Information report for BVRB_9g219140
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a protein with several WD40 repeats at the C-terminus and predicted protein-protein interaction domains at the N-terminus. Together with the TOPLESS-RELATED PROTEINS (TPRs), it is thought to be involved in transcriptional repression of root-promoting genes in the top half of the embryo during the transition stage of embryogenesis. It can also interact with IAA12 through the EAR domain of IAA12 and the CTLH domain of TPL. The ability of IAA12 to repress transcription is diminished in a tpl-1 mutant background.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G15750
Gene Resources
- Pfam: PF00400
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g219140
CTCTTCCCTAATGTTGTTGTTGTTGTTGTAGTTGTACTCTTAAAAATTTAGTACTAGTATTATTATTTTTTATTTTCTCTCTCTAAAAAAAACTCACAAAAACCCTCTCAAATCTAGAGAGAGAAAGCTCTTAAATTTATACTCAATTTTACTCACACCATTTCTTCTTCTTATGGATCTCTTCTTCTACTGGTAATTTTTTATTTTTTTTTGGAATTTGAAAGTTTAATTTTTTTATTTTTATGTTATCTACTTTTTTTGTTCTCTAATCTGCTTTTTTTTTTGGTTAATTTTTAATAAAGTTTGCATCTTTGATTTTGATAGGGTTTAAGCTTTTAAAGGGTTGCTTTAATTTTTGGTGATCTTAAGAACCCTAGTTTGCGAGCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCTCCTGTTTTTTGGGTTGTCGGCGATTTTTGAAAATGTCGTTTATGTAAAGTAAAAAAACGCAAATCTACTACTGTTTTTCCTTGGTTAGATTTTTGTTTGTTTGAATTTTTTTTAAAGTTTTTGTTTTTTTTGGATTAAATTATTTTTTTACAAGTTGTTCATGTATGGTAGATATGTCTACTTTTATTACAAAGTATATGTATATTTATATATCTTACTTTTAATATATTTATCCATTAATTTACCCTTTTTCTGATTTGGGTATTTTTTTTTTCTGGGCAGATCTGGAGTGATTTGAGGTGATATAAGTTATTTGTGGGTGAAGAGACGAAGGAGTTGTTAAGATGTCATCTCTTAGTAGAGAGCTTGTTTTCCTGATTTTGCAGTTTTTAGATGAAGAAAAGTTCAAAGAAACTGTTCACAAGTAGGTTTTCTGTACACATTTACATATTTTTACTGCAGTTATTTTTATGAATTTGGTTGTTTAGTTGTTATTAGAGTGTTTTAATTGAAATGGGTAGTGATTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTGAATAGGCTTGAACAGGAATCTGGGTTTTTCTTTAATATGAAGTATTTTGAGGATGAGGTACATAATGGGAATTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGTTTTACGAAAGTGGATGATAATCGGTACTCGATGAAGATATTCTTTGAAATTCGAAAGCAAAAGTATTTAGAGGCATTGGACAAGTAAGTTTCTTGTGAAATGTGAAAATTTAGGTTTATGCAATTGTGAAATTGTTGGTGTTTTGGTGAAAATGTGGCTAATTGGAGTTATTGTAGGCATGACCGGTCGAAAGCCGTGGATATACTTGTGAAGGATCTGAAGGTTTTCGCTTCGTTTAACGAGGAACTTTTTAAGGAGATTACTCAGTTGTTGACACTGGAGAATTTCAGGTAATAATGTATGGTGTGTGGCGGTATGTTATCTGTTATGGGAACTGTGCATGAAATTGATTGTGTATTGTTTACAGGGAGAACGAACAGCTGTCCAAATATGGAGATACAAAATCTGCCAGGGCAATCATGTTGGTTGAGCTCAAGAAGCTTATTGAAGCCAATCCTTTGTTTCGTGACAAATTGCAATTCCCGAACCTTAAGAATTCAAGGTTGCGGACCCTGATTAACCAAAGGTACAATGTTGAATCAAAATTTTTGTTTATGGTCTTTGGTGAAGTGCCCTTGTGGGATGAAACTAAGGAATTAAGGCACTATAGTGTTGGATTGCCATGCTTGTTGAAATATGAATTTGCCATACAGTACAAATGTTGAAATTGCTCACGGAGGACTGACTTATACTTTGATACCACATCATCTTGAGCTCACTATGTGGCAGCTATATTGCGATTGTAATTGCTGTTGAGGAAGTGCTAAATTAAAGCATGTCCATTCTTGAGGAGCATATGTTTGGCAATTACAAAAATTCAGTGGTCATGAGAAGAATGTGTTTTAATATTGTTAACCATATTCAGGTTCTATAAGCATATTTTTGATGCTTCTAGTTGGCTGACAACAAAATGCTTGGTTTTATTTTTGCTTCCTTGCCTGGATGCCTTGTACTATTAGCATCAACCACTGAGCATATTTCTGATCGACTGTCTATTGCAGCTTGAACTGGCAGCATCAACTTTGTAAAAACCCTAGACCAAATCCAGATATCAAGACTCTGTTTGTGGATCACTCTTGTGGACAACCGAATGGTGCTCGTGCTCCATCACCTGCAAATAATCCACTGTTAGGATCATTGCCGAAAGCAGGAGGCTTTCCACCTTTGGGTGCACACGGGGTGAGTCAAGTGGTTTAGGTTTGGCCTTTTTTTTTTTCCCCGACTGATACATGCTCATGAAACTATTTCTCTACACTCCTTCAGCCTTTTCAGCCAACACCTGCTCCAGTGCCAGCCCCTCTTGCTGGATGGATGTCCAATCCTGCTACTGTGAGTCACCCTGCAGTATCTGGTGGACCTATTGGGCTTGGTGCTCCGTCAATGCCTGGTATTACGCTTCTATGTTTTGTTGAACTTGATGAAATATTTAAACCTCTACCTTTTTCTTGCTCCATTCCAGTTTGATTATTGTGAAGCCTTATGCATCTTATGGTTTTTATTGTCCTTCCCTAGCTGCATTAAAGCATCCCAGGACCCCACCAACAAATTCTTCAATGGATTATCCATCTGGAGACTCTGATCATGTTGCCAAGAGAACAAGACCTATAGGAATTGCTGATGAGGTCTTCTGACTATACTTTTTATGCATTTAGCGTTTTTATTGTATCATCTCAGTTCAGACAATAATATCTTATTGCCAGAATATGCTTTTTTGTGATATGTGTTTTGTTTTTTGCAGGTTAATCTTCCTGTCAACGTGCTGCCAGTGTCATTCCCAGGCCACGGTCATAATCAGGCATTCAATGTACCTGATGACTTGCCGAAGACTGTTGCCAGGACTTTGAATCAAGGGTCATCTCCTATGAGCATGGATTTTCATCCTGGTCAGCTGACTCTACTACTGGGTGAGTCTCCCTCTAATACATCCAAATCATAATATATGCACATTCTGTTGGAAAAAAATGCACATGATAAAGAAGTTGCACATCTGATACAGAAAGTATGCACATGTAGTACCAAAAATATGCATAGAAATCCTTCTCATCCTTCTCATTTGACCTTATATATATACATATGCATTATTATGTATGTTTTCCTTCTCTTTAGAAGTTCTGTTTGAACAATTGGCTTCTAATTGCTCTGAAATTTGTCTTTCAGTTGGTACAAATGTTGGAGACATAGCATTATGGGAAATTGGCTCCCGGGAAAGGCTGGTTTTGCGGAACTTCAAGGTCTGGGATCTTAGTACATGTTCAATGCCTCTGCAGGTATGCTTTCTATGATCTGCATTGCACGTAGCAATCATTATTACTATATAGTTATTGGTGCTTGTAGGATTAATACAGTTCAGACTTCAGATATAAACTGTTGCTGTCTGGCTTCTTGTTCTGATGTGATCTTTTTGTCCCCTTTGTATGGTTCATAGGCGGCTTTAGTCAAAGATCCTGCTGTTTCTGTTAATCGTGTAATTTGGAGCCCTGATGGATCCTTGTTTGGTGAGCCTTAGAGAAACAATACTCTTATCATGAATATGCAGGCTCTAGATTTAAATCCTTCTTTGTGACATATTTATCTGTATCTTCTTTTATTTGTGTGACAGGGGTTGCATACTCGAGGCACATTGTACAGATATATTCATATCATGGTGGTGAAGATGTACGGCAACATTTAGAGGTAGTTATAGTAGCGAGGTTCCTGAGAGGATGATGTTAATTATTAATTATCCTCTTTTTTGAACTTTGGATGTGCAATTTTGAACAATTTTTTTCGATAATGCAGATTGATGCTCATGTTGGAGGAGTGAATGATATTGCCTTTTCTACTCCCAACAAGCAACTTTGTGTTATTACATGTGGAGATGATAAGACCATTAAAGTTCGTTTTTCATGTTACATTTTCTTTTCTTTTACAACTAGCCAAAATATGGCATTGCGTATCCATAATTGACTTCCTGTGTAACACCTTACGATTTTCTGTATAAATTGTCTGTCTATGTGTAGGTGTGGGATGCTGCCACTGGTACAAAGCAGTATACCTTTGAAGGCCATGAGGCTCCTGTATACTCCGTGTGCCCCCATTACAAAGAAAATATACAGGTAGCGATACTTTATTAATATTTGGTGTTAAATATTTTAACTCTATTGCTTGTGTTATTATGCTGTCAAGGTTTTGAGCTTTTGAATTTTTTGTCAACCAGTTTATATTTTCAACTGCTGTTGATGGGAAAATAAAAGCTTGGTTATATGACAATTTGGGCTCTCGAGTGGACTATGATGCTCCAGGTCGCTGGTGCACAACAATGGCTTATAGTCAAGATGGGACCAGGTTGGTTTATCAGAACCTTTTAGAGTTGGTTGTTCTGTTTGATTTATTAATGATCAAGTTAATGTTGTCACCACTTTTCTTTATCCTTCATTTCTGAATAATTTATGGTTGTCGGTGCTTCCAGGCTTTTTTCATGTGGCACCAGTAAAGATGGTGAGTCGCATATTGTTGAGTGGAATGAAAGTGAAGGTGCGGTGAAGCGAACATATCAAGGATTTCGGAAAAGATCTTTGGGTGTTGTCCAGTTTGATACAACGAAGAACCGATATCTGGCTGCTGGTGATGATTTCTCCATTAAATTTTGGGATATGGACAATGTGCAGCTATTGACTTCTATGGATGCGGATGGCGGGCTCCCGGTGAGTTGTTTATTGCAGTTCTGAATATAAAAAAAAATCAATTTATCCTATGTCCCTTGCTGACTCATGACCAATTTTAATCATCTAAAGGCAAGTCCACGAATTCGTTTCAACAAAGATGGTACACTATTGGCAGTCTCTGCTAGTGAAAATGGAATCAAAATTATGGCTAATTCTGATGGTCTCCGGCTATTACGAACATATGAAAATCTTTCATATGATTCCTCTCGAGCATCAGAATCTTTGACGAAG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CDS Sequence
- >BVRB_9g219140
ATGTCATCTCTTAGTAGAGAGCTTGTTTTCCTGATTTTGCAGTTTTTAGATGAAGAAAAGTTCAAAGAAACTGTTCACAAGCTTGAACAGGAATCTGGGTTTTTCTTTAATATGAAGTATTTTGAGGATGAGGTACATAATGGGAATTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGTTTTACGAAAGTGGATGATAATCGGTACTCGATGAAGATATTCTTTGAAATTCGAAAGCAAAAGTATTTAGAGGCATTGGACAAGCATGACCGGTCGAAAGCCGTGGATATACTTGTGAAGGATCTGAAGGTTTTCGCTTCGTTTAACGAGGAACTTTTTAAGGAGATTACTCAGTTGTTGACACTGGAGAATTTCAGGGAGAACGAACAGCTGTCCAAATATGGAGATACAAAATCTGCCAGGGCAATCATGTTGGTTGAGCTCAAGAAGCTTATTGAAGCCAATCCTTTGTTTCGTGACAAATTGCAATTCCCGAACCTTAAGAATTCAAGGTTGCGGACCCTGATTAACCAAAGCTTGAACTGGCAGCATCAACTTTGTAAAAACCCTAGACCAAATCCAGATATCAAGACTCTGTTTGTGGATCACTCTTGTGGACAACCGAATGGTGCTCGTGCTCCATCACCTGCAAATAATCCACTGTTAGGATCATTGCCGAAAGCAGGAGGCTTTCCACCTTTGGGTGCACACGGGCCTTTTCAGCCAACACCTGCTCCAGTGCCAGCCCCTCTTGCTGGATGGATGTCCAATCCTGCTACTGTGAGTCACCCTGCAGTATCTGGTGGACCTATTGGGCTTGGTGCTCCGTCAATGCCTGCTGCATTAAAGCATCCCAGGACCCCACCAACAAATTCTTCAATGGATTATCCATCTGGAGACTCTGATCATGTTGCCAAGAGAACAAGACCTATAGGAATTGCTGATGAGGTTAATCTTCCTGTCAACGTGCTGCCAGTGTCATTCCCAGGCCACGGTCATAATCAGGCATTCAATGTACCTGATGACTTGCCGAAGACTGTTGCCAGGACTTTGAATCAAGGGTCATCTCCTATGAGCATGGATTTTCATCCTGGTCAGCTGACTCTACTACTGGTTGGTACAAATGTTGGAGACATAGCATTATGGGAAATTGGCTCCCGGGAAAGGCTGGTTTTGCGGAACTTCAAGGTCTGGGATCTTAGTACATGTTCAATGCCTCTGCAGGCGGCTTTAGTCAAAGATCCTGCTGTTTCTGTTAATCGTGTAATTTGGAGCCCTGATGGATCCTTGTTTGGGGTTGCATACTCGAGGCACATTGTACAGATATATTCATATCATGGTGGTGAAGATGTACGGCAACATTTAGAGATTGATGCTCATGTTGGAGGAGTGAATGATATTGCCTTTTCTACTCCCAACAAGCAACTTTGTGTTATTACATGTGGAGATGATAAGACCATTAAAGTGTGGGATGCTGCCACTGGTACAAAGCAGTATACCTTTGAAGGCCATGAGGCTCCTGTATACTCCGTGTGCCCCCATTACAAAGAAAATATACAGTTTATATTTTCAACTGCTGTTGATGGGAAAATAAAAGCTTGGTTATATGACAATTTGGGCTCTCGAGTGGACTATGATGCTCCAGGTCGCTGGTGCACAACAATGGCTTATAGTCAAGATGGGACCAGGCTTTTTTCATGTGGCACCAGTAAAGATGGTGAGTCGCATATTGTTGAGTGGAATGAAAGTGAAGGTGCGGTGAAGCGAACATATCAAGGATTTCGGAAAAGATCTTTGGGTGTTGTCCAGTTTGATACAACGAAGAACCGATATCTGGCTGCTGGTGATGATTTCTCCATTAAATTTTGGGATATGGACAATGTGCAGCTATTGACTTCTATGGATGCGGATGGCGGGCTCCCGGCAAGTCCACGAATTCGTTTCAACAAAGATGGTACACTATTGGCAGTCTCTGCTAGTGAAAATGGAATCAAAATTATGGCTAATTCTGATGGTCTCCGGCTATTACGAACATATGAAAATCTTTCATATGATTCCTCTCGAGCATCAGAATCTTTGACGAAGCCGTCAATAAATCCCATTTCTGCCGCTGCCGCTGCTGCTGCCGCCGCCGCTGCTACTAGTTCTGGGATCCCTGACAGAAGCTCCCCCATGGTTGCCATGACTGGAATGAATGGAGATGCTAGAAGTCTAGGAGATGTTAAATCTCGAATTCTGGAAGAAAGTAACGACAAGTCAAAGATTTGGAAGCTTTGTGAAATCAGTGAACCATCTCAGTGTCGGTCATTGCGACTTCCGGAACACATGAGAGCGGCTAAGATATCAAGACTGATCTATACAAACTCAGGTAATGCTATCTTGGCATTAGCATCAAATGCGATCCACTTGCTATGGAAATGGCAGCGGAATGAACGCAACTCAAGTGGGAAGGCATCTGCTAATGTTCCACCTCAGCTCTGGCAGCCCTCTAGTGGCATTTTGATGACAAATGATGTCTCTGATGCAAGTCCTGAAGAGGCTGTTCCATGCTTTGCGTTGTCCAAGAATGACTCTTATGTAATGTCCGCATCAGGAGGGAAGATTTCCCTATTTAATATGATGACATTTAAGACGATGACAGTCTTTATGCCTCCACCACCAGCGGCAACATTTCTTGCTTTCCATCCTCAAGATAACAATATAATTGCTATTGGAATGGATGATTCAACTATCCAGATATATAATGTTCGAGTAGATGAGGTTAAAAGCAAGTTGAAAGGTCACTCAAAAAGAATTACTGGTTTGGCCTTCTCTCATCTGTTAAATGTGCTGGTCTCATCAGGTGCTGATGCTCAGTTATGCGTGTGGAGCTCAGATAATTGGGAAAAACAAAGGTCTAAATTTCTGCAGCTTCCTGCGGGAAGGGCACCAACAGCACAATCAGATACGCGTGTCCAGTTTCATCAAGACCAGACACATTTCTTGGTTGTACATGAGACTCAATTGGCAATTTTTGAAACAAAACAATTAGAATGTGTTAAGCAGTGGGTTCCACGCGAATCTTCTGCGCCCATCTCCCATGCGACATTTTCATGTGATAGTCAATTGGTATATGCGAGCTTCTTGGATGCGACGGTTTGTGTGTTCAGTGCTTCTAACCTCAGACTAAGATGTCGCATCAATCCCTCTGCATATCTTCCAGCCAATGTCAGTAGCTCTAATGTCCATCCGCTTGTCATTGCTGCACATCCACAAGAAGGAAATCAATTTGCAGTTGGACTTTCAGATGGTGGTGTTCATGTATTCGAGCCACTCGAATCTGAAGGAAAATGGGGTGTACCCCCTCCTATGGAAAATGGATCAGCAGGAGGCAGTGTGCCCACTACACCTTCAGTGGGACCTTCAGGCTCTGATCAACAACAAAGATGA
Protein Sequence
- >BVRB_9g219140
MSSLSRELVFLILQFLDEEKFKETVHKLEQESGFFFNMKYFEDEVHNGNWDEVERYLSGFTKVDDNRYSMKIFFEIRKQKYLEALDKHDRSKAVDILVKDLKVFASFNEELFKEITQLLTLENFRENEQLSKYGDTKSARAIMLVELKKLIEANPLFRDKLQFPNLKNSRLRTLINQSLNWQHQLCKNPRPNPDIKTLFVDHSCGQPNGARAPSPANNPLLGSLPKAGGFPPLGAHGPFQPTPAPVPAPLAGWMSNPATVSHPAVSGGPIGLGAPSMPAALKHPRTPPTNSSMDYPSGDSDHVAKRTRPIGIADEVNLPVNVLPVSFPGHGHNQAFNVPDDLPKTVARTLNQGSSPMSMDFHPGQLTLLLVGTNVGDIALWEIGSRERLVLRNFKVWDLSTCSMPLQAALVKDPAVSVNRVIWSPDGSLFGVAYSRHIVQIYSYHGGEDVRQHLEIDAHVGGVNDIAFSTPNKQLCVITCGDDKTIKVWDAATGTKQYTFEGHEAPVYSVCPHYKENIQFIFSTAVDGKIKAWLYDNLGSRVDYDAPGRWCTTMAYSQDGTRLFSCGTSKDGESHIVEWNESEGAVKRTYQGFRKRSLGVVQFDTTKNRYLAAGDDFSIKFWDMDNVQLLTSMDADGGLPASPRIRFNKDGTLLAVSASENGIKIMANSDGLRLLRTYENLSYDSSRASESLTKPSINPISAAAAAAAAAAATSSGIPDRSSPMVAMTGMNGDARSLGDVKSRILEESNDKSKIWKLCEISEPSQCRSLRLPEHMRAAKISRLIYTNSGNAILALASNAIHLLWKWQRNERNSSGKASANVPPQLWQPSSGILMTNDVSDASPEEAVPCFALSKNDSYVMSASGGKISLFNMMTFKTMTVFMPPPPAATFLAFHPQDNNIIAIGMDDSTIQIYNVRVDEVKSKLKGHSKRITGLAFSHLLNVLVSSGADAQLCVWSSDNWEKQRSKFLQLPAGRAPTAQSDTRVQFHQDQTHFLVVHETQLAIFETKQLECVKQWVPRESSAPISHATFSCDSQLVYASFLDATVCVFSASNLRLRCRINPSAYLPANVSSSNVHPLVIAAHPQEGNQFAVGLSDGGVHVFEPLESEGKWGVPPPMENGSAGGSVPTTPSVGPSGSDQQQR