Information report for CEY00_Acc26147
Gene Details
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Functional Annotation
- JMJD5 encodes a protein which contains a jumonji-C (jmjC) domain. The jumonji-C is frequently found in proteins with histone demethylase activity. jmjd5 mutant plants have a short-period circadian phenotype.
Homologous
- Brassica oleracea: Bo5g106210
- Brassica rapa: Bra035742
- Citrullus lanatus: Cla97C03G063630
- Cucumis melo: MELO3C015209
- Daucus carota: DCAR_002041
- Glycine max: Glyma.11G130600
- Gossypium hirsutum: Gohir.D06G112900
- Lactuca sativa: gene-LSAT_6X50061
- Medicago truncatula: Medtr4g066020
- Nicotiana attenuata: A4A49_40783
- Populus trichocarpa: POPTR_001G016200v3
- Prunus avium: Pav_sc0002024.1_g120.1.mk
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400021346
- Vitis vinifera: VIT_06s0004g01630
Gene Resources
- Pfam: PF13621
- UniProt: A0A2R6PQN7
- EMBL: NKQK01000023
- AlphaFoldDB: A0A2R6PQN7
- OMA: PLHYDSY
- InterPro: IPR003347 , IPR014710 , IPR041667 , IPR056520
- PANTHER: PTHR12461 , PTHR12461:SF105
- SUPFAM: SSF51197
- PROSITE: PS51184
- Gene3D: 2.60.120.10 , 2.60.120.650
- OrthoDB: A0A2R6PQN7
- STRING: 1590841.A0A2R6PQN7
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc26147
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CDS Sequence
- >CEY00_Acc26147
ATGCGGGAGGCTGAGGCGGCGCGTGAGATGGCGTGGGAGCAGCTCCACTCGGGTCCGTGGAATTCCGTGCTACCGATCTGGCGAGACGCGTACTCGATGGCGGGCCTCCCCGTGGCCAGGTTTCATTGTGCCGGCGGTCAGTTTAGCGAGGCCATTAGGGTTCTTGACATGGGGTTGATTATGGGAGGACTGGCTCTGCGGAAAGATTTGGAATCGGCGGTCGAGAAGGCGTCCGCAATGGCGAGGAATCTTAGGGTTTCGGAGGGCGGAGGTGAAGGGGTCGCACAAGCCCAATGTCTTCTTCTTCCTCAACAATTTAAAGACGCGGAGGCTTTACCCGTGGAGTCGCTGTCTCGGAAGATTGTTGCAAAACGGTCGGCTCTCTCGTTGGAGGATTTCCTCCGTGACTATTTTTTGTCAGGTTCTCCAGTTACAATCAGTGATTGTATGGCTCATTGGCCAGCTAGGACAAAGTGGAACAACATGGATTACCTAAAAATGGTTGCTGGTTACCGCACAGTTCCAGTTGAGGTTGGGAAGAACTATTTGTGCTCGGAGTGGAAACAAGAACTCATCACGTTTTCCCAGTTTCTTGAGAGGATTCAGTCTAGTGATAGTAGTTCTGATGGTCCAACATATTTAGCTCAGCATCCATTGTTTGATCAGGCATGCTTAACCTTTCACCAAGGATGCTCTATGATGGAAGTTGTTGGCAAAAAGTATGTAAGGCTTTATCCTGCTTCAATATCAGAGGATCTTTACCCACACAGCGAGTCCATGCTTAGCAATTCTAGCCAGGTTGATCTGGACAACATAGACATGAACAAGTTTCCGAAGGTGCGGGACCTAGAATTTATGGACTGCATTTTAGAGGAAGGCGGAATGCTTTATATACCTCCAAAATGGTGGCATTATGTTCGATCTCTTACCAGAAGTTTTTCTGTTAGTTTTTGGTGGAGTGATTGTAGAGGTTCACCCGAGTCCTGA
Protein Sequence
- >CEY00_Acc26147
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