Information report for fgenesh1_pg.C_scaffold_6003139
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Catalyzes the conversion of geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP) to copalyl pyrophosphate (CPP) of gibberellin biosynthesis
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc15182
- Brassica napus: BnaA09G0028500ZS, BnaC09G0013100ZS, BnaA03G0269400ZS
- Brassica oleracea: Bo9g006080
- Brassica rapa: Bra036239, Bra000864
- Capsicum annuum: T459_18509
- Gossypium hirsutum: Gohir.A11G123300, Gohir.D11G128500, Gohir.D08G075200
- Manihot esculenta: MANES_05G077200
- Medicago truncatula: Medtr7g011663
- Nicotiana attenuata: A4A49_30040
- Populus trichocarpa: POPTR_002G052100v3, POPTR_005G210300v3
- Vitis vinifera: VIT_07s0151g01040
Gene Resources
- Pfam: PF01397 PF03936
- UniProt: D7M3D1
- RefSeq: XP_002872809.1
- EMBL: GL348718
- AlphaFoldDB: D7M3D1
- InterPro: IPR001906 , IPR005630 , IPR008930 , IPR008949 , IPR036965 , IPR050148
- PANTHER: PTHR31739 , PTHR31739:SF4
- SUPFAM: SSF48239 , SSF48576
- Gene3D: 1.10.600.10 , 1.50.10.130 , 1.50.10.160
- eggNOG: ENOG502QQN6
- STRING: 81972.D7M3D1
- HOGENOM: CLU_003125_3_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_6003139
TGTCTCTTCAATATCATGCTCTAAACTCCATTCAAAGTACAAACTTTCTCAGTTCTACTAAAACAACATTATCTTCTTCTTTCCTTACAATCTCAGGTGAGTCATCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTCAGAGACATACGATCACACACAATCATGATCTGTCTTTTTTTTTCATTTATAAGTTATCGTCCAAGTCTCAAACTTTGTTTGCAATCGAAATCTTCTTGTGGGTTTAATCATGATGCGTTCCTTGACTGAGTTTTCGATGTATTTTTTGATTTTGGGTTTTTGATTTTTCCTAGAGAACAAAACAAAAATAGAGTGATGACTCTGTTTTTATGTTCTCTCAATACCCACGCGTGAAGTATCTCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAATACTACTCTCTACTTTCGATTTTTTGTTTTCTCTTTCTTCAAAGCATTATAGAATCATTAACTACTCTCCAAAATTCTCTCTGTTTTTTCTTTGTTTCCCAAAAATTCGATTTGTTTATCTTTTTCGTTATTTGGGGTTCTTTGACTCAATAGGAAATGTTTTTTTCTCTGGCTTTACAAAAAAAATAAAAAAATGTAAGTGTGTTATTGGGTCTCTCTTGATTTTTGAACAAAACAAACATTATTGTTTTTAGTTTGAATTTTTTTTTGGTATAAAAAAAATTATTTATGAGTACACTCTGTTTTTTTTATTATATGATTATAAGAAGTTTATCAATTTGAATTAATTTATTATTACAAAACGTACGTTTAGAGAATCTAGTACTCATTAGAGAATGGATTGACCTCGTATCTCCTTATTATAATTGCCAACACACATAAAGATCCCCTTTGGAAGCCTAATAAACTAATGTTTTGACGACCAAAAACTAGTTTAGTAGTTTATCTTTTTATAACATAGTAAAGCAAATTATTTTATTATTACTTTCTTATTTCTCTAAGATCTTCTTCTTTCTTTGGATAGGATCTCCTCTCAATGTCGCTAGAGACAAACCCAGAAGCGGTTCTATATATTGTTCAAAGCTTCGAACTCAAGGTCTAATTTTATAAATATTAAGCTTTTCCAAAAAATTTCAAGTCTAAATTTATCTCTTTTTATAAGAAGCTAAAAATATATATGATTTTTTTTTTCTTTGGTGTCTAGAATACACTACTTCTCAGGAGGTTCAACATGATCTGCCTCTAATACAGTGGCAACAGCTTCAAAGAGAAGATGCTCCTCAGGTGATTTTTTGGAATAAAATTTCTACTTTTCTCTTAAAAGCATTTTTAGCTACATTCTTCCTATTCTTTTTACCGTGATTTATACATTTTCCCCCGGATTTTATACTTTACATTCCATCAAAATATAGTTTTTATGTTTTACACCGAAAGGTAACAAAACTATATATACACATACATCATGGTTTAAATTGAAACATTTTTCATGATTCTATGTGCTGATAATTATTTTTTGCATTTGAATCATAGATTAGTATTGGAAGTAATAATAATGCGATCGAAGAAGCAGTGAAGAGTGTGAAATCGATCTTGAGAAACCTAACTGACGGGGAAATTACGATATCGGCTTATGATACCGCTTGGGTTGCATTGATCGATGCCGGAGACAAAACTCCGGCGTTTCCCTCGGCCGTGAAATGGATCGCCGAGAACCAACTCTCCGATGGTTCTTGGGGTGACGCTTATCTCTTCTCTTATCATGATCGTCTCATCAATACACTTGCATGCGTCGTTGCTCTAAGATCATGGAATCTTTTTCCTCATCAATGCCACAAAGGTTATTTTTTCTTTTTTCGAAATACAAGAAAACAGAAAGAAAATCTTAACTTTTTGCAGAAAATCCAAACTTTTTTAGTGGCCTAAAAAGAAAGTATACGTTATTTAAATAGTTATAAGTTAATTAGTCTAGTTTTCAACAAAAAATAAGTCTAGTCAGAACATAAGAGTTTGAATCTTTTTTTTTCTTTCTATAATCATTCAATATATTAGATCTTTAATTTAGTAGTTAACTAGTTATTCATACTCAAATAATTTGACATTTCTATTAAATATGCATGACTTTTGAAGTAATATTCAGGAATCACGTTTTTCCGGGAAAATATTGGAAAGCTAGAAGACGAAAACGATGAGCATATGCCCATCGGATTTGAAGTAGCATTCCCATCGTTGCTTGAGATAGCTCGAGAAATAAACATTGATGTACCGTACGATTCTCCAGTCTTAAAAGATATATACGCCAAGAAAGAGCTAAAGCTAACAAGGTATGTGTGTTGGGCCAAAATTTACATTTGAACATTCTATTTTTATATGAATATATTGCAAAGTATATATATGGGTCCAATGTACTTCACTCAAAAGCCAAGAAAAAAGAGTTACACGATAATATATTTGCATACGTAATATATATATAGTATAGACTAAGATATGAATTGATTTTGGTCGTACATGTGAGATCTTTTTATAGGATACCAAAAGAGATAATGCACAAGATACCAACAACATTGTTGCATAGTTTGGAGGGGATGCGTGATTTAGATTGGGAAAAGCTCTTGAAACTTCAATCTCAAGACGGATCTTTCCTCTTCTCTCCTTCCTCTACCGCTTTTGCATTCATGCAGACCCGAGACAGTAACTGCCTCCGGTATTTGCGAAATGCCGTCAAACGTTTCAATGGAGGAGGTTTGTTAGCTAGTAACCACTTGTCCTATTATATCTATTGAAGTCATATACGCATAACATCTACTTTTTGTTCACTAATATATTTTTGTTTAAATTATTCTTTTATTTTTTCAGTTCCCAATGTCTTTCCGGTGGATCTTTTCGAGCACATATGGATAGTGGATCGGCTACAACGGTTAGGGATATCAAGATACTTCGAGGAAGAGATTAAAGAGTGTCTTGACTATGTTCACAGGTTTAAAAAACGTTATATATACGTATATGTATTAACTTTATTTTTGTACCAAACTAGAGTTACTCTAATGATGATGATGATGATAAAATATCAGATATTGGACCGACAAAGGCATATGTTGGGCTAGATGTTCCCATGTTCAAGACATCGACGATACAGCAATGGCATTTAGGCTCTTAAGACTTCATGGATACCAAGTTTCCGCAGGTAAAAACTCATATCTTTTTGGTAATTTATCTTAACATTTGACATAAACAAACGTTCATTTTTTGATTTTAGATGTATTCAAGAACTTTGAGAAAGAGGGGGAGTTTTTCTGTTTTGTGGGGCAATCAAACCAAGCGGCGACCGGTATGTTCAATCTATACCGGGCATCACAATTGGCGTTTCCAAGGGAAGATATATTGAAAAACGCCAAAGAGTTCTCTAATAAGTATCTGCAAGGAAAACGAGAGAGAGACGAGTTGATTGATAAGTGGATTATAATGAAAGACTTACCTGGCGAGGTACGTTACATGTAATATAAGACCAAAAACACACGTTACTACAAATGCTTCCAAAAAACATTGCATTTACACATACGCACTGCATGCCGTTTTGGGGTCGTCTGATGGAGAAGGAATACGACAAAGCGTGTTTGGCCTTTTTTGCTTATTGATTTTCTTATCCTGATATATTTTTTCTGCATATTAGATTGGCTTTGCGTTAGAGATTCCATGGTACGCAAGCTTGCCTCGAGTTGAGACGAGATTCTATATTGATCAATATGGTGGAGAAAACGACGTTTGGATTGGCAAGACTCTTTATAGGTACTTATTATTCTTTGATTTTGAAAAATATAATTATTTTGCATATATAGACCATATGAATCCAAAACAAATGCAATATTGCACTCCCTAAATGTCAAAATGCATGCATGACATGACCATGTATATTTGGGGCATAACTGTATTTTGGTCATCGGTTTTATTTATATGACCTAGGTGAGTTTCATCTGGAGGAACCAAATTTAATTATTTGCTAATATTCTAACAATGGTGTATTTTTTTCTATGTTTAACTAAAATTGCCTGTAGTTGTAACTCTTTATTTTTCTATGCAATTGCATGTATTTAATCATGATATAAATTAATTAATCAATAATGATGGTGGACAATGTAGGATGCCATACGTGAACAATAATGGATATCTGGAATTAGCAAAACAAGATTACAACAATTGCCAAGCTCTGCATCAGCTCGAATGGGACACATTCCAAAAGTAATAGCATCTTCACTCTTCATTCTTTTTCATTAAGTATGGCTTTAACTGGTGATTGTGTGTATATATATTAAGTTAGTTAATTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTCATATGCGAAAAATAATAAAGTACAGTATGAAACTTTACTTCTGGTTAATTAATTAGTAATACACTATTTTCTGGTTAATGACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTTTCTTATTTTAAGAATCGGAAACAAAAGCTCAAACTGCAATTATTTTTAATAGAGAGGTCAGTTTGATTAGTGGCTGAAAAAACAAAAACGTGACTCAATTTAAACCTTACATTTATATTATTTTTCTTCTTATTTGTTATTAGTATATATATACAATATGTATATTCAATAATAATTCAATATAGTTTGTATTTGTACGCAGGTGGTATGAAGAAAATAGGTTAAATGAGTGGGGTGTGCGCAGAAGTGAGCTTCTCGAGTGTTACTTCTTAGCGGCTGCAACTATATTTGAATCAGAAAGGTCACATGAGAGAATTGTTTGGGCTAAGTCAAGTGTATTGGTTAAAGCCATTTCTTCTTTTGGGAAATCCTCTGACTCCAGAAGAAGCTTCTCCGAGCAGTTTCATAAATACATTGCCAATGCTCGACGAAGTGATCATCACTTCAATGGCAGGTAAATTACTCTTACGAAACATATGTTTTATATTTTCTCTTATTTATTACTTTAATTTTAATATATAGTTCAGACAAGATCATAAGATCCGATTATTAAAAATAAAAAAAAAGATCATAAGATCTATATTGCACTAGCATTAAACATACGTCATTTGGAAATATTTGACTTAACCGTACCAATGAATTTTCTCTTTTTTGGATTTAGGTATTCAAAACTGTTCGGCAAATTTTTTTGTCTTAGGTTCTAGCTTCTTTTCTTTATGGCCTTTTTGTCCGGCAAAAAAAGCTTAAACTATTAAAATCACTCAAAACTAGAGTTTATATATTTTCCATCTAGTGGTTTTCGTTTTTAACCGTATTCGTGAGGGTACTGTTAGTTTTGCGGCAGAAAACACCAAGCTAGATATATATGAAAAACAAATCTCGCCGATTAATTAATTTAAAAATATTAAGTTCATATATTTGACCTAATTTAGAAAGAAGAAAAAACTGTCCTTTTCATCGCACTGGTGATGTGCAGATAATTTTTTCAATATATACGGCGTTTTCCGCCATGCAAACAGAGATATAACTTCATTAGAATATAATATTTTTTATTGGTTAAGATCAGAGATCAATTCTCTCATTCGATAACGATAAAAATTGGTGACGTGTATAACAACAAAACAAGAAACATCTGGAGGCCTAAACTGTAAGAAATGAAAGTTCCAATACCACAAACAAACAAAAGGAATTTATCCTTTAAAATAAAAACAACAAAAGGTAAAATTTGAGATTTATATGTGTGATATTTAATCTTTCGAAAAATGAAAAGGGGAGTCAAATTAAAGAAGAAAGAAAGCTCTGGTAGAGTCAGCTGATTGACTCATTTGTCTATATATATTATTATTTTTTGAGAAACCTAACTGCATGATGGATATGAAAAATCAGGAGCATGAGATTGGACCGACCAGGATCGGTTCAGGCGAGTCGGCTTGTCGGAATCTTAATCGGAACTTTGAATCAAATGTCTTTTGACCTTTTCATGTCTCATGGCCGTGACGTTTACAATCTCCTCTATCAATCGGTACGTCTCTCTCTTTCGTATGAAATTTTAACAAGAATACACACATAATAGAGTAGGTCACAAATTAGTGCCCAATAATTAATTAGAATAAGTCACAAAACAATACCATGTTTTTATTGCATTTTTTTTTATCAAGAACAATTAACTCGCCTTGTTGAATACTGAAAGTTTGGAACGAACTTGATTTCTCGTTTGTGAATTCGAGTCCCGGATCGCTTAGCGTGTGGTTGAAAAAATAAAGAGAACGAAATTTTATGATTTTTAATTACATTAAACAAATATAATATTCTAGACAAATAGAAGAATAACAAGCAATGAGCTAGGATCGATCATTCTCAATGAAAAGAAATCTTTTTGCATTTCATTGTCTGATTTATCAATTGTAATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTGGGGAGATTGGCTGGAGAAATGGAAATTATATGGAGGTGAAGGAGAAGAAGGAGAGCTCATGGTGAAGATGATAATTCTAATGAAGAACAATGACCTAACTAACTTCTTCACTCATACTCACTTTGTTCGTCTCTCGGAAATCATCAATCGCATCTGTCTTCCTCGACAATACTTAGAGGTTAGTTTATTAACTAGTTATACTATATTATTATTATTATTATGCTTTGGTTCTCCACTAGCATTTAATTTGTAATCTTCATGGGTTATTTTTTTTCAAATACGATTGAACCATGATTTTTTTATGAATAAATTTTATATCCTTTGAAAAAATATATATTATATTATTATGAAACTGTACTCATTTTATATGCTTTTACTTTGTTAATTAAAAAGAAATTAAAACAACTCTTTTTTTTTCCCATAAATTTGGTCTTATAAGTACGATGTCCAAAACCATAACTGTTTTGTTTATGCTGTGGACCGAACCAACAAATAATCAATTGAAAATGAGTGATCCATTCGATGTTATCGGTTAGAATCTAATCAATTATTAATTGTCTTAATGCAGGCAAGGAGAAACGATGAGAAGGAGAAGACAATAAGGAGTATGGAGACGGAGATGGAGAAAATGGTTGAGTTAGCATTGTCGGAGAGTGACACATTTCGTGTCGTCAGCATAACGTTTCTTGATGTAGCAAAAGCCTTTTACTACTCTGCTTCATGTGGCGATCACCTCCAAACTCACATCTCCAAAGTCTTGTTTCAAAAAGTCTTGTAA
CDS Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_6003139
ATGTCTCTTCAATATCATGCTCTAAACTCCATTCAAAGTACAAACTTTCTCAGTTCTACTAAAACAACATTATCTTCTTCTTTCCTTACAATCTCAGGATCTCCTCTCAATGTCGCTAGAGACAAACCCAGAAGCGGTTCTATATATTGTTCAAAGCTTCGAACTCAAGAATACACTACTTCTCAGGAGGTTCAACATGATCTGCCTCTAATACAGTGGCAACAGCTTCAAAGAGAAGATGCTCCTCAGATTAGTATTGGAAGTAATAATAATGCGATCGAAGAAGCAGTGAAGAGTGTGAAATCGATCTTGAGAAACCTAACTGACGGGGAAATTACGATATCGGCTTATGATACCGCTTGGGTTGCATTGATCGATGCCGGAGACAAAACTCCGGCGTTTCCCTCGGCCGTGAAATGGATCGCCGAGAACCAACTCTCCGATGGTTCTTGGGGTGACGCTTATCTCTTCTCTTATCATGATCGTCTCATCAATACACTTGCATGCGTCGTTGCTCTAAGATCATGGAATCTTTTTCCTCATCAATGCCACAAAGGAATCACGTTTTTCCGGGAAAATATTGGAAAGCTAGAAGACGAAAACGATGAGCATATGCCCATCGGATTTGAAGTAGCATTCCCATCGTTGCTTGAGATAGCTCGAGAAATAAACATTGATGTACCGTACGATTCTCCAGTCTTAAAAGATATATACGCCAAGAAAGAGCTAAAGCTAACAAGGATACCAAAAGAGATAATGCACAAGATACCAACAACATTGTTGCATAGTTTGGAGGGGATGCGTGATTTAGATTGGGAAAAGCTCTTGAAACTTCAATCTCAAGACGGATCTTTCCTCTTCTCTCCTTCCTCTACCGCTTTTGCATTCATGCAGACCCGAGACAGTAACTGCCTCCGGTATTTGCGAAATGCCGTCAAACGTTTCAATGGAGGAGTTCCCAATGTCTTTCCGGTGGATCTTTTCGAGCACATATGGATAGTGGATCGGCTACAACGGTTAGGGATATCAAGATACTTCGAGGAAGAGATTAAAGAGTGTCTTGACTATGTTCACAGATATTGGACCGACAAAGGCATATGTTGGGCTAGATGTTCCCATGTTCAAGACATCGACGATACAGCAATGGCATTTAGGCTCTTAAGACTTCATGGATACCAAGTTTCCGCAGATGTATTCAAGAACTTTGAGAAAGAGGGGGAGTTTTTCTGTTTTGTGGGGCAATCAAACCAAGCGGCGACCGGTATGTTCAATCTATACCGGGCATCACAATTGGCGTTTCCAAGGGAAGATATATTGAAAAACGCCAAAGAGTTCTCTAATAAGTATCTGCAAGGAAAACGAGAGAGAGACGAGTTGATTGATAAGTGGATTATAATGAAAGACTTACCTGGCGAGATTGGCTTTGCGTTAGAGATTCCATGGTACGCAAGCTTGCCTCGAGTTGAGACGAGATTCTATATTGATCAATATGGTGGAGAAAACGACGTTTGGATTGGCAAGACTCTTTATAGGATGCCATACGTGAACAATAATGGATATCTGGAATTAGCAAAACAAGATTACAACAATTGCCAAGCTCTGCATCAGCTCGAATGGGACACATTCCAAAAGTGGTATGAAGAAAATAGGTTAAATGAGTGGGGTGTGCGCAGAAGTGAGCTTCTCGAGTGTTACTTCTTAGCGGCTGCAACTATATTTGAATCAGAAAGGTCACATGAGAGAATTGTTTGGGCTAAGTCAAGTGTATTGGTTAAAGCCATTTCTTCTTTTGGGAAATCCTCTGACTCCAGAAGAAGCTTCTCCGAGCAGTTTCATAAATACATTGCCAATGCTCGACGAAGTGATCATCACTTCAATGGCAGGAGCATGAGATTGGACCGACCAGGATCGGTTCAGGCGAGTCGGCTTGTCGGAATCTTAATCGGAACTTTGAATCAAATGTCTTTTGACCTTTTCATGTCTCATGGCCGTGACGTTTACAATCTCCTCTATCAATCGGCAAGGAGAAACGATGAGAAGGAGAAGACAATAAGGAGTATGGAGACGGAGATGGAGAAAATGGTTGAGTTAGCATTGTCGGAGAGTGACACATTTCGTGTCGTCAGCATAACGTTTCTTGATGTAGCAAAAGCCTTTTACTACTCTGCTTCATGTGGCGATCACCTCCAAACTCACATCTCCAAAGTCTTGTTTCAAAAAGTCTTGTAA
Protein Sequence
- >fgenesh1_pg.C_scaffold_6003139
MSLQYHALNSIQSTNFLSSTKTTLSSSFLTISGSPLNVARDKPRSGSIYCSKLRTQEYTTSQEVQHDLPLIQWQQLQREDAPQISIGSNNNAIEEAVKSVKSILRNLTDGEITISAYDTAWVALIDAGDKTPAFPSAVKWIAENQLSDGSWGDAYLFSYHDRLINTLACVVALRSWNLFPHQCHKGITFFRENIGKLEDENDEHMPIGFEVAFPSLLEIAREINIDVPYDSPVLKDIYAKKELKLTRIPKEIMHKIPTTLLHSLEGMRDLDWEKLLKLQSQDGSFLFSPSSTAFAFMQTRDSNCLRYLRNAVKRFNGGVPNVFPVDLFEHIWIVDRLQRLGISRYFEEEIKECLDYVHRYWTDKGICWARCSHVQDIDDTAMAFRLLRLHGYQVSADVFKNFEKEGEFFCFVGQSNQAATGMFNLYRASQLAFPREDILKNAKEFSNKYLQGKRERDELIDKWIIMKDLPGEIGFALEIPWYASLPRVETRFYIDQYGGENDVWIGKTLYRMPYVNNNGYLELAKQDYNNCQALHQLEWDTFQKWYEENRLNEWGVRRSELLECYFLAAATIFESERSHERIVWAKSSVLVKAISSFGKSSDSRRSFSEQFHKYIANARRSDHHFNGRSMRLDRPGSVQASRLVGILIGTLNQMSFDLFMSHGRDVYNLLYQSARRNDEKEKTIRSMETEMEKMVELALSESDTFRVVSITFLDVAKAFYYSASCGDHLQTHISKVLFQKVL