Information report for g19350
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a protein with similarity to yeast Pfs2p, an mRNA processing factor. Involved in regulation of flowering time; affects FCA mRNA processing. Homozygous mutants are late flowering, null alleles are embryo lethal.
Homologous
- Brassica napus: BnaA03G0053800ZS, BnaC03G0061800ZS, BnaA02G0048600ZS, BnaC02G0056000ZS
- Brassica oleracea: Bo2g011320, Bo3g009200
- Brassica rapa: Bra006202, Bra023416
- Citrullus lanatus: Cla97C01G007820
- Juglans regia: Jr05_01270, Jr14_01760
- Manihot esculenta: MANES_04G160100, MANES_11G004700
- Populus trichocarpa: POPTR_003G197900v3
Gene Resources
- Pfam: PF00400
Sequences
gDNA Sequence
- >g19350
TTGTCATCTTTTCTCTACCCATTGTTCTTCTCTGCTCTTGGGTTGTCATCAATTCGCGACTTTGATACACGCCCACCCCTAACGAGACCCACACTCGTTTCAAGATAACCCAAATTCGAACACTTTCGCAGTTCTCATTCGATTCGCATAAATCACTGTTCCTTCTTCGTGGGCAACAATGTACGCCGGCGGCGATTTGCACAGGGGTTCACAGATGCCACCACCACCGATGATGCGGCAGTCGTCAGCTTCTTCCTCTAACATCAATCCCGACTACCACCACCCCTCTGGCCCCTTCGACCGTAAGTAGTATTGTAGACTTGAGCTTCTTCTTTTTTTAGGATTAGTGAGATCTGATGTCTCTCTGTCTGATGTTGCAGCAAATGTAGACAGTTTTGGGGCGAAACGTATGAGAAAGCATACACAGAGAAGAGCTGTTGACTACACCAGCACCGTTGTCAAATACATTCAGGTAATGAATGTATTCCCATTGCTGTCACAGTATTTCTTTTTTTAAATGATTGATTATGTGGAACCAAAGGAATAGAGTGTATGTTTTTGTTCAGGCTCGAACATGGCAGCGAGACTCAAGGGATAGGACCTCTTTGCAACCAACCCCAGCTGCAGCAGTGGATGTTAGATTTCTTTGCTTTTCTGGGTTTTTTGATCTGAGGATCATTCTTTCCAGTATTTGAATGATTTACTGCTCTAACTTTTATATCAATGTTTCAGATGCTTCCCACAGTTGCCTATTCAGATAATCCTTCAACAAGCTTTGCTGCAAAGTTTGTTCACACATCTCTAAACAAGAACCGTTGTTCAATCAACCGTGTATTGGTATTTCCCTCTAACAGCTGGGTGCTTTTTATTATTCCCTGTTTGCCATGTTTGTCTATTCAAGAAAGCTAACATCTTTCTTTTCTTTTTCTTTCTTAACTCTGTTATGCCAACTTAATGCGATCATTGCTGATTGGGTTTCTTGTATTTAGTGGACACCTTCAGGACGACGTCTTATCACTGGCTCCCAAAGTGGGGAGTTTACTCTTTGGAATGGGCAATCTTTTAATTTTGAAATGATTCTTCAGGTTCGTTTCTCAGATTGTGTTTACTAATCTTTGGAAACTTCTGTTTTGATTCCTCTATAGCTGTTGCTCCTGGTATTGACTGTTAAAATCTGCTGTCAAAATTAGGCACATGATCAACCTATAAGGTCGATGGTATGGAGCCACAATGACAATTATATGGTTTCTGGTGATGATGGAGGCACAATAAAGTATTTTTTTTTTCTTTCATTCTCTAACTTGTGATGATGTAAATGAAAAGTTCAGAATTCTATGATTCAGATTTAATTTTTGCTGTGACGGTAAGGATCAATTGTTTCTTATGTATCAGGTATTGGCAGAACAATATGAACAATGTGAAAGCCAACAAAACTGCTCACAAGGAATCAATTCGCGATTTAAGGTAAAAAAAAGGTTTGATATGTTATTATATTAAATGAATCTCTTTAAATTTTAACAGTATGTATCGAACAGTTTCTGTAAAACAGATTTGAAGTTCTGCTCGTGTTCTGATGATACGACTGTTAAAGTCTGGGATTTTGCCAAGTGCCAAGAAGAATGCTCATTAACCGGTAATGTGATCTGAACAGATTATCGGCAGATAGTGAATTTCTTAGTTGCTTTCTCTTCTAGTTTGAATTCAGAAGGCCATTTGGAATGTGATGTATGTTTTTATAATTGGACCCTTAGGCTACACAGAAAAAGTATTATTGAGAGTCGGTTTGGTGTCATGCCATGGAAATATTAGTTAGTTTTGAAGGCTCCAAATTGGTGCTTTTTTTCCTATCCTTTTGAAGGCATGTTTTCACAGTTTTCTTCATATTTGTATTTTCTGCTATTTTTTTTACGTGACCAAAGGGTTCTTTACATTTTGAACTCAGGCAGGCCATGGTTGGGATGTCAAGAGCGTTGACTGGCACCCCACAAAGTCCCTACTAGTTTCTGGTACATTATTGTATAGACTTCTATTTTGATAATTTAATTAGAAAGAAACAGTTGTATATTTCAGAGCTTCTCTCTATGACTGATTATTCGCTATTTTAATCTGTGCTAACAGGTGGAAAAGACCAACTTGTCAAACTCTGGGATACTAGAACTGAGAGAGAGCTTTGCTCACTGTAAGTAGTGCGTAATGTATTATGTATTTTATTATAGTTTCACGTTCAAAGCTTTGACGAAATTGATGGCCTATTCTCACTTCTGCAGTCATGGTCACAAAAACATAGTGCTTAGCGTGAAGTGGAACCAAAATGGCAATTGGCTTTTAACGGCCTCGAAAGATCAGATAATTAAGGTAAGGCTCACTTTCTTGGGGGTGTATTGATTTGTAAATTAGATTTTGTCCGTGCATTATGGAAACATTTGTATGACACTTATGCATGTAATCTGCAGCTGTACGATATAAGGACTATGAAGGAGCTTCAATCCTTTCGTGGGCACACGAAAGATGTAACATGTAAGCTGTCAAATTCTGTAATGATCATGTCTTCAAACACGTGAAAGCAGACAAACTGCCCGCATAAAATGACTTTTCTGTACATTGACTAGGATTCTTAAGTATATGCCTTTAAAATATTATCATTGTACCCATGCTTTACTTAATGGAGGTCGACATATGAGACATTATCCCATGGATGCGAGTTTTCAATTTGTTTCTTCGATATTTCTAATTTGCAACTATTTCTAATTAAAAGTTGTCGAACTCTGTAAAGCTTTGGCGTGGCATCCCTTCCATGAAGAATATTTTGTCAGTGGGAGCTCTGACGGCTCCATTTGTCATTGGATTGTGGGGTAGGTACTGTTTTGCAGCAATATGCTGTTTTATTTATTCGTTCATGCCGCTATTGCTTTAATCACTTATAAGGATTTGTCAACTCTTGTTTCTTGTCTACATTGTATATTCAGTCATGATGTATCTACATATACTAGTAGCATCTTACTTTACCTTAGACTTTGTGGTTTTTGTATGAGGTGTATCTAATTATGAAAAACTTTTCTTAATTCCCAGGCATGAAAACCCGCAGATTGAAATCCCAAATGCTCATGATAACAGTGTTTGGGATCTTGCATGGCATCCTATTGGATATCTTCTTTGCAGGTAGCAATTTCAATAGTCTGGTGCTATGAGTTCCTTACAGTTTTATTCTATGATGTGTTGTGGTTCCTTGTGTAATGCTTCAGATATTGATTTTTTCCCCTATTATCTGCAGTGGTAGCAATGATCACACAACCAAGTTTTGGTGCAGAAACAGGCCTGCAGATAATCCCCGAGATGTCCTTATGCAGAACCAAGGTTTGTTTTTAGGCTATTAGTATCTGATTTTTTTAGTAGGCATTGCGATGGATAAGGTGTGGGTAGTGCATAATACTATGTCCTTTTCCGTCTGAGTAGGAAGGATGTTGTGATAGGCTTAACTGGTCAGGCCCTGGCAGGGGTCAGTCTATTCCTATAATGGCTTGTTTGAAATGAACCTTGACTTTTTAAGGTTCAGGCTCGAACAGCCATATGGCACCATGATTAACTGAAATTTTTTGTAGAAAAGAACAGACTTGACTGGTCAAGCTGAGCTGGTCTGATATGGGTGCAGATTTCTACAGGCTTTAAAAATCAGACCCAAGTACTTTTGGCTCTCGAGAACATCTTTGGTCATTAGTATCTCACTTACTGTTTTAAAGCATGTACTTTCAAGTTGCATTTGTCAGAAATTAGTGTTTTTTATTTATTGTTTATTACCGAATTGAAGCTGTAATTTGTGTGTACTAATTACTGTAATTTGTGTCAGGCTATAATGAACAAGGTTTTGGTAATCGCGAGACTGATAATTTCCAACCATCTGAGGCATCGCCATTTCCTGGATCATTTGTGCCTGGGCTGACACGGAACGAGGGGACCATCCCAGGAATTGGAATAGCAATGCCATTTGATGCATCCTCTCAAGGGGAACATAAACAGCCTCTTCCAGGTTCCATGGCACTGGGAGCTCCTCCTTTGCCACCTGGTCCCCACCCATCACTTCTTGGAAGTGGCCAGCAGCAAGGGTATCAGCAACAACAACACCACCAAGGTCATCCCCAGCAAATGCCTCCAATGCCCAATATGCCTCACCATCAGCTACCACCATCATCTCATATGCCATTGCACCCTCATCATCTTCCCCGGCCTATGCAAATGCTTCCTCACGGTCACATGCCACCTTCCTCAATGCCTATGTCTCATCAGATGCCTGGATCAATGGTATGGCTCTCAGATCTCTTGTAATTCGACCACAACTTAAGCCTGTCTTTTATGGGTACCCCATGAGTTGGATTCCTCTTTGTTTTATTTTCTTAGTGATATTTTAGGGAGGTAAAAAATCATTTTTACCGTGAAGAAAGAGATAATAATCCTCACATGTTGTTGGAATAGGGAATGCAAGGTGGCATGAATCCTCAGATGTCGCAAAGTCATTTTATGGGTGCTCCTTCAGGAGTATTTCAAGGACCACCAAGCAATGGTGGACCCCAAATGTATCCCCAGGGACGTGGTGGTTTCAACCGTCCACAAATGATTCCAGGCTACAACAACCCTTTCCAACAGGTCCCATTTAAACACTAGTCTTTTGGTTTTTAGTATACCCGTAAAGGTTTCGCATACATATATGTACAAATAGGCAAAGATGTCTACTGCACAACAATGCAAAACATCCTGATACGATTGAACCATGATATAACTTTTGCAGCTCGTTTAAAACTTACTAGCTAGGTTCTTTGGTATGATTAGATGTTGAATATGCTATTGCTGAGCTTAAAATAACATAAAATTCGTTGACTAATCCGTTCTCTGTATTTTATTTTGTGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCCGCCTTTACCTCCCGGCCCTCCACCAAACACCAATCAGCAACATCAGTAGGCAACCCTTGTTTGTATTAGTACATACATATCCTGTTTGTAGACTTGACCACTTCTTGTAAGGAGTTGGTTTTAAGATGATTCAACGCTGTGCAATGGTTTTACTACTCATGTTTTGATACTTTATGTGAACAAGTTCCCTTTAGAGAAGTTTTTAG
CDS Sequence
- >g19350
ATGTACGCCGGCGGCGATTTGCACAGGGGTTCACAGATGCCACCACCACCGATGATGCGGCAGTCGTCAGCTTCTTCCTCTAACATCAATCCCGACTACCACCACCCCTCTGGCCCCTTCGACCCAAATGTAGACAGTTTTGGGGCGAAACGTATGAGAAAGCATACACAGAGAAGAGCTGTTGACTACACCAGCACCGTTGTCAAATACATTCAGGCTCGAACATGGCAGCGAGACTCAAGGGATAGGACCTCTTTGCAACCAACCCCAGCTGCAGCAGTGGATATGCTTCCCACAGTTGCCTATTCAGATAATCCTTCAACAAGCTTTGCTGCAAAGTTTGTTCACACATCTCTAAACAAGAACCGTTGTTCAATCAACCGTGTATTGTGGACACCTTCAGGACGACGTCTTATCACTGGCTCCCAAAGTGGGGAGTTTACTCTTTGGAATGGGCAATCTTTTAATTTTGAAATGATTCTTCAGGCACATGATCAACCTATAAGGTCGATGGTATGGAGCCACAATGACAATTATATGGTTTCTGGTGATGATGGAGGCACAATAAAGTATTGGCAGAACAATATGAACAATGTGAAAGCCAACAAAACTGCTCACAAGGAATCAATTCGCGATTTAAGTTTCTGTAAAACAGATTTGAAGTTCTGCTCGTGTTCTGATGATACGACTGTTAAAGTCTGGGATTTTGCCAAGTGCCAAGAAGAATGCTCATTAACCGGCCATGGTTGGGATGTCAAGAGCGTTGACTGGCACCCCACAAAGTCCCTACTAGTTTCTGGTGGAAAAGACCAACTTGTCAAACTCTGGGATACTAGAACTGAGAGAGAGCTTTGCTCACTTCATGGTCACAAAAACATAGTGCTTAGCGTGAAGTGGAACCAAAATGGCAATTGGCTTTTAACGGCCTCGAAAGATCAGATAATTAAGCTGTACGATATAAGGACTATGAAGGAGCTTCAATCCTTTCGTGGGCACACGAAAGATGTAACATCTTTGGCGTGGCATCCCTTCCATGAAGAATATTTTGTCAGTGGGAGCTCTGACGGCTCCATTTGTCATTGGATTGTGGGGCATGAAAACCCGCAGATTGAAATCCCAAATGCTCATGATAACAGTGTTTGGGATCTTGCATGGCATCCTATTGGATATCTTCTTTGCAGTGGTAGCAATGATCACACAACCAAGTTTTGGTGCAGAAACAGGCCTGCAGATAATCCCCGAGATGTCCTTATGCAGAACCAAGGCTATAATGAACAAGGTTTTGGTAATCGCGAGACTGATAATTTCCAACCATCTGAGGCATCGCCATTTCCTGGATCATTTGTGCCTGGGCTGACACGGAACGAGGGGACCATCCCAGGAATTGGAATAGCAATGCCATTTGATGCATCCTCTCAAGGGGAACATAAACAGCCTCTTCCAGGTTCCATGGCACTGGGAGCTCCTCCTTTGCCACCTGGTCCCCACCCATCACTTCTTGGAAGTGGCCAGCAGCAAGGGTATCAGCAACAACAACACCACCAAGGTCATCCCCAGCAAATGCCTCCAATGCCCAATATGCCTCACCATCAGCTACCACCATCATCTCATATGCCATTGCACCCTCATCATCTTCCCCGGCCTATGCAAATGCTTCCTCACGGTCACATGCCACCTTCCTCAATGCCTATGTCTCATCAGATGCCTGGATCAATGGGAATGCAAGGTGGCATGAATCCTCAGATGTCGCAAAGTCATTTTATGGGTGCTCCTTCAGGAGTATTTCAAGGACCACCAAGCAATGGTGGACCCCAAATGTATCCCCAGGGACGTGGTGGTTTCAACCGTCCACAAATGATTCCAGGCTACAACAACCCTTTCCAACAGCAGCAGCAGCCGCAGCCGCCTTTACCTCCCGGCCCTCCACCAAACACCAATCAGCAACATCAGTAG
Protein Sequence
- >g19350
MYAGGDLHRGSQMPPPPMMRQSSASSSNINPDYHHPSGPFDPNVDSFGAKRMRKHTQRRAVDYTSTVVKYIQARTWQRDSRDRTSLQPTPAAAVDMLPTVAYSDNPSTSFAAKFVHTSLNKNRCSINRVLWTPSGRRLITGSQSGEFTLWNGQSFNFEMILQAHDQPIRSMVWSHNDNYMVSGDDGGTIKYWQNNMNNVKANKTAHKESIRDLSFCKTDLKFCSCSDDTTVKVWDFAKCQEECSLTGHGWDVKSVDWHPTKSLLVSGGKDQLVKLWDTRTERELCSLHGHKNIVLSVKWNQNGNWLLTASKDQIIKLYDIRTMKELQSFRGHTKDVTSLAWHPFHEEYFVSGSSDGSICHWIVGHENPQIEIPNAHDNSVWDLAWHPIGYLLCSGSNDHTTKFWCRNRPADNPRDVLMQNQGYNEQGFGNRETDNFQPSEASPFPGSFVPGLTRNEGTIPGIGIAMPFDASSQGEHKQPLPGSMALGAPPLPPGPHPSLLGSGQQQGYQQQQHHQGHPQQMPPMPNMPHHQLPPSSHMPLHPHHLPRPMQMLPHGHMPPSSMPMSHQMPGSMGMQGGMNPQMSQSHFMGAPSGVFQGPPSNGGPQMYPQGRGGFNRPQMIPGYNNPFQQQQQPQPPLPPGPPPNTNQQHQ