNA2T00101980001
- Brassica oleracea: XP_013613940.1, XP_013589842.1, Bo6g095760
- Brassica rapa: XP_009109914.1, Bra011021, XP_009105460.1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: D7KQR8
- EMBL: GL348713
- AlphaFoldDB: D7KQR8
- KEGG: aly:9329470
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: D7KQR8
- SMR: D7KQR8
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 81972.D7KQR8
- HOGENOM: CLU_053053_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >scaffold_102909.1
TTTAGTTATTTTACGAGAAATGGGAAGGGGTAGGGTTCAATTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCTAAAAGAAGAGCTGGTCTTTTGAAGAAAGCTCAGGAGATCTCTGTTCTTTGTGATGCCGAGGTTTCCCTTATTGTCTTCTCCCATAAGGGGAAATTGTTCGAGTACACCTCTGAATCTTGGTAATTGCTTAATTCCTTTTTTGTTTTAATCTTATTTTCAGTGTTCCTTTGTTTGCCCTAACTAGTAGTTTTTGCGTTACAATTAAGGCCTTTTCTGGATCTCCTCTTATCTTCTCTTCATGAAAATTTGTCACAGATTTGGTATCTGATTACTTGGATCTATGAACTGATATTGTGTTGGTCAAACCATTAGTTTGTTTTTATTATAAATTTAATATCAAAAGAAAATGAAAATTTTTAGGACTTTTTAGTGAACCCTAGAATACGATCTACTTAATTATCCTGATAGTGGCATGGATTTTTAAGAAATCATCAGAATCTTCTTAATTTAATCTGGATATGTACATTTTGCTTCGAGTCAATGAAGTTTAGTATATTAGTTACATAAAGGACCTTTGCTTATGTTAGACTAGGATTTTTTTGCTTTCAATTTTAGGAAAGCTATCCTTCTGCTTAAATATCTTTAAATAGCATAGTATGAATACAAATTTTGATATGAATAATTCTAGTCTGTCTTATGTACCATAAACAAATTAGTCTAAGAACAATCTTAAGTTTATAAAGAAAAACTCTTCATTTATTTTCCCAATTGGGTTTATAGCTAGGTATAGAGAAACTGGAAAATAAGGATGTGACATCTAAGTATAGGAAGTCTTTGACCTCTGGGGATCAATGTAAAAGAAATCATTCTTTTTTTTTCTAACATCTTCTCCGTACCGGTGGTCAAACTTAACTTCAACAGTTGTTCTTTAAATTTTAAGAAAACTAAATCGAACAAAAAAAAGAATTAATGTATTTTACCTTACATCATTTAATAAATCTTTTTTATATATTTCTAATAAAAATATTTATCGAAGGATTTGAAACTTAAAGCTGGGGTCATAGGGCGCTTCAATACGTCTTGAGAAGTAGGGTTAATGATTCAACTGTTTAAGCATATACAAAAAATGGTAGAATTGTAGAAAACAGTACTGTTTCTGGAGTAAATTCACAAAACTAGAGATCATATCTATTCTATAATAGAAAATAATGTTTAATATGATTACATTGCTAATTAATTAGGTAAACCTTATATGTTATTACCTATTTTGGGTGAATCATTCAATTTGAAACAAATGACCTTTTGTGTTAAGCTAAGAAGCTATATATATATTCGAGTATGCAAACATTGGTGGTTCTATAAATGTAATATGACAGCTTTGTGGGTGAATCGAAACTAATTCTAAGCTTAATATATATAGCATGGAGAAAGTACTCGAACGCTACGAGAGGTATTCGTACGCCGAGAGGCAGCTGATTGCACCTGACTCTCACATTAATGTATGTTTAATATGATCTCCATCATATATTTATGTATATATTGAATCTTGCATGCATTTTTAACTTCATAACATAGCATGTATATAAACTGATTACATGCATACTGGAAATTATTTGTGTAGGCACAGCCGAATTGGTCAATGGAGTATAGCAGGCTTAAGGCTAAGATCGAGCTTTTGGAGAGGAACCAAAGGTACGTTATACATTTAAATTTAATATAGAAATTAAATATTGACATTTAGCAGAAGAGATAATGGTGTTAACTAAATAATCACAGGCATTATCTAGGAGAAGACTTGGAACCAATGAGCCTCAAGGATCTCCAAAATCTGGAGCAGCAGCTTGAGACTGCTCTTAAGCACATTCGCTCCAGAAAAGTATGTAAATATATCCCACACACGATCTCTATGCCTAATTAACTATCTTTGAGTTTGTGTCGATCTATTACATTCAAATATTTTATAGAGGATTCATATGAATAAATAAGCTTTGGACTTTTTGAATGCAGAATCAACTCATGTACGAGTCCCTCAACCACCTCCAAAGAAAGGTAGCTAAGTTAAACTATTTATTATCTCTCAAGTCGTGTGTATATATGAGTGACTTATATGTTAGAGGTAATATATTAGCTAGTGTTTAAGTAATTACTAGATGTATGTTTATATATAGATATAGAAAGAGCGTGATGAAGAGAGAAATTAACAATGGTGTCATTTTTTTTTTTGGAAATGACAGGAGAATGAGATACAGGAGGAAAACAGCATGCTTACCAAACAGGTGATCATTGTTTTTTGCATTTCTAACTGTTTCACAACTATTTACTATTTACGATTCCACTGTTGAACTCCACTTCAATCTCTACCTTAAGCTACCATCTCTCCACTTTCGGCACCAACTCTTTTTGAGTTAAAAGAATTGATAGTTTTCTTTTGATTGGTATAATCATGAGCCTAGCTGCACGTATAGGTGGGCTTTGTCCGTTTAGTATTAAGGTTGTCTCCCAGATTGAACTTGAACATGAACTGTCTTCTCATAATCATAGTCTAGGTGTACTTTACATACACATTACACATTAGCTAGGAGCTCTATTTGAGTTTTATTCAGAAGTAAGCAAACGTACAAAGAAACTACTTGATTAATTAAGAGAACAAATTAAATTAAATAAATCAAAATAGTTTCATTATACGAAGCTAAAATTCGTTTAACATTTTGCAGATTTATTTATTACTTTGCATTTTGTTTGAAAATATCATATCACAAAAAAATAATAATAATAAATATTAGTTTCTTGAATAAATGCAAATAGTTAATTAGTTGCAAATGGGAATCTATAAAAATGATGCCTATATAATTTTTTTGGCGTGTGTAATCGGTATAGATAAAGGAGAGGGAAAACATCCTAAGGACACAACAAACCCAATGTGAGCAGCTGAACCGCAACCACGATGTACCACCGCCGCAACCGCAACCATTTCAACACCCTCATCCTTACATGATCTCTCATCAGACTTCTCCTTTCCTAAATTTGGGGTAACGTACGGTAGTATTTCATTTTTTGAAGTTTTTTGTGTCTATTTTTGTCTTACCATAATTAATGTCAAATTCTCATACATAGTGAAGTGTTGGCAGTCATATAGGCAATGATAGTGAATGCATTTCATATTTAGGGTTGTGTTAGGTGTGGCGTTAGAGGTTGATGACTTTATAACCACAAGTCCAAAACTATGCAATATGTACGGATTGATGGTATGCATGCATATTATTGTCTTATGTTTTGAATTTGTTATATGATTGTGATTTCAGTGGCATGTACCAAGGAGAAGATCAAACGGCGATGAGGAGGAACAATCTGGATCTGACTCTTGAACCCATTTACAATTACCTTGGCTGTTACGCCGCTTGAATAGACTACATCGATCTATC
CDS Sequence
- >scaffold_102909.1
ATGGGAAGGGGTAGGGTTCAATTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAATAGACAAGTGACATTCTCTAAAAGAAGAGCTGGTCTTTTGAAGAAAGCTCAGGAGATCTCTGTTCTTTGTGATGCCGAGGTTTCCCTTATTGTCTTCTCCCATAAGGGGAAATTGTTCGAGTACACCTCTGAATCTTGCATGGAGAAAGTACTCGAACGCTACGAGAGGTATTCGTACGCCGAGAGGCAGCTGATTGCACCTGACTCTCACATTAATGCACAGCCGAATTGGTCAATGGAGTATAGCAGGCTTAAGGCTAAGATCGAGCTTTTGGAGAGGAACCAAAGGCATTATCTAGGAGAAGACTTGGAACCAATGAGCCTCAAGGATCTCCAAAATCTGGAGCAGCAGCTTGAGACTGCTCTTAAGCACATTCGCTCCAGAAAAAATCAACTCATGTACGAGTCCCTCAACCACCTCCAAAGAAAGGAGAATGAGATACAGGAGGAAAACAGCATGCTTACCAAACAGATAAAGGAGAGGGAAAACATCCTAAGGACACAACAAACCCAATGTGAGCAGCTGAACCGCAACCACGATGTACCACCGCCGCAACCGCAACCATTTCAACACCCTCATCCTTACATGATCTCTCATCAGACTTCTCCTTTCCTAAATTTGGGTGGCATGTACCAAGGAGAAGATCAAACGGCGATGAGGAGGAACAATCTGGATCTGACTCTTGAACCCATTTACAATTACCTTGGCTGTTACGCCGCTTGA
Protein Sequence
- >scaffold_102909.1
MGRGRVQLKRIENKINRQVTFSKRRAGLLKKAQEISVLCDAEVSLIVFSHKGKLFEYTSESCMEKVLERYERYSYAERQLIAPDSHINAQPNWSMEYSRLKAKIELLERNQRHYLGEDLEPMSLKDLQNLEQQLETALKHIRSRKNQLMYESLNHLQRKENEIQEENSMLTKQIKERENILRTQQTQCEQLNRNHDVPPPQPQPFQHPHPYMISHQTSPFLNLGGMYQGEDQTAMRRNNLDLTLEPIYNYLGCYAA