Information report for BVRB_9g215320
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a homolog of human Lysine-Specific Demethylase1. Involved in H3K4 methylation of target genes including the flowering time loci FLC and FWA. Located in nucleus. Negatively regulates root elongation. Involved in repression of LRP1 via histone deacetylation.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc07494
- Capsicum annuum: T459_25488
- Daucus carota: DCAR_029206
- Glycine max: Glyma.09G185800
- Gossypium hirsutum: Gohir.D05G183500, Gohir.A05G180500
- Juglans regia: Jr11_19040
- Manihot esculenta: MANES_11G098200
- Nicotiana attenuata: A4A49_07894
- Populus trichocarpa: POPTR_002G013100v3
- Prunus avium: Pav_sc0000367.1_g050.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_1G356300
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr6g0304051
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g215320
AATGCATCAAAAAAGACTTAATAATAATATCGGTCCACTTATTCTATTTTCAGTTCGTATCGTATATTATTGTTATCGTTTTAAGTCCAACTTTTGTCAAAGAAAGTAAGCACTTATTAGTTATTAGGCAAAACAACACCAAAAAGGGAAAATAAAACTCATTGGAAATAACTAAACAAGTCGAACCCTAGTTTAAACTTCCCAAAGTCGGAAACATTCAACAAAACTCATCTACTTTCACAATTCTTATACATTGAACATGAACCCCACCACCACCACCACTACCACCAGTACCACCAACCCTCTATCCCCACCTCCCCCCTCCACCTCAGAAACGACCAACAACAACACCACCACCTTAACCGACACCACACCCACCACTTTAACCGGCACCACACCACCCACCATCACCACCACCACCAACAACAACAATGCAACCTCCGACGACGTCTCCACCCCATCAAACCCACTCTCACCTCCTCAACCCGACGACGACACAACCACCACCACCTCTGAAATACCCATCATCCCAAAACGCCGTCGCAAGCGTAAACACTACCAAGGCACAATTTCCATGGTTCTCCGTCCTCACTCCGCTACTCGTTCTTCTTCCTCTCTCCTCGAAACACTATCTCTCTCTCTCCCTCGTCGCCGCCGTCGCATCTCCGACCTCTCCAAAGAATCCCCTCCCCTCGATATCGACGCCCTCATCGCTATTTCCGTCGGTTTTCCCGTCGACTCACTTACCGAGGAAGAAATCGACGCTTCCGTTGTTCCCACTCTAGGTAGCACCGACCAGTCTCACTACATAAGTGTCAGAAACCTTATACTGTCGAAGTGGCGGTCTAATGTTTCCTCTCTCATCACGCGGGATCACGTGATGGAGTCAGTCCCCATTGAGAAGCGTCCCTTTGTTGATGCTGCATTTAGGTTTCTTGATGATCATGGGTATGTCAATTTTGGACTTGCCCCTGAGATCAAGACAAAAAAAATGTGTGATAATAATTGTAGTTTTGGTGCTAATGTTGTTGTTGTTGGGGCGGGGTTGGCGGGACTTTGTTGCGCCCGCCAGCTTCGGTCCATGGGGTTTAAGGTTGTTGTTATTGAAGGGCGGGGGCGGCCTGGTGGGCGGGTTCGCACTCGAAAGATGAGTAGTGATAAGGAAGGAGTTGTAGGTGCTGCTGATTTGGGTGGCAGTGTATTGACAGGGATTAATGGGAATCCACTTGGGGTATTGGCGAGGCAATTGGAGTTTCCACTTCATAAGGTGAGGGATTTGTGTCCTCTTTATTTGCCAAATGGAAAATCAGTTGATTCTGAGGTTGATTCTAAAGTTGAGACTGCTTTTAATAAGTTATTAGATAGGGTTTGTAAGCTTAGGCAGGTTATGATGGAGGAAATGAAATGTGTAGATGTGTCATTAGGAACTGCATTAGAAGCTTTTAGAAAGGTTTTTAATGTTGGTGAGGGTAATGATCCTCAGGAGAAAATGTTGTTGAATTGGCATTTAGCTAATTTAGAGTATGCTAATGCTTCATTGATGTCGAATTTGTCGATGGCGTTTTGGGATCAGGATGACCCTTATGAGATGGGTGGGGATCACTGTTTTATTCCAGGTGGGAATGAGAGGTTTATTCGCGCTTTGGCAGAGGATTTGCCCATCTTTTACAATCGCACGGTGGAGAGCATTAGGTATGGGGACGACGGGGTGTTGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGGGCGGATATGGTTCTTTGTACTGTGCCGTTAGGAGTTCTGAAGAGGGGAGATATTGAGTTTGTGCCTCCTCTACCTCAGAAGAAGAGGGATGCAATTGATAGATTAGGGTTTGGATTGTTGAATAAGGTTGCAATGCTGTTCCCATATAATTTTTGGGGAGGGGAGATTGATACCTTTGGGCATTTGTCGGAAGATCCTTCGAGGAGGGGTGAGTTCTTCTTGTTCTATAGCTACTATTCGGTGTCTGGTGGTCCGCTTCTTGTAGCTCTTGTTGCTGGTGAGGCAGCGATTGAGTTCGAGAAGGTATCTCCTGTGGAATCATTGGAGAGGGTAATGGATATCTTGAGAGGGATATTTCACCCAAAAGGAGTGGATGTTCCTGACCCTGTTCAGGCAGTTTGCACTCGATGGGGTCAAGACCGCTTCACTTATGGATCATACTCATATGTTGCAATTGGGGCATCCGGTGATGATTATGATATTCTTGCAGAAAGTATCGGAAATGGGCGGGTTTTCTTTGCTGGAGAGGCAACAAACAGGCAATATCCGGCTACAATGCATGGTGCTTTCCTTAGTGGGATGAGAGAGGCTGCCAATATATTGAAGGCTGCCAAAAGGAGATCATTGATTCCAACCAATAAGGCAGATGATGTTAGTTCAGAGGATATTGAGGATTTGAGTCGATTATTCTTGAAACCCGACTTACAATTTGGGAGCTTTTCTGTTTTATTTAATCCGACATCAGATGATCTTGAATCTCATTCACTGTTGAGGGTTGAGTTTGGTGGCGAGAAACTTGAAACTGGTGCTCTGTATTTGTATGGTCTGCTTTCAAGGTGTCAAGCCTTTGAGCTGAGCAAGTTGCAAAGCGATGTCGATAGGTTAAGTATATTGAATCAGAAGTTCAATGTGCGATTAGTAGGCGAAAGAGGATTATGCTCTGCTGCAGAATCACTTATTGCAGCTGTTAGAGCAAAGGCATGCTCTAAGGAAGGATCAGATGGTAAGAAGTAACAACTGTAAGTTATAAACAACTGACATAGAAAGTTTATTGCTGTACATTAGTGTTTCTAGTATGAATTGCATATTACTTTTATTAGATTAAGCAAATTCTTATGTTAGGATAGAAAATTTATGGGCATCAAGCTGACCAATTTGTTTTGGTGTTGTGACTAACCTGTTGGTTGCTGATGGCTATCGAATCCGACGTTGTGAAATTCACCGATCAATGGCCTTTCCTACTTATTAACCCCTTTGTTATTTTTCTATTGCAGAATTTTCATGCTTGCCAATACACAACTTTAACCATTAATATTTTCAATTACCTTCCACTAAAAGAAATTATACAAAAATTTGATATTTTGAAAATATATTGAGACGAATTAAGCAAGATGTTGAGTGAATAGCGTAAAAATCCAATTGTTGCAATAGAAAAAGAAGGGTAGAAAAAGAAGGGTTGCTATTTAACGCTCTAATATTTCCTACTAACGCTCTAAATACAGTATTTTTATATCGTATATTCATACCTCCATTTTTTTTTCTCTCTTTCCCCTCCCCTTTTCCTTCACCACCATTGGAGCCGTCACCACCAACACCACACCAACACTGCCGCCACCACCACTAGTTCATTGAAGATTCATATAACACAACTTCATTTTCTTTCTCCCCTTCACTCACTTCCCATTCCCTTCTTCCACACCACCACCGGCACATCAGAACTTGTGTCTCCGCCGTTGTACCACCACCACGCATCACAACCACCATCACGGCCCCACAGTGCTAGACCACTGACGAGGAGACTGATTTAAAAAAAAAATTATACACAGGCGTCCATAGCAGGTGCTCCATCAGAGGGTGAGGCGCTTACCATGGACACTTTTTTTTTGAAATTTTTTAAACAAAATTATGGAGAGGCGTCTCACCTTGTGGTGGAGCGCCTACCATGAATGCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTACTGTAAATGAAGAGGAGAGAACAAGGGTGTGGGTGATAATGTGGTGGGGGTAGGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGTGTCGGCACTGGTGCCCAGTGGGTATGTGGAAGAAGATGGGAGGAAAAGTGAATGAAGACTGAGAAAATGTGAAAATGCGGTATATTATACGTATTTAGGACGTTACTAGAAAATTTTAGGGGGTTGTTTAGCAATTCAGAAAAAAATGGATGAAATTGTACATAATATGAATGTATTATCTTTTAGGCCTTGTTTGGTTGTATATAGGAAGTCATACTTCGTAGGAAGTTATTTTTTCCATGTATTTGATATTCTTAGGAAGTGTAAAATTGTGTTTGGTTGATAATGGGAAGTAGAATTTCCTATGGGAAGCTCTACTTACCTAGGTCCCCCTAGGTAAGTAACTTTCTCCATTTTGGAGGAAGTAGAACTTCCTAGAAAGTACAAATTCTCATGATTTTGCCAACCAAACAACTTCATATACTTCTACTTTCTAGGAATCTGTACTTCTTATGATTTATTTTGTCAACCAAACAAGGCCACTCCGCCTACTTATTCCAAACAAGCTCAGGTGTCCAAACAAGCTCAGATGTCCAAACAAGCTCTACTTATTCCATCTAGGCGTCCACTGACCACTACGCCTCAGGTGTTTATAAAGCAAGCTGTTTTGTTTGTTTCCACTTTCAACTTTCAAGACTGCTATTTTCCACTATGCAAATAACTTTATGATTATGACATGCTTTCATTAAAGAAAGTATTTTCCACTATAATTCGAGAAAGTGTCCAAGGACTGATCATGATCGCTTGGAGTTGATTGGCATATGTTTAGAGATGAAAGCGGTAGGATCTGTTTGTGCCTGTTATTATTATCTGTTCAAGTCTTTAATTGTGACACCTAATTATCATAACTTATGGCAATCAATCCTGATTAAAACTCATAAATTTACTCCTTTTTTCTACTGAGAGGTGAGTCACATCTACAATATGAATGCAGAATTTGGAAATCAGATCTATTTGAATATAAGATGGTTTAATTAATATCTCTTGTATAGCTATTTTCTCAGAATTCTTCTCGAGGGGATAACTATATTAATAGCTGATTTAAGGTAGTTGCTAACTTGCTACTGCATTTTTGAAAAAAAGGTTTTCTAGCAATTGATGGGTGAACATACTAGGGTTGTTATTTATTTAGAGTTCTCGCTGTTCTTTGAGGAATGAGATTTACAAAGCTCACTTCTTGTCT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CDS Sequence
- >BVRB_9g215320
ATGAACCCCACCACCACCACCACTACCACCAGTACCACCAACCCTCTATCCCCACCTCCCCCCTCCACCTCAGAAACGACCAACAACAACACCACCACCTTAACCGACACCACACCCACCACTTTAACCGGCACCACACCACCCACCATCACCACCACCACCAACAACAACAATGCAACCTCCGACGACGTCTCCACCCCATCAAACCCACTCTCACCTCCTCAACCCGACGACGACACAACCACCACCACCTCTGAAATACCCATCATCCCAAAACGCCGTCGCAAGCGTAAACACTACCAAGGCACAATTTCCATGGTTCTCCGTCCTCACTCCGCTACTCGTTCTTCTTCCTCTCTCCTCGAAACACTATCTCTCTCTCTCCCTCGTCGCCGCCGTCGCATCTCCGACCTCTCCAAAGAATCCCCTCCCCTCGATATCGACGCCCTCATCGCTATTTCCGTCGGTTTTCCCGTCGACTCACTTACCGAGGAAGAAATCGACGCTTCCGTTGTTCCCACTCTAGGTAGCACCGACCAGTCTCACTACATAAGTGTCAGAAACCTTATACTGTCGAAGTGGCGGTCTAATGTTTCCTCTCTCATCACGCGGGATCACGTGATGGAGTCAGTCCCCATTGAGAAGCGTCCCTTTGTTGATGCTGCATTTAGGTTTCTTGATGATCATGGGTATGTCAATTTTGGACTTGCCCCTGAGATCAAGACAAAAAAAATGTGTGATAATAATTGTAGTTTTGGTGCTAATGTTGTTGTTGTTGGGGCGGGGTTGGCGGGACTTTGTTGCGCCCGCCAGCTTCGGTCCATGGGGTTTAAGGTTGTTGTTATTGAAGGGCGGGGGCGGCCTGGTGGGCGGGTTCGCACTCGAAAGATGAGTAGTGATAAGGAAGGAGTTGTAGGTGCTGCTGATTTGGGTGGCAGTGTATTGACAGGGATTAATGGGAATCCACTTGGGGTATTGGCGAGGCAATTGGAGTTTCCACTTCATAAGGTGAGGGATTTGTGTCCTCTTTATTTGCCAAATGGAAAATCAGTTGATTCTGAGGTTGATTCTAAAGTTGAGACTGCTTTTAATAAGTTATTAGATAGGGTTTGTAAGCTTAGGCAGGTTATGATGGAGGAAATGAAATGTGTAGATGTGTCATTAGGAACTGCATTAGAAGCTTTTAGAAAGGTTTTTAATGTTGGTGAGGGTAATGATCCTCAGGAGAAAATGTTGTTGAATTGGCATTTAGCTAATTTAGAGTATGCTAATGCTTCATTGATGTCGAATTTGTCGATGGCGTTTTGGGATCAGGATGACCCTTATGAGATGGGTGGGGATCACTGTTTTATTCCAGGTGGGAATGAGAGGTTTATTCGCGCTTTGGCAGAGGATTTGCCCATCTTTTACAATCGCACGGTGGAGAGCATTAGGTATGGGGACGACGGGGTGTTGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGGGCGGATATGGTTCTTTGTACTGTGCCGTTAGGAGTTCTGAAGAGGGGAGATATTGAGTTTGTGCCTCCTCTACCTCAGAAGAAGAGGGATGCAATTGATAGATTAGGGTTTGGATTGTTGAATAAGGTTGCAATGCTGTTCCCATATAATTTTTGGGGAGGGGAGATTGATACCTTTGGGCATTTGTCGGAAGATCCTTCGAGGAGGGGTGAGTTCTTCTTGTTCTATAGCTACTATTCGGTGTCTGGTGGTCCGCTTCTTGTAGCTCTTGTTGCTGGTGAGGCAGCGATTGAGTTCGAGAAGGTATCTCCTGTGGAATCATTGGAGAGGGTAATGGATATCTTGAGAGGGATATTTCACCCAAAAGGAGTGGATGTTCCTGACCCTGTTCAGGCAGTTTGCACTCGATGGGGTCAAGACCGCTTCACTTATGGATCATACTCATATGTTGCAATTGGGGCATCCGGTGATGATTATGATATTCTTGCAGAAAGTATCGGAAATGGGCGGGTTTTCTTTGCTGGAGAGGCAACAAACAGGCAATATCCGGCTACAATGCATGGTGCTTTCCTTAGTGGGATGAGAGAGGCTGCCAATATATTGAAGGCTGCCAAAAGGAGATCATTGATTCCAACCAATAAGGCAGATGATGTTAGTTCAGAGGATATTGAGGATTTGAGTCGATTATTCTTGAAACCCGACTTACAATTTGGGAGCTTTTCTGTTTTATTTAATCCGACATCAGATGATCTTGAATCTCATTCACTGTTGAGGGTTGAGTTTGGTGGCGAGAAACTTGAAACTGGTGCTCTGTATTTGTATGGTCTGCTTTCAAGGTGTCAAGCCTTTGAGCTGAGCAAGTTGCAAAGCGATGTCGATAGGTTAAGTATATTGAATCAGAAGTTCAATGTGCGATTAGTAGGCGAAAGAGGATTATGCTCTGCTGCAGAATCACTTATTGCAGCTGTTAGAGCAAAGGCATGCTCTAAGGAAGGATCAGATGACCGTATTGGAAAAGCTTTAGTTTGTCTATAA
Protein Sequence
- >BVRB_9g215320
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