Information report for fgenesh2_kg.6__1780__AT5G17800.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Member of the R2R3 factor gene family.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G17800.1
- Brassica napus: BnaA03G0075300ZS, GSBRNA2T00130200001, BnaC02G0083300ZS, BnaA02G0071700ZS, GSBRNA2T00114833001
- Brassica oleracea: XP_013618812.1, Bo2g013970
- Brassica rapa: XP_009131611.1, Bra006422
Gene Resources
- Pfam: PF00249
- UniProt: D7LXM8
- RefSeq: XP_002871782.1
- EMBL: GL348718
- AlphaFoldDB: D7LXM8
- InterPro: IPR001005 , IPR009057 , IPR017930 , IPR050560
- PANTHER: PTHR45614 , PTHR45614:SF259
- SUPFAM: SSF46689
- PROSITE: PS50090 , PS51294
- Gene3D: 1.10.10.60
- OrthoDB: D7LXM8
- CDD: cd00167
- eggNOG: KOG0048
- STRING: 81972.D7LXM8
- HOGENOM: CLU_028567_18_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.6__1780__AT5G17800.1
TGAATCCAAATCTCCTTGAGAAAGATCTAAGTGGTAAGGAAACTACAAATGGGTCAAGAAGATACGAAGAAGCAAACAACTTCGGATCTCTACCAAACTCACACACTGCTGCTTGTAAAACGTCACTCAACAACCTCTCTATCTCTAGAAACCTTTCTCATAACAAATCAGCCTCAGTCTTGCAGTCGGAAGATGAACATGGGAAAGAGAGTGGTGAAAACGAAAAGAGTTTAGGAATGAGGGGTAAAAGTGGAATTAACACAAAAGTATGCTCACGAGGACACTGGAGACCAACAGAAGATGCTAAACTCAAGGAGCTTGTTGCCCAGTTTGGTCCCCAAAACTGGAACTTGATTGCTCACCACCTTCTTGGTAGATCAGGTACATTTATTTTACTTGGTTTTGTTTTCCTTCACTTTTCTTACTCAAAATTCCGCAAATGTAACTATTTTTAAGTAGAAGAAAAATAATTAAATATGTGAAAAAAACTTTGGTGAGTTGAGTTTCCAAAGTTATTAAGCATTTTCGTAACCGTGTTTGGATTGTTTTTTAACATAGCTTTTATGATCTAATAAACGAGTTAGACTAAGTACACAACAATACATATTAGCTAGTGACATAATGCTTGATAGTAACTAATTAATATAATTTGAGAGATACGTAACTAATTAATGTTGCTTCTTTGACTACAGGCAAGAGTTGTAGATTGAGATGGTTTAACCAACTAGACCCAAGGATTAACAAGAGAGCCTTCACGGAGGAAGAAGAGCTTAGGCTTTTAGCAGCTCACCGAGCCTATGGCAACAAGTGGGCTTTGATCTCTCGTCTCTTCCCCGGACGTACCGATAACGCCGTCAAGAACCACTGGCACGTCATCATGGCTCGACGGACTAGAGAAAGCCAACGACAACGTCAACAGCCTCCTCCGGCGCTGTCAAGAGACGCTGAAATGACGGTTTCGTCCTCTTGCCGCTACAATCAAGGTAAGTTCATCAATGGAGAAGATGATGAAGATGACGATGACGATGGCTCAGCTGTCTCGACTTGTACGACGGAGCTCTCTCTCACTCCGCCTTCTTCAGCTTACCAGCCTCGCTTCTTTAATTACGATAATACCCTTGCATCAGGTAACATTTTATTTGTTTGCTTTTATTTATTTTATTATGTTTACATTTTTTTTTTGTCTCTATTAAATTATTTTCATGACCTTGTTGAGACATTTAAAGTATATAGAAACATGGAATGTTTTTATTTTCTTTTTCGGTTTTCTTGAGAAGTGTTTTTGTGAATCTAACTATAATGATTTCGGTCGGTTGGTCGAGATCAGATTGCAATCTTTATTGGGTGTATCGTTGATCATGTTCGGTTTATACTTTAACCGGTATTCCCAAATATGATTTGTGGTCAAAATTTAGCTTAGATTTCAGTCTTGTTAAAAAAAATTTGAATGTTCAAAGCATAGTAAAAGATAATTTTGGCCGATATGTTGTATAACCAACGACGAGTGACCACTTCCTACAATTTTCATATATATGGCAATAATTGTAAATTTGAATGACAAGAAAAGAAAGAAACAGTTTTTTACATCGTAAGAGTACCTATAGGCATAATAATATAAGGAGGTGAAGTACTATTGTCACGTTACTATTTCAATATAACAAAATTTCACGTGGGGGCTGAGAAATTATTTTTCTAATTTTGCAGGCAAAGATGGTCAGTGTGTGCAGAGAGCAGAAGTAAATGGCATATATGGTAAAAAGATGGACCATCAAAATCACCACACAATCTCAGTCAGTGAAAGAAAGGTGGAGCTGAAGATGAAGAATGGCTATTACTTCTTTGATTTTCTTGGAGTTGGAGCTTCTTGATTAATTAGTTGCAGAACTAGGGTTCAATGTTGAGGGAATTGTGAGATAAAAAATGGCTTTAGTTTCTTCTATTCTCCTTGTTAATTTTAGGCATGTTTGTTTAACATCTTAATTTGGGCTTTGGAAGAAGTTGGCTGGGGTATAAGGGAAAACTGGAAAAAAAAAATCAAGAAGTTAGTAATTAAGAAATAAAATAAAAAGTTGA
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.6__1780__AT5G17800.1
ATGAATCCAAATCTCCTTGAGAAAGATCTAAGTGGTAAGGAAACTACAAATGGGTCAAGAAGATACGAAGAAGCAAACAACTTCGGATCTCTACCAAACTCACACACTGCTGCTTGTAAAACGTCACTCAACAACCTCTCTATCTCTAGAAACCTTTCTCATAACAAATCAGCCTCAGTCTTGCAGTCGGAAGATGAACATGGGAAAGAGAGTGGTGAAAACGAAAAGAGTTTAGGAATGAGGGGTAAAAGTGGAATTAACACAAAAGTATGCTCACGAGGACACTGGAGACCAACAGAAGATGCTAAACTCAAGGAGCTTGTTGCCCAGTTTGGTCCCCAAAACTGGAACTTGATTGCTCACCACCTTCTTGGTAGATCAGGCAAGAGTTGTAGATTGAGATGGTTTAACCAACTAGACCCAAGGATTAACAAGAGAGCCTTCACGGAGGAAGAAGAGCTTAGGCTTTTAGCAGCTCACCGAGCCTATGGCAACAAGTGGGCTTTGATCTCTCGTCTCTTCCCCGGACGTACCGATAACGCCGTCAAGAACCACTGGCACGTCATCATGGCTCGACGGACTAGAGAAAGCCAACGACAACGTCAACAGCCTCCTCCGGCGCTGTCAAGAGACGCTGAAATGACGGTTTCGTCCTCTTGCCGCTACAATCAAGGTAAGTTCATCAATGGAGAAGATGATGAAGATGACGATGACGATGGCTCAGCTGTCTCGACTTGTACGACGGAGCTCTCTCTCACTCCGCCTTCTTCAGCTTACCAGCCTCGCTTCTTTAATTACGATAATACCCTTGCATCAGGCAAAGATGGTCAGTGTGTGCAGAGAGCAGAAGTAAATGGCATATATGGTAAAAAGATGGACCATCAAAATCACCACACAATCTCAGTCAGTGAAAGAAAGGTGGAGCTGAAGATGAAGAATGGCTATTACTTCTTTGATTTTCTTGGAGTTGGAGCTTCTTGA
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.6__1780__AT5G17800.1
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