Information report for g12480
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a AP2 domain transcription factor that can repress flowering. SNZ and its paralogous gene, SCHLAFMUTZE (SMZ), share a signature with partial complementarity to the miR172 microRNA, whose precursor is induced upon flowering.
- member of ubiquitin-conjugating E2-proteins
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G39250.1, AT2G39250
- Brassica napus: BnaA09G0508900ZS
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_1g12480v3
CACAAGACTATGGTTTATAAAAGAGATATATAAGTCACATAATCCTTCCGTATCATTCAATAGATGATCAATAAAAAAAGGGAAAAAATTTAAAAGTAATCACCTCAGATCAAAACAAGTGGTCAAAGAAGAAGAATTGTTCATGGCAATGAAAGGGAATCCTGATGATGCTACAACTGTCTTTAACGGTTTCATTTCTGTGATCGGTAGATATACCGGCAACGGCTTCCCATGCAAACTCATCACAGATCGATTCAAACCCATGTAATAATCTGCTGGTTCCAAAATTCTTTTTTTTGACGATGAAGATATTCCAAGACTTAGCTCGAGATCGTTGTGCTCATTTCCTGAAAACATTCCAAGTTTTTTTGTGAATCATGTCATAACGTCGACAATAACTAATCTTAAACTAAATATATCGCGTTGAATAAGATATATAGTTTAGTGGTTTGTGTTAGTGTTGTCGTTGAGTTAAATCTATATACTACTCCCTCCGTTTTCGAATAGTTGTCGTTTTAGAGAAATTTTTTTGTTTTTAATTAGTTGTCGTTTTCAGTTTTCGATGCAAAATTTATTACTTTTTTATTTTTTATATTTATTTTTATTATGCAACTTGATTTACTATTGGTTAAATTATGTTTAGGTAGATAATTAATAATATTTTTATATTGAAAAACTAACAACATTAATAGTTTCTTAATTTGTGTGCGTATAGTTAAAACGACAACTATTCGAAAATGGAGGGAGTAATATATATGCCTTGAATTTCTAACGAGAATGGTTCTAAAGGTAAGGCTAGCTAGCTAGGGTTTGGTTGATCAAATTAAAGGTGTATGTGCAACATGTGTCAAAGTGAAGTTGTAATTAGGGTTTTTAGCTTTCACCTAAATGACATAACACATAACAATGATTTAGTATGCATATTTATAATCGTGACCCTACATTTATAAATTACCTTTATTATGGGCACCCAACTTAATATCCCCTTCCATCTTTCTTATCTCATTGCATTTTGCTGCTGCTGCATTCCATCCCCTATGAGTATTCATTCAAACACTTTTATAAATCTTCCACATTCTTAATATTGAATGAAATTGTACCCGCGAGAAGAGTAATCGAACCTGTTTTGGAAGAGATGGATGTGATCATTTCTCGTATGGGTGTTTTTGTATTTAGAACCTCCTCTTGCTAAGCTTGCACTCGCTCGTCTATGAGATTGCACAAACTCTTCTTTGCTTAAATTCTTCATCTATCATATCATTCAAAATATCCATATATTAGTAAACGAAGGTCCAAATTCTCTGTCTCTTTATATATACACATATCTAAACCTAATTAATTAATTAGCTTAGCTCTAATATATGAAACAATAATTAAGTTTATATGAAAATAACCTTTTCAATGTCCTGTTTGTAATCATCCACGATAAAATTGATATCTGCTTGGAGTCCCCGGAATCTGATAGCAGCTCGGTCGTACGCTCTGTTATGTATTTGAATATATAAGTCAACTAATATTTCTCTAAAGATATAAATTCTTTTTAAAATGTCAAAAAAAAAAAAGAACAAGAAAACATTAATTTTTGAAAGGACGAGTGTTATGTCATGTAACATCTGTTACTATATATTTCTTACACCTTGCGGCTGTGTAGGCTGTGTCGAAACCACCTGTTTTTGACCAAACAAAAGACAAAAATGAAAAAGTGAAAATCTTTCATCATTCAGACTTCTCTAATCCAAGAAAGTGTTTAACCTTAATATAATAAGAAAGAAATAGAAAATCTCATCTACTTACCCAAATAAACCTGTTTTCCACAGTCCCTACACATAAATCCCAAAACCAAGTGTTAATCTTAAAAATAATTAAGAAAATCTTTTATAACTTAAGTTTATGAATGAATGAATACCAAATATGAGATTCCCAACGGCCAGTTCGACGGTAAAAGGTGACGCCACGATAATGGGAGCTTCTGGATCTTGGACCACGTCGGCTCTTCTTCTTCATCACCAACATTTCTTGTTTATTTCTTTGCATCGACGACAGATTCAACCACTCGTTTCCGGCGCCGGATAACACACTCTCCGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGATTTCAACCTCTTCTTTTCTTTTAAGGATTCCGAATGTAATTAAAGACAAGTTGTCGTTTGAGGGATTAATGGAATCTTCTTCTTGATTGACGATGGAGGTTGGTACTTTGCAATCGTCATCTTCGTTGTGTGTCGACAAGATTCCGTGGTTGAGATCCAACATGAGTATTTGTAGGAAGGAGTAAAATGGCGTCGTTTGTGTGATTGTTCCGGTGACTCTAGAGAGAGTCTATCTAAAAGAAGGAAGAAAAAGAACGT
CDS Sequence
- >BRADI_1g12480v3
ATGTTGGATCTCAACCACGGAATCTTGTCGACACACAACGAAGATGACGATTGCAAAGTACCAACCTCCATCGTCAATCAAGAAGAAGATTCCATTAATCCCTCAAACGACAACTTGTCTTTAATTACATTCGGAATCCTTAAAAGAAAAGAAGAGGTTGAAATCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGAGAGTGTGTTATCCGGCGCCGGAAACGAGTGGTTGAATCTGTCGTCGATGCAAAGAAATAAACAAGAAATGTTGGTGATGAAGAAGAAGAGCCGACGTGGTCCAAGATCCAGAAGCTCCCATTATCGTGGCGTCACCTTTTACCGTCGAACTGGCCGTTGGGAATCTCATATTTGGGACTGTGGAAAACAGGTTTATTTGGGTAAGTGGTTTCGACACAGCCTACACAGCCGCAAGGTAGCGTACGACCGAGCTGCTATCAGATTCCGGGGACTCCAAGCAGATATCAATTTTATCGTGGATGATTACAAACAGGACATTGAAAAGATGAAGAATTTAAGCAAAGAAGAGTTTGTGCAATCTCATAGACGAGCGAGTGCAAGCTTAGCAAGAGGAGGTTCTAAATACAAAAACACCCATACGAGAAATGATCACATCCATCTCTTCCAAAACAGGGGATGGAATGCAGCAGCAGCAAAATGCAATGAGATAAGAAAGATGGAAGGGGATATTAAGTTGGGTGCCCATAATAAAGGAAATGAGCACAACGATCTCGAGCTAAGTCTTGGAATATCTTCATCGTCAAAAAAAAGAATTTTGGAACCAGCAGATTATTACATGGGTTTGAATCGATCTGTGATGAGTTTGCATGGGAAGCCGTTGCCGGTATATCTACCGATCACAGAAATGAAACCGTTAAAGACAGTTGTAGCATCATCAGGATTCCCTTTCATTGCCATGAACAATTCTTCTTCTTTGACCACTTGTTTTGATCTGAGGTGA
Protein Sequence
- >BRADI_1g12480v3
MLDLNHGILSTHNEDDDCKVPTSIVNQEEDSINPSNDNLSLITFGILKRKEEVEILPPPPPPESVLSGAGNEWLNLSSMQRNKQEMLVMKKKSRRGPRSRSSHYRGVTFYRRTGRWESHIWDCGKQVYLGKWFRHSLHSRKVAYDRAAIRFRGLQADINFIVDDYKQDIEKMKNLSKEEFVQSHRRASASLARGGSKYKNTHTRNDHIHLFQNRGWNAAAAKCNEIRKMEGDIKLGAHNKGNEHNDLELSLGISSSSKKRILEPADYYMGLNRSVMSLHGKPLPVYLPITEMKPLKTVVASSGFPFIAMNNSSSLTTCFDLR