Information report for CEY00_Acc01881
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes RNA polymerase II transcript elongation factor TFIIS. Complements yeast TFIIS mutation. Mutant plants display essentially normal development, but they flower slightly earlier than the wild type and show clearly reduced seed dormancy.
Homologous
- Citrullus lanatus: Cla97C11G212560
- Cucumis melo: MELO3C020014
- Daucus carota: DCAR_020154
- Gossypium hirsutum: Gohir.A09G213664, Gohir.D09G215100, Gohir.D10G112700, Gohir.A10G153500
- Juglans regia: Jr12_25180, Jr07_39010
- Manihot esculenta: MANES_08G170400, MANES_09G123400
- Populus trichocarpa: POPTR_016G138100v3, POPTR_006G109300v3
- Prunus avium: Pav_sc0001582.1_g290.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_2G265300
- Vitis vinifera: VIT_08s0058g01410
Gene Resources
- Pfam: PF08711 PF01096 PF07500
- UniProt: A0A2R6RXN1
- EMBL: NKQK01000002
- AlphaFoldDB: A0A2R6RXN1
- OMA: NPHEAFY
- InterPro: IPR001222 , IPR003617 , IPR003618 , IPR006289 , IPR017923 , IPR035100 , IPR035441 , IPR036575
- PANTHER: PTHR11477 , PTHR11477:SF0
- SUPFAM: SSF46942 , SSF47676 , SSF57783
- PROSITE: PS00466 , PS51133 , PS51319 , PS51321
- Gene3D: 1.10.472.30 , 1.20.930.10 , 2.20.25.10
- OrthoDB: A0A2R6RXN1
- CDD: cd00183 , cd13749
- STRING: 1590841.A0A2R6RXN1
Sequences
gDNA Sequence
- >CEY00_Acc01881
CGCCGTTTCTCTCTCGAACTTGACCAATCACCACCACTCGATCCCAGCCATCGGTGACGAAACCGAAGCTTTGTCTGAGACAGACTCCGTCTTCTCTCTCAGAAATCCGCCGCGATTCGATCTGGTAATTATTATTGAATCTCACCACTCTATTTCAATATCTCCGATTTGGTTTCTTTCAGCTTGGATTTGATTTCTTGTGGCGATTTAGGATCGAAAAGGAAATGGAGAGAGAGCTGGTGGAGTTGTTCGATGCGGCGAAGAAGGCGGCCGATGCGGCGGCCGTCGACGGAGCTTCGTCCAAGGTCGACCGGTGCCTCGATGTGCTCAACCAGCTCAAGAATTTCCCAGTATCGTATGACGTTCTCGTGTCAACGCAGGTACAATAACAGGTCTCCAATTTTTCTTTTCAGGTCTCAAATCAATTTCATTTTTGGGCTTTCATACCAGTAACAGTGGCTTTTTTGTTGAAAATTGAGATTCGAAATCGTGAATTTGTGGAGTTTGTTAGAAATCAAGGGCAGAAGAATCTGATTTTGCTTTGATGTTTTACCGTAACTAGCGAAATGAACGCGCGTTGCTTAGAAACAGCTGCACCATTGCTTCCGAATTTATTTTCGCACATGAATCAGCTGAAAAGTACTTGTTTTGGATAGAAGTAAGGAATAATTACTTTTGGCTTTGGCTCAGTATATAGATCTCAAATGCACATGTGGTGAGAATAGTAGTGTACTATGATATACTACTTTTGGGAATTTATATATGCTGCATTGCTGTTTGGAAAACTTATGTTTTAAGGGGAAATGTAAAATGAGTGAATGTAATTAAGATGATACTGTCTGAGGTGTCATACATTCCGCTTCTCATTAACTTCTAAAGATTAAAAATTCTCTGTGATTTCAGGATTGTTATTCTCTCTATTAGTTACAGTAACGTGTGTTTGCCCTTACCCGTCAGATTATAGGTGTTATTGAACCCTTGCTATACGGTTTCTGAGCCACTGTACACTTGTAAACTATTGAAACTTTGATTAAACCAAGTTAAGATCCTTAATTGTTATTCCGTTAGAGGCAGAATTGCTTTGCTCGTAGTGTATTAAATGTGATTCATTTTGCTCGGAGGGCTGTCGGAACTCCATGCACTATCATTTTTAACCTCTAAAAATTTACTTTTTAAACTAATGTACAAAATGTTAATTGATACTTCAAATGGAAAGTCTTCCAATAATAAAATATTCATTGACAGATCAAATAGAATGTTCTAATATTTTTCCCAATAAAAATCTAAGATCAGTCTCTTCCCTCCTAAGTCCTAACAAAGTTTACAAATCTTAAAAGCCCCAAAACCCTAGCGTCCATCTATCCATCCATCCATCCATATATATAACAATGTAGTGCCACGTGGCACCATCTCTAAATTGTAAAATAAGAAAGAAAAAAACTGAAAACCACGTGACAATCCTCTCCTCTCCAATCCGTCTCTCACCTGTTTCTCCCTCTCTCCCAGACAAATAAAACTATTAAAAAAGGAATTCTAAAAGATTTGGCAATCGTAACTGTCAATCACCTTCCATGATAATAGAAAAGGAAAAAAACCACAAAAGGGACCTCAAAGTTAAATTCAGGACTCTTGACAATGAAGAAATAAAAAATGAATGATCCATATTTGTGAACTTCAGCACAAGCCTTTGCGTGAAGACATGGAATTCAGGTTTTCCATGTGCTGACAAATTTCACTAAATAACGACCACATACAACCTTGAAAGAATTACGGTTAGTTGTTCTTAAAATTTATTATAGTTTATTCTTTAAAACCTTAATTTAAGGTAGTCTATACTTCTTCCTATTTTTGTATAACTACATCTTTCAAAAAGGAACATGAAGATTGGTTTCTTTTTTCTCTTCCATTACAAAAGCCATAGGCTCCCTCCTATTCTCTTTTCCACTCCACACATTCTTATCATTGGCATCATAGCATGCAGCTGCACACTTAAAAGATTATTATTTATTCTTTCTTTCTTTTGAACTTTATACAAATTTTATCATGAGTTTCTATACTTTGCGCCTACAGGGTAAATGCAATATTCTAAATATACTTCTTTATTCCACTTTTTCTCAAATTTTGGTTGTGATATTTCCGTGGGCGATCGCTATGTCATACTAGTGATCTTTTTGTATTATTTTATTTTAATACTCATCTTTTGTTAACAATAAAAATTGTTGCACAACATGAAATTAAAAAAATAAATGTAAAAGTGTAAGTCAACGTTGGTATATTGTGAATCATATTAAAGTGATTTTGGTTTATAAAAAATGTGATATGTGCATTATATTGTTAAAATTTTAAACTATTGATGCTAATGGGTTTTTTAATGTTGTATATGTGAGATTGGTGAGACAAAATATATGGTCATTGAGATTGTGACACCAATATTTTTTTTTTAGATTTCAAGACGTATGAATAGTTTAAAATCTTCATTTTGATTGTTTGAGAACAACTTTAAACTTGATGAAATTGTCCGATTTCACACCCATTGACGTTACATCCTTTAAATTACATTATTACCCTTATAAAATGTAGAAGAAGATCTCGTCAGAATGCAACTCAGCTAACAAGGGGAAAAATCACTCTCTCTCTCCCCGCTTTACCCAAATCAAACCAAACTCCAACACCAATAAAAATTACACTGATCCACCGCCCTCCATGGCCGAGATGTCCTTTTCTTTCTCTACCTTCTCACCCCAAGGAAACCCAATGCCCTGTGTGGCACCAAGATGATCTTTAGTTCTTTACTCCCATGGAATCTGAAACCCTCTTGGCACCTCCTCTCATCTCTTTTTAACCCAAACTTGACCACAACAATCCCAAATTGAAGATAAAAAATAAACGGTCTCCCCTGTTTGGTTTTAACTCTCTTTTTTCCCCCTTGTCTTGATATAGTTTTGGTTTTTTGCTTAAGTCATCCTATTTCGTTCTTAGATTAGTTGTTAAAGCCCAGTATAGCATAGAGATGGGAACGCAATGAATTCTCTTAAAAGGATGAAGATCTTGTATATTCGACAGGGATTTGATTGGGTCAAACTAAATTAAAAAAAGAAAGTTAATAAAGAAACTTACCCTGGAACCTGACGGAAGTTCCAAACCCTACTCAATCAACTTGGTTTCCTGGCTGAATGTATATTCACAAGGCAAGGTTCTCTCGCTTGCAGTCGCATCAACCATATCACTCCTCTCTCTCTCTCTCCAATAGGCTTGCATAGATACACTGCGAAGCATTGTCCAGTTGTGGAAACCATATGAATCTAGCGGCAAAGAAAATAAAGAAAAAAACATATCAAATTATGCCTTATATTGTAAGGTAGTAATAATTTCACGCGTCTCCATTATTTTTTATTGTTATTAAATAAATTTATTTAAATATCCTTCTATTTAGTTAAAATATTTTTAAAACAAATTTAAAAAATATAAATATAAGGGTATTTGAATAATTTTATATAGTAAATACAAAAAAAAAATTGAAAAAAAGAAAAGAAAAGTGTGAAAATCACTATCTTATTATTATATTCTTAAGTTATTTAGAGGAATTTTAATATGAATAACATTGTGTGAGAAATTTAAGTATGAGAGTTCTTTTGTCTATTTATATCTAGTAAATACAAAAAAAAAAGGATTAATTCCATTATGGCCCATTTAAGCATATTTACACTATAAAAACTCCATAGTAGTTTATTAGTGCCTCTAAAGTCCATTTTTAAAAATTTAGGGATGCGAATTAACTTTTGTACCCTTATAGAGTTAGATTTCTGTTAGTTTATATTTTTTTATTGCTAGAGATTACGTTTATTATGGAATATACGTTATTCAATTGCCATATATAAAACGTGAAAATTGTTGAATCATAATCGGTAAGAATTTTTGAATTCAAATTTATGTTTCTAAGATTCCAGGTAAGAATATTCAAATTTATATTTCTAAGATTCCAGAATCGAAACGTTTATCCATGGGGTATTTTCTCTTATTGCAAATTGATATGTTCTCAATTTTCATACATGTTGAATCCTCGCAAATTGATAAGTTCTCAATTTTTGTATTTGAAAATTTCTCACAATGCATAGTTGATAGTTATTTCACGCTTTTTTTTTTATTATTTCATATTGATAATTTTCTATTGGTTATTGAAATTGACATTGATATCGACATTCTCTTAATGTATATTTCAAATTAAGATAGATATTTTCTCAATTTTTTGAATGATTTCATAATATGATACCGGATAACTTCTCAATTTTTTCCCGATGATTTATAACTTCTCTTATTTAATTGAATATTTGATAACATAATGATTGTGTTATTGTGGATTGTTTTGATGTTGAAAAATAGATTATCAATTAACGATAACTTCCCATTAGTTATTGGAATTGATATTGATAACTTTAACTTTACTAAAAGGGTATTTTATTGGATTTTCTGGAATACAAGTCCACCCAATGGTTGTGTCTCTAAAAATGATAGGAAAACTGAATGGTGGAATAGGCAAAGAGAGGGCAAATTGGGATAGATACGTAATTCGGTCTACGTTCTGTTTAATATTTCGGCAGAGCAACAGTGACCAGGGACCGCCCTGAGTTTCTAGAGGTCCTAAGTGAACTCTGAAGACGGGGCCCTATGAAAAGAGAATACATCAAGTGATTTGGGTCCCATTACTAGTATGATAGTTTTGATTTTTCGCTTGACGTAAATGATTTGACCTAGGTATATTTAAATTTAAAATTGTAAGATTAAATTTGGGGCCCCCCATTTAATTTAGGTGCAAGGGATTTTTTTGGGGACTTAATATATGGGAAAATCTAGGTTGGGGGCCCCTATTTTTTATGAGAATTTAGGGCCCTAAAGCGTCCGCTTTACCAGCTTTAGCCCTGGACCGGCTCTGAGCAGCACTCAAATTAAAATCTTAAATTGCACACATCTCATAACCGAATTGGTCGGAGATACTCCACAAATTACTATGTTGAATTTCAAATCTCATAAATATCTTATTTCCATGTAAGTTTGTTCCTTAAAAATTAAATTGTAAACGGATAGAAAACGCATGCAGTTATCCCTCTGCTATAAATGGAAAAAGAAAGAGACTTACTCCTTTGAGGGATGTTATATATCCCAGGAATATCTAATCAGATTTCTTCACCTCCTATATATTTTTCCATTTGGCATGGTGAGTCTTATTATTTTATGATGATATGATGGTCTTAAATATGCGGATAGAGTTTGTTAATCAATAAAAGGAGGAAGTGAAAAAAATGACAAAAGATATTTGCCAATGAATATCATTCTCAACATATTTTAAACTACTACGCCCATACATAGCACGGATTACTGCCAGTTATAAACAGTGAGAGGAGGACGGAAATAAAGGCAACCTAGGGTTGGGGAAAAAAAATTGGCATCATCATGAGTGAATCAGTTATAGTTTTTTCTTAGTTATAAAACTGACTTGTATAGATGATGGAGTGGACGATAAGCTTTATTTGTTACGCAACTTGGTCTGTCTAGAATATTCCTAGTGAATGCGCTTGCTCAATATGCTCTTTATTCGTTGTAATAAGAATATAGAAGTGCAGAAAAACTTTAGATTGGTGAATTAATGAACTTTTGATTTGTTTATGTTCATTTCTATATTTAGATTTTGAATGTTTATTTTATCGATTGAAGTTTAGGTGTGATATTGAATTTCAGGTTGCAAAACGGCTTCGACCTCTCACAAAGCATCCTGCTGAGCAGATTCAGGCCAGGGTTGGTGGCGTGCTCGAGATTTGGAAAAAGATAATCATCGATGAAGCATCTCGCAAGAAAAACGATGGCATTGATATTAGAAGTCCGAGAAAGACTGATGCTACAGAGGTAAGGACTATCAAAGTTGAGAAGCTTCAAAAGACTGGTTCTTTTAAGGTTGAGAAGGTTTCAAAAACTGAATGTGATTTAAAGAAACCTGGTAGTGCTTCAAGATCAGAAACTATCAGGGTTGAGAAGAAGGAAGAGAAACATGTTGTTTCCAGATCAGAAACTATCAAGGTTGAGAAGAAGGTTGGAGCGGTGGATACTGTCAAGGCTGAGAATAATGACCGGAGGGAGACCGTCAAGGCTGAAAAGATACCTAAGGAAGCGAAACCGGCTTCCAGCACAAAGAAACCACCACAAGCATCTAACGGCCCCCCAAAGCTGACATCTTTGATCAAATGTAATGATGCTACACGTGACAAAATTCGGGAACTTCTTTTAGATGCCTTGTCCAAAGTTCCTGGTGAAGCTGATGAGGACTACAAGGATGAAGTAGATGCATCTGACCCGATGCGAGTTGCGGTAGCCGTAGAATCTGTCATGTTTGAGAAGATGGGTCGGTCTACTGGGGCACAGAAGGTCAAATACAGATCTATAATGTTCAACCTAAAGGACCCAAAAAACCCTGATTTAAGGAGAAAAGTACTCCTTGGACAGGTCAAGCCAGAGATATTAATCGACATGACCCCAGAAGAAATGGCCAGTGACGAAAGGCAACGTGAGAATAAACTGATTAAAGATAGAGCTTTATTTGACTGCGAGCGTGGTGCTGCACCAAAAGCAACGACTGATGAATTCAAGTGCGGCCGTTGTGGTAAAAAAGAGTGTACTTACTATCAACTGCAGACCAGAAGTGCAGATGAACCAATGACGACTTTTGTAACATGTGTAAACTGCAACAACCACTGGAAGTTTTGCTAGACGAATTTCTGGTTGAACAACTGTTCCCATGTGGAGCGGCTCATTAGCTGCGATGCTCAATTATTCTCGAGCAAGTTTCAATATTAGCTGTTGCTGTCTTTTGCTAGTCGAAAGACAGACATTCGATGCTTATTTATTTTCTCAGCGGTTCAATAGTTTTAGGGAATAGATCATCTATGTTAAAGAGTTTAGATATTAAATTTGTGTGAACTCTGTCAAGGTACATTTTCTGGTAGTCAGTAGATTTTTGTGACCTCTTTGACTTCTCTGTTCAAGTTAGCTTGCATCCATCACGGTGAATGAACTTTACGAGATAATGCAGGAAACCTCTAGACTTGAAAATGCAGGCAATCAACCTCTGATGGCAGATAATTTTCATTTTTCAGCCACGGATAATCCTCGGACACGATGTATAGGAC
CDS Sequence
- >CEY00_Acc01881
ATGGAGAGAGAGCTGGTGGAGTTGTTCGATGCGGCGAAGAAGGCGGCCGATGCGGCGGCCGTCGACGGAGCTTCGTCCAAGGTCGACCGGTGCCTCGATGTGCTCAACCAGCTCAAGAATTTCCCAGTATCGTATGACGTTCTCGTGTCAACGCAGGTTGCAAAACGGCTTCGACCTCTCACAAAGCATCCTGCTGAGCAGATTCAGGCCAGGGTTGGTGGCGTGCTCGAGATTTGGAAAAAGATAATCATCGATGAAGCATCTCGCAAGAAAAACGATGGCATTGATATTAGAAGTCCGAGAAAGACTGATGCTACAGAGGTAAGGACTATCAAAGTTGAGAAGCTTCAAAAGACTGGTTCTTTTAAGGTTGAGAAGGTTTCAAAAACTGAATGTGATTTAAAGAAACCTGGTAGTGCTTCAAGATCAGAAACTATCAGGGTTGAGAAGAAGGAAGAGAAACATGTTGTTTCCAGATCAGAAACTATCAAGGTTGAGAAGAAGGTTGGAGCGGTGGATACTGTCAAGGCTGAGAATAATGACCGGAGGGAGACCGTCAAGGCTGAAAAGATACCTAAGGAAGCGAAACCGGCTTCCAGCACAAAGAAACCACCACAAGCATCTAACGGCCCCCCAAAGCTGACATCTTTGATCAAATGTAATGATGCTACACGTGACAAAATTCGGGAACTTCTTTTAGATGCCTTGTCCAAAGTTCCTGGTGAAGCTGATGAGGACTACAAGGATGAAGTAGATGCATCTGACCCGATGCGAGTTGCGGTAGCCGTAGAATCTGTCATGTTTGAGAAGATGGGTCGGTCTACTGGGGCACAGAAGGTCAAATACAGATCTATAATGTTCAACCTAAAGGACCCAAAAAACCCTGATTTAAGGAGAAAAGTACTCCTTGGACAGGTCAAGCCAGAGATATTAATCGACATGACCCCAGAAGAAATGGCCAGTGACGAAAGGCAACGTGAGAATAAACTGATTAAAGATAGAGCTTTATTTGACTGCGAGCGTGGTGCTGCACCAAAAGCAACGACTGATGAATTCAAGTGCGGCCGTTGTGGTAAAAAAGAGTGTACTTACTATCAACTGCAGACCAGAAGTGCAGATGAACCAATGACGACTTTTGTAACATGTGTAAACTGCAACAACCACTGGAAGTTTTGCTAG
Protein Sequence
- >CEY00_Acc01881
MERELVELFDAAKKAADAAAVDGASSKVDRCLDVLNQLKNFPVSYDVLVSTQVAKRLRPLTKHPAEQIQARVGGVLEIWKKIIIDEASRKKNDGIDIRSPRKTDATEVRTIKVEKLQKTGSFKVEKVSKTECDLKKPGSASRSETIRVEKKEEKHVVSRSETIKVEKKVGAVDTVKAENNDRRETVKAEKIPKEAKPASSTKKPPQASNGPPKLTSLIKCNDATRDKIRELLLDALSKVPGEADEDYKDEVDASDPMRVAVAVESVMFEKMGRSTGAQKVKYRSIMFNLKDPKNPDLRRKVLLGQVKPEILIDMTPEEMASDERQRENKLIKDRALFDCERGAAPKATTDEFKCGRCGKKECTYYQLQTRSADEPMTTFVTCVNCNNHWKFC