Information report for CEY00_Acc04452
Gene Details
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Functional Annotation
- Homologous to yeast SWI3 & RSC8, components of the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes. Interacts with BSH, AtSWI3A, SWI3C and FCA. Expressed ubiquitously.
Homologous
- Citrullus lanatus: Cla97C11G225210
- Cucumis sativus: CsGy4G025600
- Glycine max: Glyma.06G014400, Glyma.04G014400
- Gossypium hirsutum: Gohir.D05G180900
- Juglans regia: Jr11_18050
- Manihot esculenta: MANES_18G001900
- Populus trichocarpa: POPTR_002G004800v3
- Prunus avium: Pav_sc0000454.1_g170.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_5G005400
- Vitis vinifera: VIT_18s0122g00670
Gene Resources
- Pfam: PF00249 PF04433 PF16495
- UniProt: A0A2R6RM96
- EMBL: NKQK01000004
- AlphaFoldDB: A0A2R6RM96
- OMA: EWAQWFD
- InterPro: IPR001005 , IPR007526 , IPR009057 , IPR017884 , IPR032451 , IPR036388
- PANTHER: PTHR12802 , PTHR12802:SF44
- SUPFAM: SSF46689
- PROSITE: PS50090 , PS50934 , PS51293
- Gene3D: 1.10.10.10 , 1.10.10.60
- OrthoDB: A0A2R6RM96
- CDD: cd00167
- STRING: 1590841.A0A2R6RM96
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc04452
ATGAACACAGAGAGAGAGGATTGGAGTGGTTCGTGACCGTTAAATACCAGGGGAAGAGGGATTCCGATTCAATCTCTCTCTAAAAAGATGACCACCAAGCCACCAACAGAGGAAGACCTCCCCGCCCCCGCTCCAGAAACCACACCTCAAAAACTGGACTCCTCCCAGATAACAAATCCCACCACTCCAACCGCTCCTTCCGCGGCCTCCAAAGAAACCCCCGCCACCGCCCCCAGTTCCAAGCCGCCCGACCCGCCTTCTACCGCCACCGCCACCGCCAGTTCCAGGTTGCCTGACCTCATATACATCCCCACTTATTCCCGTAAGTACTCTCTTCCTTTACAGTTTCGTTTCCTTGCAATTCCCCTAGGGCTTCGTTTTCTTTTGAGAGAGAAATTGGAAGATATAATTGTATGCTGTATCCCTCCCTCTCTTTCTCTGTCTAATTTCATAACTTTTGTTTTTATTTTAGGGTGGTTTTCGTGGGACAACATTCACGAATGTGAGGTTCGGTTCCTCCCGGAGTTCTTCGATGCGAAGTCGCCTTCGAAGAACCCTAGGGATTACAAATATTACAGGAATTGTATCATCAGGAAGTTCAGAGAAAACCCTACCACTAAGATCACCTTCACGGAGGCCCGTAAGACTATTATAGGAGATGTTGGATCAGTTCGGAGGGTGTTTGATTTCTTGGAGACTTGGGGTTTGATTAATTACTCACCGGGTCCAGCGTCCAAATTGCCTTTGAAGTGGGAAGAAAAGGAGACCAAGTCTAACACAGCACTGTCGCAGAGCACCGAGCCCACAGGCAATTCGGTTGAACCCACGGTACCCAAGAAGAGATTGTGCAGTGGTTGCAAGACTGTGTGCAGCATTGCTTGCTTTGCCTGTGATAAGGTAAACAATCACTCATCATTATTTCTATTCTGGCAATGGAAAGTCTTATATGGAGGAAAAAATGCACTTTTATAGGTCTAGGCTTTGTTGGAACTGAGGTAAGATATCTCGAGTTCTGGGATGCTTGAGCTTGATTCATTTGACTAATGATATTGCTAAAGCTAATTTCGAGCCAGAATCGAGTTTTTTAATATGTGATTGTGCTCAGCTCATTTGACTCAAAACTATAAACATGTTTGAGCTCTAGCTGAGGCTCAAGATTTAGTAGCTTGGGCTTTTGTCAATTTTGTATATGAGTTTTTGGTTGCCAACAACTTGTCCAAAAAAAAAAGATATAGAAGGAAAGAAATAACAGAAACAAGTTAAAATTTGCTCGTGATATAGAATCAATGTAGAGCAAAGGAGAGATGATAGATTTTTCGTAATAATGAGCTTGTGATCATGAGCCTAAAAATCAAAACAAGTCAACTCTGTACTCAATCTTACCTCATGTTTGCACCTGTTCACGAAAATCACATACCGAGTAAGTTGTTGCTCTGTCATGGCTTAAATTTTTGATAGTCCTGCCCTATTTTGCATTTGAAGTTTTGAACCCAGACATTTATTGAAGTGCTTGAGTTGATCAAGCGGAAATGTGGGCACAATCCAATTTCTAATTGGTCACTAATTTACACCCCTATCTAGCTGTTATATTACAAACAACAATAATGTAACTGCTTGTTTGGTAAGCCTGTTGAAACTTGAAATTGCTTTATCAGTTTTACGGATCGATATTAGTGCAATTTTTGCTTCCAAAAGAAATATATACGAGCAAATGGTAACAAAATAATGTCCTCACGAGGAAGAATATACCTTACTCTTGTCCTTACTTCATACTATCATTCTTATAACAATCCAATACAAAGTTTCAAAACAAATTGAGGAACAAAGCCTGATGAGTGTAAAATTTTGCTTCCCTCACTCCAAAGGCTAATTTAGGTATGCTGTTTCCTCCAATATTATTGTGTAATGAATTGACTCTACTGATTAATACTTTAGTCATCTAAAACCTTCTGAAGTACATATTTCTTATGAGTACTCATTAGTATAGTCGTTACAATTGATCTTTATGGATCTTTGATTTTTGTGCAGTACGATTTGACGCTTTGTGCAAGGTGCTATGTCCGCGGAAACTATCGGGTTGGTGTTAATTCTACTGAATTCAGACGAGTAGAGATCAATGAAGAGATAAAGGCAGATTGGACTGAAAAGGAAATTTTGCACCTTTTAGAAGCCATTATGCATTATGGGGATGACTGGAAGAGGGTTGCAGAGGTTGTTGGTGGTAGAAGTGAAATGGAATGTGTCACTCGCTTTATCAAGCTTCCTTTTGGCGAGCAATTTGTTGGAGCTTCAGACTCTACTGATGTCGACAAGAAATTTTATCAAATGGAGGACCAGAATAACACTGAATTTGGATTGCAAAGTTTTGGAAAGTCATTTGCAAACAAAAGAATGCGTCTCAGCCCACTTGCTGATGCAAGCAACCCAATTGCAGCTCAGGTAAAGACTCCCATCTTTTGGGTACTTCTGAAATAATTTAGATAAGGGTGAAGGAATAGAACAGGACACTTTACCTATGGGGGTAGGCCTGTTGGGTACTGAGGCCTACCTTGGGCATTCAGTTACCTGACATAGAATTTAATGAAATGCATCAAACTGCCGAGATTAATCTATTGACTAATCAGCAGTAATGACACTAGCATTTGCATATTCCTCAATTCTTGAATGGCATATCAAAATATTATTGTTTTGGGCTCCCCAACAACTTGGTCAAAATATACTGAATTCCCCTTACATTCAAACTCATAGCTATGAGATGAATAGCTGTTTATGCTTTACCATGCTGTTATTCCACCTCTAGTCCACACTGTTAGCTCGTGGCACTGTAATGCATAGGAATATGTGAGCTTCCAAATCTGCACCATGTCTTCTTCATGACTAGTGCACCAGGCTATGGTTACTTAAAAACTCCGCCTTTGTGACAATAGTCAATCAATATGTTGGCTAATCCTTCAATATTTTGAGGATGCATAAAATAGTTTATCCCTGTTGCTTGAACTAGATTGACCAGAAAAATTATGTTTGTGTTTCTTTTGACTTGCCAATATTTGAATTTTTCCATATTGGGATTGTTGTTGCAATCCACTTGAGGATTCTCTCTCTTTAACTTTTGTTCTTGAGTTTTTTCACAGGCTGCATTTTTGTCAGCTTTAGTGGGTGTAGAGGTGGCAGAAGCAGCTGCTAGTGCTGCAGTGAAAGCTCTGGCTGAGTTCAGTTATGGAGCCATTAAAGAGAGTCCTGGATCTCTTTCAAGTCATGCAAGACAGCAAGGTAAAATAAGTTCTGCTAGTTCTCTCAAGCATTCAGTATGTTCTTGAATACCGCACATCCCACACCTGTGATTTGTTAGATTTTAATTTTGAATGATCTGAAGTCGGGTCTGATACAACAGATCTTGTTTGCTTCAATTAGTTATAATTCATTCTTTGCGGATAATAATTCAATCCGTATTCTTTTAGGGCATGATATTGTGTTTTAAAGATTTTGGTCTACCTCATCTTTATACTGTTGAAAATTATGCCCTTGCTTATAAAACTTGAAGTTAGTTGCTGTTTGCTTGCAAGTGATTTAATTCAATGCTGCTTATTTTGAAACTACTACTTTCTTTGGAGCAACACATCTGAGTGGCGGTGTCCTTGTTTGCTTCAAGCCTTCAACTATATATTATTTGCAACACTTAAAAATAGGAATAGGAAGATGGTCTATGAGACTTCTAAATAGCCACTTCTTGCCGTCAAAATTGAAAAGACAGGTGTGCAGTGCTGTACTAAGAGACCGTTTGGTTTGAGGGGTTTGGTAAGAAATGATGGGAAACGAAGAGAGACTCGGATTCCTCTCATGTTTGGATTATAAAATAGGCAAGAAATGGTGAGAAAAAGATGTCCCTTACCAAGCCTCTTTTGTTTCTCGCAAAGAATGGTGAGTTTTGGTGAGAAACAAAATTGATTGGCTATGTATTATTAATAATACTGATGTTACCCATCAAAATATAAAAGAAGAGAAAGAAATCCCTCCCATATCCTTGTCTCACGTGATTTGCTTTCTTACCTATCCAAGCACGATGGCGGGAAAACACAATCTTTTGTTTTCTTTTCCCACCCAGATGAGAGACCAAAATCATTAAGTTACCAAGTAGGCACCAATAACATTTGCATGAAATGATGCTGGTTGCTTTTTGGACACTGTAAACCAACTTGTTTGCATGTAAACTATGAATAGATTAACACACCGTGTCTTCATGGAGTCCTACCTATGTAATTACTGTGTCCTTCTTGGTTACAGCTTCTCTGAAGTTCTGAAATTGAACTTTTCCGTAAAGTTAGCAATGGCAATGTCCATGTTTCTTTGACAATAATAATGGTATGGCTTTGCAGAACATGATGCTACAGCTAATGGTGACACTAGTTTAAAAACATTGGAAGGATCCCTTGTAGATGTGAAATCTCAGCTTGATAAGGAAGAGCAGGACTTGGAGAGGGCAATCTTTAGCATTGCTGAAGTGCAGGTGAGTAAAATAAGTTCATAAACTTTCTGAAGTTACCATGGAAAAACCTCTTCTGACTGTCAATGTCTTTTTCAGATGAAAGAGATTCAAGACAAAATATCACATTTTGAGGAGTTTGAATCCCAAGTGGAGAGGGAGTGGCAACAACTGCAACAAATGAAGAACACACTTTTTGTGGATCAGCTTACTCTCCTCTTTAACAAAACTCCTGCACCTAAAGCTGGAGAAAGCGTGCAGCAGTTGGTTAATATAGAATGATTCCCGTGATTCTTCCTGTTTGGTTTTAATCAGTTTCATAGAAAGAAAGTTATTCTTTATCTTCCCATTTTTGATTGTGCCAAGCATTGGGATAACTAGTCAACAAGCACGTGATTTTCTGTGGATGTCTAATGTTGATGGGTTTAAAAACATGTTTAAAAGCGTAAAAATATGCA
CDS Sequence
- >CEY00_Acc04452
ATGACCACCAAGCCACCAACAGAGGAAGACCTCCCCGCCCCCGCTCCAGAAACCACACCTCAAAAACTGGACTCCTCCCAGATAACAAATCCCACCACTCCAACCGCTCCTTCCGCGGCCTCCAAAGAAACCCCCGCCACCGCCCCCAGTTCCAAGCCGCCCGACCCGCCTTCTACCGCCACCGCCACCGCCAGTTCCAGGTTGCCTGACCTCATATACATCCCCACTTATTCCCGGTGGTTTTCGTGGGACAACATTCACGAATGTGAGGTTCGGTTCCTCCCGGAGTTCTTCGATGCGAAGTCGCCTTCGAAGAACCCTAGGGATTACAAATATTACAGGAATTGTATCATCAGGAAGTTCAGAGAAAACCCTACCACTAAGATCACCTTCACGGAGGCCCGTAAGACTATTATAGGAGATGTTGGATCAGTTCGGAGGGTGTTTGATTTCTTGGAGACTTGGGGTTTGATTAATTACTCACCGGGTCCAGCGTCCAAATTGCCTTTGAAGTGGGAAGAAAAGGAGACCAAGTCTAACACAGCACTGTCGCAGAGCACCGAGCCCACAGGCAATTCGGTTGAACCCACGGTACCCAAGAAGAGATTGTGCAGTGGTTGCAAGACTGTGTGCAGCATTGCTTGCTTTGCCTGTGATAAGTACGATTTGACGCTTTGTGCAAGGTGCTATGTCCGCGGAAACTATCGGGTTGGTGTTAATTCTACTGAATTCAGACGAGTAGAGATCAATGAAGAGATAAAGGCAGATTGGACTGAAAAGGAAATTTTGCACCTTTTAGAAGCCATTATGCATTATGGGGATGACTGGAAGAGGGTTGCAGAGGTTGTTGGTGGTAGAAGTGAAATGGAATGTGTCACTCGCTTTATCAAGCTTCCTTTTGGCGAGCAATTTGTTGGAGCTTCAGACTCTACTGATGTCGACAAGAAATTTTATCAAATGGAGGACCAGAATAACACTGAATTTGGATTGCAAAGTTTTGGAAAGTCATTTGCAAACAAAAGAATGCGTCTCAGCCCACTTGCTGATGCAAGCAACCCAATTGCAGCTCAGGCTGCATTTTTGTCAGCTTTAGTGGGTGTAGAGGTGGCAGAAGCAGCTGCTAGTGCTGCAGTGAAAGCTCTGGCTGAGTTCAGTTATGGAGCCATTAAAGAGAGTCCTGGATCTCTTTCAAGTCATGCAAGACAGCAAGAACATGATGCTACAGCTAATGGTGACACTAGTTTAAAAACATTGGAAGGATCCCTTGTAGATGTGAAATCTCAGCTTGATAAGGAAGAGCAGGACTTGGAGAGGGCAATCTTTAGCATTGCTGAAGTGCAGATGAAAGAGATTCAAGACAAAATATCACATTTTGAGGAGTTTGAATCCCAAGTGGAGAGGGAGTGGCAACAACTGCAACAAATGAAGAACACACTTTTTGTGGATCAGCTTACTCTCCTCTTTAACAAAACTCCTGCACCTAAAGCTGGAGAAAGCGTGCAGCAGTTGGTTAATATAGAATGA
Protein Sequence
- >CEY00_Acc04452
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