Information report for g25915
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a homolog of the mammalian protein CstF77, a polyadenylation factor subunit. RNA 3′end鈥損rocessing factor of antisense FLC transcript. Mediates silencing of the floral repressor gene FLC.
Homologous
- Beta vulgaris: BVRB_5g112490
- Brassica napus: BnaA08G0260200ZS, BnaC08G0241800ZS
- Brassica oleracea: Bo8g067440
- Brassica rapa: Bra016588
- Glycine max: Glyma.19G064500
- Gossypium hirsutum: Gohir.A06G170700, Gohir.D06G178500
- Juglans regia: Jr15_00770, Jr15_00760, Jr15_00750
- Medicago truncatula: Medtr6g026900
- Prunus persica: PRUPE_1G353000
- Solanum lycopersicum: Solyc10g050540.2
Gene Resources
- Pfam: PF05843
Sequences
gDNA Sequence
- >g25915
TCACCGACCACCGTGTTTCGGCCAGACCCGTCGGAGGAGTGTTAAATTGTTGAATCTCAGATTAGGGTTTACTTCTATGGTAAACTTCTGAAGGTCTGTTTTACTGATCTGAGGTCCTTTTGGCGTTGAAGCAGCAGAAGCTGTAGCTAGACCAGTTGGAAGATTGTTACACTGATTGAATCTCAGATTAGGGTCTACGTATATCACCATTGCGTGGAATATTTGAAAGACTGTTCTTCCGAAGGTGAAATTCATGGCTGATAAGTACAACGTCGAGGAAGCAGAGGCTTTGGCCAAGAGAGCTTTGGTACAACTCTTTCCCCAGAGCTATATACTTGTCTGCTTTCTCCTACTTTTAAAAAAGTTTGGATTTTTAATTTACCATCTTCCATTGTGTCCTTTCTTCAGCATCTACCAATTGCACAGGCGACGCCCATCTACGAGCAGCTTTTGTCACTTTATCCCACTTCTGTAAGTTTCCCATGACTTTGCTTCCACGTATTTTGGGGTTTGGGGGTTAATTGTGAGCTCCTCTGTAACTCTGTAGGCGAGATATTGGAAGCAATATGTGGAGGCACACATGGCTGTAAACAATGATGATGCTACCAAACAGATATTTAGTCGTTGTTTGTTGACCTGCCTTCAAGTTCCTCTTTGGTAATGCCATGTTTTCCTTTTTTACTCGTTGATAAGAGTCAATTTAAGATCTTTGCTTTGCTGCAATGCAAGTCTTTTCTTCTCCTTGAATATAATCCTAACATCTTATTCTATTAGGCAATGTTACATTCGGTTCATCAGAAAGGTCTACGACAAGAAGGGAGCAGAGGGTCAAGAGGAGACCACAAAGGCTTTTGAGTTTATGCTTAACTATATCGGTATCGTTTCTCTTCCGCACTTTGGTTCTATTTTGTTTGTTTTTGATTTTAATCTTGTCTCATACATAGAGGGAATTTTTCGCTTATGAGAAATGGATAGAGTTATGTGTAGTAAACGATATCATTTTGATCAATTCTATGCTTAATGTTGTTGCTAATGGTAAATATTTGTGCAAGTTACTATCCATCAGCAATAGCAAGCAAACACTTACGTTTTGCATCTATTTAGAGCTCTAGTTTCTCTATATCATGCCAACACAGAAACATAACTTGGGTCTTACTGATGGTTGTTTATTTCGATGTATGAATCTCCAGGGACAGACATAGCATCTGGGCCTATATGGACCGAGTACATTACCTTTCTAAAATCTCTTCCGGTTCGTTATATCATTCTAACTTTGTCCTTGATACTAATAACTTGTTATTGCTCAGAGACTAATAGATTCTCGTGCAGGCTCTTAACCTAAACGAAGATTTGCATCGGAAGACTGCTCTCCGAAAAGTGTATCATAGAGCTATATTAACTCCGACCCACCACGTTGAACAACTTTGGAAAGATTATGAGAACTTCGAAAATTCTGTTAATCGTCAATTGGTAAACTTCTTAGAAATATAAAATTGTGTGGTTTCTTATTTTCATTAATATTTAGTGTATCACAAGTAGGTACGAAATTCATTCTCTTTGTTTTGTTGATGGATGATCTAATCTAATCCTGTGAGCAGGCAAAAGGACTTGTAAATGAGTATCAACCAAAATTTAACAGCGCCAGGGCTGTATATAGGGAACGCAAGAAGTATATTGAAGAAATTGATTGGAACATGCTTGCTGTCCCACCAACAGGATCTTCCAAGGTAAAGAATTTCTCATCCATTGTTTCTTTTTGGAGCTGCTGAATGTACAATTGTTTTCTTTATCGTTTTGAATAATACTGGATAGATTGACTCTTAAATTGGCTAAAAGACATTATGAGCATAATTCACGTCATGAGATCAGGTTGTTAAGATAGGAAATACATATGGAGCATCATTTGCTCACCCTGGTACTTTACACTATCTTATGATTTTATACAGGAAGAAACCCAGTGGGTGGCTTGGAAAAAGTTTTTGTCCTTTGAAAAGTAAACCCCTAAAACCTTATCTTATTTTTTTAATTTTAATTTACTTCATTCAGAGATGATGTGTGTTTTACGTAGCTGCTTAGCCATTTTTTCTTTACAAAAGCTAGATTTCAATATATCGCAATAGTTAATTGGTCCCTCGGTAGATTTTTTTCGGTTGATGCCTAGTGATGAGACTCTTATATCTTGTCCGTCTCTTATTTTGGCTATTAAGATTTATTGATGATTTTGACTAGAAAGCTGGAATAAATTACTATCCAATTATATCTTTAACGAGTCCTTCTAAATAAAACAAACTTCTATATCTAATACCATTGTAACTTTCAGAGGAAACCCTCAAAGGATTGACACGGCCTCGTCAACTAAGCGGATTATATATGCCTATGAACAGGTATGCGAAGAGTCAGTGATATGCTCTTGCTGAAATTTAGGACTACTAATCTCCGAAATGTGTTTCTTTCTTAATTGACTGATTATTAATCTGGTTTTACAGTGTCTGATGTGTTTATATCACTATCCCGATGTATGGTATGACTATGCTGAGTGGCACGTAAAATCTGGTACCACGGATGCTGCAATCAAAGTATTTCAGCGAGCTCTTAAGGCCATTCCTGGTAAATCTAATCTATCCTTTTTCTTTATGTCTATGAACTAGTTGCTTTATGAAGGTTCGACTATTACTCTTTGCTTACTCGCTGGCTTACAATTTTAATCTTATCTTCTATCTACTCTTAAGAATACTATTTTCTCACTTATCTGCATTCTGCGCCTCTTTTATATTTCACTAAGTGTCTACATTGCCCACTCTCGTATGTCAGATTCGGAAATGTTGAAATATGCTTATGCTGAGATGGAGGAATCTCGTGGAGCAATTCAGGTTCTTATACTTGCTGCTTGCTTCTCTTTATCTAGCTTTATAAGTTGTCTTCATACTCGTTGCTTATAGTTGTATGATTTTGCAGTCAGCAAAGAAATTATATGAAAGCATTTTGGGGGTTAGCACAAACTCTTTGGCACATATACAAGTAAGTACGCTCAAGTTTCAGAACTTAAGGACTGCTAAGATTGCATAAACAGCATATCTTTCACTTTTAAATTTTTCTCTGGAAATATTCTCATATGATATACTTCTCTATATTCTTTCGCAGTTCCTTCGTTTTCTCCGGAGGGCTGAGGGTGTTGAAGCTGCTCGCAAGTACTTTTTAGATGCTAGAAAATCTCCTAGCTGCACATATCATGTGTATATTGCTTTTGCTACCATGGCCTTTTGTATTGACAAGGAACCAAAGGTAGATTTTCTTACCCACTATGTGGTCTATGTACTATTTAGAACTGCTTTTGTTTGGTCTTGTTGATATATGAATAAATTGATTGTGAAGGAGGTAGTGGTCGTTCAGTCAATTTCAGAACCTACTCGTCTTATTTTTCTTATAGTTAAAGTAAGCCAGGACCCAGGAGACTTTTGTGATAATGAAGTCAAAATGATTTGAATATTGGGGTGTTTTGGCTATTTATGCACTTAAACTCTTCATTTGATTGCAAAGTACACGTACCTTACTTTTATGCCATGTACATTCCTCTTTGTCTTTATTTGTTCGTTTCTTTAACCGAAAAATTAACACGTTCTTGCAAGACAAATATACTAATGTAAAGCTTCTGACTTTAATTTCTATTCAGTTTCACAATAAAAATCCTTCTGTTTGTATTTTTATACAGGTTGCACATAATATATTTGAGGAGGGGTTGAAACTCTATATGAGTGAACCTGTTTACATCCTTGAGTAAGGGTCACTGCAGCTTTACTAAGAGTTCCATTTTCTTAAGATTATACTTGAAACTCTTCTTTGTTGAAGAAAATAATTAGACTTACCTTCTCAGATAAAATATCCTCAAACTTGTTTTCTCTCCCAAACTCTCCTAAAACAGAATGTTAACCCATCTGGTTTTGCTTTGCAATCTAGGTATGCAGATTTCTTGACTAGATTGAATGATGATAGAAATATCAGAGCTCTATTTGAGCGGGCATTAAGCACATTACCAGCTGAAGACTCTGCTGAGGTACGCTGATAGTGATGTATCGTTTCTCAAAGCCGTTAGAGTATGCAGATTTTGTTCTTAAGCATGAATAGAGACAACAAGGAGAATAACCAACCTGCTGATGAAATAACCGAGCATCTAATTTGATTATAGCATTTCTGAATGCTTAAATATGATAATGGTTTAGCAATTGGATGTGTAATCTTGATGCACATCTGAGCCTTATGAACAGTTGTGGGGATGGTAGACATTTAAAACTGAAATGAAAGAGTCCAATATTA
CDS Sequence
- >g25915
ATGGCTGATAAGTACAACGTCGAGGAAGCAGAGGCTTTGGCCAAGAGAGCTTTGCATCTACCAATTGCACAGGCGACGCCCATCTACGAGCAGCTTTTGTCACTTTATCCCACTTCTGCGAGATATTGGAAGCAATATGTGGAGGCACACATGGCTGTAAACAATGATGATGCTACCAAACAGATATTTAGTCGTTGTTTGTTGACCTGCCTTCAAGTTCCTCTTTGGCAATGTTACATTCGGTTCATCAGAAAGGTCTACGACAAGAAGGGAGCAGAGGGTCAAGAGGAGACCACAAAGGCTTTTGAGTTTATGCTTAACTATATCGGGACAGACATAGCATCTGGGCCTATATGGACCGAGTACATTACCTTTCTAAAATCTCTTCCGGCTCTTAACCTAAACGAAGATTTGCATCGGAAGACTGCTCTCCGAAAAGTGTATCATAGAGCTATATTAACTCCGACCCACCACGTTGAACAACTTTGGAAAGATTATGAGAACTTCGAAAATTCTGTTAATCGTCAATTGGCAAAAGGACTTGTAAATGAGTATCAACCAAAATTTAACAGCGCCAGGGCTGTATATAGGGAACGCAAGAAGTATATTGAAGAAATTGATTGGAACATGCTTGCTGTCCCACCAACAGGATCTTCCAAGGAAGAAACCCAGTGGGTGGCTTGGAAAAAGTTTTTGTCCTTTGAAAAAGGAAACCCTCAAAGGATTGACACGGCCTCGTCAACTAAGCGGATTATATATGCCTATGAACAGTGTCTGATGTGTTTATATCACTATCCCGATGTATGGTATGACTATGCTGAGTGGCACGTAAAATCTGGTACCACGGATGCTGCAATCAAAGTATTTCAGCGAGCTCTTAAGGCCATTCCTGATTCGGAAATGTTGAAATATGCTTATGCTGAGATGGAGGAATCTCGTGGAGCAATTCAGTCAGCAAAGAAATTATATGAAAGCATTTTGGGGGTTAGCACAAACTCTTTGGCACATATACAATTCCTTCGTTTTCTCCGGAGGGCTGAGGGTGTTGAAGCTGCTCGCAAGTACTTTTTAGATGCTAGAAAATCTCCTAGCTGCACATATCATGTGTATATTGCTTTTGCTACCATGGCCTTTTGTATTGACAAGGAACCAAAGGTTGCACATAATATATTTGAGGAGGGGTTGAAACTCTATATGAGTGAACCTGTTTACATCCTTGAGTATGCAGATTTCTTGACTAGATTGAATGATGATAGAAATATCAGAGCTCTATTTGAGCGGGCATTAAGCACATTACCAGCTGAAGACTCTGCTGAGGTACGCTGA
Protein Sequence
- >g25915
MADKYNVEEAEALAKRALHLPIAQATPIYEQLLSLYPTSARYWKQYVEAHMAVNNDDATKQIFSRCLLTCLQVPLWQCYIRFIRKVYDKKGAEGQEETTKAFEFMLNYIGTDIASGPIWTEYITFLKSLPALNLNEDLHRKTALRKVYHRAILTPTHHVEQLWKDYENFENSVNRQLAKGLVNEYQPKFNSARAVYRERKKYIEEIDWNMLAVPPTGSSKEETQWVAWKKFLSFEKGNPQRIDTASSTKRIIYAYEQCLMCLYHYPDVWYDYAEWHVKSGTTDAAIKVFQRALKAIPDSEMLKYAYAEMEESRGAIQSAKKLYESILGVSTNSLAHIQFLRFLRRAEGVEAARKYFLDARKSPSCTYHVYIAFATMAFCIDKEPKVAHNIFEEGLKLYMSEPVYILEYADFLTRLNDDRNIRALFERALSTLPAEDSAEVR