Information report for fgenesh1_pg.C_scaffold_8001848
Gene Details
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Functional Annotation
- Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein;(source:Araport11)
Homologous
- Brassica napus: BnaC09G0417200ZS, BnaA10G0140400ZS
- Brassica oleracea: Bo9g135090
- Brassica rapa: Bra002650
- Citrullus lanatus: Cla97C02G045240
- Gossypium hirsutum: Gohir.D05G109200, Gohir.A05G109100
- Juglans regia: Jr14_08200
- Manihot esculenta: MANES_02G211800
- Populus trichocarpa: POPTR_013G152800v3
- Prunus avium: Pav_sc0000375.1_g620.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_6G048400
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr5g0071641
- Vitis vinifera: VIT_06s0004g07420
Gene Resources
- Pfam: PF09797
- UniProt: D7MQD6
- RefSeq: XP_002864575.1
- EMBL: GL348720
- AlphaFoldDB: D7MQD6
- InterPro: IPR011990 , IPR019183 , IPR019734
- PANTHER: PTHR22767 , PTHR22767:SF3
- SUPFAM: SSF48452
- PROSITE: PS50005
- Gene3D: 1.25.40.1040
- eggNOG: KOG2053
- STRING: 81972.D7MQD6
- HOGENOM: CLU_012690_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_8001848
TGTCTTCCAAATTCGGGTTAGCGGGTGGGATACCGGAGCGCCGTGTTCGACCCATCTGGGATGCAATCGATTCTCGTCAGTTCAAAAATGCTCTCAAGCTTGTCACTTCGCTTCTCTCTAAGTACCCTAAATCACCTTATGCTTTAGTAAGTGTAACCCATCCATCATTGTTTTTTGTTTTGGTTTTGTTTGCCTCTTTCTTTAATATGTAAACGAGAGGGTAATCTGATTGGAATGATGTTGTTGCATTTAACAGGCGCTTAAAGCTCTGATTCATGAGAGAATGGGGAAACCAGATGAGGCACTCTCTGTTTGTTTGGATGCTAAAGAGCTTTTGTACAACGATGATTTAGCGTTGATGGATGATCTCACTCTTAGTACATTGCAAATTGTATTGCAGAGACTTGATCACTGTAAGTGGCACTCGTAAAAGAGCTGTTGTTTAACTTCTTGGTTATATATCTAAATCGTTTGTTTTAATTTGATCAGTGGACTTGGCTACTAGTTGTTATGCTCATGCCTGTGGCAAATTCCCTAATAATTTGGAGCTTATGATGGGGCTCTTCAATTGCTATGTTCGTGAATATTCTTTTGTGAAGCAGCAACAGGTTGGTCTTTCTGATGAACATGATTCTGGGATCTGGTATCAGTCTTTATTTCCCTGCTTCTTATGTCTTGCTTTGTGACAGACAGCCATCAAAATGTACAAACTTGCCGGAGAAGAAAGGTTCTTACTTTGGGCTGTTTGTAGCATCCAATTACAAGTACTGCCATCGTTTCCTCCCTTTTTTTTGTTTGAGCATTTTGGTTTCTCTGTTGGTTACAGTTGTGACCATTTTTGACAGGTGCTATGCGATAAGAGTGGGGAGAAGCTGTTGCTTCTGGCTGAGGGTTTTCTTAAGAAGCACATTGCCTCTCATAGTATGCATGAGCCAGAAGGTAAATTCCACCAATGTCTTCTCTTGTACAAGTGTTGTCGAACTATTTCAGATTTCTTCACCCTTTCTTCTACTAATGGAAGTATGGTATTTTCAGCTCTCATGGTGTATATCTCTTTGCTGGAACAAGAATCCAAATACAATGATGCTTTAGAAGTCCTTTCTGGAGATTTGGGATCTCTTTTGATGATTGAAGTTGATAAACTACGGATACAGGTAGGTTATAAGGATTTTTGGCCGGAAAGAACACTAAACTTCATGGTTTTTTATTATATTCTCCGTACACCTCAGAAATTGTTCATTTTCCCTATTTTTAAGTTGAACCTATCGATATATATATGCTGAGTCTGTTGCTGTATGCTCACACAAACTCTCTCACTTTAAGCTGACAGGGGAGACTCCTTGCTAGGGCTAATGACTATTCTGCTGCTGTTGATGTCTATAAAAAAATCTTAGAATTGAGGTATGTTTGCAAGGCATGAGCATCTCAGATCTCAGTGTTTTTATAGTTGGGAATGTTTCCAGTATGATTACTGATTGGTCATTCGATTGTTTCTATACAATCATATCATGCCAGTATGCTAACATTGAATTTCTGTTCACTTGGCAGTCCAGATGATTGGGAGTGTTTCCTACACTATCTCGGCTGTCTGCTTGAAGATGACAGCATCTGGAAATACTTTGACAATATTGATCAAATTCATCCAACAAAGCACATAGAATGCAAGTTTTCTCACCTTACGGAAGAAATGGTGATCATATTACCCTCTTGCATGGCTTAATGTTTCAGTTCGTGTGTTCGTTACTTTTATCATAATTTCTGGCTTAGATATACTCTATTTTCTTTTCCACCATGCAGTTTGATTCTCGTATATCAAGTGCTTCAGATTTGGTGCAGAAATTACAGAGGGACAATGAAAATAGTAATTTAAGGGGTCCGTACTTGGCAGAACTTGAAATTGAGAAGAGAAAGTTCCTATTTGGGAAGAAGAACGAAAACAAATTACTAGAATCGTTACTGCAATATTTTCTTAAGTATGTCGCTGTATGAAACCCTTTCGAGTTGATTAGTTGTTTATCAGTATGGTTCTTACATCCCTCTGAGCTTGTATCGCTTTGCATGCAGATTTGGTCATTTAGCTTGCTATGCCTCGGACGTTGAAGCATACTTACAAGTATTATCCCCAAATAAAAAGGCAGAATTTGTGGGAATGTTAGTGAAAAATTCCGACTCCTTTTCTGAGTCAGCAACCAAAGTGCTTGGTCAAACAACAACAATTCTCAAAGTCCAAGAACTGACAGGAAACATTTTTGAGCTCCCTGTCGACGGTGTGTTCTCTTAGCTTACATACTTTTTTCTGCTTATAAAATTGAATTCCAAATCTACAAGCCATTTTACTCTTTTGTGAGAAGCCTCTTTAATGCGTTCTTCTGGATCTATTTCCAATTCGATTTTTTCTTCCAATGTCTAGAAATTGAAGCCTCTGCTGTCAAACTGGCAAAGTTATACTGCCAAAATCTTTCTCTTTCTAAGGACTTGGACCCTCAAGAGAGCATGTTTGGGGAAGAACTTTTATCTTTGATTAGCAACATGTTGGTCCAGGTACGTTGGGCTGTGTTCAACAGACTCACTTCCTTTGTAATTGTTATTTATTAATGCACCTTACTGTTGGTTCCAGTTATTCTGGAGAACTCGAGATTTTGGCTATCTTGCTGAAGCTATAATGGTTCTTGAGCTGGGCTTGACCATCAGAGGGTCAGTATGCCATATTTTTGCCATCTGCTTCTTTTTTAAATGCGAAGGATTCAACATGGCTTTGATAGGTCTCACTTGATTATTACTTTTTGTTTCCACAGACATGTCTGGCAGTACAAGATCTTGCTGTTGCACATATATTCATATATTGGTGCTCTACCGCTTGCATTTGAACGGTATTTATAGCTCTCAGCTTTACTTGTTTTTGCCTGGAAACAGAAAAACCCTCATTCAGCTCGTTTTACTGAACCACCTGTTTATCTTCTGTTAGGTATAAAGCTCTTGATGTGAAGAACATCTTGACGGAAACTGTTTCACACCATATTCTACGTCAAATGTTGGAATCTCCCATGTGGGTGGACTTAAGTAACCTCCTAAAAGACTATCTCAAGTTTATGGATGATCATTTGAGAGAGTCTGCAGACCTTACGTTTCTTGCTTACCGCCATAGAAATTACTCAAAAGTAAACAATTAGATTTCTCTCCCAGAATTGTCATTACCATATCCTTGTGGGCAACCGGTTACTGTCGTGACTTATCTGGATTATCTAATCTCAGGTTATCGAATTTGTCCTATTCAAACAACGCTTGCAGCACTCAAACCAGTACCAAGCTGCAAGAGTTGAAGCGGCTGTCTTGCAATTGAAGCAAAACGCAGACAGTGTCGAGGAAGAAGAGGTAACTCATCCAAGTTCTTATCATGTAAATTACCATAGTATATATCTAACTTTGCCTGTGATTTTTTTTTTCTAGCGCATTCTTGAAAACCTGAAATCTGGAGTTCAACTTGTGGAGCTCTCAAATGACATTGGTTCCAAGACACTGAGGTTCAATGAAGATATGCAAACACGTCCATGGTGGACACCTTGTCCTGAGAAAAACTATCTACTAGGTCAGTATTTCCTTCACATTAGTTGTTGTTTATGATTGTGGTGTTATTCTTAATATCTATCAACGTTTGTAGGTCCGTTTGAAGAAATTTCTTACTGCCCCAAAGAGGATGTGGTACGTGTGTCTATTATTATCCATACATTCTTGTGGAAGGATGCAATCTAATATAATATACTTGTACTTGTTGGCTGTGTATAGAAAGACGATCGTGAAGAAAATATGAAACGAGCCATCCAGAGAAAATCCCTACTACCTCGGATGATATATCTCTCTATTCAGTGCACGTCAACGGCATTAAAGGAGAGTGCTGAAACCAATGGGTCTGGAGGTGACGTCAAAATCTGTGGAGAACTTAAGTGTTTGCTGGATGAATACACAAAAATGTTGGGATGTTCTCTCAATGACGCTGTAGAAATGATCACAGGGATCTCACAGGGTGTAAGGACTTCCGAGGTTAGCTTTTCTACTCCTTTCTCCTTCCACCTGCACTCATGTTTAGTTAACTGGTCTTACCGTTAGTAACCTTGTTGGAACATCTCTGTAGAGCCTTGGTTCAAATTTGGTGGACTGGTTGAATTTTGCGGTGTTTTGGAATGCGTGGAGCCTAAGTTCCCATGAGCATTGGCATGTGTTGAACTCCCTGTTTGAGAGGCTTATTCTGGATAGAGTCAGATCAATGGGATCTTTAGACATGAGTTCTTGCTATTCTGATGTCCAGGTTTTGATCCAGATCGTCACTGAACCGTTGGCGTGGCACAGTCTTATAATTCAGGCCTGTACCCGATCGTCTCTCCCATCTGGGAAAAAGAAGAAGAAAAATCAACATTCAGATCAATTATCTTCCTCCCCGATGTCGCAAGCAATCAAAGATTCTATACATTCACTATGCAGCACAATACAAGAAGTTTCTAGCTGGCTACTGAATCAACTGAACCATCAAGAAGATGAACAAGTGGAGAGATTTCTGTCAACTCTGAAGAGAGATGAAGATGCAGCAGGAGGACCGGGACAGATTCTTGGGGTATTAGAGAGTTTCATCGCATCCAGCGAAGAATCGGAGGTTGGAAATCGCATCTTTCAAGCACTGAAATCGTGGAACACGGCAGATACCGCACGTAAAACAGTTATGGCGCAACAGATAGTTCTCCGTGAGTTTCTCCAGATTTGTGAATCTAAGAGAAAGCTACTGGAAACGCTCAAGCAACAGATGTCCCATGTTTGA
CDS Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_8001848
ATGTCTTCCAAATTCGGGTTAGCGGGTGGGATACCGGAGCGCCGTGTTCGACCCATCTGGGATGCAATCGATTCTCGTCAGTTCAAAAATGCTCTCAAGCTTGTCACTTCGCTTCTCTCTAAGTACCCTAAATCACCTTATGCTTTAGCGCTTAAAGCTCTGATTCATGAGAGAATGGGGAAACCAGATGAGGCACTCTCTGTTTGTTTGGATGCTAAAGAGCTTTTGTACAACGATGATTTAGCGTTGATGGATGATCTCACTCTTAGTACATTGCAAATTGTATTGCAGAGACTTGATCACTTGGACTTGGCTACTAGTTGTTATGCTCATGCCTGTGGCAAATTCCCTAATAATTTGGAGCTTATGATGGGGCTCTTCAATTGCTATGTTCGTGAATATTCTTTTGTGAAGCAGCAACAGACAGCCATCAAAATGTACAAACTTGCCGGAGAAGAAAGGTTCTTACTTTGGGCTGTTTGTAGCATCCAATTACAAGTGCTATGCGATAAGAGTGGGGAGAAGCTGTTGCTTCTGGCTGAGGGTTTTCTTAAGAAGCACATTGCCTCTCATAGTATGCATGAGCCAGAAGATTTCTTCACCCTTTCTTCTACTAATGGAAGTATGGTATTTTCAGCTCTCATGGTGTATATCTCTTTGCTGGAACAAGAATCCAAATACAATGATGCTTTAGAAGTCCTTTCTGGAGATTTGGGATCTCTTTTGATGATTGAAGTTGATAAACTACGGATACAGGGGAGACTCCTTGCTAGGGCTAATGACTATTCTGCTGCTGTTGATGTCTATAAAAAAATCTTAGAATTGAGTCCAGATGATTGGGAGTGTTTCCTACACTATCTCGGCTGTCTGCTTGAAGATGACAGCATCTGGAAATACTTTGACAATATTGATCAAATTCATCCAACAAAGCACATAGAATGCAAGTTTTCTCACCTTACGGAAGAAATGTTTGATTCTCGTATATCAAGTGCTTCAGATTTGGTGCAGAAATTACAGAGGGACAATGAAAATAGTAATTTAAGGGGTCCGTACTTGGCAGAACTTGAAATTGAGAAGAGAAAGTTCCTATTTGGGAAGAAGAACGAAAACAAATTACTAGAATCGTTACTGCAATATTTTCTTAAATTTGGTCATTTAGCTTGCTATGCCTCGGACGTTGAAGCATACTTACAAGTATTATCCCCAAATAAAAAGGCAGAATTTGTGGGAATGTTAGTGAAAAATTCCGACTCCTTTTCTGAGTCAGCAACCAAAGTGCTTGGTCAAACAACAACAATTCTCAAAGTCCAAGAACTGACAGGAAACATTTTTGAGCTCCCTGTCGACGAAATTGAAGCCTCTGCTGTCAAACTGGCAAAGTTATACTGCCAAAATCTTTCTCTTTCTAAGGACTTGGACCCTCAAGAGAGCATGTTTGGGGAAGAACTTTTATCTTTGATTAGCAACATGTTGGTCCAGTTATTCTGGAGAACTCGAGATTTTGGCTATCTTGCTGAAGCTATAATGGTTCTTGAGCTGGGCTTGACCATCAGAGGACATGTCTGGCAGTACAAGATCTTGCTGTTGCACATATATTCATATATTGGTGCTCTACCGCTTGCATTTGAACGGTATAAAGCTCTTGATGTGAAGAACATCTTGACGGAAACTGTTTCACACCATATTCTACGTCAAATGTTGGAATCTCCCATGTGGGTGGACTTAAGTAACCTCCTAAAAGACTATCTCAAGTTTATGGATGATCATTTGAGAGAGTCTGCAGACCTTACGTTTCTTGCTTACCGCCATAGAAATTACTCAAAAGTTATCGAATTTGTCCTATTCAAACAACGCTTGCAGCACTCAAACCAGTACCAAGCTGCAAGAGTTGAAGCGGCTGTCTTGCAATTGAAGCAAAACGCAGACAGTGTCGAGGAAGAAGAGCGCATTCTTGAAAACCTGAAATCTGGAGTTCAACTTGTGGAGCTCTCAAATGACATTGGTTCCAAGACACTGAGGTTCAATGAAGATATGCAAACACGTCCATGGTGGACACCTTGTCCTGAGAAAAACTATCTACTAGGTCCGTTTGAAGAAATTTCTTACTGCCCCAAAGAGGATGTGAAAGACGATCGTGAAGAAAATATGAAACGAGCCATCCAGAGAAAATCCCTACTACCTCGGATGATATATCTCTCTATTCAGTGCACGTCAACGGCATTAAAGGAGAGTGCTGAAACCAATGGGTCTGGAGGTGACGTCAAAATCTGTGGAGAACTTAAGTGTTTGCTGGATGAATACACAAAAATGTTGGGATGTTCTCTCAATGACGCTGTAGAAATGATCACAGGGATCTCACAGGGTGTAAGGACTTCCGAGAGCCTTGGTTCAAATTTGGTGGACTGGTTGAATTTTGCGGTGTTTTGGAATGCGTGGAGCCTAAGTTCCCATGAGCATTGGCATGTGTTGAACTCCCTGTTTGAGAGGCTTATTCTGGATAGAGTCAGATCAATGGGATCTTTAGACATGAGTTCTTGCTATTCTGATGTCCAGGTTTTGATCCAGATCGTCACTGAACCGTTGGCGTGGCACAGTCTTATAATTCAGGCCTGTACCCGATCGTCTCTCCCATCTGGGAAAAAGAAGAAGAAAAATCAACATTCAGATCAATTATCTTCCTCCCCGATGTCGCAAGCAATCAAAGATTCTATACATTCACTATGCAGCACAATACAAGAAGTTTCTAGCTGGCTACTGAATCAACTGAACCATCAAGAAGATGAACAAGTGGAGAGATTTCTGTCAACTCTGAAGAGAGATGAAGATGCAGCAGGAGGACCGGGACAGATTCTTGGGGTATTAGAGAGTTTCATCGCATCCAGCGAAGAATCGGAGGTTGGAAATCGCATCTTTCAAGCACTGAAATCGTGGAACACGGCAGATACCGCACGTAAAACAGTTATGGCGCAACAGATAGTTCTCCGTGAGTTTCTCCAGATTTGTGAATCTAAGAGAAAGCTACTGGAAACGCTCAAGCAACAGATGTCCCATGTTTGA
Protein Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_8001848
MSSKFGLAGGIPERRVRPIWDAIDSRQFKNALKLVTSLLSKYPKSPYALALKALIHERMGKPDEALSVCLDAKELLYNDDLALMDDLTLSTLQIVLQRLDHLDLATSCYAHACGKFPNNLELMMGLFNCYVREYSFVKQQQTAIKMYKLAGEERFLLWAVCSIQLQVLCDKSGEKLLLLAEGFLKKHIASHSMHEPEDFFTLSSTNGSMVFSALMVYISLLEQESKYNDALEVLSGDLGSLLMIEVDKLRIQGRLLARANDYSAAVDVYKKILELSPDDWECFLHYLGCLLEDDSIWKYFDNIDQIHPTKHIECKFSHLTEEMFDSRISSASDLVQKLQRDNENSNLRGPYLAELEIEKRKFLFGKKNENKLLESLLQYFLKFGHLACYASDVEAYLQVLSPNKKAEFVGMLVKNSDSFSESATKVLGQTTTILKVQELTGNIFELPVDEIEASAVKLAKLYCQNLSLSKDLDPQESMFGEELLSLISNMLVQLFWRTRDFGYLAEAIMVLELGLTIRGHVWQYKILLLHIYSYIGALPLAFERYKALDVKNILTETVSHHILRQMLESPMWVDLSNLLKDYLKFMDDHLRESADLTFLAYRHRNYSKVIEFVLFKQRLQHSNQYQAARVEAAVLQLKQNADSVEEEERILENLKSGVQLVELSNDIGSKTLRFNEDMQTRPWWTPCPEKNYLLGPFEEISYCPKEDVKDDREENMKRAIQRKSLLPRMIYLSIQCTSTALKESAETNGSGGDVKICGELKCLLDEYTKMLGCSLNDAVEMITGISQGVRTSESLGSNLVDWLNFAVFWNAWSLSSHEHWHVLNSLFERLILDRVRSMGSLDMSSCYSDVQVLIQIVTEPLAWHSLIIQACTRSSLPSGKKKKKNQHSDQLSSSPMSQAIKDSIHSLCSTIQEVSSWLLNQLNHQEDEQVERFLSTLKRDEDAAGGPGQILGVLESFIASSEESEVGNRIFQALKSWNTADTARKTVMAQQIVLREFLQICESKRKLLETLKQQMSHV