Information report for BVRB_9g214380
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- This gene is predicted to an encode a nuclear-localized protein that is involved in regulating the period of circadian rhythms without affecting their amplitude or robustness. FIONA1 seems to act as a central oscillator-associated component, but its transcript levels are not regulated in a circadian or light-dependent manner. FIONA1 also appears to be involved in photoperiod-dependent flowering.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc07123
- Citrullus lanatus: Cla97C02G031050
- Cucumis sativus: CsGy7G000690
- Gossypium hirsutum: Gohir.A12G038400, Gohir.D12G033900
- Juglans regia: Jr16_16560
- Manihot esculenta: MANES_S029400
- Nicotiana attenuata: A4A49_34952
- Populus trichocarpa: POPTR_004G172100v3
- Prunus avium: Pav_sc0000373.1_g180.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_8G162700
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr6g0244411, RchiOBHm_Chr6g0244441
- Solanum lycopersicum: Solyc01g098460.3
- Vitis vinifera: VIT_03s0038g02100
Gene Resources
- Pfam: PF05971
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_9g214380
ACTCATTCATTTCAATCATTTCAACCCGAAAAAAATACCCAAGTGAGTTTTGTCCAGTTTGAGGACAAATTCGTCTTTTGCAGGCGGCGCCATTCTCTTTCAACTGTTCAACACCAGCTCTACAGTTTACAACTCAACTAAACCAAGAAAAATGGGGAACAAGAAGAGGAAACGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGAAGCATACATCCTCGTAATAAATACGCTGATAATCCCCCTGATTTCTCTCTCCTCGCTTCTCTTTACCCTTCTTTTTCTCCTTTCGTATCTTACTCTCCTGACAATCATCGACCCCGAATCGATTGGACTGATTTTAATGCCACTCGTGAACTTACTCGTGTGCTCCTCCTCCATGACCACTCTCTCAACTGGTACTTTTCTTACTTTCTTTTTGTCAGACTGTCACAAAATTCATGCAATTTGTGTTTTTCTTTTCTGGGTATTTATTCAATAGCTTACCATGTGAATATGCTTTCTGGGTTTTGGGTGTGGTTAAATTTGTTTCATCGTAGTTTTGGGATTATTTGATTGAGTTTTGTTACATCATATGCTTTAATTATTGTGCAAATTGCCAATTTTTTGTCATAAATTACTATGAAACTATGAGTGTTTGATTATGATTGGTGAAACTTGTTGTTATTTAGGTGGATTCCTGATGGGCAATTGTGCCCAACTGTGCCCAATAGGTCAAATTACATACATTGGATTGAGGATCTCTTAGCTTCTGACATTATTGAGAATAATAATGTTGGTAGAGATAAAGTAAGAGGCTTTGATATTGGAACTGGAGCAAATTGTATTTATCCTCTTCTTGGTGCATCTCTGTTAGGCTGGAGTTTTGTTGGGTCAGGTAGGCTTATTACTATGTAACATGTAATTTGCTTAACCTTGTTTTGTGACAAATTAGTTTACATTGGTCTAATTTCAATTTTGTTATATTTAACTTTAGATGTAACTGATGTAGCCTTGGAGTGGGCAGAGAAAAATGTTAAAAGTAATCCCCATGTTTCGGAATTGATTGAGATTAGAAGGGTTGAGGTTGCTGAACCTGCGCATGGCCGTGGTATCATACATTTAGATGGTAATAAGACCAATGATAATAACCAAAAGAAGGAAGATCTTGATGTTCTGACCAAACACAATACTGAGGGTGGATTGGATAATGCACGTTCAGTTGATAGTGGAGAAGTGGAAGATTCTATTGAAAGAAGGGATGGTGAAGCACAAATTGGATCCTCAAGTCCTCGTAGTGAAGCTAATGTCGATAAGTGTTATCATGGGCCGTCTATCCTTCTTGGCGTGGTTAAAGAAGGTGAAAAGTTTGATTTCTGTATGTGCAACCCTCCATTTTTTGAAAGCATGGAGGAAGCAGGATTGAATCCGAAAACTTCATGTGGTGGTACATCAGAAGAGATGGCCTGCCATGGTGGAGAGAAGGCTTTTGTCAGTCGCATTATTGAAGATAGTGTCACACTAAAGCAGTCATTTCGGTACACAATCTTTTTATGGCCAGTTTTATCATGCTTAATGTTTACAAGTGGAGCTTCTACGTATGTAGGCTGAACTACATTTGCTTCTAGGTGGTACACTTCAATGGTTGGGAAAAAGTCAAGCCTTAAGTCGCTGATGTCAAAACTTCGGGAAGTGGGGGTCACAATTGTGAAAACTACTGAATTTGTGCAGGGTCAAACTTCTCGATGGGGACTTGCCTGGTCCTTCATGCCACCAACCAGAAAACCATTATCCTCTCATGTGAGGGGTAATAGTAACCCATCCTTCATGCTTGAGGTATGCGTCATGATCCCATTATTAGGGTGTTTGAAGCTCTATTAGTAATAAATACATTTCATTCTTCTGCATGATAAGGATAGAACTAGGACATCCATTTCGGATTTTGCTGCTAACAGATCCAGGAAGCTAAATTTATACATGACCTTAGTCAAGCAATCCGACAGCTGAATTGTCTTCATCTTCCACAGATTTTACTAGCTTCTGTTAAGGCTACTTATGAAATTAGGAATATGCGATTGTGTACTTCAAAATGGAATATTGAAATCTATTCAAGCATTGACCTTAGTAACACACTCTCTTTCAAGAAGGAAATAATCAGTGGTATTCGTCCTTTTCAATGGTCTTCTTACCTCTGGTTTCTGCTGCCTGTTATTGTCTCTAGATGAGCTTTTTTACCTTTTTCTTTTTTACTTCCAAATCTTTTGTTTCATTTTCTTTTATTTTAGATTTTGGTAAAAGAACTTCTCCATGGAGAATGATGTCTCAGTAAATTACAGTAGATCATCTAATGTTGTACGGTTGCTATACTGAAATGCAATGCAAAGTGCAACCTTATTAGATCCTTTGTATTAGTTTTTCTTTTTGCATATTTATGGGTTTAGTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTATATCTCCCTTCCCTAATGTGTTCTTGTACTGTCAGCCCACAATTTTGATTCAGAGTTCTTTGCTTTCTTCAGGGTCTCGACCGTCAAACTAGTGCCTTTGATGTTTTGCGGTGTGTAGAATCCTTCTTCAATACCTTTGGGGCATTCTGTAAATCCAATGATTCATCCTTTACTGTTGAAGTCAGTTTCACATAATCATTGTCTCTTGTTTCTATTTTCTTGTGTCAAACTACAAAAGAATAAGTGTACCCTCTTCATTATGCTTAGGTAAGTGCATCAGATGATCATTGTGACACTATATTGAAGACCGATGTCAAACAGCTTGATGGGGTTTCCACTTACCTGCACGTTGCTGAAGCATCTAGGAGTGCGAGCTGTTCAAATAGTCCAATGAATTTATCTTTTCGTGTCATGGTATGACTTGAATTTCAGAAATAATTATAGATTACTCAGGAGCTGACACTGACTATATATATACAATCTATATTTTGGACTCTAGGTCTTCCAGCAGATCCCAGGAACACTCCTGGTGAAAGCATCATTACAGCTGAGAGACAGTCCGCTTTCAGGTAGTGATTTCTCATCATGTCTGAACTTTGTGAAGAACTTGCTTTGCCTTTTTTGCTTTCTCTTTTGTTTTGTTTTGCTCACAATGCAACTCTTCATTCGTATTATAGACGACGTTGCGACAGCTTTCTTGTTTAGAATTCCAATATGTTTTTCGAAACCACTGGTTTACATGGGTTTTGTGCAGCATAGACCTTTCAAAAATAATGGCCCTCTAGGCTCTAAGGCTCTAATCACTGTTTCATGTATTTTGTTGCTATTCTTGACCCAATTGTTCTTATTTTATCTTGTAAGAGCTTTCTCTTGAAATTCTTATATACTTTATAATGAGATGCATGATTGGACAGAAAAAACAGTAATCATTCTTTCTATGTACGTGTACCTGACATATAATTTCTCCAGTAAGGGAGATTGAACATGTGTTACTCATATCATATATTCATAAATCAATGTGGAATTTTCGATGATATTACAGCTTGGCAAGTTTGTGCCATTCTTTATCGAGTTTCATATCATTCTTTTGTTGTTATAACTTTAAAAGGGGGGGGGGGGAAATCAATGGTATGCTTGTTGTTGCTCATTTAAATACATTCTTATGGAGGTATGGGTATTTGCATGGTACATCCTATATGAGGTTGCACCTAGAATCATAATCAGCATCGTTCTTCTCAAGATTCTCGTGTTAGATGCCTAATCTTGCTTTCATCGCATTACTGTTAGACTGTTAGTACACACCTAATATGGTTTTTGCTGCAGGAGCATTTACGTCTGTAATTGAACAATTAGAAGTATATCTGAAGCACAAATTTTGTGGCAAAAAGGCCCGTATTTGAACCCTTAGATTTTAAGGTGATATAGAAGAATGAAGATGATAACCATTTTGTCGGCAATTAGGTAATCCTTCCTCCGTTATTTATTACTTGCATCGTTTTAGCATTTCTAGCAATTCTCTATTACTTGCATCGTTTCTATTTTTGGCAATCCTTCTCAAGATTCTCGTGTTAGATGCCTAATCTTGCTTTCATCGCATTACTGTTAGACTGTTAGTACACGCCTAATATGGTTTTTGCTGCAGGAGCATTTACGTCTGTAATTGAACAATTAGAAGCATATCTGAAGCACAAATTTTGTGGCAAAAGGCCCGTATTTGAACCCTTAGATTTTAAGGTGATATAGAAGAATGAAGATGATAACCATTTTGTCGCAATTAGGTAATCCTTCCTCCCTTTTTTATTACTTGCATCGTTTTCGCATTTCTAGCAATTCTCTATTACTTGCATCGTTTCTATTTTTGGCAATATATTCTCTTTTTCTCCGGGGTTCTTTTTTTTTTTAAAAAAAATATCTTTCTCTATCTATCTCCTCACCTTGGTCCCTGTGCAAAAGGAAACTATGCAAGTAATACAAAACGGAGGAAGTACCTTGTTATACGATGATCCCGTCTATGTCTTCTTTACTCTTTTCTTTCTCGGAATGCTGCAGTAAAAAATCTAGGTCATCAACCTGTAACATGAGGGACGTCTTCATAACTAGTTGTCCTGATCCCGTGTTTGGACTTGTTTTCCAATGTCAAGCATCATAATATGTTCTTGATGTGCTGGTGTGGCTGACCCTTCAGAAGTCAGAACAATAGCTGATTATCTCTCTGGGCTGCATCTTCGCCGTCTGTGCACCTTAACTGAAAAAGTGCTCGATAGAGTTTTAGCCTCGAATCAATTTATTTATGTAATATGGATCCAAATTCAACCATTTCTACCCCAGTACTGCCCATAAATTCGAGTGCATGATCAGGCTGAATCACAGTAAAGACCTCTCTGATGCTCTTGTAGAGTTTAATGACCTCTATCAAGCCTTTAGATGACCTCTATTAGGTTCGTTGGACTAATACCAATTTTCGTTCTCTACGCAGTTGTTATTGTTACTTTTTTTTTAGTTTGGCAGAATCTTATTGTTATTACTTTGGATTATTCTAAGAAAGATGAAGAAGAAAGAAGAGTTATGTTCTACTTGATAGTTTTTTTTTCCCTCCTTAATTTGAAACGTTACACAATTAGATGCTCTGTATTTGCCTTGTTTAATGTATTGAGTCAAAAAACTCTGTTGAATATTTGGTAATTGATGGAAATTGCTAATCCTGTAAACGAGATTCTAATGAATACCTCCCATTCTCTCTAAGTTCATCTAAATTTTGTAAATTTGTATTATCAATTTTGTATTTCAAAAGTGAACTTAGAACACTTCATTTCCTGTCTTTAGATTATGTTAAAAGCCTTCTGTGAAATAATATCCTAATACACTTTCTAGTTTCTACTTCATACATTTTCAGCCAATTACTTGATGAACGGCCATCTCAAAGGAGATGGAGAGCATCTCTATTCTCGTCTTGTCAAAAGTGTAGTTATTTATTTAAAAAATGACCATCTCAAAGGAGATAGATAGCATCTCGATTCTTGTCTTGTCAAAAGCGTAGTTGGTTTGACTCGAAAAATTAACGGAAATTTCAAGTACTAATATTGAAAAGTTTCCTGAAAAGTTGGTTCAAAAGAATTGAAATACTTATTAAGGGAGTTTTACCCATTTAAAGAAAGAAAAATCTTGATAATTATGCCATTTACCTTCTTCAAAGTTCAACCTTTTGTTTCAGAGATCTTTCAACTTATTAATAAAAATACTGTTTGATTAGTAAAAACACTAGTAACAAAAATCAATTCTAATCAATAAAATCGTTGCTAATAAAAAAATTCATTTCGGCAAAGTTAGGTGGATTGAATTGTTGAATGAGGAAGTTGAAGGGAATTTTTCCTGCCAAACACTTTGATTTTATATCAAAGGAGTTGATTATAATATGAGCTTATGCCATTGGATGCTTCTTTATCCATTTTAATTAAACATGATTAGCCAACAATAACATAGACAAGTGTCTTAATTACATAGGCTGATAGGGGAATTTATTATTTTTCTAATGAGCATGAAATTTCTTTTGTGGGAGTGCGAGTGGTTGCGCGATCAACAACTATAATCAACACTCCCTCTATTTTTATTATCGGAGATTGCTACGTCTATCTACTGGGTAGCCTATCCATTAGAAATAGACAATTAAAAAATAAATAATTTTGCTGAGTTGGACTCCACTTATTATTAATGTCTATCTCTAGTGGGTAAATTACCCAGTGGGTAGACAGATTTTCCCGTTATTATCTGTACTATACCAGTATCATGTGAGATGGGTCGGATTCTAAAAAGCACTTAAAAGTCCAAACCCACAAAGAAATTATAAAATTAGCTCAAATAAATCATTCACCAAAAGAAAAAGAATAATAGCTTAAATGAAAGGAATATTAACATTCAAGAGATAGATGGAGGTGGAATAAATTTCTTATGCATTT
CDS Sequence
- >BVRB_9g214380
ATGGGGAACAAGAAGAGGAAACGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTCGAAGCATACATCCTCGTAATAAATACGCTGATAATCCCCCTGATTTCTCTCTCCTCGCTTCTCTTTACCCTTCTTTTTCTCCTTTCGTATCTTACTCTCCTGACAATCATCGACCCCGAATCGATTGGACTGATTTTAATGCCACTCGTGAACTTACTCGTGTGCTCCTCCTCCATGACCACTCTCTCAACTGGTGGATTCCTGATGGGCAATTGTGCCCAACTGTGCCCAATAGGTCAAATTACATACATTGGATTGAGGATCTCTTAGCTTCTGACATTATTGAGAATAATAATGTTGGTAGAGATAAAGTAAGAGGCTTTGATATTGGAACTGGAGCAAATTGTATTTATCCTCTTCTTGGTGCATCTCTGTTAGGCTGGAGTTTTGTTGGGTCAGATGTAACTGATGTAGCCTTGGAGTGGGCAGAGAAAAATGTTAAAAGTAATCCCCATGTTTCGGAATTGATTGAGATTAGAAGGGTTGAGGTTGCTGAACCTGCGCATGGCCGTGGTATCATACATTTAGATGGTAATAAGACCAATGATAATAACCAAAAGAAGGAAGATCTTGATGTTCTGACCAAACACAATACTGAGGGTGGATTGGATAATGCACGTTCAGTTGATAGTGGAGAAGTGGAAGATTCTATTGAAAGAAGGGATGGTGAAGCACAAATTGGATCCTCAAGTCCTCGTAGTGAAGCTAATGTCGATAAGTGTTATCATGGGCCGTCTATCCTTCTTGGCGTGGTTAAAGAAGGTGAAAAGTTTGATTTCTGTATGTGCAACCCTCCATTTTTTGAAAGCATGGAGGAAGCAGGATTGAATCCGAAAACTTCATGTGGTGGTACATCAGAAGAGATGGCCTGCCATGGTGGAGAGAAGGCTTTTGTCAGTCGCATTATTGAAGATAGTGTCACACTAAAGCAGTCATTTCGGTGGTACACTTCAATGGTTGGGAAAAAGTCAAGCCTTAAGTCGCTGATGTCAAAACTTCGGGAAGTGGGGGTCACAATTGTGAAAACTACTGAATTTGTGCAGGGTCAAACTTCTCGATGGGGACTTGCCTGGTCCTTCATGCCACCAACCAGAAAACCATTATCCTCTCATGTGAGGGGTAATAGTAACCCATCCTTCATGCTTGAGGGTCTCGACCGTCAAACTAGTGCCTTTGATGTTTTGCGGTGTGTAGAATCCTTCTTCAATACCTTTGGGGCATTCTGTAAATCCAATGATTCATCCTTTACTGTTGAAGTAAGTGCATCAGATGATCATTGTGACACTATATTGAAGACCGATGTCAAACAGCTTGATGGGGTTTCCACTTACCTGCACGTTGCTGAAGCATCTAGGAGTGCGAGCTGTTCAAATAGTCCAATGAATTTATCTTTTCGTGTCATGGTCTTCCAGCAGATCCCAGGAACACTCCTGGTGAAAGCATCATTACAGCTGAGAGACAGTCCGCTTTCAGGAGCATTTACGTCTGTAATTGAACAATTAGAAGTATATCTGAAGCACAAATTTTGTGGCAAAAAGGCCCGTATTTGA
Protein Sequence
- >BVRB_9g214380
MGNKKRKRGGGGGGGRSIHPRNKYADNPPDFSLLASLYPSFSPFVSYSPDNHRPRIDWTDFNATRELTRVLLLHDHSLNWWIPDGQLCPTVPNRSNYIHWIEDLLASDIIENNNVGRDKVRGFDIGTGANCIYPLLGASLLGWSFVGSDVTDVALEWAEKNVKSNPHVSELIEIRRVEVAEPAHGRGIIHLDGNKTNDNNQKKEDLDVLTKHNTEGGLDNARSVDSGEVEDSIERRDGEAQIGSSSPRSEANVDKCYHGPSILLGVVKEGEKFDFCMCNPPFFESMEEAGLNPKTSCGGTSEEMACHGGEKAFVSRIIEDSVTLKQSFRWYTSMVGKKSSLKSLMSKLREVGVTIVKTTEFVQGQTSRWGLAWSFMPPTRKPLSSHVRGNSNPSFMLEGLDRQTSAFDVLRCVESFFNTFGAFCKSNDSSFTVEVSASDDHCDTILKTDVKQLDGVSTYLHVAEASRSASCSNSPMNLSFRVMVFQQIPGTLLVKASLQLRDSPLSGAFTSVIEQLEVYLKHKFCGKKARI