Information report for g25159
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a protein with similarity to mammalian nucleoporin Nup98.Its expression is upregulated in mutants that are NUP deficient. Nucleoportin which redundantly inhibits flowering together with Nup98a through multiple pathways including clock, photoperiod, and age pathways. Gates flowering in a CONSTANS (CO)-independent mode and bypasses the CO checkpoint in photoperiodic signaling and integrated signals from multiple pathways to directly target FLOWERING LOCUS T (FT) for flowering control.
Homologous
- Brassica napus: BnaA06G0066100ZS, BnaA08G0288900ZS, BnaC08G0201700ZS, BnaC09G0191800ZS, BnaA09G0171700ZS
- Brassica oleracea: Bo8g059390, Bo5g010850, Bo9g046570
- Brassica rapa: Bra018441, Bra019938
- Citrullus lanatus: Cla97C09G178300
- Cucumis melo: MELO3C024716
- Cucumis sativus: CsGy2G026970
- Daucus carota: DCAR_023771
- Gossypium hirsutum: Gohir.D03G088800, Gohir.A02G094700, Gohir.D08G121000
- Vitis vinifera: VIT_02s0025g03150
Gene Resources
- Pfam: PF04096
Sequences
gDNA Sequence
- >g25159
CCTCCTCCACTTTTCATTGTACGTAGAAAAAAAACTTTTAGGCTTTTTGATTCCGGCGAGGTCTCTGCTTCTTTCTCCTCCTTCTCCGTCGTCTCTGTCGTCTCTGTCGTCTCCACATCGTGCTTCAGCCTTCAGGTTACATTCCTCAATTCCTCTCTCTGAGTCTACGACGAACGACAATCGTTTTCGTTAATAGTTTCGGCGGTTTCTTCACGCCTGAACCCTAATTTTTCCGACTTCGGACGAACGTGTACGGAAAATTTCTGGTTCTCTATCTTGTGTGATATTCGTGAGACGTAGTTTAGTCTAGTTATATTGATTTCCATCGGATTCATAGATACTATTTGTTGAAGTTTATGTTATCGATTGGTGTTGGTTTTGATTATTTCGTACTCTGTTTTCGAATTTGATGATTCGTAGTTATGTATTACACGACTTGTGATGTTGCCTTGTTTAATGTTGATCCTATTTACGAGTAATTGTGTTGTTAATTCGTGTAAATTGGTTCGTTTTTGGGTTCTGATTGGCTGTTTCTTCTCATTAGTTTGTATCACGTTCATGATTTGGAACTTGATAACTTCCATTATAGTGTTTGCTAATGTTCATGTTTTCTTTTCTTGTTTTGTTGTACCAGGCTAGAAGAAACAATTCCTTTGGCTGAGGTCAGAGTCGTGAATATATAGACGAAGATGTTTGGTTCTTCTAATAATCGTAAGTGATTTTTGTACCTTATTGTTTATTTACTATGGGTTTTGTAGTGGCCTGTTTAGTTTGCACGGATCTTTCCTTTGTTACTTAATCAAATTTGGATATTTGTAGCTTTTGCAATGCTAACATGACCCGTTTAATATGTTTTACAGCTTTTGGACAGTCATCTAACAGCAGTCCATTTGGGACCCAAACTCAATCTTTGTTTGGGCAGACCAATAACCCGAGTAATAATCCTTTTGCTCCGAAACCCTTTGGTACTTCTACTCCTTTTGGCGCACAGACAGGGAGTTCTATGTTTGGGGGCACTTCAACCGGTGTGTTTGGTGCACCTCAAACTTCTTCACCTTTTGGTGCTTCACCACAAGCGTTTGGGAACTCTACTCCGGCTTTTGGAGCATCTTCTGCTCCTGCATTTGGTAGTTCAACGTCACCTTTTGGTGGTAAGTACCTTTTATGTATTTTACTGCATAAACTATACCAGGCCTGGAATAAACTATATGTGTTCATATAATGTGATAGATACATTGATAAGCCTGATGGAATAGGATTTACTTTCTCTCAGTTGGACTTAGATTGTAAAAATACACTTTTGCTACTGGTTTCTGATTTCTTCAAGCGTTTGATTACCTGTTAGTTTCAGGGTAGCAATATCCAAGTTTTATGGTGTTCATGAGATTTGTTACTACTTCCAAAATTAGTAGTCTTTTGGGTTTTCTTCGTGACAGTACTAGCTCCTGATTTGGTCTAGTTTGTTTGTTTTCTTTAGCCTACAGGGTCTCATTAGTCTTTTAATATATCTCTTTTGTGCACCTTTTCTCACGAAGAATGATAAATCTTTTCTTACAGGCACTTCTACGTTTGGTCAGAAGTCTTTTGGCCTCTCAACACCTCAGTCAAGTCCTTTCGGAAGCACCACACAGCAATCACAGCCTGCCTTTGGAAACAGCACTTTTGGTTCGTCTACACCTTTTGGTGCCTCAAACACTTCCGCATTTGGCGCCTCAAACACTTCCGCATTTGGCGCCTCAAACACTTCCGCGTTTGGAGCCACAAGCACACCCGGGTTTGGTGCCACAAGCACACCCGGATTTGGTGCCACTAGCACACCTGGGTTTGGTGCATCAAGCACGTCTGCCTTTGGCTCCAATAACACACCTGCTTTTGGTGCTGCAACTACTCCTTCATTCGGCTCCTCGAGCTCACCTGCATTTGGCGTGTCACCTGCTCCAGCCTTTGGTAGCTCTGGCAATGCATTTGGTAACAATGCCTTCAGTTCTGGAGGTGCTTTTGGTGCATCAAGCACTCCTGCGTTTGGGGCATCTAACACTCCTGCCTTTGGGGCATCAAGCACTCCTGCGTTTGGGGCATCAAGTACCCCATCTTTTAATTTCGGTTCTTCCCCAGCTTTTGGACAGTCTACCTCAGCATTTGGTAGCAGTTCCTTTGGTTCTACACAATCTACCTTTGGAGCCCAAGGTTCTCTAGCTAGTCCTATTCAATTACAGATTAGAAGTGAAAGTTCTCACCCATTTAATGGTAACTAATTATGTTCACATGTTTTGTTTTGCAGGTGCACAGGCTTCGACCCCAACATTTGGGGGTCAATCAACTATCGGGGGTCAACAAGGGGGGAGTAGGGTCATGCCTTATGCACCTACAACTGAGCCAGCATCGGGCACTAGTAACCAGGGCACTAGTAACCAGACTGAGAGGCTACAATCTATATCTGCCATGCCTGCATACAAAGAAAAAAACCAGGAGGAGCTTAGGTGGGAGGACTACCAGCGAGGAGATAAAGGTCATATGCCAAACAAATCCATGTTATGCGTTTGTCTTAAGGTTAGATGTTTGTACTTTATTTACCAAAATATTGATTCTCTTGCTGTTCAATTTTCAGGTGGACAACGTCCTGTTGGTCAATCTCTTGGAGGTGCTGGATTTGGTGTAACAAATTCTCAGCCTATATTCTCTTCGTCATCAGCTTTTAGCCAGACACCTGCAAATCCAGCAAACCCTTTTTCAAGCTCAATAGCCACTAGCGGTTTTGCACAGACGACTCCAACAACTAACACAATTTTTCCCCCTTCCTTTGGTCATCCCACTACCCCATCCTTTGGTCAACCCACTACCCCATCCATGTTTGGGTCAACTGTATCAAATACTACATCCGTTTTTGGACCATCCCCTAGTTTTGCAACAAACACATCACAGCCAGTTGGTTCATCAATATTTGGTTCAGCTCCTGCACATGGGTCAACTCCAGCATTTAGCAATGGTGGAAATTTTAACAACAGTCAGTCATCTCCGCTGTTTGGTTCAAACCCCTCATATGCACAGAATACCACTCCTGCATTCAGCCAGACTAGTTCTTTGTTTGCACAGAATACCACTCCTGCATTAGGACAGACTAGTCCTGCACTTGGACAGAGTAACTTTCTCAGTACACCTATCACTGGCTCTGCGAACATGTTTTCAAGCTCTGCATCCCTAACTACAAACATCTCTCCCTTTGGTCAAACAACAGTGAGTTTCTTTTTAACTAATTTAAATGCCAGTTCACTTCAGAGTTGATGTCCCTTTCACTGCCGTTTGAGTTATGTAGGGATTTCTAATATTAGTTTATTTTTGCAGCCTGCTGTTACACCCTTTCAATCAGCTCAGCCAACTCAACCATTAGGTGCTTTTGGTTTCAACAACTTTGGTCAAACCCAAATAGGTATGTCAATCAATCAAAGCACCCTGAATATTATCGTCTTGAATACTAGAAGCTAAGTCTTTTATGTTTATGTTCTGAAGCTAATACCACTGACGTTGCAGGTGGAATGGGAACTTTTAGCCAAGGCAACTTTAAGCAAGTGTATGGTCTTTCTGACATCAGTGTTTCGACTCTTATTTCTTCTTTTAGATAATTTATTAACCCAGTAGTTTTATTGTTCTTAGGAAGTTGCATCTCTGGAGCTTCATTCTTTTTTTTTTTGTTTTGCTTTGACAGGCCTGCGATGGGTAACTCTGCTGTTATGCAACCAACTCCTGTTACAAACCCATTTGGAACACTTCCTGCTTTGCCTCAGATTTCAATTGCTCAAGGTGGAAATTCACCTTCGATTCAGTATGGTATCTCCAGCATGCCTGTAAGTTTTTTCTGCCTTTTTCAACACCCACACACCACCTTTTTTTCTTTATAACTTCTTTCCAGATTTGAAGCAAATAAAATACATCTCCTCTCATAGATACAATGATACAGAAACAAATGACTGCTCCATGGTATTAACCCGTATATTTTCCTTTCTTCATAGGTCGTTGATAAGCCTGCTCCAGTTAGAGTATTACCACTCCTAACTTCTCGACACTTTTTACAAAGACGGGTCAGGCTACCTACAAGAAAGTACCGTCCCGGTGATGATGGTCCAAAGGCATGTTTTCTGTTTTCTGAATTTTGGCTTTGTCTTGAATATATCTGTCTTTAGTTTTGTTACTGAGGTTCTTTCTACCTGTTTGTTTTTTCAATGTTTGTTCAGGTTCCATTCTTCAGCGATGAAGAGGAGAATTCCAGTACACCAAAGGCTGATGCGTTTTTCATTCCAAGGGAAAACCCTAGAGCTCTATTTATACGCCCAGTTGAAAGGGTAAAATCAGAACGTCCTAAGGATAGCCCGACCCCACTGCAGGAGAACGGTAAGCTTACCTTTTTATTGGCTTATTTATTGCAAGATTAGAGCCTTCGTTCAATTGCAAAAAGAAGCTTTCCGTTGTCCCAATAGCCCCCTTTTTTTCTAGACATGGCTCCAATAGTTTCTCTTAGATAAGAAGTAAGAAGTTTCCACTTAGAACATCTTATTTGATGCTACCTCTATAGCTGACCTTTCTATGGATACTTGGGACTCGGGAAATGACCTGTTTGCATATTAATATAGTGGCGTAATTTGATCATATCTGACCTTATTTTACATGTAAATTTCAGGTAAGAAGTCAAATGGGGTTACTAATGGAGCCAACCATGAGAGTGAGTATTTAAAATATGCATATGTAACAAAATAGTGATTAACGTTTGTGCATTGGTGAGGCCATTCACTGACTCTACTGTTAATATTTGCAGATAAGGATAACGGTGAAATTCGTGAAGCTACCCCGGCCAAAGCCAATCAGAAAACAAAGGGGACACATGAAAATGAAATTCGTGAAGCTACCCCGGCCAAAGCCAATCNGAAGCTACCCCGGCCAAAGCCAATCAGAAAACAAAGGGGACACATGAAAATGAAATTCGTGAAGCTACCCCGGCCAAAGCCAAT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CDS Sequence
- >g25159
ATGTTTGGTTCTTCTAATAATCCTTTTGGACAGTCATCTAACAGCAGTCCATTTGGGACCCAAACTCAATCTTTGTTTGGGCAGACCAATAACCCGAGTAATAATCCTTTTGCTCCGAAACCCTTTGGTACTTCTACTCCTTTTGGCGCACAGACAGGGAGTTCTATGTTTGGGGGCACTTCAACCGGTGTGTTTGGTGCACCTCAAACTTCTTCACCTTTTGGTGCTTCACCACAAGCGTTTGGGAACTCTACTCCGGCTTTTGGAGCATCTTCTGCTCCTGCATTTGGTAGTTCAACGTCACCTTTTGGTGGCACTTCTACGTTTGGTCAGAAGTCTTTTGGCCTCTCAACACCTCAGTCAAGTCCTTTCGGAAGCACCACACAGCAATCACAGCCTGCCTTTGGAAACAGCACTTTTGGTTCGTCTACACCTTTTGGTGCCTCAAACACTTCCGCATTTGGCGCCTCAAACACTTCCGCATTTGGCGCCTCAAACACTTCCGCGTTTGGAGCCACAAGCACACCCGGGTTTGGTGCCACAAGCACACCCGGATTTGGTGCCACTAGCACACCTGGGTTTGGTGCATCAAGCACGTCTGCCTTTGGCTCCAATAACACACCTGCTTTTGGTGCTGCAACTACTCCTTCATTCGGCTCCTCGAGCTCACCTGCATTTGGCGTGTCACCTGCTCCAGCCTTTGGTAGCTCTGGCAATGCATTTGGTAACAATGCCTTCAGTTCTGGAGGTGCTTTTGGTGCATCAAGCACTCCTGCGTTTGGGGCATCTAACACTCCTGCCTTTGGGGCATCAAGCACTCCTGCGTTTGGGGCATCAAGTACCCCATCTTTTAATTTCGGTTCTTCCCCAGCTTTTGGACAGTCTACCTCAGCATTTGGTAGCAGTTCCTTTGGTTCTACACAATCTACCTTTGGAGCCCAAGGTGCACAGGCTTCGACCCCAACATTTGGGGGTCAATCAACTATCGGGGGTCAACAAGGGGGGAGTAGGGTCATGCCTTATGCACCTACAACTGAGCCAGCATCGGGCACTAGTAACCAGGGCACTAGTAACCAGACTGAGAGGCTACAATCTATATCTGCCATGCCTGCATACAAAGAAAAAAACCAGGAGGAGCTTAGGTGGGAGGACTACCAGCGAGGAGATAAAGGTGGACAACGTCCTGTTGGTCAATCTCTTGGAGGTGCTGGATTTGGTGTAACAAATTCTCAGCCTATATTCTCTTCGTCATCAGCTTTTAGCCAGACACCTGCAAATCCAGCAAACCCTTTTTCAAGCTCAATAGCCACTAGCGGTTTTGCACAGACGACTCCAACAACTAACACAATTTTTCCCCCTTCCTTTGGTCATCCCACTACCCCATCCTTTGGTCAACCCACTACCCCATCCATGTTTGGGTCAACTGTATCAAATACTACATCCGTTTTTGGACCATCCCCTAGTTTTGCAACAAACACATCACAGCCAGTTGGTTCATCAATATTTGGTTCAGCTCCTGCACATGGGTCAACTCCAGCATTTAGCAATGGTGGAAATTTTAACAACAGTCAGTCATCTCCGCTGTTTGGTTCAAACCCCTCATATGCACAGAATACCACTCCTGCATTCAGCCAGACTAGTTCTTTGTTTGCACAGAATACCACTCCTGCATTAGGACAGACTAGTCCTGCACTTGGACAGAGTAACTTTCTCAGTACACCTATCACTGGCTCTGCGAACATGTTTTCAAGCTCTGCATCCCTAACTACAAACATCTCTCCCTTTGGTCAAACAACACCTGCTGTTACACCCTTTCAATCAGCTCAGCCAACTCAACCATTAGGTGCTTTTGGTTTCAACAACTTTGGTCAAACCCAAATAGGTGGAATGGGAACTTTTAGCCAAGGCAACTTTAAGCAAGTGCCTGCGATGGGTAACTCTGCTGTTATGCAACCAACTCCTGTTACAAACCCATTTGGAACACTTCCTGCTTTGCCTCAGATTTCAATTGCTCAAGGTGGAAATTCACCTTCGATTCAGTATGGTATCTCCAGCATGCCTGTCGTTGATAAGCCTGCTCCAGTTAGAGTATTACCACTCCTAACTTCTCGACACTTTTTACAAAGACGGGTCAGGCTACCTACAAGAAAGTACCGTCCCGGTGATGATGGTCCAAAGGTTCCATTCTTCAGCGATGAAGAGGAGAATTCCAGTACACCAAAGGCTGATGCGTTTTTCATTCCAAGGGAAAACCCTAGAGCTCTATTTATACGCCCAGTTGAAAGGGTAAAATCAGAACGTCCTAAGGATAGCCCGACCCCACTGCAGGAGAACGGTAAGAAGTCAAATGGGGTTACTAATGGAGCCAACCATGAGAATAAGGATAACGGTGAAATTCGTGAAGCTACCCCGGCCAAAGCCAATCAGAAAACAAAGGGGACACATGAAAATGAAATTCCTACCCCGGCCAAAGCCAATCAGAAAACAAACGGGACACATGAAAATCATGGAGGCAACAAAGAAGGTTCACACAGTTCACCAAGTGGAGCAGATATCGAGTCATTGATGCCGAAGTTGCATCACTCTGAATATTTCACAGAGCCTCGGATCCCAGAACTGGCTGCAAAAGAAAGGGTTGAACCGGGTTATTGCAAGCGGGTAAAGGACTTTGTTGTTGGGAGACACGGTTACGGAAGTATAAAGTTTCTAGGAGAGACGGATGTGTGTAGACTGGACCTGGAAATGGTGGTTCAGTTCAAAAACCGAGAAGTGAATGTATACATGGACGAGAGCAAAAAACCGCCAGTGGGTCAAGGATTGAATAAGCCTGCGGTAGTAACTTTGCTGAACATAAAATGTATGGACAAGAAGACTGGTACGCAAGTGAAGGAAGGCGAGAGATTGGACAAGTACAAGGAAATGCTGAAGAGGAAAGCTGAGCAACAAGGAGCTCAGTTTGTGTCTTATGATCCTGTGAATGGCGAGTGGACTTTCAAGGTCGAACATTTCAGTTCCTACACGCTTGGAGATGAAGATGATGTGTAG
Protein Sequence
- >g25159
MFGSSNNPFGQSSNSSPFGTQTQSLFGQTNNPSNNPFAPKPFGTSTPFGAQTGSSMFGGTSTGVFGAPQTSSPFGASPQAFGNSTPAFGASSAPAFGSSTSPFGGTSTFGQKSFGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASNTSAFGASNTSAFGASNTSAFGATSTPGFGATSTPGFGATSTPGFGASSTSAFGSNNTPAFGAATTPSFGSSSSPAFGVSPAPAFGSSGNAFGNNAFSSGGAFGASSTPAFGASNTPAFGASSTPAFGASSTPSFNFGSSPAFGQSTSAFGSSSFGSTQSTFGAQGAQASTPTFGGQSTIGGQQGGSRVMPYAPTTEPASGTSNQGTSNQTERLQSISAMPAYKEKNQEELRWEDYQRGDKGGQRPVGQSLGGAGFGVTNSQPIFSSSSAFSQTPANPANPFSSSIATSGFAQTTPTTNTIFPPSFGHPTTPSFGQPTTPSMFGSTVSNTTSVFGPSPSFATNTSQPVGSSIFGSAPAHGSTPAFSNGGNFNNSQSSPLFGSNPSYAQNTTPAFSQTSSLFAQNTTPALGQTSPALGQSNFLSTPITGSANMFSSSASLTTNISPFGQTTPAVTPFQSAQPTQPLGAFGFNNFGQTQIGGMGTFSQGNFKQVPAMGNSAVMQPTPVTNPFGTLPALPQISIAQGGNSPSIQYGISSMPVVDKPAPVRVLPLLTSRHFLQRRVRLPTRKYRPGDDGPKVPFFSDEEENSSTPKADAFFIPRENPRALFIRPVERVKSERPKDSPTPLQENGKKSNGVTNGANHENKDNGEIREATPAKANQKTKGTHENEIPTPAKANQKTNGTHENHGGNKEGSHSSPSGADIESLMPKLHHSEYFTEPRIPELAAKERVEPGYCKRVKDFVVGRHGYGSIKFLGETDVCRLDLEMVVQFKNREVNVYMDESKKPPVGQGLNKPAVVTLLNIKCMDKKTGTQVKEGERLDKYKEMLKRKAEQQGAQFVSYDPVNGEWTFKVEHFSSYTLGDEDDV