Information report for BVRB_9g220200
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes HTA9, a histone H2A protein. Loss of all H2A.Z (triple mutant with HTA8 and HTA11) results in a reduction in DNA methylation of transposons but not that of genes. Loss of H2A.Z causes misregulation of many genes involved in the response to developmental and environmental cues, and that these genes tend to have high levels of gene-body H2A.Z.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc22182
- Brassica napus: BnaC06G0123500ZS, BnaC06G0069300ZS, BnaA06G0017100ZS, BnaA05G0165200ZS
- Brassica oleracea: Bo6g030680
- Brassica rapa: Bra030365, Bra018984
- Gossypium hirsutum: Gohir.A13G198200, Gohir.D13G203700
- Manihot esculenta: MANES_11G049100, MANES_04G118600, MANES_14G128100, MANES_03G018100
- Nicotiana attenuata: A4A49_31668
- Populus trichocarpa: POPTR_006G249400v3, POPTR_006G249300v3, POPTR_018G032100v3, POPTR_018G032000v3
- Vitis vinifera: VIT_04s0008g04700
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g220200
AAATTAATCCAAGAAATATCAATCCCTCTTTTATTTTCACTCGTTCTTCTTTATTCTCTCTCCATCTCACTTCTCTCTTTGCCAGGTTTTTCACTCTTTATAGCTTTCGTGGGTGGGTTTTTGTCCCACAATCAATCGAAATCCCAACAAAAACAACTGTGTTTTCGTTTGTTTTTAGGAGGGAAAAACAAAACCCGTCACTTTAAAAACCCAGAATAATTTAGAAGATTTAGTAAGGAAAACAAAAATGTCGGGAAAAGGAGCAAAAGGTTTGATTACTGGGAAATCATCTGGATTGAACAAGGATAAAGACAAAAAAGTGCCTGTTTCTCGCTCTTCTCGTGCTGGTCTTCAGGTCTATCTCTTTCTCTCTCCTCTATTTCTTGTTTATTTCTTTAGATCTACACTTTTTTCTTTGATTTATTGTTGTAATTTTTTCTGGGTGTTGTTGTTTTGGTTAGTTTTGTGTAAACTTGTTGAATTTGAGGGGTAATTTTTATGTATTATGATTTTGTTTAACATGTTTTATGTGATGGTGTTGCTATAGTTGACTTAATTCTGTGTGTTTCAAAGTTTGTTTCTTGTTTTAAGGGAGATGTGGGTGTTGGGTTTTGTGTAATTTTGTTGAATTATATGTTTTGGGTTTTGTGTGTGAGGATTTTGTTTTGTGTAATTTTGTTGAATTATATGTTTTGGGTGTGTTAAATTTGTTTGATTGAATTGAAGGACATTTTGTGATGCTCAACAGTGTGGGATTTGTTTAAAGACTTAAATTACCTTGTGATAAGACATTGAGTGATGGTTTATTTAGAGTTGGGTTGAGAATTTTACAGGCATTTTGTTTTCGTGGTAGGTTCTTTAGTGAGATGTGTGTGTGGTGCTCGTGAGAACCTTTTCAGTTTTTTAGAACGTTGTGTTCGTGTTGGAGTTTGTACTTGGTATGTGTTAGCATGGGTTTAATCTAGAAGAGACTTTTTGTGGTTGTGTAAATCTATGTCTTGTAAAGCGTGCTTTTGGAAACGATGTTGGGAAGAAGTAATGGGCTACTACGAGGACAAGCTGATGTTCCTGATGTATGTTTAACTGTCGATTTACCTAGAAGTTGAGATGCACATCTAGAGTGTATGTGGGGAAGGGAATGTAATCCTTTTCGGCCACATGTGTGGAATTGTTGGAGACGTTATGACTGTTTTTGCTTATATTCTGGATACATTCACCAGTGTTCATTTGATTAGTTTGATCACTTAGTAACCCTTGTGGGGTTTTTTTTAGAACGTCATGTGAGTTGGAGCTCATATCTTTATATTGAGATGCTTAGGTACAAGATATCTAGGTGTTTTTTGGTTCACATAAGATACATGGAGGTAGGACTTTTTAGGAAGTAAAATAAGGTGAGGTTGATGTGTTGACAAAAGTGTAGAAAGTTGCACTTCCTAGGAAGTTCGACATTCCATAAAATGGAGGAAGTTGCTTACCTAGGGGGACCTAATTAAGTAGAACTTCCCATGTAAAGTTGTACTTCCCATAAGCAACCAAAAACTTTTGCCACTTCCTAATTTAGAATTTAAGGGAAAAACAATTTCCTAGAAATACTACTTCCTACATACAACTAAACAACACCCTATTGTGTTTATGGGAAGGAATTTTAATCCTTATTGGCTGACATTCGTGGATTTGTGGAGAGTTTTGTGACTGTTGTGTGAGAATTATCAGATCTGTCTGGACTTATCTGTGTTCATATGAGTATTTTGAGCACTTGATAATTCAGAGATATGCACTTATGATTCAAGGTAACAATGCATTGAAGCATTTATTGAGTGAAACAGTTACTGGTAATTAGTATCTCCCTATATCTTGATAAGTGATTTTGACAATAGAAGTCTATATGTGTTCCTGGCCTAGGATATGAGGTGGAAGATTCTGTTGTATGAAAGTAATGGATTGCTCAGAGTCGCTCTGTATGCACAAGTGATTTATTCTTAGTATTTCTTTCAATTTCTCCATTATTTGTTCATTTAGGTCATAGTCTGAGCAGACCCGACTTTTCAAGGGTGGGTTTAATTAGTCAAACTGTCAAGCCAACTAGACAAGGATGTTAGAGATTGCTAGATTTCCTTTTATCCCTTTTTTGTTGCTGCTTGTCTCTTTACAAGTACATAATTTTTTCTTTGTGTTTTTAGCATTAAACTATTATGTAGGTTATTATGATATGTCTCGGACTAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTAGAATCTGTTTTTTTTTTGTGCTAGACAGACTGTTAATTTGCTTTTTTTGTCGTTGCCTTCTTGAAATAGAAGCTATTCTTGTTTAGGAGATGTGATGTGAAATAGCCTTATGCAGTTAGATCTCCAGCTTGTTTGAGGTATATACTTTGTGAAGTATCAATCATAGGGCCTGGTTTGAGGTTTTCCAAGATATCAGGAAATAGCATCTTCCATGGGGTCTTGTTTTCTGTCAAGATTTATTGGTGGTTCTTGCTGCTAAAGGATTGAATATAACTTGTCGTTTTCGAGGTTGGTTAGTTTGATGTTATATGACATTTTAATCTTCAAACCAGAAAACTGGTGAGAAATATGCCAAGGGTAGGAAGGTTGATAAAAAGGAGATTCATTTGAACGCTGCTTATCTTGTTGGATTCAGTAGATAGTTATGACCTGCATGATTGACACATCTGATAGTTTATAAGTTAATGGAAGGGGGAAATTATAGGTGGTGAACCTAGTTCGAAAATGCGGTTTCGGTCACGATCGACGTAACAGTCATGGTGATGCGGGAACGGGATGATTCGATTGTCGTATTGCTAAATATCGGCTTAGACCATGAGATATCTCTAGAACCTGTCTAACACGCGGTTTTTTTTTTTTTACACCTTTACAATGCGGGTAATATTGTTGCGGTAGATTTGAAAACCTTTACGACACGGGAGTTATGATACAATGTCTTGTTTTGGCTCTGTTCAGTTATTTGGTATTACTTGGATGAGATTGCTGCAGCAGCCACAAATTTGATGAAACTGGCCTAGTCTCTCCAACTTTTTCTTCACAATCTTACTTCTTCTTTCTTTTTAGTTGTACCATAATGACTTTTCAAGTTTGCTTATGCACCACTTTGACCATTAATATCTTTAACTATTCATTAGTAAAAATTATAAAAAGTTGACATTTTGAAAGTATATATTGAGTTAACTTCATAAGATTCTATAAGACAACAAATGCTTTTCCATATCCATTAAAGATAATGGTTAAAGTTAGGAATAGTTCAAAATGTTAATGTGGTGCAACTAAAATCAATTGGAGGAAACTTTTTTTTTCAATGTGTATATTTATCAGAAAATTTGATGACTGATGCTCTTGGGCTACATTACTTGGACTCGGGTATGTATTTAAGTGTCATGGCTCTGCTACTTTTGAAGAAATTTCACGATTTTAGCCCGAAATGAAGTGTCATGGTGTGAGTGTCCCAGGCCCATGTCAGATTGCCGAATATCCAACATAGGTTAGAAGTTTGAAAGTTTGATTTTGGATCAGACCTGAACTCTAACATAGCATAAACATAGTCCAGCTAAGTTGGAAGAACATATATGCTGTTTTTACCCTTTGTTGTGGTATAATGATAAGATTATGATTCATTTAACTATTGTTGCCCTGAGCATCATCTCCTTGGTCGATGCTAAAATGTTTTGTTTCTTGGGGATAAGACAGGATTTTACTAGTATTACTGGATTTATAGTACTTGAAATAGAATCACACTTTTATAGGAAAGCAGTCACTGTTTTGATTCTAAAGTATCTTCAGTCTCCTTTTGCCACTTTAACAATGTGACCATAATAAATCTTCAGTCACTATTACTGGTTTGTGATGTGCCTTTCTGTCTCACGGTCTCACCACTATCATAGATATGCCCCTTTTTTAATTTGATATGGCAAGCTATGGAAAATGATTCCACCAAGCGCATGATATGGTACACAGAAGATGAGATATCAATCATTTTCAAATAGAACACATTGGAAAGCCTTCATTTTTGTTTGGTATTGTGCACACAGGGGATAGTATATCCTGAAACTTGAAGTCTCACTGTCATAATTTTGTATAGTCAAGAAGATAAATCAGCTGGTCTTGTTTTGAAGCCACACTCTTTCATGTTTACAGGTTCTGTTACCGACTTGTGTTTTGAGCCATACACTATAGGTGGCACAAAGAAGCAACTTTTCATTATATTTTTGAGTCTCACACTCATTAGATTGTAAATTTGAGGTTGTTTTAAGATTCTGGCTCCTTGGAGATTTAGCCTGATGTTTGGAAGACAAGGATCATTACACTTTGTTTGGATAAAATTCACGGAGAGGAAGGTAGGGAGGAAAGGGGAAGGGAATTGAAGGGGTGGGAAGAGTGAATCCTTCCAACTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTCATGCTCTGTTAGAGTTAAATTTAGAAAGACTTAGCTTTGTTGAATTCAGTGAACATTTTTATTAAAATGGGATCATCTTTGAGCTGCAGTTGCCATTTTAAAAGTGGTTTGAGATGGTTAACTGACTTCTACCTCTGCCAATTTTTGTGAAGTTCAAGATTTGGAATGTATTACGTAAGCATTGATGTATTATTATGTGAACTAAAGTTCAATTTTCAAAAGTACATCTTTGTCCTACTTTTTTATGAACCCTTTCTTATGTGTGTTAATGCCTGCAGTTTCCCGTGGGTCGTGTTCATCGTCTGCTGAAGACCAGGGTTACTGCAAATGGGAGGGTTGGTGCAACAGCTGCTGTGTACACTGCGGCGATTCTTGAGTACCTTACTGCAGAAGTATTGGAGCTTGCAGGAAATGCGAGTAAGGATCTGAAGGTGAAGCGTATCACTCCTAGGCATCTGCAGCTGGCTATCCGTGGAGATGAGGAACTTGATACACTGATCAAAGGAACCATCGCTGGTGGTGGAGTTATCCCTCACATCCACAAATCTCTG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CDS Sequence
- >BVRB_9g220200
ATGTCGGGAAAAGGAGCAAAAGGTTTGATTACTGGGAAATCATCTGGATTGAACAAGGATAAAGACAAAAAAGTGCCTGTTTCTCGCTCTTCTCGTGCTGGTCTTCAGTTTCCCGTGGGTCGTGTTCATCGTCTGCTGAAGACCAGGGTTACTGCAAATGGGAGGGTTGGTGCAACAGCTGCTGTGTACACTGCGGCGATTCTTGAGTACCTTACTGCAGAAGTATTGGAGCTTGCAGGAAATGCGAGTAAGGATCTGAAGGTGAAGCGTATCACTCCTAGGCATCTGCAGCTGGCTATCCGTGGAGATGAGGAACTTGATACACTGATCAAAGGAACCATCGCTGGTGGTGGAGTTATCCCTCACATCCACAAATCTCTGATTAACAAATCATCCAAGGATTAG
Protein Sequence
- >BVRB_9g220200
MSGKGAKGLITGKSSGLNKDKDKKVPVSRSSRAGLQFPVGRVHRLLKTRVTANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKD