Information report for fgenesh2_kg.4__174__AT2G22540.1
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a nuclear protein that acts as a floral repressor and that functions within the thermosensory pathway. SVP represses FT expression via direct binding to the vCArG III motif in the FT promoter.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G22540.1, AT2G22540.2
- Brassica napus: BnaC04G0438900ZS
- Brassica oleracea: XP_013600280.1, Bo8g101000, XP_013631060.1, Bo4g149800
- Brassica rapa: XP_009112514.1, Bra038511, XP_009140365.1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: D7LE18
- RefSeq: XP_002878622.1
- EMBL: GL348716
- AlphaFoldDB: D7LE18
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: D7LE18
- SMR: D7LE18
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 81972.D7LE18
- HOGENOM: CLU_053053_14_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.4__174__AT2G22540.1
TCATCCTTCACCAATCAAATGTCTTCTTCTCTACCTTTGAGGTGGAAAATTAAAATTTTAATATATTCCTTTAGCTTTCTCCTTTTCTCCTTCTTCTCTCTGAGTTTTTGTTTGATATATCCTCTCCATTTTCCTTGTTGATTCATCAACTAGATCTAATTCTCACAAAGAGACTTAGATTTTCTTTCTTTCAAATCCTTCAAAAACTAGGGTTTTTACTGTCTTCAAGTCATATTTATTCTTCTAAATTTAGCAAAAAGAACACGATTTACTTTCCATTTCAGTCGTCTTGTCACACTCTCTCTTCTTTAAAGTCTCCCTTTTTAGCAAAAAAATCTCTCTCTCACAAATTTTCCTCTGGGTTCTTCTTCCTCCTCTCTTTACTTTCTCATATATATCTCTCATTCTTGAATCTTGATCCATCAAAATCAAATCCCGTTCGAAACCTAAGCTCTCTTCTTGCTTCTAGGGTTTTTTCTTGTTGTAATGGCGAGAGAAAAGATTCAGATCAGGAAGATCGACAACGCGACGGCGAGACAAGTGACGTTTTCGAAACGAAGAAGAGGCCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCTCTCCGTTCTCTGCGACGCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCCACCGGAAAACTCTTCGAGTTCTGTAGCTCCAGGTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAACTATCTATCTCGTTTAGATGTCTCATAACTCGTAGAAGGAATCTTGTCTAGATCCAGACAAAAACTGTTTTTCAGATGTATATGTGATACATAGAAGTTTACTGTATCAATCTTTATAGGACCACTAACTATTTATATAATTAAAATACTTGTTGGAAATATTAATCATGACCATAAATGACATAGATAAAGTGTATAGTAAACTCTGTATTTAGATAAATTAAGGTATCTAATTACGGTAATATTCAAAAAGATGTAAATATGGATATATGTATATATATAAGGTATCTAATTACGGTAATATTCAAAAAGATGTAAATATGGATATATGTATATATATATAAATCTATGTATATGTATCTTGTGGTATAATATGTATAAGCCATCAATGTCATATTTATTTCGAAATATGTGGATACCATAACATTAGGAGTTTAGGAGGTATCTATATGTGTGGAATATTAGTGTTGGGAAAAGTCATTGAGATATTATGGATATGTTATTAATATCGTATTAGAAAGCTACGATATTGGATTTTTGACCCACTAGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGGTAAAAGGTTAAGGGTCTAAATGGTGACATTATCTTGAGGAATTGTTGTGGAAAACTTGTTGAATTATTCTTTGGTCACATCATTTACACTTGAGGAAAACTTGAGGAAATTAAGTCACGTCATTTGGTTTAGTAATATTTTTAAGCTTGTAATATTATTATTGTTATGTTTTTAATAAATTATGAATACTTTCATATTATAAATCATAATTTTCATAAATCTTTTTAATCTGTTTGTGTGATGATTATAAAAAATAGTTAGTTAACTTTTCTTAAAAAATAAAAAACATAAATATTGATGAAATTGGTTAGGTTTATATTGATGACTAAACACTAAAAATAATTCCGTAAATAATTAATTTTAATAGCTTATGGTTTTATATATCAATTATGTTTGATAAAACTATTAAAAATATTAACCTATAATTCCACCAAAATCTACCTTTTTTAATTATAGTTTATTTGCTAAATTATGTTGTTATATTAATAAGATTATTAAGTATATAAAACTTTAAATAAATTATTTTCATTTTTTATGGGGCTTTTGCAAAAATGCCACTTTTCAAAAATACCCCTTTTTAAAAACCTTATAAAAAATGTTCTTAAAAATATAAGATTTATCCAAATATGTATGTAATATTATTAAAACATACACAAACTACATTTCTATGTATCTAAAATCTTATAAATACTTTATAAATACTTTATAAATGCATTTTAAATACCTTTAAAAACCTTTAAAATATCTTGTAAAACATTTGAAAAACCTTAAAAATCCTTTAAAATAACTTGTAAAACCTTTAAAACACCTTATAAAACCTTATAAATACTTGGATCGAGTCTTCAAGTAGTAGTTACAATCCATAAGTACCTTATAAACCTAATAAAACTTTATAAAAATTTCAGATTTAAAAAAGGGCATTTTTGAAAATGGACATCTAAAAGAGGCATTTTTGAAAAGAGGCACACCAAAAGGGGTATTTTTAACAATTTTCCTTTTTTTATCATCGTAAATTTTGATAAAAATTGGTAAAATTACCTAAACATATAAAAAAACTTATAATAACTTATTTTGTTTATTTCATTAATATGGTTGACAAAAATATATTTAATTAAGTATTTTTATAAGTTTATATCTTTCATTAATTTTTCAAAAATTCAGCCAGATTCAGCGGTTACCATTTGAGTTCTAAATTATTCAGCCAGATTCAGCAATTCAGCAATTCAACCAGATTCAGCCGGATTCAGCGGTTACCATTTAGACCCTAAGTTTCGACCCACTAGTTATCAGTTCAGTTCCTACCTTCGGTGACATACACACTCACAAATAAGTGTGTATGTAACTAAAAACTTCAGTGTTTGACATGAAATAATGTATATGTTTGGGATTAGGTTTGCATCTTTTGATTTTAGAATTTGGGTATATTGTCGATGTTTATATAACATACATAATAGAGCAAAGATCATTGACAGTCTTATATAATAAGAAATTTATTGGAATGTGTTTGCATTATATAATGAAGCATGAAGGAAGTCCTAGAGAGGCATAACTTGCAGTCAAAGAATTTGGAGAAGCTTGATCAGCCATCTCTTGAGTTACAGGTTAGCTACATTTTCTTTCGCAATTTCTGTAACTTACAAAATAAGAGTATTGCTCCGGTGGATTACCAATATTTTTTAGATTACTATATATACTCATGTACACAAGATTGATCAAGAATCTGTAATTTATTGTATCAATAGGCATAGGCCTGAGCAATATACCTGGAACCGAATACCCGAACCTAAAAACCCGGAAAGATATCCAAACCGAACTAAAACCGATTTTTAAAAATATCCGAATGGGTCCTAGACCTTCCTATTTGAAAAAACCTGAACCGAATTCAATATCCGTGGGCATCCGAATACAAATATACACCTAAAAATATTAGTTATATTTATATTTATAATACTCCGAATACCTAAAATTACAATAATAAATCTGAAAATATTATATTTTGTTATATTTGGTTAAATACAATGTATTTTTGAGTAATCGGGTATTTCAGTTAGATTTGGGTATATATGAGTAAAAACTCCGAACCCGACCCGAACCCGAAAATATTTCGGATATTTTTAGTTATTTTCGGGTATTTTGTTTTTTTTTTGTAAATACCCGAATCCGAACCGAATTTTTAGAATACTCGAATGGGTCTCAACCTTCCTATCCGAATAGATCCGAAACCCGAAAAAAAGATCCGATCGGGTGTAGGTACCCGAATGCCCAGGCCTTTGTAGGCAAGCATTATATTATTGCTTATGATTAATTAGTCTACATTTTAACATAAGAAAATAATCAATCCATGTAGGAGTAATGAATGGATGCGAGCTGTCTAAGGATATACTTGTATAATAGTCATGTGTAGAGATTTGAGCTTTAGAGCATTATGGATATGATTAAGAGCTTAACTCAATGTTTATTCTGTAGCTGGTTGAGAACAGTGATCACGCCCGAATGAGTAAAGAAATTGCGGACAAGAGCCACCGACTAAGGTACATTATCTATGTAAATTCCATGAATTTTTGAACTAACTATCATTTTCTAACTATGTGTTTATATGATCATATATAGGCAAATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGGACTTGACATTGAAGGGCTGCAACAGCTAGAGAAGGCCCTTGAAACTGGTTTGACGCGTGTGATTGAAACAAAGGTTAATTGTTAAGAAAATTACATGATACAATGTAGAAGATTTCTCTAAGCTTACGACTATACACAATTTACTATTACGAGATGTTGTTATTGCAGAGTGACAAGATTATGAATGAGATCAGCGAACTTCAGAAAAAGGTAAGAATTAATCAAAATAACGTTTATTCTTTACTTCTTGATTTCAATATAAATTAAATTTTGGCAGTTTCAAGAGCCAACAATATCATATTCCTTTCTTTTTTTGGTGTTCAGGGAATGCAATTGATGGATGAGAACAAGCGGTTGAGGCAGCAAGTATGTGTCTTACCCTCCGTTTATAACAAAACTTTTTTCCTTTGTTTACACTACACACACTCCTGAATTTAAACTCAGGATTATGAATTACTAAGTTACAGACCCTGATTATCTATAACATATATCTTTGATCATACTGTGAGATAAATGAATAAACCAAAGTGATTATCGCGACTGAAATTTGTTTTTAAATCTATGGTAACCATGTAGCTAGTTAGTTAGTCCCTAAGGTCCTAGAGGTAAGAGTGTGCATGGTTTTGGTTCGTTTTTTTTTTCGTCTTCATAATTTTTTTAAAAAGTTTTATGAAATATGGAACCGAAAATATAATGAATTTAATTCTTGTTTGATATGGTTTGGTTGAGACTTCATGTCAAGATTTGCTCATTCGTAATTTGATCTCTAGCTAGAGAAATTCAAAACACATGCATGGTGCCAAAATGCAAATAATTAGAGAACTTAATGATTTGTTTTGTCTTTATTTTTGCAGGGAACGCAACTAACGGAAGAGAACGAGCGACTTGGCATGCAAGTACGTGTATATATAATCTTGATTATTTTGAGTTTTGTATGTTTCTTTCGGTTTAATGTTAAATTTGGAATATTTGTTTGGTTACGGTGTAGATATGCAATAATGTGCATGAATACGGTGGTATCGCTGAATCGGAGAACGCCGCCGTGTACGAGGAAGGACACTCGTCGGAGTCTATTACTAACGCTGGAAACTCCACCGGAGCACCTGTTGACTCCGAGTGCTCCGATACTTCCCTTAGGCTCGGGTAACAAATTAATCACCCTTTCTTTTCTTTTTTCCATTCTCTTTATTTAACAATAATTTAGGCACCAAAAGACCATATGTTGGCTATTTATTTACAATGCAAAAAATGGATGACAAAATCGTAAATAAGTTGGTTCATTTATATTTATATGCTTTTGATAAACACTGTTATTTCTCTCCGATATCTTACTATTTGTTTTCATGCACAAAAAAATATACCACTTATTTATGTTTGTCTTTTTAAAATTTTTGCCCCTAAATATAATCATCTAGCTAGCTTTATCGCTCTAAAAAGAGTATCGGATTTAATGCTTGGTGTTGTGCAGCTTACCGTATGGTGGTTAGAGATGGGACAATCCAAAGAAGTTGATGGAGGGAGGAGAGTAATGTAAATCTTTTT
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.4__174__AT2G22540.1
ATGGCGAGAGAAAAGATTCAGATCAGGAAGATCGACAACGCGACGGCGAGACAAGTGACGTTTTCGAAACGAAGAAGAGGCCTTTTCAAGAAAGCTGAAGAGCTCTCCGTTCTCTGCGACGCCGATGTTGCTCTCATCATCTTCTCTTCCACCGGAAAACTCTTCGAGTTCTGTAGCTCCAGCATGAAGGAAGTCCTAGAGAGGCATAACTTGCAGTCAAAGAATTTGGAGAAGCTTGATCAGCCATCTCTTGAGTTACAGCTGGTTGAGAACAGTGATCACGCCCGAATGAGTAAAGAAATTGCGGACAAGAGCCACCGACTAAGGCAAATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGGACTTGACATTGAAGGGCTGCAACAGCTAGAGAAGGCCCTTGAAACTGGTTTGACGCGTGTGATTGAAACAAAGAGTGACAAGATTATGAATGAGATCAGCGAACTTCAGAAAAAGGGAATGCAATTGATGGATGAGAACAAGCGGTTGAGGCAGCAAGGAACGCAACTAACGGAAGAGAACGAGCGACTTGGCATGCAAATATGCAATAATGTGCATGAATACGGTGGTATCGCTGAATCGGAGAACGCCGCCGTGTACGAGGAAGGACACTCGTCGGAGTCTATTACTAACGCTGGAAACTCCACCGGAGCACCTGTTGACTCCGAGTGCTCCGATACTTCCCTTAGGCTCGGCTTACCGTATGGTGGTTAG
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.4__174__AT2G22540.1
MAREKIQIRKIDNATARQVTFSKRRRGLFKKAEELSVLCDADVALIIFSSTGKLFEFCSSSMKEVLERHNLQSKNLEKLDQPSLELQLVENSDHARMSKEIADKSHRLRQMRGEELQGLDIEGLQQLEKALETGLTRVIETKSDKIMNEISELQKKGMQLMDENKRLRQQGTQLTEENERLGMQICNNVHEYGGIAESENAAVYEEGHSSESITNAGNSTGAPVDSECSDTSLRLGLPYGG