Information report for BVRB_9g215320
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a homolog of human Lysine-Specific Demethylase1. Involved in H3K4 methylation of target genes including the flowering time loci FLC and FWA. Located in nucleus. Negatively regulates root elongation. Involved in repression of LRP1 via histone deacetylation.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G62830
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g215320
AATGCATCAAAAAAGACTTAATAATAATATCGGTCCACTTATTCTATTTTCAGTTCGTATCGTATATTATTGTTATCGTTTTAAGTCCAACTTTTGTCAAAGAAAGTAAGCACTTATTAGTTATTAGGCAAAACAACACCAAAAAGGGAAAATAAAACTCATTGGAAATAACTAAACAAGTCGAACCCTAGTTTAAACTTCCCAAAGTCGGAAACATTCAACAAAACTCATCTACTTTCACAATTCTTATACATTGAACATGAACCCCACCACCACCACCACTACCACCAGTACCACCAACCCTCTATCCCCACCTCCCCCCTCCACCTCAGAAACGACCAACAACAACACCACCACCTTAACCGACACCACACCCACCACTTTAACCGGCACCACACCACCCACCATCACCACCACCACCAACAACAACAATGCAACCTCCGACGACGTCTCCACCCCATCAAACCCACTCTCACCTCCTCAACCCGACGACGACACAACCACCACCACCTCTGAAATACCCATCATCCCAAAACGCCGTCGCAAGCGTAAACACTACCAAGGCACAATTTCCATGGTTCTCCGTCCTCACTCCGCTACTCGTTCTTCTTCCTCTCTCCTCGAAACACTATCTCTCTCTCTCCCTCGTCGCCGCCGTCGCATCTCCGACCTCTCCAAAGAATCCCCTCCCCTCGATATCGACGCCCTCATCGCTATTTCCGTCGGTTTTCCCGTCGACTCACTTACCGAGGAAGAAATCGACGCTTCCGTTGTTCCCACTCTAGGTAGCACCGACCAGTCTCACTACATAAGTGTCAGAAACCTTATACTGTCGAAGTGGCGGTCTAATGTTTCCTCTCTCATCACGCGGGATCACGTGATGGAGTCAGTCCCCATTGAGAAGCGTCCCTTTGTTGATGCTGCATTTAGGTTTCTTGATGATCATGGGTATGTCAATTTTGGACTTGCCCCTGAGATCAAGACAAAAAAAATGTGTGATAATAATTGTAGTTTTGGTGCTAATGTTGTTGTTGTTGGGGCGGGGTTGGCGGGACTTTGTTGCGCCCGCCAGCTTCGGTCCATGGGGTTTAAGGTTGTTGTTATTGAAGGGCGGGGGCGGCCTGGTGGGCGGGTTCGCACTCGAAAGATGAGTAGTGATAAGGAAGGAGTTGTAGGTGCTGCTGATTTGGGTGGCAGTGTATTGACAGGGATTAATGGGAATCCACTTGGGGTATTGGCGAGGCAATTGGAGTTTCCACTTCATAAGGTGAGGGATTTGTGTCCTCTTTATTTGCCAAATGGAAAATCAGTTGATTCTGAGGTTGATTCTAAAGTTGAGACTGCTTTTAATAAGTTATTAGATAGGGTTTGTAAGCTTAGGCAGGTTATGATGGAGGAAATGAAATGTGTAGATGTGTCATTAGGAACTGCATTAGAAGCTTTTAGAAAGGTTTTTAATGTTGGTGAGGGTAATGATCCTCAGGAGAAAATGTTGTTGAATTGGCATTTAGCTAATTTAGAGTATGCTAATGCTTCATTGATGTCGAATTTGTCGATGGCGTTTTGGGATCAGGATGACCCTTATGAGATGGGTGGGGATCACTGTTTTATTCCAGGTGGGAATGAGAGGTTTATTCGCGCTTTGGCAGAGGATTTGCCCATCTTTTACAATCGCACGGTGGAGAGCATTAGGTATGGGGACGACGGGGTGTTGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGGGCGGATATGGTTCTTTGTACTGTGCCGTTAGGAGTTCTGAAGAGGGGAGATATTGAGTTTGTGCCTCCTCTACCTCAGAAGAAGAGGGATGCAATTGATAGATTAGGGTTTGGATTGTTGAATAAGGTTGCAATGCTGTTCCCATATAATTTTTGGGGAGGGGAGATTGATACCTTTGGGCATTTGTCGGAAGATCCTTCGAGGAGGGGTGAGTTCTTCTTGTTCTATAGCTACTATTCGGTGTCTGGTGGTCCGCTTCTTGTAGCTCTTGTTGCTGGTGAGGCAGCGATTGAGTTCGAGAAGGTATCTCCTGTGGAATCATTGGAGAGGGTAATGGATATCTTGAGAGGGATATTTCACCCAAAAGGAGTGGATGTTCCTGACCCTGTTCAGGCAGTTTGCACTCGATGGGGTCAAGACCGCTTCACTTATGGATCATACTCATATGTTGCAATTGGGGCATCCGGTGATGATTATGATATTCTTGCAGAAAGTATCGGAAATGGGCGGGTTTTCTTTGCTGGAGAGGCAACAAACAGGCAATATCCGGCTACAATGCATGGTGCTTTCCTTAGTGGGATGAGAGAGGCTGCCAATATATTGAAGGCTGCCAAAAGGAGATCATTGATTCCAACCAATAAGGCAGATGATGTTAGTTCAGAGGATATTGAGGATTTGAGTCGATTATTCTTGAAACCCGACTTACAATTTGGGAGCTTTTCTGTTTTATTTAATCCGACATCAGATGATCTTGAATCTCATTCACTGTTGAGGGTTGAGTTTGGTGGCGAGAAACTTGAAACTGGTGCTCTGTATTTGTATGGTCTGCTTTCAAGGTGTCAAGCCTTTGAGCTGAGCAAGTTGCAAAGCGATGTCGATAGGTTAAGTATATTGAATCAGAAGTTCAATGTGCGATTAGTAGGCGAAAGAGGATTATGCTCTGCTGCAGAATCACTTATTGCAGCTGTTAGAGCAAAGGCATGCTCTAAGGAAGGATCAGATGGTAAGAAGTAACAACTGTAAGTTATAAACAACTGACATAGAAAGTTTATTGCTGTACATTAGTGTTTCTAGTATGAATTGCATATTACTTTTATTAGATTAAGCAAATTCTTATGTTAGGATAGAAAATTTATGGGCATCAAGCTGACCAATTTGTTTTGGTGTTGTGACTAACCTGTTGGTTGCTGATGGCTATCGAATCCGACGTTGTGAAATTCACCGATCAATGGCCTTTCCTACTTATTAACCCCTTTGTTATTTTTCTATTGCAGAATTTTCATGCTTGCCAATACACAACTTTAACCATTAATATTTTCAATTACCTTCCACTAAAAGAAATTATACAAAAATTTGATATTTTGAAAATATATTGAGACGAATTAAGCAAGATGTTGAGTGAATAGCGTAAAAATCCAATTGTTGCAATAGAAAAAGAAGGGTAGAAAAAGAAGGGTTGCTATTTAACGCTCTAATATTTCCTACTAACGCTCTAAATACAGTATTTTTATATCGTATATTCATACCTCCATTTTTTTTTCTCTCTTTCCCCTCCCCTTTTCCTTCACCACCATTGGAGCCGTCACCACCAACACCACACCAACACTGCCGCCACCACCACTAGTTCATTGAAGATTCATATAACACAACTTCATTTTCTTTCTCCCCTTCACTCACTTCCCATTCCCTTCTTCCACACCACCACCGGCACATCAGAACTTGTGTCTCCGCCGTTGTACCACCACCACGCATCACAACCACCATCACGGCCCCACAGTGCTAGACCACTGACGAGGAGACTGATTTAAAAAAAAAATTATACACAGGCGTCCATAGCAGGTGCTCCATCAGAGGGTGAGGCGCTTACCATGGACACTTTTTTTTTGAAATTTTTTAAACAAAATTATGGAGAGGCGTCTCACCTTGTGGTGGAGCGCCTACCATGAATGCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTACTGTAAATGAAGAGGAGAGAACAAGGGTGTGGGTGATAATGTGGTGGGGGTAGGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGGTGCGGCGGTGGTGTGTCGGCACTGGTGCCCAGTGGGTATGTGGAAGAAGATGGGAGGAAAAGTGAATGAAGACTGAGAAAATGTGAAAATGCGGTATATTATACGTATTTAGGACGTTACTAGAAAATTTTAGGGGGTTGTTTAGCAATTCAGAAAAAAATGGATGAAATTGTACATAATATGAATGTATTATCTTTTAGGCCTTGTTTGGTTGTATATAGGAAGTCATACTTCGTAGGAAGTTATTTTTTCCATGTATTTGATATTCTTAGGAAGTGTAAAATTGTGTTTGGTTGATAATGGGAAGTAGAATTTCCTATGGGAAGCTCTACTTACCTAGGTCCCCCTAGGTAAGTAACTTTCTCCATTTTGGAGGAAGTAGAACTTCCTAGAAAGTACAAATTCTCATGATTTTGCCAACCAAACAACTTCATATACTTCTACTTTCTAGGAATCTGTACTTCTTATGATTTATTTTGTCAACCAAACAAGGCCACTCCGCCTACTTATTCCAAACAAGCTCAGGTGTCCAAACAAGCTCAGATGTCCAAACAAGCTCTACTTATTCCATCTAGGCGTCCACTGACCACTACGCCTCAGGTGTTTATAAAGCAAGCTGTTTTGTTTGTTTCCACTTTCAACTTTCAAGACTGCTATTTTCCACTATGCAAATAACTTTATGATTATGACATGCTTTCATTAAAGAAAGTATTTTCCACTATAATTCGAGAAAGTGTCCAAGGACTGATCATGATCGCTTGGAGTTGATTGGCATATGTTTAGAGATGAAAGCGGTAGGATCTGTTTGTGCCTGTTATTATTATCTGTTCAAGTCTTTAATTGTGACACCTAATTATCATAACTTATGGCAATCAATCCTGATTAAAACTCATAAATTTACTCCTTTTTTCTACTGAGAGGTGAGTCACATCTACAATATGAATGCAGAATTTGGAAATCAGATCTATTTGAATATAAGATGGTTTAATTAATATCTCTTGTATAGCTATTTTCTCAGAATTCTTCTCGAGGGGATAACTATATTAATAGCTGATTTAAGGTAGTTGCTAACTTGCTACTGCATTTTTGAAAAAAAGGTTTTCTAGCAATTGATGGGTGAACATACTAGGGTTGTTATTTATTTAGAGTTCTCGCTGTTCTTTGAGGAATGAGATTTACAAAGCTCACTTCTTGTCT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CDS Sequence
- >BVRB_9g215320
ATGAACCCCACCACCACCACCACTACCACCAGTACCACCAACCCTCTATCCCCACCTCCCCCCTCCACCTCAGAAACGACCAACAACAACACCACCACCTTAACCGACACCACACCCACCACTTTAACCGGCACCACACCACCCACCATCACCACCACCACCAACAACAACAATGCAACCTCCGACGACGTCTCCACCCCATCAAACCCACTCTCACCTCCTCAACCCGACGACGACACAACCACCACCACCTCTGAAATACCCATCATCCCAAAACGCCGTCGCAAGCGTAAACACTACCAAGGCACAATTTCCATGGTTCTCCGTCCTCACTCCGCTACTCGTTCTTCTTCCTCTCTCCTCGAAACACTATCTCTCTCTCTCCCTCGTCGCCGCCGTCGCATCTCCGACCTCTCCAAAGAATCCCCTCCCCTCGATATCGACGCCCTCATCGCTATTTCCGTCGGTTTTCCCGTCGACTCACTTACCGAGGAAGAAATCGACGCTTCCGTTGTTCCCACTCTAGGTAGCACCGACCAGTCTCACTACATAAGTGTCAGAAACCTTATACTGTCGAAGTGGCGGTCTAATGTTTCCTCTCTCATCACGCGGGATCACGTGATGGAGTCAGTCCCCATTGAGAAGCGTCCCTTTGTTGATGCTGCATTTAGGTTTCTTGATGATCATGGGTATGTCAATTTTGGACTTGCCCCTGAGATCAAGACAAAAAAAATGTGTGATAATAATTGTAGTTTTGGTGCTAATGTTGTTGTTGTTGGGGCGGGGTTGGCGGGACTTTGTTGCGCCCGCCAGCTTCGGTCCATGGGGTTTAAGGTTGTTGTTATTGAAGGGCGGGGGCGGCCTGGTGGGCGGGTTCGCACTCGAAAGATGAGTAGTGATAAGGAAGGAGTTGTAGGTGCTGCTGATTTGGGTGGCAGTGTATTGACAGGGATTAATGGGAATCCACTTGGGGTATTGGCGAGGCAATTGGAGTTTCCACTTCATAAGGTGAGGGATTTGTGTCCTCTTTATTTGCCAAATGGAAAATCAGTTGATTCTGAGGTTGATTCTAAAGTTGAGACTGCTTTTAATAAGTTATTAGATAGGGTTTGTAAGCTTAGGCAGGTTATGATGGAGGAAATGAAATGTGTAGATGTGTCATTAGGAACTGCATTAGAAGCTTTTAGAAAGGTTTTTAATGTTGGTGAGGGTAATGATCCTCAGGAGAAAATGTTGTTGAATTGGCATTTAGCTAATTTAGAGTATGCTAATGCTTCATTGATGTCGAATTTGTCGATGGCGTTTTGGGATCAGGATGACCCTTATGAGATGGGTGGGGATCACTGTTTTATTCCAGGTGGGAATGAGAGGTTTATTCGCGCTTTGGCAGAGGATTTGCCCATCTTTTACAATCGCACGGTGGAGAGCATTAGGTATGGGGACGACGGGGTGTTGGTTTATGCAGGTGGGCAGGAGTTTCGGGCGGATATGGTTCTTTGTACTGTGCCGTTAGGAGTTCTGAAGAGGGGAGATATTGAGTTTGTGCCTCCTCTACCTCAGAAGAAGAGGGATGCAATTGATAGATTAGGGTTTGGATTGTTGAATAAGGTTGCAATGCTGTTCCCATATAATTTTTGGGGAGGGGAGATTGATACCTTTGGGCATTTGTCGGAAGATCCTTCGAGGAGGGGTGAGTTCTTCTTGTTCTATAGCTACTATTCGGTGTCTGGTGGTCCGCTTCTTGTAGCTCTTGTTGCTGGTGAGGCAGCGATTGAGTTCGAGAAGGTATCTCCTGTGGAATCATTGGAGAGGGTAATGGATATCTTGAGAGGGATATTTCACCCAAAAGGAGTGGATGTTCCTGACCCTGTTCAGGCAGTTTGCACTCGATGGGGTCAAGACCGCTTCACTTATGGATCATACTCATATGTTGCAATTGGGGCATCCGGTGATGATTATGATATTCTTGCAGAAAGTATCGGAAATGGGCGGGTTTTCTTTGCTGGAGAGGCAACAAACAGGCAATATCCGGCTACAATGCATGGTGCTTTCCTTAGTGGGATGAGAGAGGCTGCCAATATATTGAAGGCTGCCAAAAGGAGATCATTGATTCCAACCAATAAGGCAGATGATGTTAGTTCAGAGGATATTGAGGATTTGAGTCGATTATTCTTGAAACCCGACTTACAATTTGGGAGCTTTTCTGTTTTATTTAATCCGACATCAGATGATCTTGAATCTCATTCACTGTTGAGGGTTGAGTTTGGTGGCGAGAAACTTGAAACTGGTGCTCTGTATTTGTATGGTCTGCTTTCAAGGTGTCAAGCCTTTGAGCTGAGCAAGTTGCAAAGCGATGTCGATAGGTTAAGTATATTGAATCAGAAGTTCAATGTGCGATTAGTAGGCGAAAGAGGATTATGCTCTGCTGCAGAATCACTTATTGCAGCTGTTAGAGCAAAGGCATGCTCTAAGGAAGGATCAGATGACCGTATTGGAAAAGCTTTAGTTTGTCTATAA
Protein Sequence
- >BVRB_9g215320
MNPTTTTTTTSTTNPLSPPPPSTSETTNNNTTTLTDTTPTTLTGTTPPTITTTTNNNNATSDDVSTPSNPLSPPQPDDDTTTTTSEIPIIPKRRRKRKHYQGTISMVLRPHSATRSSSSLLETLSLSLPRRRRRISDLSKESPPLDIDALIAISVGFPVDSLTEEEIDASVVPTLGSTDQSHYISVRNLILSKWRSNVSSLITRDHVMESVPIEKRPFVDAAFRFLDDHGYVNFGLAPEIKTKKMCDNNCSFGANVVVVGAGLAGLCCARQLRSMGFKVVVIEGRGRPGGRVRTRKMSSDKEGVVGAADLGGSVLTGINGNPLGVLARQLEFPLHKVRDLCPLYLPNGKSVDSEVDSKVETAFNKLLDRVCKLRQVMMEEMKCVDVSLGTALEAFRKVFNVGEGNDPQEKMLLNWHLANLEYANASLMSNLSMAFWDQDDPYEMGGDHCFIPGGNERFIRALAEDLPIFYNRTVESIRYGDDGVLVYAGGQEFRADMVLCTVPLGVLKRGDIEFVPPLPQKKRDAIDRLGFGLLNKVAMLFPYNFWGGEIDTFGHLSEDPSRRGEFFLFYSYYSVSGGPLLVALVAGEAAIEFEKVSPVESLERVMDILRGIFHPKGVDVPDPVQAVCTRWGQDRFTYGSYSYVAIGASGDDYDILAESIGNGRVFFAGEATNRQYPATMHGAFLSGMREAANILKAAKRRSLIPTNKADDVSSEDIEDLSRLFLKPDLQFGSFSVLFNPTSDDLESHSLLRVEFGGEKLETGALYLYGLLSRCQAFELSKLQSDVDRLSILNQKFNVRLVGERGLCSAAESLIAAVRAKACSKEGSDDRIGKALVCL