Information report for CEY00_Acc19959
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Controls flowering and is required for CO to promote flowering. It acts downstream of FT. Overexpression of (SOC1) AGL20 suppresses not only the late flowering of plants that have functional FRI and FLC alleles but also the delayed phase transitions during the vegetative stages of development. AGL20/SOC1 acts with AGL24 to promote flowering and inflorescence meristem identity.AGL20 upregulates expression of AGL24 in response to GA.;Encodes a MADS‐box protein
Homologous
- Citrus sinensis: orange1.1g028923m, orange1.1g028911m, orange1.1g028889m, orange1.1g028864m, orange1.1g028858m
- Glycine max: Glyma.05G050700.5.p, Glyma.05G050700.2.p, Glyma.05G050700.3.p, Glyma.05G050700.4.p
- Juglans regia: Jr02_18860, Jr02_18870
- Manihot esculenta: MANES_02G030100, Manes.02G030100.1.p
- Populus trichocarpa: POPTR_003G119700v3, Potri.003G119700.3, Potri.003G119700.2, Potri.003G119700.1, POPTR_001G112400v3, Potri.001G112400.1
- Solanum lycopersicum: Solyc08g080100.2.1
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400022748, PGSC0003DMP400039438
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A2R6Q880
- EMBL: NKQK01000018
- AlphaFoldDB: A0A2R6Q880
- OMA: MERYILH
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A2R6Q880
- CDD: cd00265
- STRING: 1590841.A0A2R6Q880
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc19959
TTCCTTCAATGACTTTATTGTAAACATTCATTGAACAAGACTAGGCTTCACAATTATTTCTCAGAGCAGATCAAAGCACAACTCTCGAGAGCCTTGAAATGGCACAATTAAGAATCGTATCAGCTACCGGGTAGTTCGTGGTTGGGGTAGTCCTATGAACAATTCGGTCTCCACTTCTACAATTTCCTTCTGCGTCGATTGCATCTCATCCCACTGAAGAATCAGTCATGGTCGATATCGTCGTTTTAGTACAACTGCTTACGCGAATGCGAATTCAAACGTATAACAAATAACAGCATGAAAAATACAAACATATATAATACTTCACCTTCTCGCGTAATTTTGCATTTTCTATTGCTAGTATTTTCTCCTGAATTATAAGAATATAAAAAAAAAGGTAACATATATTAGCGAGTCCCAAGCTAATATGTAGCATATGTACGTCTATCGTGTACGTATGAGATTTACCTCTTCTTTCAGTTGATGAATCCTCTCTTTAAATAATTGAGTCTGAGAAATATTCGCAACACCAACGTTTGTATTAGAGATTATGTTCATTTAAGATTTTGAGTCGACGAGTTGGATCAGGATGCGAGTGAAATACCTTTGTTGCCCTAATTTTGCTTAAGCTTTGCTCGAGCTGGTTTTCAACTTCTTGTAGTTCATCGATAGTGTACGACTCTAAACTGTCCCCCAAGAGCCTTCTATGGGATGAAGATTTCGGTCATTTAGAGCCGGGTATCGATATGATTGAAGTAAAAACGAGTTTGAAAAAAAGAAAAAACGGATTCAAAACGTACTTACCGTTTAGAGGCTTCGAGGAGTTCAATCTTTTCTGACATGTAATTAGCTTCCTCCTTCAAATGCTGAATGCAGAGCAATTGTTATAAGAACAAAGTAGAAAGAAAAAGTACAAAAAGAACACCAAAATTTGACATCAATAATTTCAATCGTAACAAACCATACCCTAGAGTTTTGATCATGTTACGATTGAAATCAAAGTTTTTAAAGAGGATAATGTCAACGTCGTCGTTTTCCTAATCTTTTGGCAGAAGTAAATTGGTTCCGTCAATTCTACCGAAACGAAGACTGACATATGGTTTTAATTGTGAGCAAATCAAATCCCATATTTTCTTTGCAATTTTTCCAAAAATTACTTTATCAATTTTATGGTTTTCAATAAATAGCATAATAAAAAAAATGGAAGCATTTGTATGATTAGCAAATTAACCAAAGTATGAGATTACAAATAAATTGTTATCGAAATAAGAAATTACTAATTCAAAATTATTGCAATAAAACAGTATGAAGGAAGAAAAGGAGTGAGCTAATTACCTGTAAATTATCTTGAGACGTTGTTTTTTGGCCAATTCCCATTTCATTTACACTTCTCTGATAGCGTTCTATCGTCTTGTTAATACTGAGGCAACTCCACAAACGCAAAAAGGCAATAAATTATTCATTGTAGCAACCTTTGAACATTCGTTTTCGATTGTTCTTCAGTCTCCACAGTTTCTAAATCGTGATCGATACAAGATTCAAAACAAGAAAATACAAACTTGAAGATTGCGCTACTCATCAACTATTGTTGATGTTGCAAGGAATGAAGCTCATTCTATATATCCTTGGACTCTTTCTTGTTCATTGAATAACCCTTAGACCACAAAAAAGAAACCAATGACTTTGAATCAAATGTGGGGAAAAAAACCTTTACTTGCTTAGCAATTGATGCAGAAGAGCAGTTTATTCATTACATATGTCAAATTTAACTTGAACCCTATCATTTCTATCCATTTCGAGTAGGCCATCCATAATCAAATCCAAATACATCGATTAGACCCTTGTGGGAACGCATATTTAAGTCAAATATTGCAGCAGGAAAGCGGATATACAATGAAGTAAGAAAACAAACGATAATATAAAGGTAATGATAAAAGGAAACTCTCACTCTCCATCCGTCCATATTATTAATCAACACAAAAACTCCTTAACCAAAGACTTTACTAGAGTATCTATATATGTAGAAACCCTAGCTTTATTAGGAGAGGACTAAGAAAATGAAATTACTTGCTAATCAAGCCTAAAACAAGAAATTACGAAAATTACAAAAAATCAATAGAAAACTAGAAAGAAAAAGGACCATCTCCCAAAAACCTAGCTAAAATTGTAATTTAAATCGAAGAAGAAATTGACCAAATAATTATTTCCTATAATAGCCACTTTGTCAAATTGAAGATTTAAACGAAGAAAAGTTTGCCAAAATCCGCCTTTAGTTCACAACAAATTCGTGAGCTTTTACTCCTTAGGCTGTTTCCAATCGAATACAAGTGACCCGACCTAAAGTTCCATTGTCAGAAAGTCATGTAAATGATAAAAAAAACTTTCATACATGCGTACTCAATAAGCTTTGCATCTTATAGTCCAAAATTGTGACTGGTGAGATTGATGGCACAATCTAATTGTGCACAACTCTAACCACTGAAGGCACTTCTGATCTCAGATTTGGAAACCTCTTAAATACTGTATAAATGAACTGTACGGACTTCTTAAAAAAAATGGGTGTGCTAATTAAGTGCTAACACCCAATCCCCATGCATGCAACATTGAAAATATGGTCCGTCTCAAATTCAATGCATGCATGTAAGGCATGGGATAATGTATTTACCAACACAATGCACGATAATTATGATTTCAAGAATGTTCACTAACTTATTTGAGAATAGTAAATGCACACAAAAATTAATTTCTGTGGCCTCAAATGCAAATGTTTTTTTTTTTTGCAAAACAAACATCAACGTTATTTGAAGTTCTTTTCACAATCCCCAAGATGAAGATGAAGATTTTTTTCTAGAAAAACTAACATACTCGTTAATTGAAATTGTTTTAGCAATCCCCCAAATCTCTGCAAAAGCGAAAGATTGAAGAAGAATCACGCACACAATCGATGATCTCTCGTAAATGAATGCCAATGGAACCGGTTTCATTCGCCCAATGAGAACAAGTGAAATAAGTATGGCACAGCAGACAAAGTTTTGAAAGTAGTGATCCGTAACGATTAACCAGCCATTCAAAAAACACAAGTTTCCTTCTCAATAAGCATGCTTAAGAAGCCAAAGGGGTAAATTAGCGCCAAGCCCCACACTCAAGGAAACCTTCATACTCGGATCAGAACACACATGTCGCACATCCTTCTTCAATCATAGTACTGAAGCAGATATAGAGTAGCAGTATAACATGAATAATATGTGTGAGATTAAAGCTTAATAGTAATAAAGTTATTAGCAACCATGGTAATCACCAACTTATCAAGAGATGTACTACTCATGAACCAGACACAGACCAAAGAAGAGCTTGGTACCAAAATAGTGACCAACCATCCTAACTTGTACATGAAATGCATGCACTTTCGTACCACTATTTTAAGCATGTTTAACAATGCCCTTGTGCGGTTGTTAATACAATTATTTATCTTTTGATGTCTAAATCATGCTGAAGATGCCGTCAAGAGATGAGATGTAAAAACGTGAAAAAAAGTAAGAGAGATAGCAAAGCCTCTGTGGGTGAGGGAAGAAGAAAGCAAAATATGTCTTCCATGGAGACTTAAGTAAGAAGCCTCAGTGTTTAGTGCTTGGTTGGAAATTAAAGTTTTAATTTATTTCAGGATGCATTTAATTACCTATATCTAGCAGTTAACTAGGGAATTACGAAACTAGGCTTCATATTAGGAAACATATTACAAAGTATATGAAAAGTTATATTTGTAATTACCTATCTTGTATTGCGTAATTGAGTAACTGGTTTTTGATTTTCTATTTTTTGCTTCACAACCCCAAACAAGACTTAATTATGTTCTAGATATCTTAAGTTATAAGGAGTCTCACCTGTTAAGTTAGGAAGGGAGTTACTTGGCACTCATAAAATGCTACTCCCAAAAAAAATAGTTTGCATACTGTATAGTATAGGTGCATTATAATTGCCTATCTAGCAGTTAATTCGAGAAATAAGAACACAAGTTCGTCTTGCTATCTTGAGGAACAGCCCCCTCAGCAAATTTTGAAGATAATCGGTGTATACATTATGTATTGATCGTTTTGTATCGGGATTTTGGTTCTCCAATATCGATATGTAACGACGCCTAATATATAGAGTTGTATCACCAATACCGATACCAATATCGTAACCAATACAATAATTTAAAACCTAATAAATGAATAGCAAACTGGATAATTTTGGCTACTGTTTCTCAAATACTCTATAATGCTATCCCCAAATGAAGGCAGCACAGACAAAAGCTTCATGCATTAATATAGTTATGGCTATCCACTTTCCTCTTATGTGGCTTTTCTTCTAGGTTTGAAACCCTACTACAACTTTTATCAGTACAGACTACAAAGTTTTATACATATACTATTATTCCCGACTCGTAAATTATTTTTATTTTATTGTAGTAAAAGTAATATATAAATACACCGGTAGCATTTAAAAATAAAATCAGGCTTTTTATGATAACAAAAATTATACACGTATAAGATTTTTTAATAAATTGAACAGAAAAAGGGATACGTGTCAAGATTGCATGGCTGGACCATGTGGAAGTATGAGAGCCATATGGTGGTGATGACTCACCACCATGACTCATCAATGGGCATGATTACTTGAGTAACTCACCATGTAACTCACCACATGGGACACCCAAGTCAACAAAACACACACAATTTTGTCCCCAGCAATGTTGCTGGGAACTTGTGCGCTAGAGAAAGAGGGAAAGACGGAGAGAAAAAAGGAGAAAGAATGAAAAATAAAGAGAGAAGGGAGAAAGGGATAGAAAGCTTGATATAGAAAGAGAAAGGAAGAAATAGAGGAGAGAAGGAGAAGTGAATAATATTACTTAGTTTTCTCCGAATTCAGGTAAAACATTGTCTCTTTCCTATTGTTTTATAATTTTCTTTCACTAAATAAAGTGATGACCGATTGGGATAGAAGTAATAACCCATATCATGATTAAAGTTTAACAATATGTCGAGAATAAGTCACGTATACGCTGTTGTAGGATCGAAACCCAAATAGAGAGTATGTCATGTTTTTTATCAAAACAGTCAGTTAGTATTTTGGGCACAAGTCCTTTATACGACAATCTTTTGACTTGATTCGAGTTGCGTATGAAAGCTATTTCAAATACCTATAACTTTTATTTAAAGTGTTTTTCCTGATTTAGAGGTTTACTGGCTCAAAACAGGCTTGAAATTCAAGTCATAAAAAAATATCTTGTCTTGAACCGGTCCAGTTTTTTCCCTACCAGTTCAGCTTTTTTTTGACCTGTTAAACCTCAAGAATTTTTACAAATTTAAAACTCAATTGATTTATCTAGTACCCGAGTCACTTCCGATACCTCATACACACTTACTATGCTTAGATTAGGTACACGAAACAGTAATTCAATTATACAAAATAAGGTAAACGAAAGGATAATTAAAGAAAGAATATTAAATTCGAAATTGTTAATTATAGGACCGAAACCCGAGGGGCCCTTACTTTAACTTATGAGCGGGCACTGAAAGAGCTCAAGATAAACAGAAGGTGAGTCAGTCTTGTTATGTTTTACTTACTTAAAAGTAAAAGTTTTACAATTAAAGTATGTATATTTTGGTTGATTAAAAATGATAATTTATGATTAAATGCATGTTATGTTTTAAATGTGCCATGAAATATAAAAAATAATTACTTTAGAAAAGTATATTTTAGATGACACATGGTTCAAACGGTGTCCCAACCTCTAGGGGAAAAGAATATAGCAAAAGGTGATGTAATAAGGGTGGGATAATAGTCAGATGATCATGGATAATATCATGTCATATATATTATATTGAGGTCGCTCCCTAATAATCGGTGATCGTTGAACAAGTGTACGTGGCACAAGGGTCAATCCAATATAATTTTGAACTCTTGATATGAAATCAAAGTAAATGAGCCTAGATGAGCCAATGATTGAATGAAAAAGAATTGAAAAAAATAAAGTTATTTAATTAAGGGTACTTGACCCGACGAGCCAAGGATTTTGGTTAAAAGATAGGCCTAGATGAGCCGAGGTTTTGAAAAGTGATTTCATGTTGAAATGAATTGAGGTTTTTATAATTTCATGAGCGCTTGTTAGTATTATATAACTTGACTCACGCTAGTCTAATACTTAAGACGTAGTTATACGTAATAATTTCTAGTAATGAGATTGAAGAGCATTGCAATTGAGGGCGTGTGACCCCAGTGTTGATTTTGGAAGGCCTATACTGCGTACTTGGATAGGAATGTTAGTTCTTTTGAATTTGTAAAGTTTTGATGATGGTTGTGTCAGGTTTGTGGCCAAAATCGTAGTTGTAAATATTTTTATTCAGAAGTAAATACAGTTATTTGTATATACAAACACGTCATCTCAGGTACAATTAAATACGCTTCCGTATGTAATATTGCATTTGAGAATAAATGCCTTGAATGACAGGAAAATACCTTGAATGACAGGAAAATTCTTAAACTAATTGAGTTGTAGGTCTCAGTGGATTCAAAATTTGGTGGAGGAAGATGAAAGTAAATGAAAAAGTCAATAGATTCAACAATTCAAATTTAATTTTTTTTATATATTTTTTTTCACTCATAAATTTCTATCTAAATTCTTTATTTAGAGGCATAAAGCATCTTAATCTAATTAAACCCAATGTGTTGAATTAAAATTATTTACAGTAGATTGATCATTATGGAGGAGAATAGGATTCATAAGGATAGGAAATTGAGGATGGCCAATTGCTTTTTTACCAATTAATGGTAAAAGCTATCAGAACTAATTAAATTCTTAATTTGAACACCAACCATAATGGACAAAACATCATTATGTTTTTCTCCCAACAAAGCATGCATGCAAGGGTGGACATTTTATAGCTCTTAGAAATTGGAGTATACTATGAAGCATGTGGCACGGGCACGACTACTAGTAGGATACGAATATGTCAGCACAACAAAACTTTGAAAAAATAATTTATGGGTACAGCTAGGTGTATCCTTAAAAAAGATGCTTTTAATTTTGAATAATTAATTATGTTATAGTATAATAATTAGAAATTAAATGGAAAAAAATGATTAATAGCGTAGTTATTTATGAATCCATGCCATATATTACAGTTCAATAAAAAAGATAAGTACAAATCGGAGTTTAGTAGCGTTGCACTAAAAAACTACACATCAAAGGTTATTATTATAGGATGCTAAAGAAGAGAAAAAAAGTCAAATCAAACTAACTTGAACTTTATTTAAAAATAAGAGTTATTCCGGCTACTTTACGATTGGGGGTGTATAGTGAATATGTCTGAGATACGACAAGAATTAAGGAAAAGAATTCAATATGAGTACAAAATGCTATGCAAATTACTAGTATCTAGTACATATAATTACGGGTACAACAACTTTTTGAAATACCCACACAACATACATGGGATATCAAGCATGAAATTATGCAAAAATTAATATACTAATTCATTCCCATCTAGTATTTGTTAAGTGCAAACCATGAGACCATGAAATGAATGCAAATCACTCATTTAAAAGTGAATTAACATTACCTCATAATGTGTGATTAGTTAGTTCACCTGGGGTTCACTATTTTGAGCGGGCTTCTATTGCATTGAAAGAACCGACCACAAAAGTAAATAATGTTTGCCCACTTTTAAATTAAGTAAACGAAATTACATTCCCCTTAGATATATATGCCTCCTTGGTAATTCTAAATACTACGTTTATTTCTTTATTTACTTACTTATTTATAGTTGAGTGTGCTCTAAAGTTGTCCCAAACTCAGTCATTAGTAGACTGTAGAGTGTAGACCCAAAAGAACTAGTTTTTATTAACAAATGTACACAAGTACTTAATGCAACATTTCAAGCTCTATAAAGTTAACAAAAACCCACTTATGATACTGTCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGATTATGTACTATTCCATGCTGCCTATCAGTGAGTTCAAAACTGCTTTCTTGTTAGGATCAAAAAAAGCTGTACATTTAGTATTCATGATGAACAATTAGAAAGATAAATTATACTCCTAATTTGGTGAATATGACAAGTATTTGCAGATTCAACACATCAAAAAGCAAAATACAAATTTAAATGAGGATTTCAAAAATAATAGATTTCGTGTTTGGAATTTGAGAGTTTTATCACCGCAAATTTGAAATGAATGAGAGTGATTTAAAATTTTTCTTGCTAAGTACCATAATCATACAAGTTCCACTCTAATTCAACATGCGACCTGTAACTGAATCTCTTATGTTATTGTCAAAATTAAACAACCTTTAATTGAAAGTTCACGTCTATCCATGTTGTGAATCTCAAATCTAGACACCTAAAATTTGTTAAAGATATCAAGGGTGAGAAAAGTTCTGTTGGTACAGATAAAGCCGGAAATCATAGTACTTGTGGGCCAGTTAATTGTTCCCTAAATTCATACTATATGCTCATTAATAATAATAATAATAATAAATTAACATTCAAATACACATAACAAAAGAACAAAATGGGTTCTCATAGAATGATAATACCTGGAGTTTGAGAACTCATAGAGCTTGCCTTTAGAAGAGAAAATAATGAGAGCAACTTCAGCATCACATAGGACTGATAGCTCAAAGGCCTTCTTGAGAAGCCCACCTCTTCTCTTAGAGAAAGTCACTTGCCTGCTTGTTGTATTCTCTATCCTCTTCATCTCAGTTTTCCCTCTCACCATTCTCACACCTCCCAAAAAAATAGGAAACAAATCCCCAAGAAAAAAAACAGGAGAAAAATTAAACCCACATAAACAATCACACAACCCAAAAAAAAAAAAGAAACTTTTCTCGAGCCCAGATGTGGGTTTTCTCGTTGTAATCTTTTCTCAAGTTAATAATATTTTTCTTATACCGATCAAAAAAAATCACACCCCCAACAAAAACGGAAACAAAGAAAACCCACAAAAAAGAATAAAGGAAGCAAATTCCCAAGAAAAGAAAAACTGGGAAAAACAACAAAACAAAGAAATCACCCAACCCAAGAAAAAAGGAAACAATTTCCCAAGAAAAAATCCAGATGAGAAAACCCACATGAACAATCAAAAACCAGAAAGAGTAATGGAAAGGGGCTTAGAAGATAAGGTTATTAATCTGGCCCCAAAAGAGGGAAACAAGTGAAAAAGACT
CDS Sequence
- >CEY00_Acc19959
ATGGTGAGAGGGAAAACTGAGATGAAGAGGATAGAGAATACAACAAGCAGGCAAGTGACTTTCTCTAAGAGAAGAGGTGGGCTTCTCAAGAAGGCCTTTGAGCTATCAGTCCTATGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATTATTTTCTCTTCTAAAGGCAAGCTCTATGAGTTCTCAAACTCCAGTATTAACAAGACGATAGAACGCTATCAGAGAAGTGTAAATGAAATGGGAATTGGCCAAAAAACAACGTCTCAAGATAATTTACAGCATTTGAAGGAGGAAGCTAATTACATGTCAGAAAAGATTGAACTCCTCGAAGCCTCTAAACGAAGGCTCTTGGGGGACAGTTTAGAGTCGTACACTATCGATGAACTACAAGAAGTTGAAAACCAGCTCGAGCAAAGCTTAAGCAAAATTAGGGCAACAAAGACTCAATTATTTAAAGAGAGGATTCATCAACTGAAAGAAGAGGAGAAAATACTAGCAATAGAAAATGCAAAATTACGCGAGAAGTGGGATGAGATGCAATCGACGCAGAAGGAAATTGTAGAAGTGGAGACCGAATTGTTCATAGGACTACCCCAACCACGAACTACCCGGTAG
Protein Sequence
- >CEY00_Acc19959
MVRGKTEMKRIENTTSRQVTFSKRRGGLLKKAFELSVLCDAEVALIIFSSKGKLYEFSNSSINKTIERYQRSVNEMGIGQKTTSQDNLQHLKEEANYMSEKIELLEASKRRLLGDSLESYTIDELQEVENQLEQSLSKIRATKTQLFKERIHQLKEEEKILAIENAKLREKWDEMQSTQKEIVEVETELFIGLPQPRTTR