Information report for PHAVU_008G142400g
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes the Arabidopsis homolog of the transcriptional regulator MED12, is dynamically expressed during embryogenesis and regulates both developmental timing and the radial pattern formation. Involved in flowering time. The mutant enhances the expression of the flowering time (FT) gene. A knockout mutant of this gene showed late-flowering phenotype.
Homologous
- Glycine max: Glyma.18G232900, Glyma.09G259400, Glyma.03G009200, Glyma.07G070700
- Juglans regia: Jr07_06640, Jr07_06650
- Manihot esculenta: MANES_05G034300
- Medicago truncatula: Medtr7g077700, Medtr8g030800
- Prunus persica: PRUPE_2G170500
- Vitis vinifera: VIT_15s0046g02510
Gene Resources
- Pfam: PF09497
- UniProt: V7B5E1
- RefSeq: XP_007140791.1
- EMBL: CM002295
- OMA: THSIGNF
- InterPro: IPR019035
- PANTHER: PTHR46567 , PTHR46567:SF2
- OrthoDB: V7B5E1
- eggNOG: KOG4522
- STRING: 3885.V7B5E1
Sequences
CDS Sequence
- >PHAVU_008G142400g
CAATCCACTAGGGACATTGGAAGAACCGATTCATCTTCCTTGCCAGCTAACTTTCCTTTGAGTTCAAGGCGACAACCACTATTAACCCCATACAAGTTGAAGTGTGATAAAGAACCTCTGAACTCTAGGCTTGGGCCCCCAGACTATCACCCCCAAACACCAAATTGCCCTGAAGAGACTCTGACCAGAGAATATTTGCAATCTGGATACAGGGACACAGTTGAAGGGCTTGAGGAATCTAGAGAAATTTCTCTGACCCAGGTTCCGAATTTTAACAAGGCAATTGTACTTAACTGCAAAGAGGCCATCAAAAAACGTCTGAGGGCAATCAATGAATCTCGTGTTCAGAAGCGGAAGGCTGGTCAAGTTTACGGAGTGGCTCTTTCAGGGTCACAACTTGCTAAGCCTGGTGTTTTCCCTGAGCAAAGGCCATGTTCTGAAGACATCCGGAAGAAATGGATTGAGGGATTATCTCAGCAGCACAAGAGATTACGGTCTTTAGCAGATCTTGTCCCTCATGTTAGAAGGAAATCACTTTTAGAGGTTCTTATTAGGAATAATGTTCCATTGCTGAGGGCTACCTGGTTTATAAAGGTTAATTACCTTAATCTGGTTCGGCCAGGTTCTGCTAGTATTCCTTCTGGGACTGGTGACAAAACTCAGCTGACTTGTTCTGAGCTTTGGACCAAAGATGTTATTGAATACTTGCAAACTCTTCTTGATGAATTTTTTTCAAAAAATACTTCTCATTTTACCCCTCATAATCGAGATCGATCACCCCAAGTACCTTATACTGCATCACATCAGCACAGAAGTGATCAGTTATCTGTTTCTGATGGTGAAGAACCATCTTTACATTTTAGATGGTGGTATATTGTTCGGCTTTTGCAATGGCATCACGCCGAAGGGCTTCTTATTCCATCTCTTATCATTGACTGGGTTTTGCGCCAATTACAGGAAAAACAATTGCTTGAGATTTGGCAGCTGCTATTGCCTATTGTATATGGCTTTTTAGAAATTGTGGTGCTATCTCAAACATATGTTCGCACTCTTGCTGGTGTAGCTCTTCGTGTTATTCGGGATCCTGCTCCTGGTGGATCAGATCTAGTAGAAAATTCCCGGAGAGCATATACAACTTCTGCTCTGATTGAGATGCTCCGGTTTTTAATACTTGGGGCTCCAGAAACTTTTGTTGCTTTGGATTGCTTTCCTTTGCCATCCTCTATACTTTCATATACAATAAATGATGGAAATTTTATATTAAAAGCAACTGAAGCTGCAGGAAAGATAAAAAATAGTTCAGAAGATGTTGTTTGTTTATTTAAAAGTAAAGGGTTTGATGCACAATACCAATCATTGGCATTTGATCATGTTATTTCATGCATTCAAGAACGAGTACAAGATCTAACAAAGGCTGTAAAGCCAGGCTATCCAGGTCAATATCTGGCTAAAGCGGCACAAGCCTTGGATAAATCCCTTGTACTTGGGGATCTACATGGAGCATACACATTCCTTTTTGAAGATCTTTGTGATGAAACTGTATCTGAAGGTTGGGTTGTGAAAGTCAGTCATTGCTTAAGGTTATCTCTGAAGTGGTTTCGGACTGTAAATACATCACTTATTTATTCAGTGTTTTTCCTGTGTGAGTGGGCTACATGTGATTTTAGGGATTTTCGGACTGCTCCCTGTGACGTAAAGTTCACTGGCAGGAAAGATCTTTCCCAAGTGCATATTGCAATTAGACTTTTAAAGATGAAGCTGAGGGATATGGAGGTTTCTCCAAGACAAAAGAGTGGAAATACTCGTGGTCGTGGGGTCAGTTATTTAGGAAAATGTTCAGGTCAGCAGAGTAATCGAAACATTGTGAAAAATGTGTCCAAAACAAAATCTAGTTCAAGAAGTATGGATCAGAATATATGCTCTTCAGCTATATTTGAAAGCCCTGGTCCTCTGCATGATATTATTGTTTGTTGGATTGATCAGCATATGGTGCATAAAGGGGGAGGTCTCAAACGTCTACATCTACTTGTAGTGGAACTCATACGGGCAGGCATCTTTTATCCACTGGCATATGTACGCCAGCTGATTGTGAGTGGGATCATGGATATGAATGTGATTGATTTGGAGAAACAGAAGAGACATTGCCGAATCTTGAAGCAACTTCCTGAGAAGTTTGTGCGTGATGCTTTGGTAGAATCAGGGGTTAATGCAGGGCCACAGCTTACTGAAGCATTGCAAATTTACTTGAATGAACGCCGCCTCATACTACGTTGTTCCTTGTGGGAGAACCATGGTAATGCCAGTAATGTGAATATATCATCTCTTAAACAAAACCAGTGTATATCTTCAACAAAAGACAGAGCTTCTACGGTGTCAACTGATCAATGGAAAAGTGTTCTTTCTAGTAAAACAGCCTCTAAAAATGGCAAGGATGACAACGGTGTTGAAGATCTGAAGACATTCATCTCAGCCCTGTTACAGCTACCAAAAAGTTTATCTAATTTGAGCTCTACCGGAACGGATGAATCTCAAGGCAATGTCAGGAAACCTATTGGGTCCCAAAGCAAGATTGATCTAGTGGAGACTACTCCTGGATGTGAAGAATGTAGAAAATCAAAGAGACAAAAATTGAGTGCGGAAAGAAGTTTGTTTGTTCAAGCTCCTTCTCCTGTACTGTCTGATGATGAAGATACATGGTGGGCGAAGAAGGGTCTAAAATCCTCAGAGCCTCTCAAAGTTGATCAACCACTTAAACCTATCAAGCAGGTTACTAAGACTCGGCAGAAGACTGTTCGTAAAACCCAAAGTCTTGCTCAACTGGCAGCTTCTAGAATTGAGGGTAGCCAAGGGGCTTCAACAAGTCATATGTGTGACAATAAGGTTAGCTGCCCTCACCATAGAACTGCTATGAATGGAGATACAGCAAGATGTGTTGATGGAATTCAATCTATTGAATGTGAAGATATTGTCTCAATTGGAAAGGCTCTAAAACAGCTGCGCTTTGTTGAAAGAAAGGAAATAACACTTTGGCTGTTGACTGTAATTAGGCAGCTTATTGAAGAGTCTGAAAAAGTTGTTGGTAAAGTTAGCCAGTTTGGCAGGCCTTTTGCCACTGTGGATGATAAAAGTTCAATACGGTGGAAACTTGGCGAGGATGAACTTTCTGCTTTACTTTATCTGATGGATGTGTCAGATGATTTAGTCTCAGCTGTCAAATTCCTCTTATGGTTGCTGCCAAAGGTTTATAGTAGCCCCAGTACTACTATTCATAGTGGAAGGAGTGTTTTAATGCTGCCAAGGAATGTGGAGAACCAAGCTTGTGATGTTAGTGAGGCTTATCTGTTATCATCCTTAAGAAGGTATGAGAACATTCTTGCTGCAGCAGATCTTATTCCTGAAGCTCTGTCATCCATAATGCATCGTGCTGCAGCTATTATGGCATCTAATGGAAGGGTTTCAGGTTCAGGTGCCCTAGCTTTTGGTCGTCATTTGTTAAAAAAATATGGCAATGTGGTGAGTGTCAGTGAGTGGGAGAAAAATTTCAGGAGTACATGTGATAAGAGACTTGCTTCTGAAATTGAGTCTGGACGGTCAGTTGATGGAGAGTTAGGGCTTCCACTTGGTGTTCCTGCTGGAGTTGAGGACCCTGATGACTTTTTCCGTCAAAAGATAAGTGGTGGCCGGTTACCATCCAGAGTAGGTTCAGGAATGAGAGATGTTGTGCAGCGTAATGTGGAAGAAGCATTTCACTATCTTTTTGGTAAAGACAGGAAGCTATTTGCTGCTGGTACACCCAGAGGTCCTGCTTTTGAAAAATGGGATAATGGGTATCAAATTGCTCAACAAATAGTTGTGGGTCTGATAGATTGCATACGGCAGACTGGTGGTGCTGCTCAAGAAGGGGATCCATCTTTGGTTACTTCTGCTGTATCTGCCATTGTTGGCAGTGTTGGTCCTACTTTGGCAAAATTGCCAGATTTTTCAGCTGGAAGTAACCATTCAACTATGTCATTGGCTACAAGCTCTTTGAACTATGCTAAATGCATTTTGCGAATGCATATAACTTGTTTGTGCTTGCTTAAGGAAGCCTTAGGAGAACGCCAAAGCCGTGTATTTGAGATTGCTCTTGCAATGGAGGCCTCTACTGCTCTTGCTGGAGTTTTTGCTCCAAGTAAAGCATCTCGAGCTCAGTTTCAAATGTCACCTGAAACCCATGATACTGGTACTATTCCAGGTGATGTTTCAAACAACAGTAGTAAAATTGTGGTTGCAAGAACAACAAAAATTAGTGCTGCTGTTTCTGCCCTTGTTGTTGGTGCAATTATATCTGGTGTTATGAGCCTGGAAAGAATGGTAACCATTCTCAGATTAAAGGAGGGCCTGGATGTTGTACAATTTGTAAGAAGCTCAAGATCCAATTCAAATGGGAGTGTACGTACAGTTGGGGCTTTTAAGGTGGATAGTTCAGTTGAAGTTCATGTCCATTGGTTTAGATTGCTTGTTGGAAACTGTAGAACCATCTGTGAAGGCTTAGTGGTTGATCTCTTGGATGAACCGTCCATTGTTGCTCTTTCAAGGATGCAGCGGATGCTTTCTCTATCATTGGTCTTTCCACCTGCCTATTCAATATTTTCTTTTGTTATGTGGCGGCCTTTTGTTATGAATGCCAATGTAGCAGTTCGTGAAGATATGAATCAACTTTACCAGTCTTTAACAATGGCCATAAGTGATGCACTAAAACATTTGCCGTTCCGAGATGTATGCTTAAGAGATTGTCAGGGTCTTTATGATCTTATGGCTGGAAATACGACTGATGCAGAGTTTGCAACCCTGCTAGAGTTGAATGGCTCTGATATCCATTCGAAATCTGTGGCATTTATTCCCCTCCGTGCTAGACATTTTCTAAATGCCATGATTGATTGTAAGATGCCTCAGTCTGTTTATACAAAGGATGAAGGAAGCAGGAATTCTGGACATGGTGAATCTAAAATTGATTTTACTGATAGTGAATCTACACTACAGGATAAGCTTGTGAATGTGTTAGATGCTTTGCAGCCTGCCAAGTTTCACTGGCAATGGGTTGAACTAAGGCTGCTTTTAAATGAACAAGCCCTCATTGAGAAAATGAAGATGCATGATATATCTTTAGCTGATGCTATACAGTTGTCCTCACCTAGTTTAGAGAAGAGTGGTGCTTCTGAGAATGAGAACAATTTTATTGAAATAATTCTGACAAGGTTACTGGTTAGACCTGATGCTGCACCCCTTTTCTCGGAGGTGGTTCATCTTTTTGGGAAGTCACTAGAGGATTCAATGTTGTTACAGGCTAAATGGTTCCTTGCAGGTCAAGATGTCCTCTTTGGTCGGAAGACTATTAGGCAACGACTGATTAACATTGCAGAGTCTAAAAGATTTTCTGTTAAGACACAGTTTTCCGAACCCTGGGGTTGGTGCAGCCCATGTAAAGTTCCAGTTACTCTCAAGGGGAATAAAAAGAAAGTTGATTCTATGCCTCTTGAAGAAGGAGAAGTTGTTGAAGAGGGAATGGATGTGAAAAGGTCCATAAAAGGGTTCTACCCAATGTTTGAATCTGAAAGCTCTACCAGTAAGCAGCAGCATGGGACTGAGAGGGCACTTCTTGAGTTAATTCTTCCTTGCATAGATCAAAGCTCTGATGAATCTCGTAATTCCTTTGCAAGTGATTTGATTAAACAATTAAATTATATCGAGCAACAGATAGCTGTAGTTACCCGAGGACCAACTAAGCCAGTAAATACTCCTGTAACTGAAGGTCAGACAAACAAAGTAAATAGCCGCAAAACTATAAGAAGTGGCAGCCCTGGTTTAGCCAGACGACCAACACCTGCTCCGGATTCTTCTCCACTTTCTCCTGCTGCTTTGCGAGCATCAATATCTTTACGTGTGCAGTTACTCATGAGATTTCTTCCTATTATTTGCACAGATGGGGAGTCTTCTGTACGGAGTATGAGATACACGCTTGCATCTGTACTTCTTCGTCTCCTTGGCAGCCGGGTTGTGCATGAGGATGCAATGGTGAATGCCATGCAATATTCTCCATTGAGAAAGGAGGCGGAGTCACCTGCTGAGGCTGCTTTTGTAGATTCTTCTGTTGAATGCCTGTTTGATCGTCTCTTGTTGATCTTGCATGGATTGTTGAGTAGTTCTCTTCCAAGTTGGCTTAGGTCGAAACATGTTACAAAGACAGCTAATGAACCTGCAAGGGAATTTTCTGGATTTGACCGTGAGCCCTTGGAGGCATTGCAGAATCACCTTGATAACATGCAACTGCCAGACACTATCCGGTGGCGTATCCAAGCTGCAATGCCTGTACTTCCTCCCTCTATACGGTGCACTTTCTCATGCCAGCTGCCAACAGTTCCAACTTCTGCTCTTGCATCTCTTCAACCCAACACTACAAATTCTTGGTTTAACTCCAGCAGTTCAACTGTCCCTCAGAGGAACCTGGTTCCTTCATCAAGGACTACATCATCGGGGAAGTCAAAGCAGCAGGACAATGATTTGGACATTGACCCTTGGATGCTTTTAGAAGATGGGGCTGGATCTTGCCCATCTGCAAATAATACTAATATCATAGGAAGTGGTGATCGAGTTAATATTCGTGCTGCCAGCTGGCTTAAAGGGGCAGTAAGAGTGCGGAGAACAGACCTTACATATGTTGGCGCTGTGGATGAGGATAGTTGA
Protein Sequence
- >PHAVU_008G142400g
NSRLGPPDYHPQTPNCPEETLTREYLQSGYRDTVEGLEESREISLTQVPNFNKAIVLNCKEAIKKRLRAINESRVQKRKAGQVYGVALSGSQLAKPGVFPEQRPCSEDIRKKWIEGLSQQHKRLRSLADLVPHVRRKSLLEVLIRNNVPLLRATWFIKVNYLNLVRPGSASIPSGTGDKTQLTCSELWTKDVIEYLQTLLDEFFSKNTSHFTPHNRDRSPQVPYTASHQHRSDQLSVSDGEEPSLHFRWWYIVRLLQWHHAEGLLIPSLIIDWVLRQLQEKQLLEIWQLLLPIVYGFLEIVVLSQTYVRTLAGVALRVIRDPAPGGSDLVENSRRAYTTSALIEMLRFLILGAPETFVALDCFPLPSSILSYTINDGNFILKATEAAGKIKNSSEDVVCLFKSKGFDAQYQSLAFDHVISCIQERVQDLTKAVKPGYPGQYLAKAAQALDKSLVLGDLHGAYTFLFEDLCDETVSEGWVVKVSHCLRLSLKWFRTVNTSLIYSVFFLCEWATCDFRDFRTAPCDVKFTGRKDLSQVHIAIRLLKMKLRDMEVSPRQKSGNTRGRGVSYLGKCSGQQSNRNIVKNVSKTKSSSRSMDQNICSSAIFESPGPLHDIIVCWIDQHMVHKGGGLKRLHLLVVELIRAGIFYPLAYVRQLIVSGIMDMNVIDLEKQKRHCRILKQLPEKFVRDALVESGVNAGPQLTEALQIYLNERRLILRCSLWENHGNASNVNISSLKQNQCISSTKDRASTVSTDQWKSVLSSKTASKNGKDDNGVEDLKTFISALLQLPKSLSNLSSTGTDESQGNVRKPIGSQSKIDLVETTPGCEECRKSKRQKLSAERSLFVQAPSPVLSDDEDTWWAKKGLKSSEPLKVDQPLKPIKQVTKTRQKTVRKTQSLAQLAASRIEGSQGASTSHMCDNKVSCPHHRTAMNGDTARCVDGIQSIECEDIVSIGKALKQLRFVERKEITLWLLTVIRQLIEESEKVVGKVSQFGRPFATVDDKSSIRWKLGEDELSALLYLMDVSDDLVSAVKFLLWLLPKVYSSPSTTIHSGRSVLMLPRNVENQACDVSEAYLLSSLRRYENILAAADLIPEALSSIMHRAAAIMASNGRVSGSGALAFGRHLLKKYGNVVSVSEWEKNFRSTCDKRLASEIESGRSVDGELGLPLGVPAGVEDPDDFFRQKISGGRLPSRVGSGMRDVVQRNVEEAFHYLFGKDRKLFAAGTPRGPAFEKWDNGYQIAQQIVVGLIDCIRQTGGAAQEGDPSLVTSAVSAIVGSVGPTLAKLPDFSAGSNHSTMSLATSSLNYAKCILRMHITCLCLLKEALGERQSRVFEIALAMEASTALAGVFAPSKASRAQFQMSPETHDTGTIPGDVSNNSSKIVVARTTKISAAVSALVVGAIISGVMSLERMVTILRLKEGLDVVQFVRSSRSNSNGSVRTVGAFKVDSSVEVHVHWFRLLVGNCRTICEGLVVDLLDEPSIVALSRMQRMLSLSLVFPPAYSIFSFVMWRPFVMNANVAVREDMNQLYQSLTMAISDALKHLPFRDVCLRDCQGLYDLMAGNTTDAEFATLLELNGSDIHSKSVAFIPLRARHFLNAMIDCKMPQSVYTKDEGSRNSGHGESKIDFTDSESTLQDKLVNVLDALQPAKFHWQWVELRLLLNEQALIEKMKMHDISLADAIQLSSPSLEKSGASENENNFIEIILTRLLVRPDAAPLFSEVVHLFGKSLEDSMLLQAKWFLAGQDVLFGRKTIRQRLINIAESKRFSVKTQFSEPWGWCSPCKVPVTLKGNKKKVDSMPLEEGEVVEEGMDVKRSIKGFYPMFESESSTSKQQHGTERALLELILPCIDQSSDESRNSFASDLIKQLNYIEQQIAVVTRGPTKPVNTPVTEGQTNKVNSRKTIRSGSPGLARRPTPAPDSSPLSPAALRASISLRVQLLMRFLPIICTDGESSVRSMRYTLASVLLRLLGSRVVHEDAMVNAMQYSPLRKEAESPAEAAFVDSSVECLFDRLLLILHGLLSSSLPSWLRSKHVTKTANEPAREFSGFDREPLEALQNHLDNMQLPDTIRWRIQAAMPVLPPSIRCTFSCQLPTVPTSALASLQPNTTNSWFNSSSSTVPQRNLVPSSRTTSSGKSKQQDNDLDIDPWMLLEDGAGSCPSANNTNIIGSGDRVNIRAASWLKGAVRVRRTDLTYVGAVDEDS