Information report for fgenesh2_kg.7__1222__AT4G29730.1
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- cell cycle-related repressor genes encoding WD-repeat proteins.
Homologous
- Brassica napus: BnaA09G0121700ZS, BnaA07G0011200ZS, BnaA01G0076000ZS, BnaA09G0608600ZS, BnaC08G0462300ZS, BnaC09G0127500ZS
- Brassica oleracea: Bo9g027720, Bo1g016080, Bo8g102680, Bo7g005750
- Brassica rapa: Bra040678, Bra011133, Bra031085
- Citrullus lanatus: Cla97C03G065860
- Glycine max: Glyma.15G169800
- Gossypium hirsutum: Gohir.A06G072700
- Manihot esculenta: MANES_16G101900
Gene Resources
- Pfam: PF12265 PF00400
- UniProt: D7MCI5
- RefSeq: XP_002867391.1
- EMBL: GL348719
- AlphaFoldDB: D7MCI5
- InterPro: IPR001680 , IPR015943 , IPR022052 , IPR036322 , IPR050459
- PANTHER: PTHR22850
- SUPFAM: SSF50978
- PROSITE: PS50082 , PS50294
- Gene3D: 2.130.10.10
- OrthoDB: D7MCI5
- eggNOG: KOG0264
- STRING: 81972.D7MCI5
- HOGENOM: CLU_020445_2_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.7__1222__AT4G29730.1
AAGAAGAAAATGGAAAGCGAAGAAGCAGCAGCGACTGTTCAAGCCACCAGGCCGAGAAGAGTATCTAGGACTCCGGTGACGGCCATTTTGACGAAGAAGAGAGGTCGGAAACCTAAGAAAAACGACGAGTCTCATTCACCTTTTTCTCAACAGCAGAGTCAAAAGGCCACTGTTGACGACAAGTACTCTCAGTGGAAGACTCTTCTTCCCATTCTCTATGATTCGTTTGTTAACCATACCCTCGTCTGGCCCTCTCTCTCTTGCAGGTCTGTGTTTTCTGTTTTTGGGTTTTCTGTTTCTAGGGTTTTGGAGAAAGTTGTTTTCTTTTTGGGAAATAAAAATTCAAGCTTTGTGCTTTTGGTCAGGCGATTAAGTTACATTTCCGTTTTTACTAGTGAAATGCTGATAGATTGAGAGTTTTTCTTAGCAGGTTTCTGGAATTTGTGAGATTAGGACATGTTCTAGTTAGGGTTTATGATTTAGCTCAGTCTTCATGCTTTTATGTGTTTCTTTCTCTTATATTTTGATCTGTTACAGCTCATTAGCTAACTGATGTTTCCAATTTGTACCTCTGGAACTTGGTTTGATAGGAGAATGATCGATTGGTCATTGTTAACACTTGACCAACTCGGTTATAGTGTTCTGTTTTGTTACTTTTTGGTTTCAGATGTTTAATAGTGCTAAGATTTAGTGAAGTGTTTAGATTTTGTGTAAAGAGGTTCGATTTCGTTGTAACTGTTGTTTGATTTGAGCAGATGGGGGCCACAGCTTGAGCAAGCAGCTTCTAAGACTCAACGTCTCTATCTCTCGGAACAAGTGAGTTTGCTCACTTTTTCTTGTGGTTTGTACATTTTTTCTTTGAGGAAAAGTATCCAAAGTTTGTCTACTGCTCCTTATGTTCACTTTTTTTTTCCTGGTTCTGTCACTAGACGAATGGCAGTGTGCCTAATACTTTGGTCATAGCCAATTGCGAATCTGTTAATAGGCAGGTAATTAGTTTTTCTCTACCAAAACTTGTGGTTTTTTCCTTGTGTTACTCTTGGTGAGATGAAATTATTGAAATACCGTTTCTTTTTATGCTTTCAGCTTAATGAAGAGGCACACTCTCCAACTGTGAAGAAGTACAAGACCATCATCCACCCTGGAGAGGTGTGAGTTCTACCCTTTTGAGAGATATTCCTGTATTCTCATTGTTGTTTCTTAGATGGATTTACTGAATCAGCATTTCGTTTAGGATTTTGAGTGCTGAAAAAGACTCTGTATTTGTACCCTTCATTAATCGCAGGTCAACAGAATCAGGGAACTCCCACAAAATAGCAAGATTGTAGCTACTCACACCGACAGTCCTGATGTAAGCCCTGCTTGCTTTCGTTATTCAGTATCCTTGTTTTGAACGTAGTTTCCAGTTTCAGTCATGCAAGTATGATATATTGGTTTTCAGGTTCTCATTTGGGACACTGAGACTCAACCAGACCGGTATGCTGTGCTTGGAGCTCCACATTCTCGTCCAGATTTGGTATGCTCTTGTGAGAATTTTTGTGTTGTCGCACTGAGTTAAACCACCTGCTTGTGCATCATCTTAACAAACGAAAGAGCTACTCCTTTTGCATCACCTGAACAACTTTTATTTTCAGTTACTAACTGGGCACCAGGATAATGCTGAATTTGCTCTTGCAATGTGCCCAATCGAACCTTTTGTTCTCTCTGGAGGTTTGTATCAGTTCTATCTTTGTGTCATATCTTGTGGTTTGCAAGTTTTTCATCAAAGATTCTTCCGTGCAGGGAAGGACAAGTCCGTTGTTTTGTGGAGTATCCAAGACCATATCGCAATGGCTGGTACGGATTCCAAATCCCCTGGATCAAGCTTCAAGCAGACTGGTGAAGGTAGTAATAAAACTGGTTGTCCTTCTGTTGGCCCTCGAGGCGTATATCATGGCCACGAAGATACAGTTGAAGACGTGGCATTCTGTCCATCTAGGTAACTTCTTGGGTCTGTCTCCTTTTTTTTTAAATCTTTTAAGTTTACACGCAAATGCAGAACTACTGAAAATTTTCTGATGCTTTTGGTAAAAAATTCTGGTGATTTTTTTTTGCCCTGCAGTGCACAAGAATTCTGCAGTGTTGGTGATGATTCTTGCCTAATGCTATGGGACGCAAGAACTGGCACTGGTCCTGCCATAAAGGTATTTCTTTTTTTAACCATATCCACATTTGAGGTTTGACCTTTTGGTCTTGTTTCAGTTTCCATCTGTTTCTTCTTGTGTGCTGGCAGGTTGAGAAGGCACATGATGCTGATCTTCACTGTGTCGATTGGAATCCTCATGACAACAATCTGATCCTGACCGGGTACTGATTTTGCAAACTTAAATACTTGTCCAAAAGTACAGAGATGCTCGTCCTATCACTCTCACTTCTACTTCACTTTTCCAGGTCAGCAGATAACACTGTCCGTGTGTTTGACCGCCGAAACCTGACCTCAAATGGAGTTGGTTCACCTATTTACAAATTTGAAGGCCACAAGGCTGCTGTTCTTTGTGTTCAGGTTTCAACAACATGCCACTACCTCTGTTCTTTTTTGTTTTATTCATATCATTTGTCCTGTAAATGAGAATACCTATCCCCAGTGACAGTGCTTCGTTATCAATTCAGTGGTCTCCTGATAAATCATCTGTGTTTGGGAGTTCAGCAGAAGATGGTCTCTTGAACATATGGGACTATGATACGGTTTGTACATTTTCTCAGATTTGCATTATAAAAGTTTCTCCTACTTTCAAGCTCATCATATTCATATATGCATGTGTGCATCAGGTCGGCAAGAAGTCCGAGCGTGCACCCAAAACTCCTGCTGGGCTTTTCTTCCAGCATGCTGGTCACAGGTTATCAAGACTTAATCCTAATTCGCTTGTTTGCTTTTCCCTTTTACTCTCTTCAGTGTAATCTATAATTTCCTTGTGTATATCTTCTTAGGGACAAATTGGTCGACTTCCACTGGAGCCCAATGGACCCTTGGACTATTGTCAGTGTTTCTGATAATTGTGAGAGTAGCGGTGGAGGTGGTACGTTGCAGGTAAATGGCTTGCTACATTTACTCTGGAACCTACCTATGATTACTTTCTCGGTAAAAATGAAAACTTTGATTTTAAATTAATGCAGATATGGCGGATGAGTGACTTGATTTACAGACCGGAAGATGAAGTCCTGACAGAGCTAGAGAAATTCAAGTCACATGTTTTCACATGTACCTCCAAGCCTTGAGGAAGCAACCACATCATGTCTATTAGTAAGTTGCTGCGGTTTAGGTGTCAGTTTTTGAGAGATAAATCGGTATACTTATGTGATTTAGGTGTTATTTTAGCGGGAAAATTACTTGGTTTGTGTCAGCCAGTAATTCAACATATTGGTAGGTTTAGGACGTCCGGAATCTTATATGGTTCTTGATCCTGTTTCTTCAGGTTAATCGTAGGCACCTAACTTGCTTGTAGTTTCAAACATTGTTGTGAATCCAAACTTGGTTAAGC
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.7__1222__AT4G29730.1
ATGGAAAGCGAAGAAGCAGCAGCGACTGTTCAAGCCACCAGGCCGAGAAGAGTATCTAGGACTCCGGTGACGGCCATTTTGACGAAGAAGAGAGGTCGGAAACCTAAGAAAAACGACGAGTCTCATTCACCTTTTTCTCAACAGCAGAGTCAAAAGGCCACTGTTGACGACAAGTACTCTCAGTGGAAGACTCTTCTTCCCATTCTCTATGATTCGTTTGTTAACCATACCCTCGTCTGGCCCTCTCTCTCTTGCAGATGGGGGCCACAGCTTGAGCAAGCAGCTTCTAAGACTCAACGTCTCTATCTCTCGGAACAAACGAATGGCAGTGTGCCTAATACTTTGGTCATAGCCAATTGCGAATCTGTTAATAGGCAGCTTAATGAAGAGGCACACTCTCCAACTGTGAAGAAGTACAAGACCATCATCCACCCTGGAGAGGTCAACAGAATCAGGGAACTCCCACAAAATAGCAAGATTGTAGCTACTCACACCGACAGTCCTGATGTTCTCATTTGGGACACTGAGACTCAACCAGACCGGTATGCTGTGCTTGGAGCTCCACATTCTCGTCCAGATTTGTTACTAACTGGGCACCAGGATAATGCTGAATTTGCTCTTGCAATGTGCCCAATCGAACCTTTTGTTCTCTCTGGAGGGAAGGACAAGTCCGTTGTTTTGTGGAGTATCCAAGACCATATCGCAATGGCTGGTACGGATTCCAAATCCCCTGGATCAAGCTTCAAGCAGACTGGTGAAGGTAGTAATAAAACTGGTTGTCCTTCTGTTGGCCCTCGAGGCGTATATCATGGCCACGAAGATACAGTTGAAGACGTGGCATTCTGTCCATCTAGTGCACAAGAATTCTGCAGTGTTGGTGATGATTCTTGCCTAATGCTATGGGACGCAAGAACTGGCACTGGTCCTGCCATAAAGGTTGAGAAGGCACATGATGCTGATCTTCACTGTGTCGATTGGAATCCTCATGACAACAATCTGATCCTGACCGGGTCAGCAGATAACACTGTCCGTGTGTTTGACCGCCGAAACCTGACCTCAAATGGAGTTGGTTCACCTATTTACAAATTTGAAGGCCACAAGGCTGCTGTTCTTTGTGTTCAGTGGTCTCCTGATAAATCATCTGTGTTTGGGAGTTCAGCAGAAGATGGTCTCTTGAACATATGGGACTATGATACGGTCGGCAAGAAGTCCGAGCGTGCACCCAAAACTCCTGCTGGGCTTTTCTTCCAGCATGCTGGTCACAGGGACAAATTGGTCGACTTCCACTGGAGCCCAATGGACCCTTGGACTATTGTCAGTGTTTCTGATAATTGTGAGAGTAGCGGTGGAGGTGGTACGTTGCAGATATGGCGGATGAGTGACTTGATTTACAGACCGGAAGATGAAGTCCTGACAGAGCTAGAGAAATTCAAGTCACATGTTTTCACATGTACCTCCAAGCCTTGA
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.7__1222__AT4G29730.1
MESEEAAATVQATRPRRVSRTPVTAILTKKRGRKPKKNDESHSPFSQQQSQKATVDDKYSQWKTLLPILYDSFVNHTLVWPSLSCRWGPQLEQAASKTQRLYLSEQTNGSVPNTLVIANCESVNRQLNEEAHSPTVKKYKTIIHPGEVNRIRELPQNSKIVATHTDSPDVLIWDTETQPDRYAVLGAPHSRPDLLLTGHQDNAEFALAMCPIEPFVLSGGKDKSVVLWSIQDHIAMAGTDSKSPGSSFKQTGEGSNKTGCPSVGPRGVYHGHEDTVEDVAFCPSSAQEFCSVGDDSCLMLWDARTGTGPAIKVEKAHDADLHCVDWNPHDNNLILTGSADNTVRVFDRRNLTSNGVGSPIYKFEGHKAAVLCVQWSPDKSSVFGSSAEDGLLNIWDYDTVGKKSERAPKTPAGLFFQHAGHRDKLVDFHWSPMDPWTIVSVSDNCESSGGGGTLQIWRMSDLIYRPEDEVLTELEKFKSHVFTCTSKP