Information report for fgenesh2_kg.6__3138__AT4G11880.1
Gene Details
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Functional Annotation
- AGL12, AGL14, and AGL17 are all preferentially expressed in root tissues and therefore represent the only characterized MADS box genes expressed in roots.;Encodes a MADS‐box protein
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G11880.1, AT4G22950.1
- Brassica napus: BnaC09G0289100ZS, GSBRNA2T00071267001, GSBRNA2T00145444001, BnaA09G0245500ZS
- Brassica oleracea: XP_013609178.1, XP_013609177.1, XP_013609176.1, XP_013609175.1, Bo9g093920
- Brassica rapa: XP_009114656.1, XP_009114655.1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: D7M0B6
- RefSeq: XP_002872630.1
- EMBL: GL348718
- AlphaFoldDB: D7M0B6
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: D7M0B6
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 81972.D7M0B6
- HOGENOM: CLU_053053_0_4_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.6__3138__AT4G11880.1
CTTGCCGACTCTTCCCAAAGACTCTCTCTCTCCCAACTCTATCCTGTTCTTTCTCTTAGAGGCACAAATCAATCAAAAGCATACAGCAAAACAAAGGGGGTAATCTTTTTCTCCTCTATGCCTAAATTTCTGATTGATCTCTTCTCTATTTATAGTAGAAGGTCGATATTGTTCTTGTTCTTCATGTTTGCTGTTCTTGCCATAAGAAATCTCTCTGGATAAAATTCAATAATGGCTTCCACCTAATTTCCTTTCATGGATACTTTATTTTACTGAAATCAACTATTTTTCATTTAATTCTCATGGAATTTTTTTTTATCAAAATTAAGTGTTGATTATAACTTAGGGTTATAAATTGAATTAGGAGATAATGGTGAGGGGAAAGACAGAGATGAAGAGGATAGAAAACGCGACGAGCAGGCAAGTGACTTTCTCCAAGAGAAGAAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTTTGAATTATCAGTCCTTTGTGATGCTGAAGTTGCCCTAATCATCTTCTCTCCTAGAGGCAAACTCTATGAATTCTCTAGCTCATCCAGGTTATCATCTACTTAAGTTTTATGTATTTACACATTTCTGTATATTGATCCATTGCATCATAATCGGTTTTGTCCATAAATTTTTTTACTGAAATCCATTACATTTTTTAGTCTAGACTCGCTTGGCATTGGTTGTTTTAATTTTAATTTTAAACGAAGATCCTTAATTTTAGAAAGAAAGAAAAATCAGATAGATCAGAAATAGAAAGTAAGGATTCGAGATTAAAACGTGGTTCGCACATGGACATGGGTAAATGTTTTTCCTTGAAGTTGCAAAATAAAAGAACGAAGATGTGTGTGGATAGATGATGAGATAGTTTGGAGTCAGGACAACTAACAGAAAATTCTATATATGTAGCAATAAGTTTGAGCACAGTCTTCTTACTCAAATTAGGCAATAAAGTCTCATATGAGATAGATATTCCATTTTTACTTGGTTCATGTTTGACCAGATTTAGAAAAAAAAAAAGGTTCCTTCTTAGAGGTGGGTTTTTCTATATTATATTTCTGCTTATGTGTGTATTTGTATTATGTACAAAGAACTTACACCCAAACACTTACTATTGTATTGATGTACTCGCAAATTTTTTTTTTTTTTCAAAGAGCATGTGCAATGGATAGAGCTCATCTAAATTATTTGGATACATATAATTTAATTTATCTTTTATTTACATTTTAGATTATGAAAAAAAATCAAAACCAATTACATTATGACATGTGTGATAGTAGTCTCTCAAGAGATTGTTAAGAGATTTGCATTGCACATGATCTAACTTATTTCTCTCATATTTTTTTATTATTTTTATTTTTATATTGTTGAGAATATCTGTGAAAACTTTCCACTATTATAAGAATATGAGATTAGACCGCTCATATTCAGATATATATGCATGAATTTGGTTATATTTTGTGATTTGAACTAACAGATTTCACACTAGTACTGATGAGATTTGAGTATTTTGATGTCATGGGAAGCTAAGTATTGCATTATATTTGCATGTATATCATTGTATATACATTCGAAACATTTTTCTAAACTCATTTATGTACATACATAAACAGCTAGGTATGATTATGACATATATTTTTATGCTCGATCACACTAGCTATGTAATACAAGTATAAAATGGTAATCAAAGAAAAATTATGTGCATGCCTTCTGAATATTTTTTTTTTCTTACATGTTCCGGTAAATATCCGATCAACGTTTCTTTAATTTATTTGTGTGTTTAAAAATATGTTTTTTTTTTAACTCTTGGGCAAAGAGAAATTTTAAAACCAAAACAGAAAAACACTAACGGTTTTTTTTTTTAAACCGTCAGTATACTAATTCATTCTGCCATTCCACTAATGCCATCCATAGTTTTATGTATTCTTTTTTTTATAATATACTATTTTGAATGTGTGTATATGTAGATTTATGTATCTATATATGTTCATGTAAGATTTATGTATGTTTATTGAGGTAACAAAGAAGCATTTGCAACAGCAACAGTATACACCCACATAGTACAAAGGCCTCTTTATCTCAGTGATGACAGTGAAGGAGTCATTAGCATGTGTCTAGATCAGAATATGTTGATTCTTTTTATGCTTTCTCTATTTGTTATATTTTTGTGTAGTTAGAAATTATTATGTATGCGTGTTATGTGATTATTTAAATATATGTACGTACTTTATTAGACCAAAAACAATGGTATTTTAGTACTTAAGCAAGACAGGGGTTAATTAATCACAATTAACTAGGTGTGAATTACTTAACTAAGCCATATCCATTTGACTAGACGCTTTGATTCAGTACATCAACATTTTATATTCCCTCCAATTTTTTTACATTTGATGTTTTAGAAAGAAAAGCTTATTCTAAATTAGATGATGTTTTTAACATTTAATGCGAATTAATTAATTTTTTATTAGTTTTGACGATTTATATTCTGCATATTGTTATATTATTGGCTGAATCTTATTGAAATAGATAATAAATGATGTTTTAGTATAGAATTGAACAAAAATTAAATTTCTTAATTTGTATTTAAAAATCTTAAACATCATGTATTAAGAAATAGAGAGGGTAGTAATCTTTTAGTTATTGAGGTCTTTACTCTATTAGTGTTCTAAAAGGCGGTTTAGGTGGTCACCTGGGCTCCGACTAAGCGCTAGGCGCTTAGGTGACGCCTAGATGACCGCTTCGACCATCTAAAATATCACTATCATTAATGCTTGAGGGATCTAGCATGGACTTTTGCTTCCTAATAATTTTGAAAATTTCAGTATACCAAAAACAGTAGAACGATATCAAAAGCGGATACAAGATCTCGGGTCTAACCATAAGAGAGATGATAACTCACAGGTAAACAAACTTTCTTAAATTGTTTGTGTATAATCATTATCATTTTTGCATTTGGAAAAAAAATCTTTTAAATCCATATGCATAAAATATTCTTCTCATGAAATGATCTAGTAATTAAAAAGAATTTCTATATCGATCGATGGTCGTCATAATCTGTTAGGATTCATCGTGTATTTATTAATCCATTCTTGTACCACTTTTAAAAAATGAATATACATGTAAAAATTTATGCTTTATTTATCGAACATGGGTGAGAAAAAATTTGTACTTACAATTTTAGTTAAATATTGTATTTCTATAGATTATCACAGTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTACATGATCAAAATTTGTTGACAGCAGTCGAAGGATGAAACCTATGCCTTGGCGAGAAAGATCGAACATTTGGAGATTTCGACACGGTTTTGAATTCAAAATATTTACGAATATTTTGTTATAAATAGAAATTGTAGGTGTCTATTTACCAATATTTTTTATTTTCTTAAAATACACATTTGCAGAAAAATGCTGGGAGAAGGACTTGACGCATCTTCTATAGAAGAGTTACAACAATTGGAGAACCAGTTGGACAGAAGCTTAATGAAAATAAGAGCCAAAAAGGTAACTTACATTTACATATATGATGTGATCATCATATATTTATTGTTTCATCGAGATTTACGACTATGACGTGGTGGTTTGGTTCGATTTCTGTTTATAAAAAGAAAATTCTATTATCACAAATGAGCTGATTATGTAAACAATAAACACACACATACTTGAAGGCATGCATGCAGCATGCATATGTGATGAGAAAAGGACCTTATATGTTATCTTTTATGAGTCTTTTGTTTTTTTGAAGATATCTTTTATGAGAGTTCTTATTTACTTGTTTTTACCAAAACTTATTTAGCTATTTTATTTCTTAATTTCAGTATCAATTATTACGCGAAGAAATTGAGAAGTTAAAAGAAAAGGTACCACATGTAGCTTTTCATACATCTAGAAGTCTATCTAAATGTATTGGTTAGGTACTAAACATATTTCCTTAATTAAACGGTTAACCATATTTTTTTTGTTTCTTGTCAATACTTTAGGAGAGAAACCTCATTGCACAAAATAAAATGCTGATGGAGAAGGTACATATTAATATTAACATACGGCTTCTTTAGAACTACTATCGTACTGATTTGTATTATAATTCTATTATTATTAATTTATCTGTTTTAATTTTTTTCTTTTCAAAACGAGTGTTTTAATTTGACTATTTGAGGAATGTGTGAATGAAGTATGAGATGCAAGGAAGAGGAATAATAGCAAGAACATCCTCAGAACTGGACATAGATAACAATGATGATATGGAAGTGGTGACTGATTTGTTCATTGGACCTCCTGAGACTCGACACTCCAAAAAGTTTTCTCCTCCAAACTAACACATA
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.6__3138__AT4G11880.1
ATGGTGAGGGGAAAGACAGAGATGAAGAGGATAGAAAACGCGACGAGCAGGCAAGTGACTTTCTCCAAGAGAAGAAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTTTGAATTATCAGTCCTTTGTGATGCTGAAGTTGCCCTAATCATCTTCTCTCCTAGAGGCAAACTCTATGAATTCTCTAGCTCATCCAGTATACCAAAAACAGTAGAACGATATCAAAAGCGGATACAAGATCTCGGGTCTAACCATAAGAGAGATGATAACTCACAGCAGTCGAAGGATGAAACCTATGCCTTGGCGAGAAAGATCGAACATTTGGAGATTTCGACACGAAAAATGCTGGGAGAAGGACTTGACGCATCTTCTATAGAAGAGTTACAACAATTGGAGAACCAGTTGGACAGAAGCTTAATGAAAATAAGAGCCAAAAAGTATCAATTATTACGCGAAGAAATTGAGAAGTTAAAAGAAAAGGAGAGAAACCTCATTGCACAAAATAAAATGCTGATGGAGAAGTATGAGATGCAAGGAAGAGGAATAATAGCAAGAACATCCTCAGAACTGGACATAGATAACAATGATGATATGGAAGTGGTGACTGATTTGTTCATTGGACCTCCTGAGACTCGACACTCCAAAAAGTTTTCTCCTCCAAACTAA
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.6__3138__AT4G11880.1
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