Information report for fgenesh2_kg.3__496__AT3G05120.1
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a gibberellin (GA) receptor ortholog of the rice GA receptor gene (OsGID1). Has GA-binding activity, showing higher affinity to GA4. Interacts with DELLA proteins in vivo in the presence of GA4. The DELLA region alone can interact with GID1A in GA-dependent manner in a Y2H assay.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT3G05120
- Brassica napus: BnaA05G0477500ZS, BnaC05G0539100ZS, BnaA06G0350800ZS, BnaC07G0343000ZS
- Brassica oleracea: Bo5g146670, Bo7g093470
- Brassica rapa: Bra039460, Bra009970
- Gossypium hirsutum: Gohir.D13G178300, Gohir.D08G229900, Gohir.A08G212900, Gohir.A13G172500, Gohir.D13G178200
- Populus trichocarpa: POPTR_013G028700v3
- Vitis vinifera: VIT_14s0030g00440
Gene Resources
- Pfam: PF07859
- UniProt: D7L3Q5
- RefSeq: XP_002882394.1
- EMBL: GL348715
- AlphaFoldDB: D7L3Q5
- InterPro: IPR002168 , IPR013094 , IPR029058 , IPR033140 , IPR050466
- PANTHER: PTHR23024 , PTHR23024:SF485
- SUPFAM: SSF53474
- PROSITE: PS01173 , PS01174
- Gene3D: 3.40.50.1820
- OrthoDB: D7L3Q5
- SMR: D7L3Q5
- eggNOG: KOG1515
- STRING: 81972.D7L3Q5
- HOGENOM: CLU_012494_22_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh2_kg.3__496__AT3G05120.1
TTAAACCCCATTTTGATCTCTCAAGTTTTCAAAAGCAGGAGATTTTCCTTTTCAAGAAAGAGAAATTTCACTAATCAAAGTTGCGAGCTTTCACTTGTCGACTTGAAAATTCTCGTCCTTTTTACAGAATTCGATCTGGGTTTTTGTTCTTGATTAGTAAAATAACAAAAGGGGGGTTTTCAGAAATGGCTGCGAGCGATGAAGTTAATCTTATTGAGAGCAGAGTAAGTTTGTTGCTTCTTTTTTTCTGGCTTTAATTTTGTTTTTTAGTTTCTAAGTATATATTCTCATGTTTGCAATTTTTGGGGAAAATTTTATCAGTGATTTTGACATGGGTCTCTTTCGATTTCTGGTTTAATTCTGTTCCTGATGTTTTTTCGTCTTTTGCTTTTGTGTTTGAGCTTATGTAGAATGATTTATAGTGTTTTGATTGTTCTTTTTTTCAAAAAACAGAAATTGAAAGCTTTAGGATTTCAAATCGTTTGAGGTGATGAAACGTGTCGTTAGTTTGATAGTGGTCTCTGTGCTTCTCCTTGGCGTCTCTGTCTTCTTCTGTTTGATTTTTAATCTGAGTGTTTAATCAGATTTTGTTATTCAATTTCACACTTAAATTCAACCGACTCTTTCTTTGATTGGATTCTACTATGTAGTGTTAATCAAAAAAGTTCGAATTTTGAGTTTTGTGTTTGATAAAGACTCTCCTTTGATGCTTGAATTGAATGCAAAGCACTCTTTTTGTGTGGTTTGTGTATGATAAGCTTAAGCCCTTTCATTGATCTCTCTTGTTAATGCGTTTATCTCATCTTCTATTGGTGTTCTCTGTGGTGGAACTAAGTAATCTGCAAATTTTGTGTGTTTGATGCAGACAGTGGTTCCTCTCAATACATGGGTTCTAATATCCAACTTCAAAGTAGCCTACAATATCCTGCGTCGCCCTGATGGAACCTTTAACCGACACTTAGCTGAGTATCTAGACCGTAAAGTCACTGCAAACGCCAATCCTGTGGACGGGGTGTTCTCGTTCGATGTCTTGATTGATCGCAGGATCAATCTTCTAAGTAGAGTCTATAGACCAGCTTATGCAGATCAAGAGCAACCTCCTAGTGTTTTAGATCTCGAGAAGCCTGTTGATGGTGACATTGTCCCTGTTATATTGTTCTTCCATGGAGGTAGCTTTGCTCATTCCTCTGCAAACAGTGCCATCTACGATACTCTTTGTCGCAGGCTTGTTGGTTTGTGCAAGTGTGTTGTTGTCTCTGTGAACTATCGGCGTGCACCCGAGAATCCATACCCTTGTGCTTATGATGATGGTTGGATTGCTCTTAATTGGGTTAACTCAAGAGCTTGGCTTAAATCCAAGAAAGACTCAAAGGTTCATATTTTCCTGGCGGGGGATAGCTCGGGAGGTAACATTGCGCATAATGTAGCGCTAAAAGCGGGTGAATCAGGAATCAATGTTTTGGGGAACATTCTGCTGAATCCTATGTTTGGTGGGAATGAGAGGACGGAGTCTGAGAAAAGTTTGGATGGGAAATACTTTGTGACAGTTAGAGACCGCGATTGGTATTGGAAAGCTTTTCTACCTGAGGGAGAAGATAGAGAGCATCCAGCGTGTAATCCGTTTAGCCCAAGAGCGAGAAGCTTAGAAGGATTGAGTTTCCCCAAGAGTCTTGTGGTTGTCGCGGGTTTGGATTTGATTCGAGATTGGCAGTTGGCTTACGCGGAAGGGCTCAAGAAAGCGGGTCAAGAGGTTAAGCTTATGCATTTAGAGAAAGCAACTGTTGGGTTTTACCTCTTGCCTAATAACAATCATTTCCATAATGTTATGGATGAGATTTCTGCGTTTGTAAACGAACGTTAACACGGTGTTAGAGAGAGAAGGTTGTTTTAACAGAGCCAAGACATCTTTCAAACTAACAAACAGGTGAATGTATTGCCTGTGGATTCTCTCGGATAGTTTTGTTTTTGTGTTTAGTATCTAAGTGTGTGGCGGTTTGCGGAAGCCTTTGTGATGACTGTTTAAACGCTGGATTCTGAAACGCTAAAGCTTGTGGAAGAATAGTGAGGCGTTTAGAGACTTGGAAAGGAACAAAGCAGTAGTAAAAATTTCTCCTTTGTGTCTGTAATATTTGGCCTTTAGCTTTTAGCCTTGAGTCTTTTTATTAACTAAAAGCTGAATTTTTTCGGCATGGGAGTGGTAATTAAATATAAATATTTCAAGAATGTAATGTTTTATACAAATTGTAATGATTTTGGTAAATGTCAGGTTTGCAGTTGGTATTGTTGCTCCTCTTTTTCATTGAACTCTAATAGATTTTAC
CDS Sequence
- >fgenesh2_kg.3__496__AT3G05120.1
ATGGCTGCGAGCGATGAAGTTAATCTTATTGAGAGCAGAACAGTGGTTCCTCTCAATACATGGGTTCTAATATCCAACTTCAAAGTAGCCTACAATATCCTGCGTCGCCCTGATGGAACCTTTAACCGACACTTAGCTGAGTATCTAGACCGTAAAGTCACTGCAAACGCCAATCCTGTGGACGGGGTGTTCTCGTTCGATGTCTTGATTGATCGCAGGATCAATCTTCTAAGTAGAGTCTATAGACCAGCTTATGCAGATCAAGAGCAACCTCCTAGTGTTTTAGATCTCGAGAAGCCTGTTGATGGTGACATTGTCCCTGTTATATTGTTCTTCCATGGAGGTAGCTTTGCTCATTCCTCTGCAAACAGTGCCATCTACGATACTCTTTGTCGCAGGCTTGTTGGTTTGTGCAAGTGTGTTGTTGTCTCTGTGAACTATCGGCGTGCACCCGAGAATCCATACCCTTGTGCTTATGATGATGGTTGGATTGCTCTTAATTGGGTTAACTCAAGAGCTTGGCTTAAATCCAAGAAAGACTCAAAGGTTCATATTTTCCTGGCGGGGGATAGCTCGGGAGGTAACATTGCGCATAATGTAGCGCTAAAAGCGGGTGAATCAGGAATCAATGTTTTGGGGAACATTCTGCTGAATCCTATGTTTGGTGGGAATGAGAGGACGGAGTCTGAGAAAAGTTTGGATGGGAAATACTTTGTGACAGTTAGAGACCGCGATTGGTATTGGAAAGCTTTTCTACCTGAGGGAGAAGATAGAGAGCATCCAGCGTGTAATCCGTTTAGCCCAAGAGCGAGAAGCTTAGAAGGATTGAGTTTCCCCAAGAGTCTTGTGGTTGTCGCGGGTTTGGATTTGATTCGAGATTGGCAGTTGGCTTACGCGGAAGGGCTCAAGAAAGCGGGTCAAGAGGTTAAGCTTATGCATTTAGAGAAAGCAACTGTTGGGTTTTACCTCTTGCCTAATAACAATCATTTCCATAATGTTATGGATGAGATTTCTGCGTTTGTAAACGAACGTTAA
Protein Sequence
- >fgenesh2_kg.3__496__AT3G05120.1
MAASDEVNLIESRTVVPLNTWVLISNFKVAYNILRRPDGTFNRHLAEYLDRKVTANANPVDGVFSFDVLIDRRINLLSRVYRPAYADQEQPPSVLDLEKPVDGDIVPVILFFHGGSFAHSSANSAIYDTLCRRLVGLCKCVVVSVNYRRAPENPYPCAYDDGWIALNWVNSRAWLKSKKDSKVHIFLAGDSSGGNIAHNVALKAGESGINVLGNILLNPMFGGNERTESEKSLDGKYFVTVRDRDWYWKAFLPEGEDREHPACNPFSPRARSLEGLSFPKSLVVVAGLDLIRDWQLAYAEGLKKAGQEVKLMHLEKATVGFYLLPNNNHFHNVMDEISAFVNER