Gene Details:
- Gene ID: Jr01_34220
- Suggest Gene Name: PHYTOCHROME C
- Description: putative flowering gene
- Species: Juglans regia
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Encodes the apoprotein of phytochrome;one of a family of photoreceptors that modulate plant growth and development.;Encodes photoreceptor phytochrome C
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT5G35840
- Oryza sativa — LOC_Os03g54084
Sequences:
CDS Sequence
- >Jr01_34220
ATGTCATCATATTCGACAAACAAGACGAATTGCTCTAGGAGCAGCTCTGATCGATCAAAACGTGGGGCTCGTGTGGTTGCGCAGACCCCCATCGATGCGAAGCTTCATGTAGACTTTGAAGAGTCTGAACGGTTCTTTGATTACTCAACTTCAATTGACGTCAACATCTCAAGTTCCACTAGCAATGTCCCTTCCTCTACTGTGTCAGCTTACCTGCAAAGGATGCAGAGAGGAAGCCTTATTCAACCGTTCGGTTGCTTGATTGCTGTGGACGAGCAAAACTTCACGGTTCTTGCCTACAGCGAAAATGCCCCTGAAATGTTGGACTTGGCTCCACATGCTGTTCCAAGCATTGAACAGCAAGAAGCCCTAGCTTTTGGAACAGATGTTCGAACACTCTTTCGGTCGTCGGGTGCCACTGCTTTGCAGAAGGCAGCTAATTTTGGGGACGTAAATCTTCTCAACCCCATATTGGTTCATTGTAAAACCTCAGGTAAGCCCTTTTACGCGATTCTGCACCGAATTGATGTGGGGTTAGTTATAGATTTAGAACCAGTGAATCCAGCTGATGTGCCAGTGACTGCTGCTGGGGCCTTGAAATCTTATAAGCTAGCAGCCAAAGCCATATCGAGATTGCAGTCCTTGCCAAGTGGGAATATATCACTGATATGTGATGTTTTAGTCAAGGAAGTTAGTGACTTGACAGGTTATGATCGTGTAATGGTGTATAAATTTCATGAAGATGACCATGGAGAAGCGGTAGCTGAGTCCCGCAGACCTGATCTGGAACCTTATCTTGGTTTGCATTACCCGGCTACCGATATACCACAAGCTTCAAGATTCCTATTCATGAAGAACAAGATTAGAATGATATGCGATTGTTTGGTGCCTCCAGTTAAAGTAATTCAAGACAAGAGATTGTCTCAGCCACTGAGCCTTTCTGGATCTACGCTGAGATCTCCTCATGGTTGTCACGCACAGTATATGGCAAATATGGGTTCAATTGCATCTCTTGTGATGTCTGTGACTATCAATGAAGATGATGGAGAGCTGGAGAATGATCAGCAGAAGGGAAGAAAATTGTGGGGTTTGGTTGTTTGCCATCACGCAAGTCCTAGGTTTGTTCCATTTCCTTTGAGGTATGCCTGTGAGTTCTTGATTCAAGTGTTAGGTGTGCAGATCAACAAAGAAGTGGAGTTGGCTGCTCAACTAAGGGAGAAGCATATTTTGCAAACTCAAACTGTTCTTTGTGATATGCTCCTTAGAGATGCTCCTGTAGGTATTGTTACTCAATCACCTAATGTTATGGATCTTGTTAAGTGTGATGGAGCTGCACTATACTACAGGAAGAAATTTTGGTTGCTTGGAGTCACCCCAATTGAGGCACAGATTACAGATATAGCTGAATGGCTTCTTGAGTGCCATGATGGTAGCACGGGTTTAAGTACCGATAGCCTTATGGAGGCTGGCTACCCAGGTGCCTCAGGTCTTGGAGATGAAGTCTGCGGGATGGCAGCCGTTAGGATTACTTCAAGGGATTTCCTGTTTTGGTTCAGGTCTCACACCGCAAAAGAAATCAAGTGGGGTGGTGCAAAACATGACCCTGATGACAAGGACAATGGAAGAAAGATGCATCCCAGGTCATCCTTCAAGGCTTTTCTGGAGGTGGTTAAGCGACGGAGTGTCCCTTGGGAAGATGTGGAAATGGATGCCATCCATTCCTTACAGCTGATATTGAGAGGGTCTTTGCAAGATGAGATTGTGGATGAGTCCAAAATGATCGTGAATGTTTCATCAGTTGATGACAGGATACAGAGAGTGGATGAATTACGCATCATCACAAATGAAATGGTGCGCCTTATAGAGACAGCTGCAGTCCCCATTTTGGCTGTCGATGCCTCTGGTTGTATAACTGGGTGGAATACCAAAGCTGCTGAACTAACAGGCCTGTCTGTTGAGCAAGCCATCGGTATGACCTTGATTGACGTTGTCTGGGAAGATTCAGTTAAAGTGGTGAAGAATCTGCTCATCTTGGCATCTCAAGGTATAGAAGAGAAAAATATTGAAATCAAACTTAAAACATTTGGTCCTCAGGAAAACAGTGGTCCTGTAATCTTGGTAGTTAATGCATGTTGCAGCCGAGACACAAAAGAAAACTTTGTTGGGGTTTGCTTTGTTGGCCAAGATGTCACTGGACAAAAAGTAATTTGGGACAAATATACTCGTATCCAAGATGATTATGTTGGAATTATGCGGAGCCCTTCTGCACTTATTCCTCCAATTTTTATGGCCGATGAGCATGGCCGATGCTTGGAATGGAATGATCCAATGCAAAAAGTGTCTGGTTTGAAGAGGGAAGAGGCCACTTCCCGGATGCTTCTTGGGGAGGTCTTCACGGTAAATAGTTTTGGCTGTCGGGTTAAAGATCATGATACATTAACCAAGCTTAGGATACTACTTAATGGGGTAATTGCAGGCCAGGAGGTAGATAAGTTGTTGTTTGGATTCTTTGATCAGCAGGGTAATTATATTGAAGCATTACTTTCAGCGAACAAAAGGACTGATGCAGAGGGAAGGATTACTGGGGTTTTGTGCTTTTTGCATGTGTCAAGTCCAGAACTTCAGTATGCTATGCAGGTGCAGAGGATATCCGAACAGGCTGCAGCTGATAACATCAAGAAATTGGCATATATTCGTCGAGAAATCAGTAAGCCACTGAATGGGATTATGTTTATGCAGAATCTAATGGGATCTTCTGATTTAAGCAAAGAGCAGAAGCAGCTACTTAAGACAAGCTCATTGTGTCAGGAACAATTAGCTAAGGTTGTTGATGACACTGATATTGAAAGTATCGAGGAATGTTACATGGTAATGAGCTCTGGTGAATTTAACCTTGGTGAAGCTCTTGAAGCTGTCATAAACCAAGTTATGATCTTGTGTCGGGAGCGCCAGGTGCAGGTCATCCATGATTTACCTGCTGAAGTATCATCGATGCACTTATATGGAGACAACTTGAGGCTTCAGCAGGTTCTTTCACAGTTTATGACTAATGCACTCCTCTTCACCCCTGCCTTTGAAGGATCACTTATTGCCTTCAGGGTGAATCCAAAAAAGGAACGTATAGGGATGAAAATACACATCGTCCATCTTGAATTTAGGATCACCCAACCAGCACCTGGTGTACCAGAAAATCTGATTCAAGAGATGTTTCACCACAATCCCCGTGTCTCAAGGGAAGGTCTCAGCCTATACATTAGCCAGAAGCTTGTGAAGATTATGAATGGCACTGTACAGTATCTAAGAGAAGCAGACAAATCATCCTTTATAATTCTTATAGAATTTCCATTGGTATGTCACACTGACCAATGA
Protein Sequence
- >Jr01_34220
MSSYSTNKTNCSRSSSDRSKRGARVVAQTPIDAKLHVDFEESERFFDYSTSIDVNISSSTSNVPSSTVSAYLQRMQRGSLIQPFGCLIAVDEQNFTVLAYSENAPEMLDLAPHAVPSIEQQEALAFGTDVRTLFRSSGATALQKAANFGDVNLLNPILVHCKTSGKPFYAILHRIDVGLVIDLEPVNPADVPVTAAGALKSYKLAAKAISRLQSLPSGNISLICDVLVKEVSDLTGYDRVMVYKFHEDDHGEAVAESRRPDLEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMKNKIRMICDCLVPPVKVIQDKRLSQPLSLSGSTLRSPHGCHAQYMANMGSIASLVMSVTINEDDGELENDQQKGRKLWGLVVCHHASPRFVPFPLRYACEFLIQVLGVQINKEVELAAQLREKHILQTQTVLCDMLLRDAPVGIVTQSPNVMDLVKCDGAALYYRKKFWLLGVTPIEAQITDIAEWLLECHDGSTGLSTDSLMEAGYPGASGLGDEVCGMAAVRITSRDFLFWFRSHTAKEIKWGGAKHDPDDKDNGRKMHPRSSFKAFLEVVKRRSVPWEDVEMDAIHSLQLILRGSLQDEIVDESKMIVNVSSVDDRIQRVDELRIITNEMVRLIETAAVPILAVDASGCITGWNTKAAELTGLSVEQAIGMTLIDVVWEDSVKVVKNLLILASQGIEEKNIEIKLKTFGPQENSGPVILVVNACCSRDTKENFVGVCFVGQDVTGQKVIWDKYTRIQDDYVGIMRSPSALIPPIFMADEHGRCLEWNDPMQKVSGLKREEATSRMLLGEVFTVNSFGCRVKDHDTLTKLRILLNGVIAGQEVDKLLFGFFDQQGNYIEALLSANKRTDAEGRITGVLCFLHVSSPELQYAMQVQRISEQAAADNIKKLAYIRREISKPLNGIMFMQNLMGSSDLSKEQKQLLKTSSLCQEQLAKVVDDTDIESIEECYMVMSSGEFNLGEALEAVINQVMILCRERQVQVIHDLPAEVSSMHLYGDNLRLQQVLSQFMTNALLFTPAFEGSLIAFRVNPKKERIGMKIHIVHLEFRITQPAPGVPENLIQEMFHHNPRVSREGLSLYISQKLVKIMNGTVQYLREADKSSFIILIEFPLVCHTDQ