Information report for fgenesh2_kg.6__2924__AT4G09180.1
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein;(source:Araport11)
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G09180.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00073811001, BnaA08G0068000ZS, GSBRNA2T00153299001
- Brassica oleracea: XP_013599939.1, Bo8g026850
- Brassica rapa: XP_009107915.1
Gene Resources
- Pfam: PF00010
- UniProt: D7LX86
- EMBL: GL348718
- AlphaFoldDB: D7LX86
- KEGG: aly:9310632
- InterPro: IPR011598 , IPR036638 , IPR045239 , IPR045843
- PANTHER: PTHR16223 , PTHR16223:SF51
- SUPFAM: SSF47459
- PROSITE: PS50888
- Gene3D: 4.10.280.10
- OrthoDB: D7LX86
- CDD: cd11393
- eggNOG: ENOG502RY1W
- STRING: 81972.D7LX86
- HOGENOM: CLU_063812_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.6__2924__AT4G09180.1
AAAAAATAAAACAGAGCAAGAAACAAAAAAAAAATGTAAAGAAAGAGAAAAAAAACTTTTGTAGTCTTGTCTATTGAAACCAGAGAAAAGCCAAAGGGGGGATGCAATCAACATCCGTCGGTAGTAGCGGCGGTGGTGATGACGGAGGAGGTGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCTGAGTCGAAGTGGACTATCTCGGATACGTTCAGCTCCAGCGACTTGGCTTGAGGCTTTACTTGAGGAAGATGAAGAAGAGTCTTTGAAACCTAATCTTGGTCTCACCGATTTGCTTACGGGGAACTCGAACGATTTACCGACAAGTCGTAGTTCGTTCGAGTTCCCGATTCCGGTTGAGCAAGGTTTGTATCAGCAAGGTGGGTTTCACCGACAGAATAGTACTCCGGCGGATTTTCTTAGTGGTTCTGATGGATTTATCCAGAGCTTTGGGATTCCGGCGAATTACGATTACTTATCGGGGAATATCGATGTTTCTCCGGGAAGTAAGCGGTCTAGAGAAATGGAAGCACTCTTCTCTTCTCCTGAGTTTACTTCTCAAATGGTAAAAGATATATGTTCTATTAATCATTTGAGTCAACCAAAAGTAGTTCTTAAAATTAGGGTTTTTTAGTTTACCAAAAATAGGAAGGACTTAACTGAATTAGTACTTGTTTTAGTTTTGTCAAGTTGTTTGAAATTGTAGTTAAATTGCTGACTAATGTTCTCGATATTGAAAAGACCAGTCTTGTCTTAAAATTGACAACTTGTGTTTTTCTGAACCAAACTCAGCAAGTTGCAGTTTCTATTTTAACCCAAAAAAAAATGTGGCAGTTTTTATTTCTCTTTTTGTTGTTGCCTCTGTTGCTTTGATGTGTGAATGTGAACATTAAAGAAAGCTCATAAGGGTAACTTGTTGAGAAGAACATAAGGCCACATGATGATATATACTTCTTTGTTCATGTTGATTTTGGTGGCTGATGTGTAAATATGTATTGATCTTCCTCATCGTTAGGATTGTGTTACTATACTTGATACACAACTTGGATTATATATGTAACCTATGTTATGTATTGAGTGATGTTGATTAAGGTTTCAGGCTTAGTGCTGATTGCCTCTTTTCGGGTTTTTTTCTGGAAGTAGAAAGGAGAGCAAAGCAGTGGTCAAGTTCCTGCCGGGGTATCAGGCATGACAGATATGAACATGGAGAACCTTATGGAGGACTCTGTTGCTTTTAGGGTTCGTGCTAAACGCGGTTGTGCAACTCATCCCCGAAGCATCGCCGAGAGGGTAAAAAATATTCAATCTTTATTTTAAATTTGTGAAGTTTAATGATAAAGTGGTTTTATCTTAAAATTCAATTCGTTGAAGTTTAGTGATACAACTTTTATATTTACTTTCAATTCACGGATGTTCAATGATTCACTGTATGCTTCATTGAACAGAGAATTGTTCTGTTCTGGTCAGCGATTTATGTCTACCTTTCATTGTGTAGGTACGAAGGACGCGGATTAGTGATCGGATAAGGAAGCTACAAGAGCTTGTACCTAACATGGACAAGGTAATATCTTTTTCAGCGTATATATAATCTGATGATCTCGAATGTCTTACACAATAATATTGACTAGAAATGGGTCAAAGATTATATATGCTTAAATCAAGTGTAGAAGTTAGAGGTTAATAGGTTAGCCGTATAGAAGACAAATTAAATATGACTGTTGATGGTTTTGATGCAACTTCAGAGACACGGTTCTCAGCTCCGCAACTTAAGTAATTTACAAACTGTGGTTTAAACTATTAAAACCCAATGGGAAGGATCTTGATATCGACTCGAATTGTTGTCACCTCGATCAAATATGTATGAATTTGGTTTCATCTCTATAGATTATGAACAACTGATGATAACTTCGGTTTCTGGCATATATAAAGATCTTGAATCTACGCTGTGTGTATATCGGTTTACTTTTTGTCTTTGTTGCAGCAAACCAACACTGCAGACATGTTAGAAGAAGCTGTAGAATACGTGAAAGTTCTTCAAAGGCAGATTCAGGTAAATTATCTAAGTTAATATGTATGTGCGCATAAAACCTTCAAGAAGAATCCAATAGTAAAATTGATTAGTCAAAAAAGTATTTAGTAAAAAGAGTTCTTAATATTGAACTATACATTTTGAGTTTGTTTTACTTGGTGTGAAAAATTTAGGAGTTAACAGAAGAACAGAAGAGGTGCACATGCATACCAAAAGAAGAATAATAAGGTTTGCTCCTGATTTGTTTTATATCTGCTAAATGGCAATGATCTGATCGAAAAAAATCGAAAGATGATCTTTTTGCTCGAATTAGATGGATGTCAGGTTGAAAAGTATATTATTTGATAAAATGGATGTAGGTGTAAAATAAAAATTTTGTACAATAATGAAGAAAGTTCAAAAAAATTAATGAAAACATATATTCTTTATAACATTAGTGAAATGACTTT
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.6__2924__AT4G09180.1
ATGCAATCAACATCCGTCGGTAGTAGCGGCGGTGGTGATGACGGAGGAGGTGGCAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCTGAGTCGAAGTGGACTATCTCGGATACGTTCAGCTCCAGCGACTTGGCTTGAGGCTTTACTTGAGGAAGATGAAGAAGAGTCTTTGAAACCTAATCTTGGTCTCACCGATTTGCTTACGGGGAACTCGAACGATTTACCGACAAGTCGTAGTTCGTTCGAGTTCCCGATTCCGGTTGAGCAAGGTTTGTATCAGCAAGGTGGGTTTCACCGACAGAATAGTACTCCGGCGGATTTTCTTAGTGGTTCTGATGGATTTATCCAGAGCTTTGGGATTCCGGCGAATTACGATTACTTATCGGGGAATATCGATGTTTCTCCGGGAAGTAAGCGGTCTAGAGAAATGGAAGCACTCTTCTCTTCTCCTGAGTTTACTTCTCAAATGAAAGGAGAGCAAAGCAGTGGTCAAGTTCCTGCCGGGGTATCAGGCATGACAGATATGAACATGGAGAACCTTATGGAGGACTCTGTTGCTTTTAGGGTTCGTGCTAAACGCGGTTGTGCAACTCATCCCCGAAGCATCGCCGAGAGGGTACGAAGGACGCGGATTAGTGATCGGATAAGGAAGCTACAAGAGCTTGTACCTAACATGGACAAGCAAACCAACACTGCAGACATGTTAGAAGAAGCTGTAGAATACGTGAAAGTTCTTCAAAGGCAGATTCAGGAGTTAACAGAAGAACAGAAGAGGTGCACATGCATACCAAAAGAAGAATAA
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.6__2924__AT4G09180.1
MQSTSVGSSGGGDDGGGGRGGGGGGLSRSGLSRIRSAPATWLEALLEEDEEESLKPNLGLTDLLTGNSNDLPTSRSSFEFPIPVEQGLYQQGGFHRQNSTPADFLSGSDGFIQSFGIPANYDYLSGNIDVSPGSKRSREMEALFSSPEFTSQMKGEQSSGQVPAGVSGMTDMNMENLMEDSVAFRVRAKRGCATHPRSIAERVRRTRISDRIRKLQELVPNMDKQTNTADMLEEAVEYVKVLQRQIQELTEEQKRCTCIPKEE