Information report for Gohir.D12G111900
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes the Arabidopsis homolog of the transcriptional regulator MED12, is dynamically expressed during embryogenesis and regulates both developmental timing and the radial pattern formation. Involved in flowering time. The mutant enhances the expression of the flowering time (FT) gene. A knockout mutant of this gene showed late-flowering phenotype.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc20206
- Glycine max: Glyma.18G232900, Glyma.09G259400
- Juglans regia: Jr07_06650, Jr07_06640, Jr12_03720
- Manihot esculenta: MANES_05G034300
- Populus trichocarpa: POPTR_014G084500v3, POPTR_002G159900v3
- Prunus avium: Pav_sc0000102.1_g390.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_2G170500
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr1g0355261
- Vitis vinifera: VIT_15s0046g02510
Gene Resources
- Pfam: PF09497
- UniProt: A0A1U8N088
- RefSeq: XP_016732460.1 , XP_016732461.1 , XP_016732462.1
- KEGG: ghi:107943228
- InterPro: IPR019035
- PANTHER: PTHR46567 , PTHR46567:SF1
- OrthoDB: A0A1U8N088
- STRING: 3635.A0A1U8N088
Sequences
CDS Sequence
- >Gohir.D12G111900
ATGCATAATGCAGCGTCTTTGCAGCATAGGAGTGCCCCAGCATCAGCAACCCTTGATGGTGAGGAGCCGTCTCTTCAATTCAAATGGTTGTATGTGGTGCGACTCTTGCAATGGCATCATGCAGAAGGGCTGGTTCTTCCCTCTCTTATCATTGATTGGGTTCTGAATCAACTGCAGGAAAAGGAATTGCTTGAGATTCTGCAGTTGCTATTGCCAATTGTTTATGGAGTTTTAGAAACAGTTATTTTATGTCAGACATATGTACGTAATCTTGTGGCTATAGCTATTCGCTTTATCCGTGAGCCTTCACCTGGTGGAGCTGATTTGGTTGATAATTCCCGGAGAGCGTATACAGTATCTGCACTGGTTGAGATGCTTCGCTATTTGATACAGGCTGTGCCAGATACATTTGTTGCTTTAGATTGCTTTCCTTTACCAACTTGTGTAGTTTCACATGCATTTAGTGATGGTGGTTTTTTGTCGAAGTCATCAGATGATGCAGGGAAAATAAAAAGCAATTCAGCAGATGCTTATGTTGTCAAAGTTAAAGGGTTTGATTCCCAATACCAGTCCTTGTCATTCGATCATGTTGTTTCCACCATCCACAAGTGTGCTGATAATCTTGCTAAAGGTGCAAGTGCTGGATATCCTAGCCAAAGTATGGCAAAAGCTGTGCAGACTCTGGACAAAGCTCTTTTGCATGGAGATCTAATAGAGGCTTATAAACATATCTTTGATGATCTTTGTGATGGAGCAGTTGGCGAAGGTTGGGTTGCTGAGGTCAGCCCATGCTTAAGATCATCACTAAAATGGCTTCAAACTGTGAATTTGTCATTGATTTGCTCAGTTTTTTTCCTCTGTGAGTGGGCAACATGTGATTTCCGAGACTTCCGGACTGCTCCTCCCCATAACTTGAAGTTCACTGGTAGGAAAGATTTTTCACAAATATATCTTGCAATTCATCTTCTAAAGCTGAAGAGGGAAGAGTGGCAGAACCCAGAATACAAGAGGGGAAGAGCTTCTGGACTTTACAGCACTGCAAAGAATACCAGTTATCAGAATAACTATTCCAGGAGGAATTTGTTGGGAAATATATATGAAGCTAAAAGCAATGGAAAATATGTTAATGGAAGAAGTAGTAGTTCTTCAGATATATTTGACAGCCCTGGTCCCCTGCATGATATTATCGTGTGCTGGATCGATCAGCATGAAGGGCTTAAAGGAGAAGGTGGCAAGCGTCTTCAGCTTTTGATACTGGAACTCATACGATCTGGAATCTTTTATCCTCAGGCATATGTGAGACAGCTTATAGTTAGTGGGATTATCGATATATCCCGACCTATGGCTGACCTGGACAGAAGGAAGAGACACCATCGAATCTTGAAGCAGCTACCTGGGCAGTATATGCTAGATATTTTGGAAGAAGCAAGAATTGCTAAGGGCTCAGAATTGCTTGAGGCTGTAAATGTTTACTCAAATGAACGTCGTCTTGCCCTTCACAATCTTCTTTTTGATCAACATAATTGTGCAAACACTTCTCATGTATCAACTAATGACAAAAAGTCTCATTCTACCTCAGGAAGGGATGGTGCTTTCCAAGTTTCTGGTGATCAGTGGAAAACTCTTCAGTCTTCAAAGACTTTCAGGAGAGATGTGGACCTTGAAGGACTGAAGGCTTCCATTTCAGTATTGTTGCAATTTCCTAGCTTATCTTCTACATCTGCAGATAGTGGAGTTGAAGAGTCTCAAGGGAGTTCCAAAAGGTCTGTTGGGTCAACATGCAACAAGCCGGACATGTTTGAAGGTGCCCCTGGGTATGAAGACCGTAAAAGGGTAAAAAGACAGAAATTAAGTGAAGATAAGAGTTTATATCTTCAAGCACCTTCACCAATTCCATCAGATGATGAAGATACTTGGTGGATGAGGAAGGGGCAGAAAAACATAGAATCTTTCAAATCTGATCCTCCGCATAAATCAACAAAGCAAGTTTCTCGTGGTAGACAAAAGACTGTGCGTAAAACTCAGAGTCTTGCTCAATTAGCAGCTGCTAGAATTGAGGGTAGCCAGGGAGCATCTACAAGTCACATTTGTGATAATAAGATAAACTGCTCACATCATAGAACTGAGGTAGAAACTTTAAAGCCAGTGGATGGAATCAGAACAACCCATTTTGGAGATATTGTTTCGATTGAAAAGGGTTTAAAGCAGCTTCGCTTTGTGGAGAAGAGGATTGTCATGGTTTGGTTGATATCTGTAGTCAAGCAGCTTGTTGAAGAGTCGGAGAAATCTGTGGCCAAGGCTGGCCAGTACGGCAGGCCCTTCATTGCAGCTGATGAGAAGAGTCCTTTGAGATGGAAGCTTGGTGAGGATGAACTATCAGTTATACTGCATCTAATGGATGTTTCCTGTGATTCAGTTTCAGCGATCAAATTTCTCCTTTGGCTGTTGCCAATAGTTAGCAGTAATCCTGGTCCTACTGTTCATAGTGGGAGAAACAGTCTAAGGGTGCCCAGGAATGTAGATAATTGTGCATGTGCAGTGGGGGAGGCATATCTTTTATCATCTCTTCGAAGGTATGAGAATATACTTATTGCTGCAGATCTTGTTCCTGAAGCTTTGTCAGCTATAATGCTTCGTGCTGCTGCAATTATGGCCACTAATGGAAGAGTTACAGGTTCGGGAACCCTAGTGTTTGCTTGGTATTTGTTGAAGAAGTATGGCAAAGTTGCCAGTGTAATTGAATGGGAGAAGAAATACAAAGGTGCTTGTGACAAGAGACTTTTCTCTGAACTTGAATCTGGACAACAAGAGGGAGATTTTGGGTTTCCATTTGGAGTTCCAGGAGGTATTGAAGATCCTGATGATTATTTCCGTAAAAAGATAACTGGTGGACGTTTTTTGAGAGTGGGTTTAAGCATGAGAGATATGGTTCAGCGTCATGTTGATGATGTCTTGCACTCTATCTTAGGTAAAGAGAGAAAACTTGTTGCAGCCGGTGCACCAAAAACTCCTGCCGTTGAAAAAGGGGGTGATGGTTATCAAGTTGCTCAACAAATCATAATGGGACTAATGGACTGCATTAGACAGACTGGCGGTGCTGCTCAAGAAGGGGACCCAGGTTTGGTGTCTTCTGCTGTTTCTGCCATTGTTGGCAATGTAGGATCAACACTAGCAAAGATACCTGATTTTACTGGTGGCAGCAATTATTCAAATTATCAACCCTCTATAAGTTCCTTGAGTTTTGCAAAGCGTATCTTGCGCATTCATTTAATATGCCTATGCCTGCTAAAGGAAGCCCTTGGAGAACGCCAAAGCCGGGCATTTGAGGTAGCTCTTGGAACAGAGGCCTCTTCTGCTTTAGCAGTAGCATTTGCTCCTGCAAAGTCCTCTCGTGGTCAGTTTAAGTTGTCTCCTGATGCTCCTGAGTCTAGTGCGAACATATCTGGTGACAATTTGAACAGTTCTGCCAAATCGACTCTAGGGAGAACAACCAAAATGTCAGCTGCTATTTCTGCTCTTCTTTTGGGGGCTGTTGTTCATGGGGTCATTAGCTTGGAGAGAATGGTAACAGTCTTAAGATTAAAGGAAGGTTTGGATGTTGTTCAGTTTGTAAGGAGCACAAAAACCAGTTCTAATGGTAATGCCCGATCTGTTGGTGCTTTTAAGTTGGACAACTCATTTGAAATTTATGTGCACTGGTTTCGGCTGTTTGTTGGGAACTGCAGAACTGTTTGTGATGGGCTAGTTTTGGAACTCTTGGGTGAACAACCTATTGTAGCTCTTTCTAGGATGCAGAGACTGCTTCCAATTAATTTGGTCTTTCCGCCAGCTTATGCAATATTTGCGTTTGTTATATGGAAACCATTCATTTTGAGTAGTAACATTGCAAGTCGTGAAGATATTCATCAATTGTATCAGTCTTTAACAATGGCCATCGGTGATGCTGTGAAACACATACCTTTTCGTGATGTTTGTATGAGGGATACCCGTGGTTTTTATGATATTATAGCTGCAGATACCACTGATTCTGAGTTCGCAGCCTTGCTAGAGTTGAATGGTTTGGACACGCACTTGAAATCCATGGCCTTTATCCCTCTTCGTGCAAGGCTTTTTCTAAATGCTATAATTGATTGTAAGATGCCTTATTCTGCTTTTACACATGATGAGGGGAATTGGGTTTCTGGACATGGCGAGTCTAAAGCTCTGCGTGGAGAGAATGATTCAAAGCAAGGTAAGCTTATTCGTGCATTGGATGCTTTGCAACCAGCTAAGTTTCATTGGCAGTGGGTTGAATTAAGGCTTCTTTTAAATGAACAAGCACTCATTGATAAGATGGAGAATCATGACATGTCCTTGGTGGATGCACTTCGCTCTTCCTCACCCAGTTCTGAAAGAGCTTCTCCTTCTGAGAATGAGAAAGTTTTCATTGAGATCATCCTCACCAGATTGTTGGTCAGACCTGATGCTGCTCCTCTTTTCTCAGAGGTGGTTCATCTTTTTGGAAGGTCATTAGAAGATTCATTGCTGATGCAGGCTAAATGGTTCTTAGGAGGCATGGATGTTCTTTTGGGACGGAAAACTGTTAGGCAACGGCTCATTAATATTGCTGAAACTAAGAACCTTTCTACTAAGACCCAGTTTTGGAAGCCTTGGGGATGGTCTTATTCTGGTGGTGATCCTGTGACAAATAGGGGAGAGAAGAAGAACGAAGCCACCTTTCTTGAGGAAGGTGAAGTCATTGAGGAGGCAGTGGAGTCAAAAAAGTGTGCGAAAGGTTCTCAAATCGATGTTGAAGGTTCCAATATCAGCCAGCAGCATGTAACAGAGAAGGCATTTATTAAATTGATTCTTCCTTGCATAGACCAAAGCTCTGCCGACTCGCGCAATACCTTTGCAAATGATTTGATAAAGCAGTTTAGCACTATTGAGCAGCAAGTAAAGTTGGTTACTCGTGGCATAAGCAAGCAGACTGGAACTGCCTCTTCAATTGAAGTTTCTACTAATAAAAGCAACAGTCGGAAAAGTATAAGAGGTGCTAGTCCTGGATTGGCTAGACGAACAATGGCTCCTGCAGAGTCTGTACCTCCTTCTCCTGCAGCTTTGCGAGCTTCTATGTCATTAAGGTTGCAGTTTATTGTGAGATTACTGCCGATCATATGTGCAGATGGGGAACCATCATCAAGAAACATGAGGCACATGCTTGCCTCTGTAATACTTCGATTGCTTGGAAGTAGGGTTGTGCATGAGGATGTGGACCTATCTTTTAATTTCAAACAGTTGAAGAGGGACGCGGAGCTGGTGTCTTCTATTGCATCCTCAGAGATTTATAGAGATAGTCTTTTTGATCGCTTATTGTTAGTTCTACATGGGTTGTTAAGCAGTTGCCAGCCAAGTTGGCTAAGGTCAAAGACTGCCAATGATTTTTCTGGATTTGATCATGAGGCATTGGAGAGTTTCCAGAATGAATTAGATTCCATGCAACTACCTGAGATCATTAGATGGCGTATTCAGGCAGCGATGCCAATATTATTTCCTTCTTTCCGCAATGTGATCTCCTGCCACACACCTTCGGTCCCAGTCGGTGCTCTTAGTGCACTTCAATCCAGCATCTACATCCCTGAATCTTGCAATGGTACCTTAAATGCACCTCAGAGACAGGTTGCATCGGCACGAACTGCAAATAACATACCGGGAAAAGCCAAGTCAATGCCTTCACTACAGGAGTACGATATGGAAATCGACCCATGGACACTTTTGGAAGATGGAGCAGGTTCAAGTCTATCTTCAAGTGGCACTATTGTCATTGGTGGCAGCGACCGTGCTAATCTTCGAGCCTCCAGTTGGCTTAAGGGGGCTGTAAGAGTGAGGCGAGCGGACCTGACATATACCGGTGCAGTGGATGATGGCAGTTGA
Protein Sequence
- >Gohir.D12G111900
MHNAASLQHRSAPASATLDGEEPSLQFKWLYVVRLLQWHHAEGLVLPSLIIDWVLNQLQEKELLEILQLLLPIVYGVLETVILCQTYVRNLVAIAIRFIREPSPGGADLVDNSRRAYTVSALVEMLRYLIQAVPDTFVALDCFPLPTCVVSHAFSDGGFLSKSSDDAGKIKSNSADAYVVKVKGFDSQYQSLSFDHVVSTIHKCADNLAKGASAGYPSQSMAKAVQTLDKALLHGDLIEAYKHIFDDLCDGAVGEGWVAEVSPCLRSSLKWLQTVNLSLICSVFFLCEWATCDFRDFRTAPPHNLKFTGRKDFSQIYLAIHLLKLKREEWQNPEYKRGRASGLYSTAKNTSYQNNYSRRNLLGNIYEAKSNGKYVNGRSSSSSDIFDSPGPLHDIIVCWIDQHEGLKGEGGKRLQLLILELIRSGIFYPQAYVRQLIVSGIIDISRPMADLDRRKRHHRILKQLPGQYMLDILEEARIAKGSELLEAVNVYSNERRLALHNLLFDQHNCANTSHVSTNDKKSHSTSGRDGAFQVSGDQWKTLQSSKTFRRDVDLEGLKASISVLLQFPSLSSTSADSGVEESQGSSKRSVGSTCNKPDMFEGAPGYEDRKRVKRQKLSEDKSLYLQAPSPIPSDDEDTWWMRKGQKNIESFKSDPPHKSTKQVSRGRQKTVRKTQSLAQLAAARIEGSQGASTSHICDNKINCSHHRTEVETLKPVDGIRTTHFGDIVSIEKGLKQLRFVEKRIVMVWLISVVKQLVEESEKSVAKAGQYGRPFIAADEKSPLRWKLGEDELSVILHLMDVSCDSVSAIKFLLWLLPIVSSNPGPTVHSGRNSLRVPRNVDNCACAVGEAYLLSSLRRYENILIAADLVPEALSAIMLRAAAIMATNGRVTGSGTLVFAWYLLKKYGKVASVIEWEKKYKGACDKRLFSELESGQQEGDFGFPFGVPGGIEDPDDYFRKKITGGRFLRVGLSMRDMVQRHVDDVLHSILGKERKLVAAGAPKTPAVEKGGDGYQVAQQIIMGLMDCIRQTGGAAQEGDPGLVSSAVSAIVGNVGSTLAKIPDFTGGSNYSNYQPSISSLSFAKRILRIHLICLCLLKEALGERQSRAFEVALGTEASSALAVAFAPAKSSRGQFKLSPDAPESSANISGDNLNSSAKSTLGRTTKMSAAISALLLGAVVHGVISLERMVTVLRLKEGLDVVQFVRSTKTSSNGNARSVGAFKLDNSFEIYVHWFRLFVGNCRTVCDGLVLELLGEQPIVALSRMQRLLPINLVFPPAYAIFAFVIWKPFILSSNIASREDIHQLYQSLTMAIGDAVKHIPFRDVCMRDTRGFYDIIAADTTDSEFAALLELNGLDTHLKSMAFIPLRARLFLNAIIDCKMPYSAFTHDEGNWVSGHGESKALRGENDSKQGKLIRALDALQPAKFHWQWVELRLLLNEQALIDKMENHDMSLVDALRSSSPSSERASPSENEKVFIEIILTRLLVRPDAAPLFSEVVHLFGRSLEDSLLMQAKWFLGGMDVLLGRKTVRQRLINIAETKNLSTKTQFWKPWGWSYSGGDPVTNRGEKKNEATFLEEGEVIEEAVESKKCAKGSQIDVEGSNISQQHVTEKAFIKLILPCIDQSSADSRNTFANDLIKQFSTIEQQVKLVTRGISKQTGTASSIEVSTNKSNSRKSIRGASPGLARRTMAPAESVPPSPAALRASMSLRLQFIVRLLPIICADGEPSSRNMRHMLASVILRLLGSRVVHEDVDLSFNFKQLKRDAELVSSIASSEIYRDSLFDRLLLVLHGLLSSCQPSWLRSKTANDFSGFDHEALESFQNELDSMQLPEIIRWRIQAAMPILFPSFRNVISCHTPSVPVGALSALQSSIYIPESCNGTLNAPQRQVASARTANNIPGKAKSMPSLQEYDMEIDPWTLLEDGAGSSLSSSGTIVIGGSDRANLRASSWLKGAVRVRRADLTYTGAVDDGS*