Information report for CEY00_Acc05725
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a nuclear protein that functions in mRNA processing. Mutations in this gene cause embryo lethality and reduced transmission through the female gametophyte. Over-expression of a CLPS3:TAP protein changes the relative levels of two alternatively processed FCA transcripts. It also causes abnormal phyllotaxy and flower development, early flowering under long and short days, and increased levels of CUC1 and WUS expression.
Homologous
- Capsicum annuum: T459_01856
- Citrullus lanatus: Cla97C09G179810
- Glycine max: Glyma.20G242900
- Gossypium hirsutum: Gohir.D04G050600, Gohir.A05G364100
- Juglans regia: Jr10_02550, Jr01_00620
- Lactuca sativa: gene-LSAT_4X176840
- Manihot esculenta: MANES_17G021000
- Medicago truncatula: Medtr1g116060
- Nicotiana attenuata: A4A49_22719
- Populus trichocarpa: POPTR_017G077200v3
- Prunus avium: Pav_sc0000299.1_g180.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_3G272100
- Solanum lycopersicum: Solyc01g009290.3
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400030284
- Vitis vinifera: VIT_14s0066g02630
Gene Resources
- Pfam: PF06807 PF16573 PF16575
- UniProt: A0A2R6RK84
- EMBL: NKQK01000005
- AlphaFoldDB: A0A2R6RK84
- OMA: VQYVNCH
- InterPro: IPR010655 , IPR027417 , IPR028606 , IPR032319 , IPR032324 , IPR038238 , IPR038239 , IPR045116
- PANTHER: PTHR12755 , PTHR12755:SF6
- SUPFAM: SSF52540
- Gene3D: 2.40.30.330 , 2.60.120.1030 , 3.40.50.300
- OrthoDB: A0A2R6RK84
- STRING: 1590841.A0A2R6RK84
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc05725
ATAATTTGGCGGTAGGTTTTGAAAACAATTCGACGACAAAGAACCAAAGAGCAATAGAACTGCACCAGAGAGAGGTCGATCATGGCGTACGGTGGTTCAGCCGTGGGTCCGCCAGCGGTGGCGTTGGGAGGAGCGCCGGCGACAAGACAGGTGAAGCTAGAGAGAGAGTGTGAACTGAGAATCGAAGTCGCCCCAGACACGCCTCTCCGCCTTCGGCTCCTCACCGGCACCGCCGAGATCTTCGGCACCGAAATCGCTCCCGAAATCTGGCTCACCTTCCCTCCTAGGCTCAAATTCGCTGTAAGCAAATCTCAGACCTAATTAGTACTCTATTTTCAAGATATTTCCAAACACACACGAGTGTATATTTGCCGACGAATTAATGTAGATAATCAACCAAAACGATAATGGACGCATTGGAGCATCTTCAATCCATCACCAGATCTTTTATCAAAATAGGAGGCTCCAACAATTTCATCAAAATGGTGTCAAATGAGGGAAAACCTAATTTGAAACTTCCCCCGAAATTGGTGACAATTATAAATAGGTTTGGGCCCATGTATGATTTGATTTGTCATAAACTTTTCGTTTTGGCTTTTAAATTTGATTTGCCAAAAAATTCTCTTGTTCACAAGAATAAATCTTTGTGTATCTTTACACTACTAGCAAAAATATGCACACTCACAGAAGCTCAAGCGTTTAAGTATGTCCAGAAGTTTATATGCATATCATTCTACGCACATACAAGATATAAGTGCATGCAATCATTGTATTACACACATGGAAGGATCTAGGTTTCAGAGTGAAACTGGCCTATAATCAAAGTGCATTGAGCCAATTCCTTGCTAGGATATCATATTTTAGAATGTTGTAGACAACTATATAGGAAATCTACTGAAGTGCTTGGAAATGATCTTGTAAGTTAGTATATTCTGTAGCCTTGTTTGACGGATATTCGTTTTTATGTATCAGGTTTTTACGTGGTATGGAGCCACAATTGAAATGGATGGCAACACTGAAACTGATTATACAGCAGATGAAGTATGCTTGTTAGCTCAAAACAGTTTTGCATCGTAATCTGGTTTTATGCTATTTTTTTAAAAGACTAGAATTTCAGATAGTTTTTAATAACAACAACATTCTTAATTTCAGACACCCATGATTAGCTATGTGAATGTGCATGCTGTGCTGGAAGGTCGTAGAAATCGTGCTAAGGCATCACCTAGTGACGTTGATCTTTCTCAGGTATTACTTCATTGTATTTTTTATACACCAAGAAAAGACAGTGCATTTTTAACATGGGAGCAACCACTTTTTGTAATTAAAGAAAGAGTTCCATCCTAACAAAAATAAGAGATGCCCTTTAACTACTTCCAGAGAAGATGTCAACAATGATTTCTGCCCTGCTTTGTTGTTGTAATCCAAACACTTCCAGCCTAAAAGATTTATGAAGTTATCCTCCCACCTATTGCCGATAATATTTACAGTCATGTGGATAGATGCACAGGTACTTTCTTTAATTCATTTAGACGTGACATTGTGAGAAAGCAACTAGTTTTAATGTCTGCGTAACTAATGATTTTCCAACAAGAATATACAGGTGTATAAATGAGTCAAAACTGATAAATCAATACCATCCCTGATTTGTAATATGAACTGCACTTTGATGCTTATTAGATGAGACTGAAGTATATAAAACAGTGTAAAGACTGTTGAAGTTTTCTTGAAACCTAGTTTGTTAATTGGAGGGAAGTGCAAAAATCACTAGACATTGCACAATGCATACCATGTTCATTTGATCTGCAAACACAAGTACACAGTTTTGATTAACTTAATGGAGCAGCTAGAATGCTTTGATGTTGAAGGCCACATTTAATTGAATGGTGCGGGGTAAGTCTAATCGTATGGTTGAAGTAATCCCATATAACACTGAGCCCTTTGACAAAATCCCCTAATATATCTATCCTTTCTCATTTCAATAGCTGTTGTCTATGACTTATATGTTTGCAACTTAACTATTCATAATGTTTCTTCTCATCATTTAAGGTTCCTGTATGTGTTAGCGAACATGCATTCATAATTTAATACAATTCAGATTATCTGCCCTGGATTCCATGATCCATCTATGCATGCTTGTGTGGTTCACTTCTTGTCAGGTCTCATTATTTTTGTTGGTCCAGGGTCCAAGGGTAATTGTTGTGGGACCTACAGATTCTGGAAAGAGTACCTTGTCAAGAATGCTTCTTAGTTGGGCAGCTAAACAAGGTTGGAAACCTACTTTTGTGGATTTGGATATTGGCCAAGGATCTATAACCAGTCCTGGATGTATTGCTGCTACCCCAATTGAAATGCCAATTGATCCAGTGGAAGGAATCCCTCTTGAAATGCCTCTTGTTTACTTCTATGGACATACAACTCCTAGGTACTACTTTTTCTTCGTCGACTGCTAGTTCTTCACTTACTTTTTTACTTTCTAGATTGGTTCCCCTTGAATACAAGAACTTGTACTACCCCTCCATTTTGAGTTTCATTTTAAGCCTTTTCAGTCACCATCATGGATGTTCTTAATGCTGGTGCTTTTCAGTGTCAATGCAGATTTATACAAGGTGCTCGTGAAGGAGCTTGCTCAGATTCTGGAGAGACAGTTTTCCGGAAATGCAGAATCTCGAGCTGCAGGCATGGTAATCAATACCATGGGATGGATAGAGGGTGTTGGTTATGAGGTAACTGAATTGCAAGATTTACTGTAAACCCTGCTTGTTAGCAGGGATGCTCAATTAGTTCAAATATGTGGGATTTTTTGTTTGATAAGTGCCTTTTTAATGTTGCAGTTGCTTCTTCAAGCAATTGACACATTTAATGCCAATGTTGTTCTAGTTTTGGGTCAGGTAAATGATTCACATTTGAGAACTTGTGTTTTATGTATTGCTGTGATTCAAGTTCGGTTAACTATTATTTCTGTTAGGAGACATCCTTCTTGCATTTGTTTTGATTTTGTTAGGATATTTTGTGTGCCAATGCAATGTTGAGTTGGTATATTATGATAGTTGGACATTATATGAGATACATTGATAAACTTCACAGTTGAAATTTACCATTTTTTATGTTCAATGCCAATGTGTTCTCCAGCTGAAATCTGTAATTATATAGAGACTCCAAACTCAATCCTGCCTCTGGGAATTTTTATGATTTATTATTTTAGCTGTATCACACTGCGGTGTCAAATATATTGGAAACTAGCTTGGACTAACGACAAGGATATTTGATCTTGAACCATTCTCTAATTTAAGAACCTATTTTTGTAATGTTCAATTTCATCCTGGCCTGTTCATGCTTTAATGCTCAAACCTTTTGCAGGAGAAACTTTGCAGCATGCTTAAAGATGTTCTGAAAAGCAAGCCTAATGTTGATGTTGTGAAACTTCAAAAATCTGGTGGTGTTGTGTCTAGGAATGGAAAAGTTCGTCAGAGGGCCAGGAGCTACAGAATAAGGGTAAACAGCAACATTTTTGTTTTTTAAATTGGAATTTTGGCTATCATCAGTACTTTATGTGGTCGTCTCGGGAATGTTGAATGATTAGTTATGTTTTCTTGGTACACCAAAGCTAAATCATGCAGATATTTCTTATTCCAGGAATATTTTTATGGCATTGCAAATGATCTTTCCCCACATTCCAATATTGCAAATTTCAATGATTTGTCAGTCTATAAAATTGGTGGTGGACCACAAGCCCCACGCTCGGCCCTGCCAATTGGTGCAGAACCTGTTGCGGACCCTACAAGATTAGTTCCTGTGACTATCAACAGGGATTTGCTCCATCTAATTCTTGCAGTTTCATTTGCCAAAGAACCAGATCAAATTATTTCAAGGTATGCAAGGACATTCCATAAAATCCATGTCATCATAATATAGAAAGGATAAACACTTGATCCACGTCCTTCCCTCGAACAAGGTAGAGAGAGTTTTATTCTGGCAAATGTAAGCCAATTGTCTCGACAATGGTAGTTTGTATGGGACCTTTGGGTAATTCATTTCTTGCTGCAATTTAATAAATATTATTCAAATGTCAGTACTGTAATGCATTTTGCTTCATACCTCTAATATGGAAGGCATGATCTCTACTATATGTTGTGCAGAAGTGCCTGTTAGACCCATCATTTCAGCTACCCCTTCCGAATAGCCGTGTATAGGAAAAAAATAAAAAATAACATTAAATGAAAATAATCAAGTTTTTTATTAGGTCAGGTGATAATGGACTTGAGCCCTAGCATTTAATTTGAGAGACCAAACCAAATACGCCCTGGCCTATGTGGTCAGTGGTGACAAAACAGTCGAGCGTATTTGTAGCTTCCAGTTTGATTAACTGTAATGTTAAACCCCTTTAAGTGTATGTGCTGATTACATTACTTCATCTGACAGTAACGTCGCTGGATTCATCTATATCACAGACATAGACATTCAAAGGTTTGAACTTCAATTTTCGTCACTTCTTGACGTGGCTCATATGCCTGCCTATTTGGTTCCGATTCTAATGCTAATTCTATTCCATCTTTTTCAGGAAGAAAATTACATATATTGCGCCATCGGCTGGGGAACTACCAAGCAGGTTCTTGGTAATGGGAACTTTGACATGGCTTGAAACTTGAAGTGTGTGAAATAATTGCCTTGGTATTCAGGTGCAAGTTGTGTATGATACCTGTACGGATGGTGCAAGGGGTTTTAAGATATGAAACCCTTTTAATACTACTAGTATGGTTTTAGTGATCGTAGTCTTTGTATCTGCTGGTGCTGTTCTATGTTGTCACTTTCTTATTACTCTAATTAATACTCTCAGATCTT
CDS Sequence
- >CEY00_Acc05725
ATGGCGTACGGTGGTTCAGCCGTGGGTCCGCCAGCGGTGGCGTTGGGAGGAGCGCCGGCGACAAGACAGGTGAAGCTAGAGAGAGAGTGTGAACTGAGAATCGAAGTCGCCCCAGACACGCCTCTCCGCCTTCGGCTCCTCACCGGCACCGCCGAGATCTTCGGCACCGAAATCGCTCCCGAAATCTGGCTCACCTTCCCTCCTAGGCTCAAATTCGCTGTTTTTACGTGGTATGGAGCCACAATTGAAATGGATGGCAACACTGAAACTGATTATACAGCAGATGAAACACCCATGATTAGCTATGTGAATGTGCATGCTGTGCTGGAAGGTCGTAGAAATCGTGCTAAGGCATCACCTAGTGACGTTGATCTTTCTCAGGGTCCAAGGGTAATTGTTGTGGGACCTACAGATTCTGGAAAGAGTACCTTGTCAAGAATGCTTCTTAGTTGGGCAGCTAAACAAGGTTGGAAACCTACTTTTGTGGATTTGGATATTGGCCAAGGATCTATAACCAGTCCTGGATGTATTGCTGCTACCCCAATTGAAATGCCAATTGATCCAGTGGAAGGAATCCCTCTTGAAATGCCTCTTGTTTACTTCTATGGACATACAACTCCTAGTGTCAATGCAGATTTATACAAGGTGCTCGTGAAGGAGCTTGCTCAGATTCTGGAGAGACAGTTTTCCGGAAATGCAGAATCTCGAGCTGCAGGCATGGTAATCAATACCATGGGATGGATAGAGGGTGTTGGTTATGAGTTGCTTCTTCAAGCAATTGACACATTTAATGCCAATGTTGTTCTAGTTTTGGGTCAGGAGAAACTTTGCAGCATGCTTAAAGATGTTCTGAAAAGCAAGCCTAATGTTGATGTTGTGAAACTTCAAAAATCTGGTGGTGTTGTGTCTAGGAATGGAAAAGTTCGTCAGAGGGCCAGGAGCTACAGAATAAGGGAATATTTTTATGGCATTGCAAATGATCTTTCCCCACATTCCAATATTGCAAATTTCAATGATTTGTCAGTCTATAAAATTGGTGGTGGACCACAAGCCCCACGCTCGGCCCTGCCAATTGGTGCAGAACCTGTTGCGGACCCTACAAGATTAGTTCCTGTGACTATCAACAGGGATTTGCTCCATCTAATTCTTGCAGTTTCATTTGCCAAAGAACCAGATCAAATTATTTCAAGTAACGTCGCTGGATTCATCTATATCACAGACATAGACATTCAAAGGAAGAAAATTACATATATTGCGCCATCGGCTGGGGAACTACCAAGCAGGTTCTTGGTAATGGGAACTTTGACATGGCTTGAAACTTGA
Protein Sequence
- >CEY00_Acc05725
MAYGGSAVGPPAVALGGAPATRQVKLERECELRIEVAPDTPLRLRLLTGTAEIFGTEIAPEIWLTFPPRLKFAVFTWYGATIEMDGNTETDYTADETPMISYVNVHAVLEGRRNRAKASPSDVDLSQGPRVIVVGPTDSGKSTLSRMLLSWAAKQGWKPTFVDLDIGQGSITSPGCIAATPIEMPIDPVEGIPLEMPLVYFYGHTTPSVNADLYKVLVKELAQILERQFSGNAESRAAGMVINTMGWIEGVGYELLLQAIDTFNANVVLVLGQEKLCSMLKDVLKSKPNVDVVKLQKSGGVVSRNGKVRQRARSYRIREYFYGIANDLSPHSNIANFNDLSVYKIGGGPQAPRSALPIGAEPVADPTRLVPVTINRDLLHLILAVSFAKEPDQIISSNVAGFIYITDIDIQRKKITYIAPSAGELPSRFLVMGTLTWLET