Information report for g26570
Gene Details
Functional Annotation
- AGL12, AGL14, and AGL17 are all preferentially expressed in root tissues and therefore represent the only characterized MADS box genes expressed in roots.
- Rav2 is part of a complex that has been named `regulator of the (H+)-ATPase of the vacuolar and endosomal membranes’ (RAVE)
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G11880.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00145444001, BnaA09G0245500ZS, BnaC09G0289100ZS, GSBRNA2T00071267001
- Brassica oleracea: XP_013609178.1, XP_013609177.1, XP_013609176.1, XP_013609175.1, Bo9g093920
- Brassica rapa: Bra029424, XP_009114656.1, XP_009114655.1
Sequences
gDNA Sequence
- >g26570
AGCAACATCAATTTTTCTTCCAGGGAAAAAGAAATTCCCTACATATTATCTTAAGTTGATAATATATCTTTTTCAAGATAAATATATAAACACTATGTGTTAGTTTGGAGGAGGAAACTTTTTGGAGTGTCGAGTCTCAGGAGGTCCAATGAACAAATCAGTCACCACTTCCATATCATTGTTATCTATGTCCAGTTCTGATGATGTTGATGATGATGATGTTCTTGCTATTATTCCTCTTCCTTGCATCTCACACTTCATTCACACATTTCCTCAAATTAAAACTCTCGTTTTGAAAAGCAGATAATTTCATAATAATAGAATTAGAACACAAATCAGTACGATAGTAGTTAAGCCGTATGTTAATATTAATTTGTACCTTCTCCATCAACAGTTTATTTTCTGCAATGAGGTTCCTCTCCTAAAATATTGACAAGAAACCGAAAAATATGGTTTAACGTACCGTTTAATTAAGGGAATATGTTTAGTACCTACGGTAGGTAACCTACCTAACCAATACATTTATCTACACTTCTAAAATATATGAAAAAGTTGTGTTACCTTTTCTTTTAACTTCTCAATTTCTTCACGTAATAATTGGTACTGAAATTAAGGAATAAAATAGCTAAATTAGTTGGTAAAACAAGTATATAAGAACACTCGAAAAATATATCTTCAAAAAAAAAAGACCCGAGTGTTCTTATAAGGTCCTTTTCTTATCACATATCCATGCATGCATGCCTCCAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATGTATTATTTATAGGAAGATCCCATGGTTATATGTAATCTAGTTTACTGTTTACATAATCAGCTCATTAATTTGTGATAATCGATTTTTTTTATAAACATAATTCGAACTAAACCACCACGTCCTAGTCGTAAATCTCGATGAAACAATAATAATATATATGATGATAAGAGTGAAGATTTTATTTTCATCTAAAGCAAAGAAATGATCACATTTATGTAAGTTACCTTTTTGGCTCTTATTTTCATTAAGCTTCGGTCCAACTGGTTCTCCAATTGGTGTAACTCCTCTATAGAAGATGCGTCAAGTCCTTCTCCCATCATTTTTCTGCAAATGCATTTAGAAAAATAAAAGTATGGTAAATTTATAGACACTTACAATGTCTAAGTAGATTCATATAACAAAATATTCGTAGATATTTTGAATTCAAACCGTGTCGAAATCTCCAAATGTTCGATCTTTCTCGCCAAGCCATAGGTTTCATCCTTCGATTGTTGTCAACAAGGTTTGATCATGTGAAATGCAAAACATATTTTCTTAAACAAAATATTTAACCAAAATTGTAAGTACAAAAATTTATATAAAAAAAATTCTCACCCATGTTCGATAAATAAAGCATACATTTTTAGAATGTATATTCATTAAAAAGTGGTACAACAACTGATTAACTACACGATAAGTTGTACTAGATTTTGATGGACATTGATATAGAAAATTTATATTTTTTGCAAATGTATCTATGCATATATAAAAGACTGTTTCTTGAAATGCAAAAATGAATAATGAAATAACCATGATATATCAACAAATATAGAAAGTTTGGTTACCTGTGAGTTATCATTTCTCTTATGGTTAGATCCGAGATCTTGTATTCGCTTTTGATATCTTTCTACTGTTTTTGGTATACTGAAATTATATTTCAAAAATCAAATCAGTATTTAAAAAAAAAAACAAATCAAATCAATAGGAAATAATATTAAGAAGCAAATGTCTAAGCTAGATTTTTCGAAATTTAATTATAATCATGACATGTTTCACCCCAAGCCTATTAATTAATCCAACAAACACAGAGACAAAAGTATTATCTCTAATCTCTATCATAGAATTTTTAAGGAAAAATAATCATTTCATATATATTTTGTGATCTAATAAAACTTATATATCAATCTTCTCTGCTGATCTTTGGGATTAATAATGAAGTAAGAATATAAATAACTTTAAAAAAATAATATATAAAATGTTGAAAACTAAATCAAAGATATCGTCTAGTCATGTGGATATGGCTTAATTAAGTATTTAATAAACTGATTAACATGTAAATATGTGATTAATAGCACCTAGTTAATTGTGATATTAACCCCTCTTGGGTTGCTTTAAAAAAGAAAATATCATTTGTTTTTTTGTCTAATAGAGTACGTACATGTAATTAAATAATCACATAATAAGCATTCATAATAATTTATAACTACACAAAAATATAAACAATAGAGAAAGCATAAAAAGAAAGAAATTTGGTCAATACTACTACATTTTACCAAAGTCTTTCTACTTCTACTACATTTGATAATCTTTTTTTCACTCATATCACATTCATGTGGTATTGTGGTATAAAAAAGACGGTTTTGCCCTCAACTGATGTGACAGATAAAGTGCAACATTTAGGAACAAGTATCTTGGGGACAATAAACCTATTCGGGGACAATAGTCAAACGAAATATAAACATCAAACAACATGAAAAGATCGCAATTAGAATATAGGAGAATTAAAATCGAAGAACAATGAATTAAAATCGAGTGACAAAAACCAGCTAACATGCAAAAATAAGATGAAATTGTGGAATGCTCAAACTTCGGGGACAACTGTATGTAAATTTTCTTTGTGCTCAAACAATGAATTTTGTCCCCGAAGTTTGAAAACACAAAAAATGGTAAAATGGTCATTACACACGGTAATTGTGGTATGAATGATAAATAGGTCTGCAATATGGTAGAAAGAAAAAGAATTGGCCAAATGTGACATAAATGTTAACATATTCTGATCTAGACACATGCTAATGACTCCTTCACTGTCATCACTGAGATAAAGAGGCCTTTAATTTGTACTATATATGTGGGTGAAAACTGTGGCAAATGCTTCTTTGTTATCACAATAAACATACATAAATCTTAAATGTACATAGATACATGCATCCACATTCACACACATTCAAAATTTATAGTGACGATTATTTTTCTATTTTGGTTTTGAATTTTCTCTTGGCCCAAGAGTAAAAAAAATAAAAAATAACGCAGAAATAACTTAAAGAAACGTTGGTCAGCTATTAATTGACCGGTACATCTAAAAAAAAATTAAAATTCAAAAGGCACGTAAATTTTTCTTTGACTACCATTTTATACTTGTATTACTTTGTGTGATCGAGCATAATAAATCTGTCATAATCGTAATTAGTTGTTAATGTAGTTATATACGTATGTATTCATAAATGAGTTTAGAAAAATGTTTCGAAATGTATATACACGCAGTTCATACATGATATACATGCATATATAATGCAATACTTAGCTTCCCGTGACATCAAAATACTCAAATCTCATCAGTATTAGTGTGAACCATTAATTCAAATTACAAAATATAACCAATACATATATGTGAATATGAGCAGTCTAATCCCATATTCTTAGAAAAAAAAAACTTTGCAGGTACATTAATACAGTAGTAAGTGTCTGTAAATAGTATATAAATAGATATATATCTATATATATGTATGTGTGTCAGTGTGTGTGTAAGTTCTTCATACATTATACAAAAGCAGAAATATAAATATAGGGAAACACACCTCTAAAGAAGGAAATATTGTTTTTTTCCAGATCTCATATGAGACTTTATTGCCTAATTTGAGTAAGAAGAGTGTGCTCAAAATTATTGCTATATATAGAAGTAATATAGTTAAACAGCATTTCAAGTTTAGCTCTTCTTTGTGAAAAATAATTTTTATCTTTACTGGAATTTTCTGTTTGTTGTCCAGACTCCAAACTATCTCATCATCTCTATTTACACACCTTTATTCTTTTATTTTGCAATTCTAAGGAAAAACATTTACCCATGTGCCAACCACGTTTATAATCTCGAAATCCTGACTTTCTATTTCTGATCTATATATATGATTTTTCTTTCTATATTAAATTTAGGATCTTCGTCTGAAACACATAAAACAACCAATATCAATCGAGTCTAGACCAAACAAGTAATGTATTTCTGTACATGTTTTATGGAAATAAGTAATTAACCGGTCATGATGCAACAGATCAATATATTATAGCAAATGTGTAAATACATATAACTTATGTAGATGATACCTGGAGGAGCTAGAGAACTCATAGAGTTTGCCTCTAGGAGAGAAGATGATTAGGGCAACTTCAGCATCACAAAGGACTGATAATTCAAAAGCTTTCTTCAAAAGTCCATTTCTTCTCTTTGAGAAAGTCACTTGCCTGCTCGTTGCGTTCTCTATTCTCTTCATCTCTGTCTTTCCCCTCACCATTCTTCTAATTTAATTGACCCTAATTCATAAACAACAGTACTTTGATTTTGATTTTACCACTCTTTCCATGAGATATTAAATGAAAAAAAAACTTGATTTCAGTAAAATAAAGTATCCATGAGAGGAAATTAGATGGAAGCAATTATTGAATTTTTATATAGACAGATTTCTTACTACAAGAACATCAAACATGAAGAACAAGAACAATTTCGACCTTAAACTATAAATAGAGAAGATCAATCCGAAATTAAGGACAAGGTTGAGAAAAAGAGATTACCCTCTTTGTTTTTTTGTAAGCTTTTGATTGATTTTTGTCTCTTAGAGAAAGATGAGAGAGAGAGAGAGTCTTTGGGAAGAGTCGGCAAGATTGAAATGGAGAATTCTTGGAAACCCTAAATTTATGAAATCAGGAGCCAATAACAAAAAAGATGTAAAAAAAAACTTTATAGTATTCTTCTATATCCATGAACTG
CDS Sequence
- >itb13g26570
ATGGAGAAGTGTGAGATGCAAGGAAGAGGAATAATAGCAAGAACATCATCATCATCAACATCATCAGAACTGGACATAGATAACAATGATATGGAAGTGGTGACTGATTTGTTCATTGGACCTCCTGAGACTCGACACTCCAAAAAGTTTCCTCCTCCAAACTAA
Protein Sequence
- >itb13g26570
MEKCEMQGRGIIARTSSSSTSSELDIDNNDMEVVTDLFIGPPETRHSKKFPPPN