Information report for CEY00_Acc30606
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a low molecular weight nuclear WDR protein which displays functional homology to the Swd2 protein, an essential subunit of the yeast histone methylation COMPASS complex. APRF1 acts upstream of FLC and promotes flowering under long day conditions.
Homologous
- Beta vulgaris: BVRB_4g095150
- Citrullus lanatus: Cla97C10G196710
- Cucumis melo: MELO3C009987
- Cucumis sativus: CsGy3G037710
- Daucus carota: DCAR_015059
- Gossypium hirsutum: Gohir.D10G086800, Gohir.A10G102600
- Juglans regia: Jr01_04920
- Manihot esculenta: MANES_17G112900
- Populus trichocarpa: POPTR_001G345900v3, POPTR_017G071900v3
- Prunus avium: Pav_sc0000040.1_g240.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_3G290600
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr2g0172941
- Vitis vinifera: VIT_14s0066g00720
Gene Resources
- Pfam: PF00400
- UniProt: A0A2R6P961
- EMBL: NKQK01000027
- AlphaFoldDB: A0A2R6P961
- OMA: HNEGYIR
- InterPro: IPR001680 , IPR015943 , IPR020472 , IPR036322 , IPR037867
- PANTHER: PTHR19861 , PTHR19861:SF9
- SUPFAM: SSF50978
- PROSITE: PS50082 , PS50294
- Gene3D: 2.130.10.10
- OrthoDB: A0A2R6P961
- STRING: 1590841.A0A2R6P961
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc30606
ACTCTCTCTAGATATTCGCTTTTTAGTGTCACTCAAATATATTTACGTCTTTTGACTATGAAATAGGAAAAGGAAAAAATGCGTAAAGCTGCAGACAAAATTTTACCCAAAAATCCTGACTTCCCCCTTAATGTATGTATATAGCAATTGTGGAAGAGAGGAAAGATGGATAATAATTCAACACACTCGAAATTCCCCAGGCTTGAAGAGGACCAAGCAATGGTCTCTACATATACATGGCGTACACAGTCCCCGCTGCAGGTTTTCGGTAAAATAAGGAGACATCAGGACTCATTCATCAGCGTCCATAGTTCCGATTTCAGACACAGATTTCGAGGGATTAGGTATCCAAAATGTAAGAACCGAAGATGCAGCAACAAACATTGCCCTGCGAGGTGCCCACTTCAAACAAGAGGCAACGCCTATATGGCTTTCCCAGCTTGCCACCTGCATAATGACGGTAGAAAATCAGTATTTGCAGTCTAAGAATCATTTAAACTACGAATTTAGAAGCTATAAATTCTTTAAACCGTATTAGGAGGATTCAACTGTAATCAAAAAAAATCAGATATGCCCATTAAGTATTCATGCCACAAAGCATTGTTGTCAATGAGAACTAGTTATCGAATTGATGATTTTGTGACTTGTTCATCAGCGTGTATCTGACAATTACACAAACCCCATCAATCCTCTACTACCTCAGGAACGAGCTTCATATTCTCAGAGTTACCAAATGGCTGTTGTTCTAATAATCTTCCTATTCCTGATATCTACTGTGGAAATTGTATTGATCATTGTTTGAAGGCAGTGGCTGTTGCATGGAGTTAAACATCAGAATCCAGATTGATGGATTCTTTGCTTAAGAAGTTTACCGTTCACGGAGATCGAGGCTGTGAAATGGGCTTTCATAATTATATGCAAATTAAGACGAATAACTTTTCTTAAATATAGCCAACGAGATTTTTTTTGGAAAATAAACACAACACTAAAGGGCAATAGGCCTTACAAGAAGAGAAATCAAATCAAAACAACTAAAACAACTTGGCCAATAAAATTATGCAGGGCTGAATGCAAAATGCGCCTTGAATCGTTCTTACTTTCATAAAATTATTATTATTTATCCTACCTCTTTCTTTTCTTCTTTTTTTTTAAGCAGCTGGAGGATTGTAAACATATCAAACCTGTTGCAGCTCCATAGTTTTACGAGTTTCGGTTCTTCGTTCAATCCCTTCACCTCTACACTCTCACCTTGGGATTAGGGATGACAATTTGCCCCGCCCCGATCGGGGTGAATTTTCGAGGATTTTTCGGGAATCAGGGCGGGGATCGGGGATTAAAAAAAAAATCGAGGATCAGGGCGGGGACGGTTTTGTTTATCCCCACCCCGATCCCCGAAAATTCACCCCGAAAATATTAAAATAAAAAATAAAGGGTACAAAATCATAATATAATCAAAGTTAAGGGTGCAAAGTGTAATTAATCCTAAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGGTTCTGGACCTCTGGTTCCGAGTCTCAAAACTTAAAATCTCTCCTCTCTCTCTAGAACCACGCGAGACCCTCTCCAGGAGGTCCGATTGGTGCCGAGGAAGGTCCGGAACGGCGAGCTATCCGCCTTGGACGACGTCGACGAGATGTTGCCGCCGCACAAGATCGTCGTGAGAGGGTCGGCGATCTTGCCGAATACGACCTTCTCGGTGCTCGAAGGCGCCAGGAGGAGGCTCAAGGGTAGAGATCTGAAACGTAGCGTACTGGAGTGTACTGACCGATTTTTAGTTCTATGTCACCAGTACCCTCATCTCTCTCAAGTTTACTCTCTCTCTCACATGCGCGCGCACAACCATGAATTTTTTGGGGGGTTCGGATTCGGAGCGGGGATCCCCGGTCCTCGTTAGGGGCGGGGATGGGGGGTAAAACAAAATCCCCGCCGGGGATCGGGGCTTAAAAAAATTCGGGGATCGGGGACGGGGATACCAACCTCCGGGCCCGCCCCGCCCCATTGCCATCCCTACTTGGGATAGAAAAGCTTACTAGCAAATGCGGTCCAGTTAGCTAAGCTCCCAGCCCTATCAAGAATTCAGGTAGAAGTTGATGTTTCCTTTCTTTTTGACACCAGATTGATGCTTTGACGCCATAGTCAAAATCATAGAGATGCTCCTTTGAAGTTGTTTTGATGATGTCTACTTATCAGCTTAGTGTTTTTCTTTTTAGGACTCTTCTTTGTAGCCTACTGTCATATTTGTACTTTATTAGGACCCTTTTGCATTGTCATGGTACTTGTTAGTTGTTTAATTTCGTGTATCCTTTATTTTATTAAAGTTCTCTTTTTGCGAACCCCCACCCCCGGTACCCAAAAAATAAATCAATTACGCATGTTTCATCTACAGAATTAGGTGATAGCTATCATAGTAAGCCTAACACATACCAAGACCAAGTGATTGGCTGGTGGATGAGGCAATGTTTGGTGATCCAGGTTAGAGTCTTACTGCTGCGAGCTGTGTAGGCTCCCCTAACCCTATTACCTCCCAAACGTATGTAAAAAAGGTAAAACCTAACTCCCTTTAGAACCTCGTCAGTTACCACCACCCCACCCCCACCCCCACCCCGCCACCAGCGATTCAATGCACCAAAAGAAGAAGAAGAATGATACTTTGGCAATTTAACATGGGAAACTGCAGAGTTCTTCCGCAGCACCCGAAATGCGATGGCAGACAACACAGAGACGCACTAATAGAGTAATAGTCAAGGAGATCAACCCCAGTAAGTAGACTCTTGTAATAACGACAAGCAAGCTGAGTTTTCTTTTGCAGTGTTAGCTCATCAAAAGTATCGCTCCATCCACAAGCAAGCAAGTAAAATGCATGTACAGATAGAGTTAATTTAGGTTCATGCCTTTTCCCAGCCACAAAAAGAATATTAAAAAAGAAAAAAACATAACTAGAGGTTTAGAATAGAATACAACGATACCTTACTCCATGTGGCGATGCTCCAGGCGTACAAATTTCCATCTCCTGATCCTTAAACACAGACAAATACTTAAATTTTAACATCCAAAACAGGAGAAAGCGAAAAGGAAAAAAAAAAATTGAGAAATAAAAAATGCAATATAAGCAGGCAAACACTTAAAAAATTGCTTAGTATTAATAGTACCCAGAACCAGAGACATTCACGTGAAAAATGCAATATCATCAAAACTTATGATTCTAGACTATAAAGAAATTTATCATACATCCATACTTGGAGGTCTTTTTCATTTCACATTAGCCAATATTGTAGAAGTAGATACCTGAGAGCACATACTGGCCATCTGGAGTAAATGTTGCCTCTATTGTTATATTAGGAGATGGATCCAAACTGAATGCAAAACGCTGCACCAAAGATAGTTCTGTCTTATAAATTCTCAGATCCAGTCTTGCAAAAAGACTGGCACATCAAACAAAGAGAACATACTTTCTAGACATAATCCAAATAGACACAGCAGACAGTTGGAAACTTGGACGATATAAACCTCAAATGAAACAAGTTACTTGCACTAACCTTCTCTCCTCCATATGCATCAAGAACATAAACATTATTACTTGTGGTCGTCAAAAGCATTGATTTACCATCATTGCTGAACTTAATATCACAGACCTCAGCCATATCTCCACCAACTAAAAAGGTATCAAACGGACCCTACATATTGGATAGAGAAAAAATCCATTAACGAGTTGCGGAAAAATAATGCTGAACTAGCTAGTGACTGCAAGTAAGAACCTTGTCAAAGGATCTTGAGTCAAATAATTTGATAGCACCCCCTTCCATTGCCACTGCAAAAACGAGGCCTTGTTGGTCATATGCAACTGTTGGCCGACCTCGTAAACGTAAAATTCCCTGAATACTACAACAGTGAGCATAAATCACAATCATGTGTTTCCATTAAGTAGTAAAAGACAACATTGCCAAATGGCCCATCCAAGCCACAAAATACCCTACCACCAGAGTGATTAATTTGTTTTGTACCAAGGTAAAACCGTTTCAAATGAATGCAGGTTTAAAATTTCCCTAATTAATGTTACCAGTCACTCTCAAGTTCCTTCAGAACCTGATAACATGACATCAATTCGACATCGTAGAATTAACTTCGTAACTTTAAAGTCCATCAAACTTCAAAAATTAAAATAAATGTGCACAACATGTTACCATCCTCACATATAGCAATTAATTGTTCATACATTATCCTTAGAAGTTACTCCCTCCATCCCGTTTTGTTGATCTATTTTAGGAGATCCAACTTTTTAGGGAACATGCATTTAATGCACTCAAAACCAAACCAAAAGGTATTGATTTCCAACATCGCCCATTTATCCCATTTTTAAAAGTATTCATAACCATTTCTAAGGGATAGTTTTGAAAAAATAAAAAGTTTTATGCTTTGACTGTTCAAAGAGGATGAGCATTTCGGGGAATCCCAAATTGGAAAGATGGACAAATAAAATGAGACAAAAGGAGTATATCTTTACATGACACTGTGCTCATATACCTACTTTTCAATCATAATTTGCAGGTCATTCAGAAAATATGTGAACCAACCTGGCAGGCATTTACACGAAGATCCCATATTCGGACGCTATGATCAAGAGAACCAGACATAAAGCTGTCATTAACAGGAGACATGCAGAGGGAAACTACCCTACAAGAAGCAAATAGTAGAGGAGAATAAGCATCAAACCGTGGCATATGCAAGGAAAATTTTTATAAAGAAAATTGTAGACAGAGAAAAAGGCGAAAGAGGAGGAGTTTTACTTGTATTAATAGATTATTACTTTATATTGTCTACCACCCTTCAAACTTCAATTACAGTAGCCAAAGAAGAGACAAACTATCATCTATAAATTAATCACAGCTATAAATAGTCGCAAGCAATATAGGAAGAAAAATATTTGTCGCGCATAAATGTCAATCACGCTCTAAATACTAGAGGCTGATTTTGTCTCTTTCTTTTT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CDS Sequence
- >CEY00_Acc30606
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Protein Sequence
- >CEY00_Acc30606
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