Information report for g14043
Gene Details
Functional Annotation
- encodes a component of the FAcilitates Chromatin Transcription (FACT) complex, SSRP1. Along with STP16 binds to the promoter of FLC.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc05731
- Arabidopsis thaliana: AT3G28730
- Brassica napus: BnaC02G0470300ZS, BnaA06G0375900ZS, BnaC07G0315400ZS
- Brassica oleracea: Bo7g091510
- Brassica rapa: Bra033055, Bra025350
- Capsicum annuum: T459_06960
- Nicotiana attenuata: A4A49_40133
- Prunus avium: Pav_sc0000299.1_g130.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_3G271500
- Sesamum indicum: SIN_1007980
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400018099
- Vitis vinifera: VIT_14s0108g00040
Gene Resources
- Pfam: PF00505 PF17292 PF08512 PF03531
- UniProt: D7LM34
- EMBL: GL348717
- AlphaFoldDB: D7LM34
- KEGG: aly:9311537
- InterPro: IPR000969 , IPR009071 , IPR011993 , IPR013719 , IPR024954 , IPR035417 , IPR036910 , IPR038167 , IPR048993 , IPR050454
- PANTHER: PTHR45849 , PTHR45849:SF1
- SUPFAM: SSF47095 , SSF50729
- PROSITE: PS50118
- Gene3D: 1.10.30.10 , 2.30.29.150 , 2.30.29.220 , 2.30.29.30
- OrthoDB: D7LM34
- CDD: cd13230 , cd13231 , cd22013
- eggNOG: KOG0526
- STRING: 81972.D7LM34
- HOGENOM: CLU_017374_2_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >g14043
GTGCACCACCGCCTGAGTATCTATATAAGTTCATTATCAATGTGTGAAAAAAAAATCACTCTCTCTCTGTCTTTAGCTCTCTCTCGTGACTCTCACCGGAAACCATGACGGACAGCCATTCCTTCAATAGCATCTCCCTCAGCGGCCGCGGCGGAACGGTACTCTCCTCTCTCTCTATCTCTCTATCTCTCACTTCCTTCAAAGTTTTCACCTTTTCCTCTTCCTTCAAAAACCCTAATTTCTTCTCCCTGTATCCGTTTCTACTTCCGCCGTTCGATTCCAAAAGAAAAGAATGACACAAATCTAGGGCAAAAAAAAAGATTGTCGCTTTCATTTTTCAATTGTGTTGTTTTCTTGTTTACAATTGTTGAAAGCTGCGGTAGTTTCTGGGGTTTTTAAGGGCTAATTAGGGTTTCAATTTTGGTAATTTTAGAACCCTGGACTTCTTAAAATCAACTCTGGAGGAATTCAATGGAAGAAACAAGGTGGTGGAAAAGCTGTGGAAGTTGATAGATCTGATATTGTAAGTGTTAGTTGGACAAAAGTTACAAAGAGTAATCGATTGGGAGTCAAAACCAAAGATGGATTGTACTATAAGTTCGTTGGATTTAGAGATCAGGTTTGTGTTTATATATATCTTCTTACTTCTGTTTTGATATGATATTTGTTTTGTTTGTGCTTGTTTTGAGATTTTTGTGTTTGTTTGGTTTATAGGATGTTCCTAGTCTGAGTAGCTTTTTCCAAAGTTCTTATGGAAAAACACCGGAAGAGAAGCAATTATCGATTAGTGGTCGTAATTGGGGTGAGGTGGATTTACATGGTGAGAGTTGTTATAACTTTTAGGCACACTTAAGGTTGTTGTCTAGTTTGTTTGTGGATTTTAAAGGAGAAGTTTTTGTTTCGTTGTGTAGGGAATACACTAACCTTTTTGGTTGGATCAAAGCAAGCTTTTGAAGTATCTTTAGCTGATGTTTCACAGACTCAGATTCAAGGGAAAGATGATGTTACTCTGGAGTTTCATGTTGATGATACTGCTGGTGCTAATGAGGTACTTTCTATTTCAATCTGGTTTTTTAGATATGTCATCTCTAGGCTGTTTTGTATGTAAGGGTACATACGTTAGCTGGTTTACTGATTATATTCTACGTGTTTACAGAAAGACTCGTTGATGGAGATTTGTTTTCATATTCCTAGTTCCAACACCCAGTTTGTTGGTGATGAAAACCGTCCACCTTCTCATGTAAGTTCCCAAACCTTTTTAATTATATGTATGTGTCTCGAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTGATGCTAAGAGCATGTCTCAGGTTTTCAATGACACAATCGTTGCAATGGCTGATGTTAGTTCTGGAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCGGGTGGTTTTTCTTCGACGGATGAGAGTTGGATCGATCGATCCCCTCCTGGGATCGATCGATCCCGAAGCTCCTGGGGTCAAGCTCTGCACCCTGCTTCAAATGCTCGCCAGATTGACCTGTCTTCACTAATTCGGGTGTAACTCTTAAATGCACCGTTCGATTTCCGTCAAACAACTTGGAAAATCAAGCTAACATCTTCAT
CDS Sequence
- >g14043
ATGACGGACAGCCATTCCTTCAATAGCATCTCCCTCAGCGGCCGCGGCGGAACGAACCCTGGACTTCTTAAAATCAACTCTGGAGGAATTCAATGGAAGAAACAAGGTGGTGGAAAAGCTGTGGAAGTTGATAGATCTGATATTGTAAGTGTTAGTTGGACAAAAGTTACAAAGAGTAATCGATTGGGAGTCAAAACCAAAGATGGATTGTACTATAAGTTCGTTGGATTTAGAGATCAGGATGTTCCTAGTCTGAGTAGCTTTTTCCAAAGTTCTTATGGAAAAACACCGGAAGAGAAGCAATTATCGATTAGTGGTCGTAATTGGGGTGAGGTGGATTTACATGGGAATACACTAACCTTTTTGGTTGGATCAAAGCAAGCTTTTGAAGTATCTTTAGCTGATGTTTCACAGACTCAGATTCAAGGGAAAGATGATGTTACTCTGGAGTTTCATGTTGATGATACTGCTGGTGCTAATGAGAAAGACTCGTTGATGGAGATTTGTTTTCATATTCCTAGTTCCAACACCCAGTTTGTTGGTGATGAAAACCGTCCACCTTCTCATGTTTTCAATGACACAATCGTTGCAATGGCTGATAGTTGGATCGATCGATCCCCTCCTGGGATCGATCGATCCCGAAGCTCCTGGGGTCAAGCTCTGCACCCTGCTTCAAATGCTCGCCAGATTGACCTGTCTTCACTAATTCGGGTGTAA
Protein Sequence
- >g14043
MTDSHSFNSISLSGRGGTNPGLLKINSGGIQWKKQGGGKAVEVDRSDIVSVSWTKVTKSNRLGVKTKDGLYYKFVGFRDQDVPSLSSFFQSSYGKTPEEKQLSISGRNWGEVDLHGNTLTFLVGSKQAFEVSLADVSQTQIQGKDDVTLEFHVDDTAGANEKDSLMEICFHIPSSNTQFVGDENRPPSHVFNDTIVAMADSWIDRSPPGIDRSRSSWGQALHPASNARQIDLSSLIRV