Information report for CEY00_Acc20216
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a SWI/SNF chromatin remodeling ATPase that upregulates transcription of all three CUC genes and is involved in the formation and/or maintenance of boundary cells during embryogenesis. Also mediates repression of expression of seed storage proteins in vegetative tissues. Interacts strongly with AtSWI3C, also with AtSWI3B, but not with AtSWI3A or AtSWI3D.
Homologous
- Citrullus lanatus: Cla97C05G081810
- Cucumis melo: MELO3C006101
- Cucumis sativus: CsGy3G008780
- Glycine max: Glyma.07G069400
- Gossypium hirsutum: Gohir.A11G090000, Gohir.D11G094400, Gohir.A07G141800
- Juglans regia: Jr07_06900
- Manihot esculenta: MANES_01G255300, MANES_05G032800
- Populus trichocarpa: POPTR_002G160900v3, POPTR_014G086500v3
- Prunus avium: Pav_sc0000254.1_g1560.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_2G172900
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr1g0356661
- Vitis vinifera: VIT_15s0046g02290
Gene Resources
- Pfam: PF00271 PF00176
- UniProt: A0A2R6Q8Z4
- EMBL: NKQK01000018
- OMA: HNQAPKW
- InterPro: IPR000330 , IPR001487 , IPR001650 , IPR014978 , IPR027417 , IPR036427 , IPR038718 , IPR049730
- PANTHER: PTHR10799
- SUPFAM: SSF47370 , SSF52540
- PROSITE: PS51194 , PS51666
- Gene3D: 1.20.5.170 , 1.20.920.10 , 3.40.50.10810 , 3.40.50.300
- OrthoDB: A0A2R6Q8Z4
- CDD: cd18793
- STRING: 1590841.A0A2R6Q8Z4
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc20216
TAACAGTTTAGCCTAAGAATTGCAAATTTCGTGAAATTGAGAGAGAGAGAAGAGAGGAGAGAGAGTGTGGAATCGGAGGATTCCGGCAACTTCGGGGGCTAGCCGGCCACGAGATCGATCTTCCATTGGTCGCGCCAAAAAAGCCCCTTCTCTGTGCTCAGCAAAATTATCGCTTTCTAGAGAGAGAAACGAGAGATATACATGTAGAGAGAGAGTGGGCAGAGAGAGAGAGAGACGGAGAGAGACAGAGAAACAGAGACGTTTTTTGAACGTTGGGATCGGAGTGCCAAAGGGTTTTAAACGACAGCGGTTTACGAAAACCGCGTGAATTTTGGAGGGATTTGACAGTTGAAGTCCAATTAAATTTTCGCGTGTGGTGGTTGTTCTATCACAGCTTTTTGTATGCAATCGGGAGGTGGGGCCCAGCAGGGCCACGGTGGCCATGGGCGGAGCACGGCGGCGGCGGGACCGCCTTCTTCTTCTGCATCGCCGTCGTCTTCCTCGTCGGCCGTGTCGGCCCCACATTTAGGGTTTGATTCGATCCAGCAATATCAGCAGCAGCAGCAGAGGCAGGTTAGGGTTTTTCGAAAATGGTTTAATCCGTCCTTGTTTATTGAATTGAAAAATGGGTTTTGAAATTGGAATTGTTGTCTGAATTGGGTTGGCTTGGATTTGTGTAATTAATGGAGTGTAGTACACAGTGGCGTGAACCTCACTGTTCAATTAAATTGATAAATGGGTTTTGAAATTGGAACTGTTTTACATGGTGTGTTGGACTGAATTGTATAATTAATGCAGTGTAGGAGAAGTTCACTGTGGTGGGAATGTCACTGCTCAATTAATTTGATCAGTTGTTCACTGTCGTTGGATTTAATTGTCTAGATGTCAATTTGGCTACTTTGGGATTTGTTCGAGGAAAGGGTTTTAATATCTTTTTTTCATTTCAGATTCTAATGTGTTTTGGAATTGATAATGCTTTTGCAATGCTGTAATTAATGTTTTTGATTAGAGCATTTTGATGTTTTTTTATACGAGTCCACTTTCAAATAATTAACTTAGCTGCTCTAGGGTTTTGAAGTAGCCATGTCCTAATTTAGAAGAAAAAGGAAACTGATATTAACAAAGCTTAAATCTACTTTTAGGTGTCAGCTTCATGTTTTTTTCCTTGTCACTAACAATATTTTGTATTATGTAATAATGGGCTGCCATTCTTTTGATCTTTTATTTTGTCTTTGTTACTATTTAAATTTTCATTAGGACTGGGGTTGAGACATTTGTTTACTTTATACAAGCATTCTTTTTTCTGAACTTCCATACTATCTTTTTTTTTGGTGGGGTGGGTGCATTTTGAGGAGTTCAGTGTCACATTTCTGTTATCTTGAATTCTAAACCGAAGCTATTCTAGCTAACTGGCATGTGTCGAGTGTAAATTATGCCTAGTTAGTACCCATTAATTGGCATATGTCTAGTGTACTCATGCTATATCTTCACTGAGTTGGGTTGATGGGTTTGGAGTGTCTGGGGGGAAAATACTGTACTGGGTTCTGGTGCAAAGAAAGGCACTTTTTGTTTCCTATTCAATTTATTAGAAAATTGATAATGACAGAGAAAAAACACATTCAAGTAAATACGTGCAGATTGTGTAGCTTTTACTACTCTTGATATGCTGTTGGCACTTCTATTAGAACTGGAGTTCCTGCTGTCTTATTCAATATTTCCAGGACTCCTTTTGTCATCCTTTTAGTGGATATGAACTTGTAATTTTGATGTGTATTCCGACTCATACAGTTCTCCCCAGTTCTTATCTACCGGTAATACCTGTACCTTACATTATGCTGTTATTGCAACAATAAGGGTAGCATTTGCTATTAGATTATTTGAATGCTTGTTAATAGGTTTTGATATTTTCGGTTTTTACATTAAAATTAGTTTCTTGCATGATTTAGACTTTGATGTTGTTGGTGCAGTCATTGCAACAACAATTGCTTAGAAAACCTGAAGGGAATGAAGCTATTCTAGCCTACCAGGCTGGTGGTCTCCATGGTCTTCTGGGAGGGGGCAATTTCGCTTCATCTTCTGGTGTGATGCAACTGCCTCAACAGTCCAAGAAGTTCATTGATTTGTCTCAACAAAATAGTGCTGCTCACATTCGGGAGGAGGGCCAAAATAGGAGTCAAGGAATTGAGCAGCAAATGATGAACCCTGTCCAGCAAGCTAACCTCCAATATGCTTTCCAGGCAGCCCAACCGAAATCAGCCCCGGGGATGCAATCTCAGCAGCAAGCAAAAATGGGAATGGTGGGGCCTCTATCAGGGAAGGATCAGAACACTAGGATGGGTAATCTCAAGATGCAGGAGCTCATGTCTATTCATGTGGCTACCCAGGCACATGCATCTTCCTCCCAGAAACAGCCTGAACATTTTGGTCGAGCTGAGAAGCAGACGGAGCAATCACAACCAGCAGTTTCCGATCAAAGGAGCAATCCAAAACCTCCAATCCAGCCAACTTCTATGGGCCACTTTATGCAGGCAAATGTTGTAAGACCTATCCAGGCACCTCAGACTCAACAAACCATCCACAACAATGCGAACAGCCAGCTTGCCATGAATGCACAGATTCAGGCAATGCAGGCTTTGGCACGTGAGCGCAATATTGATTTGTCACTTCCTGCAAATGCCAACCTGGTCGCTCAGCTTATTCCACTCATGCAGTCTAGGATGCTTGCACAGCAGAAGACAAATGAAAACAATATGGGCGCACAGTCTTCGCCTGGCTCATTGCCAAAGCAGCAGGTGGCTTCTCCACAAATTGCAAGAGAGAGTTCTCCCCATCAAAATTCGTCGAGTGATATGTCTGGACAGTCTGGCTCTTCTAAAGCTAGGCAGACAGTTGCGCCTGGCCCGTTCGGCACAACTTCGAATGCTACAACAGTTAATAATGCGAACAACATTACGGCACAGCAACGATCTGCTAATGGCAGAGAGAATCAGGTGCCTCCGAGACAGACAATGTTGATTGGTAATGGGATGCCTCCCATGCACCCCCCCCAGTCACCTTTGAACTTGAACCAGGGTTTGGATCGTTCATCCCATTCAAAAAGCATGTCAACTGGTCCAGAAACTTTGCAAATACAGCATGCTAGGCAAGTGAACCGTTCTTCTCCACAATCTGCTGCTTCAATTAGTGATGGGAGCCTGGGAAATTCCTTTTCATCTCAGGGTGGAACGGTGCCCCAGATGCAACAACAGCGTACAGGGTTTACCAAACAGCAACTGCATGTTCTTAAAGCACAAATACTAGCATTTAGGCGTCTGAAGGTCTGGAAACTCCATCCTGCATCCCCACCTCTGCCACACACACACAAACATACACATATTGGCTACCTTATGTTACTTGTTCTCAGTACTCACAAAGCTCATTGGTCTTGCTACTCAAATACTGACGGTAGTATACTCTTTTTTTTCCTGCTTACTGACAGAAAGGAGATGCAACTCTTCCACAAGAACTACTTCGAGCCATTGCGCCACCACCTCTTGAAACCCAGCTGCAGCAGGTGCCGCTTCTTACTGGAACAAGTACTAAGGATAGATCTGTTGGAGAAAATGCAGAAGCCCGAGTAAAGCAATTGGAGGCCAGTGAGACGGACCCTCAGGTTGTAGCATCATCTAGTGGATTGAAGGATTCAAAAGAGGAAACTTTTGCAGGAGATGAGAAAGCAACTGCTTTGAAAGATCATTCACAAGTTATGACAAGTTTGACGAAAGAGACTCTGCCAGTGGTTCCTTCTGGAAAGGAAGAGCAGGAAACAGCCATATTCCCCGTTAAACCTGAACCGGAAGTTGAACGGAGTAACCAGAAAACACCTTTTCGAAGTGATCTTAGTGTAGATAGGGGAAAGGCAGTTGCACCACAGGTTGCTGTATCTGAAACACTGCAAGCTAAGAAACCCTTACAAGCAAGCAATGCATCACAGCCAAAAGATGTCGGATCTACCAGGAAGTATCATGGGCCACTATTTGATTTTCCATTTTTCACTCGTAAACATGACGCCTTTGGGTCTGCTATGATGGTGAACAACAACAATTTAACATTTGCATATGATGTCAAGGATCTGCTTCTCGAGGAAGGAATGGAAGTGCTTACCAAGAAAAGGACAGAAAATTTGAGGAAGATCAGTGGTTTACTAGCAGTGAACTTGGAGAGGAAAAGGATCCGGCCAGATCTTGTTCTCCGGCTGCAAATTGAAGAGAAGAAACTTCGACTTATGGATCTTCAGGCACGCTTGAGGGATGAAGTTGATCAACAGCAACAGGAGATAATGGCAATGCCTGACAGGCCCTATCGGAAGTTTGTTCGACTTTGTGAGCGTCAACGCATGGATCTCACTAGGCAAGTACAAGCCTCTCAGAAAGCCATGAGAGAAAAACAACTGAAATCCATTTTTCAGTGGCGTAAGAAGCTTCTTGAGGCTCATTGGTCTATCCGTGATGCACGAACTGCTCGTAACAGGGGAGTTGCAAAATATCATGAGAAAATGTTGAGGGAGTTCTCGAAAAGAAAGGATGATGATCGTAATAAAAGGATGGAAGCATTGAAGAATAATGATGTTGAGAGGTATAGAGAAATGTTGCTGGAGCAGCAGACTAGCATCCCTGGTGAAGCTGCTGAGAGATACAATGTTCTCTCATCATTTTTAACGCAGACAGAAGAGTATCTTCAGAAACTGGGAAGTAAAATTACAGCTACAAAGAATCAACAGGAGGTCGAGGAAGCGGCAAATACTGCTGCCAATGCTGCACGAGCTCAGGCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATATATCTTCTCCTTTTAGCTATATTTTAAAATGCTAGTCAAGTTAATGGAAAATAATTCCAGTTTAAGTTTTTTTATTTTGATTTGTTGTATAAAGGGTCTCTCTGAAGAAGAAGTAAGAGCTGCAGCAGCTTG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CDS Sequence
- >CEY00_Acc20216
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Protein Sequence
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