Information report for scaffold_100851.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Similar to POL2A, DNA polymerase epsilon catalytic subunit. Essential for Arabidopsis growth. Null homozygotes are embryo lethal, partial loss of function alleles show embryo patterning defects such as root pole displacement. Delayed progression through cell cycle results in embryos with smaller numbers of larger cells.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc30068
- Arabidopsis thaliana: AT2G27120
- Brassica napus: BnaA06G0048900ZS, BnaC05G0060800ZS
- Brassica rapa: Bra018641
- Citrullus lanatus: Cla97C02G048110
- Cucumis sativus: CsGy6G012460
- Glycine max: Glyma.12G087000
- Gossypium hirsutum: Gohir.A05G082500
- Juglans regia: Jr14_17170
- Manihot esculenta: MANES_04G006100
- Medicago truncatula: Medtr4g054980
- Nicotiana attenuata: A4A49_19906
- Prunus persica: PRUPE_6G124200
Gene Resources
- Pfam: PF00136 PF03104 PF08490
- UniProt: D7KI06
- RefSeq: XP_002889682.1
- EMBL: GL348713
- InterPro: IPR006133 , IPR006172 , IPR012337 , IPR013697 , IPR023211 , IPR029703 , IPR036397 , IPR042087 , IPR043502 , IPR054475 , IPR055191
- PANTHER: PTHR10670 , PTHR10670:SF0
- SUPFAM: SSF53098 , SSF56672
- Gene3D: 1.10.132.60 , 3.30.342.10 , 3.30.420.10 , 3.90.1600.10
- CDD: cd05535 , cd05779
- eggNOG: KOG1798
- STRING: 81972.D7KI06
- HOGENOM: CLU_000556_0_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >scaffold_100851.1
AATCTATCATCGCCGCAAAATGAGCGGAGACAATCGAAGACGGGATCGAAAGGATACGCGGTGGTCGAAGAAGCCTAAGGTAGTGAACACTGCGGAAGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATTTGGGCTTTTCTCTGAAGGTGAAACCCGACTTGGCTGGTTACTCACATTCTCATCCGTAAGTTCCCCGACACTCTAAGCTGGACTCAACCTTGTTAATTGAGAGTATTTGATTAGGTTTTCGGATTCGATTATATGTGATTGGTTCTTCAACTACGTTTTGCAGTCATCTTGGGAAGATCGCGATACTGGGAAAGTCTATAGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGTGAGCTGTTATTACTATGTCAGCTTGCTGCGTATAAGTTGATGAACATTTATATTTTTGTTGTTGCATTTTTCTAAATAGTTAACTAAGTTGAGGATTTTTTTCAGGACGGGTTTTCTTTCAAGACAAAGTACAAGTTCCGCCCTTACTTCTATGCAGCCACGAAAGTATGATAGTTTCTCTTTGTATATCATCTGAATGCTCATTAAAACACTCATACAATATCATTTTATATGTCAATAAACTGCAATGCCGAATTACAGGACAAAATGGAATTGGAAGTCGAAGCCTATTTGAGACGACGATATGAAAGACAAGTCGCTGATATTGAGATTGTTGAAAAAGAGGATCTTGATCTTGTAAGTCAGTAAAGCATACCTTGTTTATTAGTTAAAGTCTGGCTTCCTCATTGTGTTCTTTAGTTGACTAGTGTCTTCCACCAGTTGATTAATGTTGTTGTTTTCTCTACTTATATCAGAAACATTTGCTACAACCTTTAGTTATTATCCTCTTCTTGTAACCTAAAAACTGCACACTTGTAGTAATAAGTCCAAATGTGATCTTGAATCAATTAGGTGAAATCTCTAGTCGTTTGCTAGTATGTAACATGGGCTGTAGATGTTAAAGTTAGTTTTCTTTAAGTGTTTAGTGATTGTCCTTTAGTGCAATAGTATGCAAGTTATAAAGGTTTCAGTACTTTTTAGTTGTCAATTCGCTTAGGATTTCTTTGTAGCTTTTTTCTGTGATACACCATTTTTGAGTTTCTTCATTTTTATGTTCATGAGCAGAAAAATCATCTATCCGGCCTGCAAAAAAAATACCTAAAAATATCATTTGATACTGTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGAGGGATCTGTTGCATATCGTCGAACGAAACCAGGCAAAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGGTAAGACAATGTAGTTTTGTTCTTTTAAATCACTTAAGAGTTTTGTTGGTTTTCAAATTTACATCTTTACCTTGTTTCTTGTAGTTTTTTTTTCAAGTTTATTTTCAGGGGTTTCAGATTCCCAGATCATTTTTATTTTTATTCTTGGAACGCAGAGAACAACGTCCTCAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATGTTCGATTTGCAATTGATAATGGTATCCTGTTTAGCCAAGCCAGAATTTCTGTTTAGTTCTCAAAATTGTCAAAATCATGATGTTTTCTTGGTATCCAGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGCATTTCCAGCACCGATGTCATACTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAAGTCCGTGTTTGTGCCTTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCTTTGAAGTTTCCGGATGCTGAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATTAACAGAGAGGTAACTGCTGTATACATTTGTCTGTATTGGATCTGATATTATAATGATTATATTTTTACATGCTGGATGGGGATTGTTAATTCATTAATTTAGAGAACCTACTATATGGCCTTGCTTTGCCATCTTTTTAGAAATGATCCATATATGATTATCCCGCTTGTTTAATTGATTTAGTATGATGTGGCTTTCAGACTGTTTTTGGACTAGCTTAACATTTTGCTATAATTTAAAACATGATTTCTGATTTGTTAACCGGTTTTCGTTGCATATGTCAACTCTGGTTGATAACTCAGCTCTATTCTTTCCTTAAAAATATTTGGACTACTGCAATCTCGTTTGATTACAAATGTAGTATTTTTGCACTTAATTCAGTGTGTTGGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCCAAACCAGAATTTGAAGGGTATTTCAAAGTTACTAATGTTAAAAATGAGGTAAAGTACTTAAGCTCCTGATTTGAATGTAAAATCATAAACATTGATGTGCAGGTGAGTTATTTCTTGGTTTTTTCTTGTAGGTTGAACTCCTCCAAAGATGGTTTTACCATATGCAAGAGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAATGGTGACTTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAGGTATGCTAAAGTTTTATTTGTTGGTGTTTTGTTTTAATTTTATCTGTCTGCATGACTAAAAGGATATATATGATCTACTTGGAAAGTCTGTATAAAAGTTTGTTATATTATTCGCTGACATTCTATTGTGGCCTTGTGAGTGTGCCTCTGCATAAAGTAGAATAGTGACACTGCTCAAGTGCTTCCTAGACTGTCTACTGAATTATCTTGCATGAGGATGCTTACTTCTACATATCATTGTTTCCTTTAGTGGAAGATAAATTTTCTTCCTTCAAATATTCAGTGACTTGTGTTTTGCATTTGAATACTGAAGTCTTCTGAGAGTTGGCAAGGTGCTGCCACTCGTTCTCCCGGACTTGGTTCTATTCTCTGTTTAATTTAAACCTCTATTTTTTCACTTCCTGTTTTTTCATTTAAAACCTAGTTCGTTGCATCTTACTCGTCACTTCCTATCCTATTCCTATTATCTTCCGTTGGAGCGCAATGGTCAACTGTAATTCCATAATTGGTTGGTGTGTTTTGATTCTTTTCCTCATGGTTCAGGAATTGGGATTCCGGTGTGATCATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGTTTGTCATTTGGATTGTTTTGCTTGGGTTAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTGAAGGTTCATTCTTCTTCTATCTCTAAGCGAGTATTTATCTTTTGTGGTCATAATCTTTTGTTAAGAAATTCATATTATGATTTTGATGCTTGTCTCTTAATGAAATGCCAGGCTGTAACAAAGGCAAAACTGGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGATATGGTTCGGTTTGCGATGGAAAAGCCACAGGTATTGACGAGAAGTTAATCCTGCTTTTTCTGTATAACATAAGTTTTTTTTTTACCATTAGAGCTGGTTGTTAAATACTATGGGCTAGAGTAACAAACAGTCAATGAGAATTGATCAAGTGATTCAACTATATACCTCTTTAAGGGTTGCATAAATGTTCTTCTGCCCATGTTAAATTCATTGTCTTATCATCAGTACACAAAATTTAGAAGCGGACATAGATATCAAGCAATTAATGGGGTCAACTGTAGATTTTTCTAGTCTATGCTGTAGTGCTTGCAATATTTGCATGGAATTGGGTGCTTATATCTTATTTCTATCCCATGCTGGGAATCATCTCGCAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCAATCCGTTCATTTTTTCTCTCGCAACTATCATCCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTCTGATGGTTCAGGTATCAACCTATCTACCACAAGGTCTTTAGCAATCTTTACTGTGTGACACATTCTATTAATTGGAAGTTTTCCGTTCAGCACAGGCTTACAAGGTAAATGTTGTATGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAACTTCTTGAAAGTGAGACATATATTGGTGGGCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGTGTTTTCAGATCTGACATTCCAACCAGTTTTAAACTCGATTCATCGGCATACCAGGCAAGTTATCTCCTTTATATTTATTCACTGTAATGTTCGTTGATTTGCTTAATTGATTGCTGGGCATTTTTTCTGATAGAGTTTCAATTCAATTGTCACTGATTTTTCTGTAGTTTCCTCTGAAGTGGTGCAGTTTATAGTACTATGTAGTCTGTAATGAATGCCTGAAGCAAAATGCTTCACATTCTTGTGCGATTGATTGTATTTATATCTAATTTATGCACCTATCTGATATTTGACGCTTTGATTGCCAGCAACTGATTGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTGGAAGGGAAAATGAGAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTGAAGGACGAAATCAAGGAGAAGGTAATGAATTCCTCTTCTGAATAAGAGATATTGATTTAATGCTTGTTCCCTTGTTTCTTGACAGCATGTTGTTTCTCTTGTCGCTTTGAATGGCTGACACTGCATACTCATTCATACTGAGAGAGTTTGCTTATACACTCATACATGCTTAGCTCGTATCTATGAGCCTTCTCTCATGAAGAGTAATCCCATTAGGGCTTGTGGAAAGAACATTAATAAGTCCTTAGACTACTGTATGAGCCTCCAGAAGAAATCTGTCTATCAAGTATCCTCAATCATAGTTGTTGTCAACTAGCATCTGTATGCTTGGATATTTTAAAGCAGAACATAGAACATGATTGTCTTATGAATTATTTCCCTTTATCTCTGATTCGGGATGAAGTCTTAGTTCTGTTGTGGTTTGGCGGTTTTATTGATTTGCAGCTCGAGAAATTACGAGATGACCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCG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CDS Sequence
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Protein Sequence
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