Information report for BVRB_9g220210
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes HTA9, a histone H2A protein. Loss of all H2A.Z (triple mutant with HTA8 and HTA11) results in a reduction in DNA methylation of transposons but not that of genes. Loss of H2A.Z causes misregulation of many genes involved in the response to developmental and environmental cues, and that these genes tend to have high levels of gene-body H2A.Z.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G52740
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g220210
GTGTTCATCTTCCCATCTTTTTCTCTTCTAAGTTCTACCCGCTCGTTTCCACTTTCGCGCATCCATAAATCCAATTCAAAGAAAAGGGTTCTACTTGTCTTTGAGAGGGAAACTAAAACCCCAATTTTTCTACACGTAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGGGTAAACAAAGAAGAAGGTAACAATGTCAGGTAAAGGAGCAAAGGGTTTGATTACAGGAAAATCTTCGGGAATGAATAAAGACAAAGACAAAAAAGCCCCTGTTTCTCGCTCTTCCCGTGCTGGTCTTCAGGTTTTTTCCAATTCCATTTTTTGTTTTTTAATGACATTTTTGTAGATCTACACTTGTTTAGTCAACAGTAGTTTCTTGTGTTTTTTTGGGTTGAAATGATATGATTTTATGATGTGATATGGTATGATATGATATGATAGATGTGATGTGTTTTCATTTGAGTTATATTGTTTTTTTGAGGTGGGTGTTGTATTAATTGTTATTTGTTTTCTGCTTATGTGGGTAATTCTTCATGAAGTTAAGCCAAGAACTGTGTAATTGTTGAAATGGATGCTTGCTGATGATTTTGAGATAGGATTTGACTTGGGTTTTGGTCTGTGGTATGAGATAATTTGGGATAAGATAGTTTTTTTTTAATGATGTGATTTTGTTAGAATTGACTGAATTATGATGGTAGTATTTTTTTTTTTGAGTTTATTTTGCTCATATGGAGAGTGAGAATAGAGTGATATTCTGTAAATCCTTTTGGTTTTTTAGGTGGGTTGTTTGGTGAAGATATGTGGCAGTTCTTCTTGAGTTTAATGGTATCGATCTATTGTTGAACTTTGGAAGTATAAATAAGATAGGAAGAGCATGAGATTACTGTCTTTGAAAGATTTAACGTCCTCGTCTTGTCGACTTTCGTGTAGTATGTAGTCAGAAAGAGAAACAAGGAAGTATGAACATGGTTTGGTGTCAGATTATGTTGGTATAAACTCTGTTGTTTGGGATGCTTCCCTTTGACGTTTTAGTGTAATGGTGCATGGACTGTTTGTAGGAGTAGTTTGTTTTGGGGAAATACGAGATGTCACTGAGGTTCCGATGATCTGGGTATAAGATATATCAGGTTGTAATTGGTATCATGATCTTGGGTTCGACATGTCTAGTTTGTTCTGTTCCTTAAAATATTAGCCTTGCAAAGTGTAGGTAGGAGGGATAGTATTGCATAATCTTTGTAAGGCAGTTTTTTGTTTATGGTAGAGGGTCAGTAAAGGAAGAACGGGGTTTGTTGGGGAACTTGCTAAGGACGCAGGAGAGCAGAAAGGCTCTTTTATAGATTATTTTACAGCTCACATATTGTAAATGAAGATTATACTGGAAGGTTTCAATATGAATAATGCATCATATCAATTATTTGTGTGCAAAACAAATAGAGAAATAAAAGGATGGAAGCCATCTATCTAATTAAGTAGGTTGTTTTGTTGATATGATTAATACTCCTAAGTCCTAACTATTTTAGATTCCTGTTGATTGTGCTGAAGACATGAGAAAGGAATGCAGTAGTTCCCAAAGGTTTTCAGTTCGTGTCCTTGATTTGCTCTTTTGTGCCTTTTTTGGATATTGTAAAGTAATTCTGAGACATAATGGAAGTTTTCTGTTGGGGAATTATTTCTGGTTTCTGTATGGCATCGGTCTTTGTCAATCTTGACTTCTTCAGTCGCGAAAGATCAAATATCAGGTTCAAGGTTTCTGAATATGACGGAATTTTATGTGAGCTCATGTTTAAGTGAGATTTACTGGTGAATCATATTTAAATTGAACAATGGGTTGGAGGATTAAGCCCTCTCCTCATGCCTTCCTGCTTATATAGCTCCGCATAAAATGCATTTGAAATTGACGGGAATGCTGTGAGACGTTAAAGTAGACTGCCTTGCTTGTGTTGTTGTGTCGATGATAGATCTCTTTTCCTTCTCCAACCTATTGGTCCACAGATGTGACAGGATAGCTGGGGTAAGGGTTAGGCTGAGTTGCTGACTAATTAAGACATTGTTAGAGGCATGAGGCTTGAGGCATTTTGAGGTGGTTTTTTTTTTTTTAACCTGAGGAGGTGCTTAGAGATACTCGAGGTTAAAAATAGGGTTCGTATGTACTACTTTTACCATAGTTGCAAAACTGAGTTTGAGTTATTGATTATGACATTGTTAGTTGGGAAGCTCGAACACACATTCCAATATTCTTTTGTAAGCAAATAAAAGCTTAAAAGACTAAGGTTTGATGGAAGACTTTGCTTTCCTTATTATTCTGAATACATGTGTTTTTGAATGCTTGCAGCAGTTATAAGTTTGATACCTTTTGGGCAAAATATGAGCTGGGTAAACTTATGAGGTTAAAGTTCTCTTAGAGTGTACTGGCGATCACATTCTCCATGAGAGCTTCCGCTTATTTTGTCTTTGACACTGGATGCTGTAAGGGTTAATTGTTAGTATAACTTGATTCATTCCAAAAACTAAAAAGTCAAGATATTGAAAGATGGCAGTTATATTATTATGGACCTAGGCACTTCAAATTACTATGAAGTTGGTATAAAAATCTTGGTCACTCGCAAAGTCCTGACTTCATGAGTCATTTAGCAGTTGTTTAGCCTCAACATCTCTTAAGGGTGGATGCTGCTGCCTTGTCAATTGTCAATTCTGTACATTGCATTATCTGTCCTAGTTTATAACGAAAAGAATGTGCGGCTTGCTTGTGGCACCTTTATAATATTGGCGTTGACAATAAAAGATTGGCAATAATAGGACGCAAGTTTAAGTGGATTCAGGTGAAGTTGCAGTATATGGTTGATTGCTCTTTTGTGGTGTATCCTAAATGTTCCTGCATTGCTTGATTCTGTCATTGTGTAATCGTGTGTTGATTTTTACAGCTCCACCACTAATATCAAAATTCATGCTTTATATTTTTAACAAGCTCGCCGCTGAAACAACTATTGATGATCATATTCATTGATGAGACCAAGAAATTTAGATGAATTTATCATCATAATTTTATAGAAGTAGATTTTTGTTGAACAAACAAGTCCTTTAACCGAACCCTATTTTTTTATGCTTTAGTATTTTCTTAACCTAACAAAAAAATAGCAGCAATTCATATACTTCGCTATTTTTGGGCATTGGCGTAGTATTGCTGACAGTAATGCTGACAGTCATACCGCAGCCCTCTTTCCTGAGATAAGATTCTTACTGATCAATATAATGTGCAGTTTCCTGTGGGTCGTGTTCACCGTCTGCTGAAGACTAGGGTTTCTGCAAACGGGAGGGTCGGTGCAACAGCTGCTGTTTACACGGCAGCCATACTCGAGTACCTTACTGCAGAAGTACTGGAGCTTGCAGGAAATGCAAGTAAGGATCTGAAGGTGAAGCGTATTACTCCTAGGCATCTGCAGTTGGCTATCCGCGGAGATGAGGAACTTGATACACTGATCAAAGGAACCATTGCTGGTGGTGGAGTTATTCCTCACATTCACAAATCTCTGATTAACAAGTCATCTAAGGATTAACTTAAGTGATTATCTGGTGCTAGATTACTGCATTTTCATGCAGACCCTTGGAACAAATGTGATGCGGATTGCGGAGGGCGAAAAATGAAATGCTGACAAAGACCCTTGAACAGTTGTCCCGCTTCTGCTTGATTTAGCCTCAGGATGGTGATTATGTTACTGATTATTGCGTTGTTTTAGGTGTACTTTTAGTCTCTGAGATTACATTTTGTGCATTATCTATTTGGTTGTCAGAGATATCTATTCCTAGTTACGTTGTTCATATGGTCGTGATTCGTGAAATGATGCTTGACATTCAACAATGCCATTGTCAGATTGTTAGTTGTTTTACCATGATATTCTCAGTATATATATTTAGCATAGAATCTGCTTAAATAATTTTAAATGTGTCTA
CDS Sequence
- >BVRB_9g220210
ATGTCAGGTAAAGGAGCAAAGGGTTTGATTACAGGAAAATCTTCGGGAATGAATAAAGACAAAGACAAAAAAGCCCCTGTTTCTCGCTCTTCCCGTGCTGGTCTTCAGTTTCCTGTGGGTCGTGTTCACCGTCTGCTGAAGACTAGGGTTTCTGCAAACGGGAGGGTCGGTGCAACAGCTGCTGTTTACACGGCAGCCATACTCGAGTACCTTACTGCAGAAGTACTGGAGCTTGCAGGAAATGCAAGTAAGGATCTGAAGGTGAAGCGTATTACTCCTAGGCATCTGCAGTTGGCTATCCGCGGAGATGAGGAACTTGATACACTGATCAAAGGAACCATTGCTGGTGGTGGAGTTATTCCTCACATTCACAAATCTCTGATTAACAAGTCATCTAAGGATTAA
Protein Sequence
- >BVRB_9g220210
MSGKGAKGLITGKSSGMNKDKDKKAPVSRSSRAGLQFPVGRVHRLLKTRVSANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKD