Information report for CEY00_Acc05725
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a nuclear protein that functions in mRNA processing. Mutations in this gene cause embryo lethality and reduced transmission through the female gametophyte. Over-expression of a CLPS3:TAP protein changes the relative levels of two alternatively processed FCA transcripts. It also causes abnormal phyllotaxy and flower development, early flowering under long and short days, and increased levels of CUC1 and WUS expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G04680
Gene Resources
- Pfam: PF06807 PF16573 PF16575
- UniProt: A0A2R6RK84
- EMBL: NKQK01000005
- AlphaFoldDB: A0A2R6RK84
- OMA: VQYVNCH
- InterPro: IPR010655 , IPR027417 , IPR028606 , IPR032319 , IPR032324 , IPR038238 , IPR038239 , IPR045116
- PANTHER: PTHR12755 , PTHR12755:SF6
- SUPFAM: SSF52540
- Gene3D: 2.40.30.330 , 2.60.120.1030 , 3.40.50.300
- OrthoDB: A0A2R6RK84
- STRING: 1590841.A0A2R6RK84
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc05725
ATAATTTGGCGGTAGGTTTTGAAAACAATTCGACGACAAAGAACCAAAGAGCAATAGAACTGCACCAGAGAGAGGTCGATCATGGCGTACGGTGGTTCAGCCGTGGGTCCGCCAGCGGTGGCGTTGGGAGGAGCGCCGGCGACAAGACAGGTGAAGCTAGAGAGAGAGTGTGAACTGAGAATCGAAGTCGCCCCAGACACGCCTCTCCGCCTTCGGCTCCTCACCGGCACCGCCGAGATCTTCGGCACCGAAATCGCTCCCGAAATCTGGCTCACCTTCCCTCCTAGGCTCAAATTCGCTGTAAGCAAATCTCAGACCTAATTAGTACTCTATTTTCAAGATATTTCCAAACACACACGAGTGTATATTTGCCGACGAATTAATGTAGATAATCAACCAAAACGATAATGGACGCATTGGAGCATCTTCAATCCATCACCAGATCTTTTATCAAAATAGGAGGCTCCAACAATTTCATCAAAATGGTGTCAAATGAGGGAAAACCTAATTTGAAACTTCCCCCGAAATTGGTGACAATTATAAATAGGTTTGGGCCCATGTATGATTTGATTTGTCATAAACTTTTCGTTTTGGCTTTTAAATTTGATTTGCCAAAAAATTCTCTTGTTCACAAGAATAAATCTTTGTGTATCTTTACACTACTAGCAAAAATATGCACACTCACAGAAGCTCAAGCGTTTAAGTATGTCCAGAAGTTTATATGCATATCATTCTACGCACATACAAGATATAAGTGCATGCAATCATTGTATTACACACATGGAAGGATCTAGGTTTCAGAGTGAAACTGGCCTATAATCAAAGTGCATTGAGCCAATTCCTTGCTAGGATATCATATTTTAGAATGTTGTAGACAACTATATAGGAAATCTACTGAAGTGCTTGGAAATGATCTTGTAAGTTAGTATATTCTGTAGCCTTGTTTGACGGATATTCGTTTTTATGTATCAGGTTTTTACGTGGTATGGAGCCACAATTGAAATGGATGGCAACACTGAAACTGATTATACAGCAGATGAAGTATGCTTGTTAGCTCAAAACAGTTTTGCATCGTAATCTGGTTTTATGCTATTTTTTTAAAAGACTAGAATTTCAGATAGTTTTTAATAACAACAACATTCTTAATTTCAGACACCCATGATTAGCTATGTGAATGTGCATGCTGTGCTGGAAGGTCGTAGAAATCGTGCTAAGGCATCACCTAGTGACGTTGATCTTTCTCAGGTATTACTTCATTGTATTTTTTATACACCAAGAAAAGACAGTGCATTTTTAACATGGGAGCAACCACTTTTTGTAATTAAAGAAAGAGTTCCATCCTAACAAAAATAAGAGATGCCCTTTAACTACTTCCAGAGAAGATGTCAACAATGATTTCTGCCCTGCTTTGTTGTTGTAATCCAAACACTTCCAGCCTAAAAGATTTATGAAGTTATCCTCCCACCTATTGCCGATAATATTTACAGTCATGTGGATAGATGCACAGGTACTTTCTTTAATTCATTTAGACGTGACATTGTGAGAAAGCAACTAGTTTTAATGTCTGCGTAACTAATGATTTTCCAACAAGAATATACAGGTGTATAAATGAGTCAAAACTGATAAATCAATACCATCCCTGATTTGTAATATGAACTGCACTTTGATGCTTATTAGATGAGACTGAAGTATATAAAACAGTGTAAAGACTGTTGAAGTTTTCTTGAAACCTAGTTTGTTAATTGGAGGGAAGTGCAAAAATCACTAGACATTGCACAATGCATACCATGTTCATTTGATCTGCAAACACAAGTACACAGTTTTGATTAACTTAATGGAGCAGCTAGAATGCTTTGATGTTGAAGGCCACATTTAATTGAATGGTGCGGGGTAAGTCTAATCGTATGGTTGAAGTAATCCCATATAACACTGAGCCCTTTGACAAAATCCCCTAATATATCTATCCTTTCTCATTTCAATAGCTGTTGTCTATGACTTATATGTTTGCAACTTAACTATTCATAATGTTTCTTCTCATCATTTAAGGTTCCTGTATGTGTTAGCGAACATGCATTCATAATTTAATACAATTCAGATTATCTGCCCTGGATTCCATGATCCATCTATGCATGCTTGTGTGGTTCACTTCTTGTCAGGTCTCATTATTTTTGTTGGTCCAGGGTCCAAGGGTAATTGTTGTGGGACCTACAGATTCTGGAAAGAGTACCTTGTCAAGAATGCTTCTTAGTTGGGCAGCTAAACAAGGTTGGAAACCTACTTTTGTGGATTTGGATATTGGCCAAGGATCTATAACCAGTCCTGGATGTATTGCTGCTACCCCAATTGAAATGCCAATTGATCCAGTGGAAGGAATCCCTCTTGAAATGCCTCTTGTTTACTTCTATGGACATACAACTCCTAGGTACTACTTTTTCTTCGTCGACTGCTAGTTCTTCACTTACTTTTTTACTTTCTAGATTGGTTCCCCTTGAATACAAGAACTTGTACTACCCCTCCATTTTGAGTTTCATTTTAAGCCTTTTCAGTCACCATCATGGATGTTCTTAATGCTGGTGCTTTTCAGTGTCAATGCAGATTTATACAAGGTGCTCGTGAAGGAGCTTGCTCAGATTCTGGAGAGACAGTTTTCCGGAAATGCAGAATCTCGAGCTGCAGGCATGGTAATCAATACCATGGGATGGATAGAGGGTGTTGGTTATGAGGTAACTGAATTGCAAGATTTACTGTAAACCCTGCTTGTTAGCAGGGATGCTCAATTAGTTCAAATATGTGGGATTTTTTGTTTGATAAGTGCCTTTTTAATGTTGCAGTTGCTTCTTCAAGCAATTGACACATTTAATGCCAATGTTGTTCTAGTTTTGGGTCAGGTAAATGATTCACATTTGAGAACTTGTGTTTTATGTATTGCTGTGATTCAAGTTCGGTTAACTATTATTTCTGTTAGGAGACATCCTTCTTGCATTTGTTTTGATTTTGTTAGGATATTTTGTGTGCCAATGCAATGTTGAGTTGGTATATTATGATAGTTGGACATTATATGAGATACATTGATAAACTTCACAGTTGAAATTTACCATTTTTTATGTTCAATGCCAATGTGTTCTCCAGCTGAAATCTGTAATTATATAGAGACTCCAAACTCAATCCTGCCTCTGGGAATTTTTATGATTTATTATTTTAGCTGTATCACACTGCGGTGTCAAATATATTGGAAACTAGCTTGGACTAACGACAAGGATATTTGATCTTGAACCATTCTCTAATTTAAGAACCTATTTTTGTAATGTTCAATTTCATCCTGGCCTGTTCATGCTTTAATGCTCAAACCTTTTGCAGGAGAAACTTTGCAGCATGCTTAAAGATGTTCTGAAAAGCAAGCCTAATGTTGATGTTGTGAAACTTCAAAAATCTGGTGGTGTTGTGTCTAGGAATGGAAAAGTTCGTCAGAGGGCCAGGAGCTACAGAATAAGGGTAAACAGCAACATTTTTGTTTTTTAAATTGGAATTTTGGCTATCATCAGTACTTTATGTGGTCGTCTCGGGAATGTTGAATGATTAGTTATGTTTTCTTGGTACACCAAAGCTAAATCATGCAGATATTTCTTATTCCAGGAATATTTTTATGGCATTGCAAATGATCTTTCCCCACATTCCAATATTGCAAATTTCAATGATTTGTCAGTCTATAAAATTGGTGGTGGACCACAAGCCCCACGCTCGGCCCTGCCAATTGGTGCAGAACCTGTTGCGGACCCTACAAGATTAGTTCCTGTGACTATCAACAGGGATTTGCTCCATCTAATTCTTGCAGTTTCATTTGCCAAAGAACCAGATCAAATTATTTCAAGGTATGCAAGGACATTCCATAAAATCCATGTCATCATAATATAGAAAGGATAAACACTTGATCCACGTCCTTCCCTCGAACAAGGTAGAGAGAGTTTTATTCTGGCAAATGTAAGCCAATTGTCTCGACAATGGTAGTTTGTATGGGACCTTTGGGTAATTCATTTCTTGCTGCAATTTAATAAATATTATTCAAATGTCAGTACTGTAATGCATTTTGCTTCATACCTCTAATATGGAAGGCATGATCTCTACTATATGTTGTGCAGAAGTGCCTGTTAGACCCATCATTTCAGCTACCCCTTCCGAATAGCCGTGTATAGGAAAAAAATAAAAAATAACATTAAATGAAAATAATCAAGTTTTTTATTAGGTCAGGTGATAATGGACTTGAGCCCTAGCATTTAATTTGAGAGACCAAACCAAATACGCCCTGGCCTATGTGGTCAGTGGTGACAAAACAGTCGAGCGTATTTGTAGCTTCCAGTTTGATTAACTGTAATGTTAAACCCCTTTAAGTGTATGTGCTGATTACATTACTTCATCTGACAGTAACGTCGCTGGATTCATCTATATCACAGACATAGACATTCAAAGGTTTGAACTTCAATTTTCGTCACTTCTTGACGTGGCTCATATGCCTGCCTATTTGGTTCCGATTCTAATGCTAATTCTATTCCATCTTTTTCAGGAAGAAAATTACATATATTGCGCCATCGGCTGGGGAACTACCAAGCAGGTTCTTGGTAATGGGAACTTTGACATGGCTTGAAACTTGAAGTGTGTGAAATAATTGCCTTGGTATTCAGGTGCAAGTTGTGTATGATACCTGTACGGATGGTGCAAGGGGTTTTAAGATATGAAACCCTTTTAATACTACTAGTATGGTTTTAGTGATCGTAGTCTTTGTATCTGCTGGTGCTGTTCTATGTTGTCACTTTCTTATTACTCTAATTAATACTCTCAGATCTT
CDS Sequence
- >CEY00_Acc05725
ATGGCGTACGGTGGTTCAGCCGTGGGTCCGCCAGCGGTGGCGTTGGGAGGAGCGCCGGCGACAAGACAGGTGAAGCTAGAGAGAGAGTGTGAACTGAGAATCGAAGTCGCCCCAGACACGCCTCTCCGCCTTCGGCTCCTCACCGGCACCGCCGAGATCTTCGGCACCGAAATCGCTCCCGAAATCTGGCTCACCTTCCCTCCTAGGCTCAAATTCGCTGTTTTTACGTGGTATGGAGCCACAATTGAAATGGATGGCAACACTGAAACTGATTATACAGCAGATGAAACACCCATGATTAGCTATGTGAATGTGCATGCTGTGCTGGAAGGTCGTAGAAATCGTGCTAAGGCATCACCTAGTGACGTTGATCTTTCTCAGGGTCCAAGGGTAATTGTTGTGGGACCTACAGATTCTGGAAAGAGTACCTTGTCAAGAATGCTTCTTAGTTGGGCAGCTAAACAAGGTTGGAAACCTACTTTTGTGGATTTGGATATTGGCCAAGGATCTATAACCAGTCCTGGATGTATTGCTGCTACCCCAATTGAAATGCCAATTGATCCAGTGGAAGGAATCCCTCTTGAAATGCCTCTTGTTTACTTCTATGGACATACAACTCCTAGTGTCAATGCAGATTTATACAAGGTGCTCGTGAAGGAGCTTGCTCAGATTCTGGAGAGACAGTTTTCCGGAAATGCAGAATCTCGAGCTGCAGGCATGGTAATCAATACCATGGGATGGATAGAGGGTGTTGGTTATGAGTTGCTTCTTCAAGCAATTGACACATTTAATGCCAATGTTGTTCTAGTTTTGGGTCAGGAGAAACTTTGCAGCATGCTTAAAGATGTTCTGAAAAGCAAGCCTAATGTTGATGTTGTGAAACTTCAAAAATCTGGTGGTGTTGTGTCTAGGAATGGAAAAGTTCGTCAGAGGGCCAGGAGCTACAGAATAAGGGAATATTTTTATGGCATTGCAAATGATCTTTCCCCACATTCCAATATTGCAAATTTCAATGATTTGTCAGTCTATAAAATTGGTGGTGGACCACAAGCCCCACGCTCGGCCCTGCCAATTGGTGCAGAACCTGTTGCGGACCCTACAAGATTAGTTCCTGTGACTATCAACAGGGATTTGCTCCATCTAATTCTTGCAGTTTCATTTGCCAAAGAACCAGATCAAATTATTTCAAGTAACGTCGCTGGATTCATCTATATCACAGACATAGACATTCAAAGGAAGAAAATTACATATATTGCGCCATCGGCTGGGGAACTACCAAGCAGGTTCTTGGTAATGGGAACTTTGACATGGCTTGAAACTTGA
Protein Sequence
- >CEY00_Acc05725
MAYGGSAVGPPAVALGGAPATRQVKLERECELRIEVAPDTPLRLRLLTGTAEIFGTEIAPEIWLTFPPRLKFAVFTWYGATIEMDGNTETDYTADETPMISYVNVHAVLEGRRNRAKASPSDVDLSQGPRVIVVGPTDSGKSTLSRMLLSWAAKQGWKPTFVDLDIGQGSITSPGCIAATPIEMPIDPVEGIPLEMPLVYFYGHTTPSVNADLYKVLVKELAQILERQFSGNAESRAAGMVINTMGWIEGVGYELLLQAIDTFNANVVLVLGQEKLCSMLKDVLKSKPNVDVVKLQKSGGVVSRNGKVRQRARSYRIREYFYGIANDLSPHSNIANFNDLSVYKIGGGPQAPRSALPIGAEPVADPTRLVPVTINRDLLHLILAVSFAKEPDQIISSNVAGFIYITDIDIQRKKITYIAPSAGELPSRFLVMGTLTWLET