Information report for BVRB_8g195490
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a nuclear localized member of the MYB family of transcriptional regulators that is involved in negative regulation of flowering. It is expressed in vascular tissues and at low levels in the shoot apex during the transition to flowering. Loss of function mutations are early flowering.EFM is involved in the autonomous, thermosensory and GA pathways and expression is directly regulated by SVP. EFM interacts with JMJD5 to repress FT expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT2G03500
Gene Resources
- Pfam: PF00249
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_8g195490
TACAATAAACATAATTATTCCAAGGGAAAATATATAAATTTAACCAAAAGTGAAAGACTTGATGTAAATCTATTGATGAATTTTATCATTGGATAGTGAATAAGACATCACTTAAAGGAATAATAGTTAGCAAAACAAAGTAACAAACACTCATCACTTTCTGTTTTATGGCCTGCCTCTTTAATTTAATTTAATTACCCTCCCAATCTACACAGATAATTCACACAAGAATGAGGACAAAAGTTAGAAACTCAAACCCTAATCCTAACTCTAACCCTAGAACACTAGAACTTAAGAGTAATCTCACTGCCATTACTCTCTTGATCACCATCATCTCTAAATGCTGCAAGCTTCTTTCTCTCTTCGTCTTCCCCACTTTCACCTTTCCAGCTACTGCTCTCAGACTTGCCGTCTTCGATGCTCTCGGACCGGCCAGCACCGGCTCCCTGAGCATCTGATTCCGGTGAGCTACGAGTCTGTGTGTGCGAGGCGGTTTTGTAAACATGGAGCTGGTGGTGGTGGTGATGGTGATGTAGGGCTGGGTGGTGCAGTGCTTGAGGGTGAGCTTGTGGTGGTGCTGATAGTTGTGGGTAAAAATCTGGTGGCACTGTTGGTGAACAATAGTGTGATGATACTTGACTTGTTGGGTGAGTACTATAGATTGTGGGTCCACCTCCATGCGCCGCGGCCGCTGCCGTGGCGTATTCTGGTGGGACCCATATTCCTCCTAACACAACCAGCTGTGGTGGTGGCCCTCCTGCTGTTTGGGGACTTGGGCTTGGCCTTCTTGTGTGAAGTCTATATTTCTGCATGTTGGTAAATTACAACAGTTAAAAAATAAATAGAGATTGATACATCTATCCACTGGATAAATTACAGCTAAAAAATAATTACTATATAGACACTTTTTTTTTTAATAAAAAAAAACAATTTAAAGTAGCCCCAATTCAAGAATAAAAAGAGTAGAGACAATTAGTATATTATCTGCAATATTGTACAGTATAACAGCTTTGACGATGTTTATTTCATGATTGCATGCACAGAAATGAGAGATTTAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGATCTAGAGAGAGAGAGTTTTACCTGGAGATGACTTTTCACTTCATCATTGGTGAGACCATCAACCTTCATTAACTCCCTAATTTGTTTAGGGGTAGCCACTGTTTCAATAGATAAGCAATAACCAATAATTAGCCAATTAATATAACTTCTCTTAGATTGTTTCTTAAAGCTAATGATAATGAAATGATTAACATTTTCTAATTAAGACATGATGATTATACAACAAGGACTTGTAATTTGTAAACATCTCATCATTATGTTCTAAGTATGTAGTACATGATGATGTTGAAATTATTATCCTTAATTAGAATTATATATATACCTTGAGAACCACCAAGCATTTGAAGAGCATTGACAAATCGTCGGTGCAAGTCCGGTGACCAACACCGCCTCGCCTTCCTATTCGCCTGTGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTAGTGGTTGTCGTGGTAGGTGGTTGGCTATCTATAGCCGCCATACCAACCATGGCATTTCCTCCTTTACTAGAATTATCACTCCTTGATCCACTTAATCCATTTTCACTCTCTAATCTGTTATTATCTTCTACATCTCTTTCACTAGATGCTAGAGCCAAATCAGGAAGTGACCTTAAGCTTGAATTATCAAGGACCGAATTTCGTTCTTTTGCAAATGGAAGAAAAGCTCCTCCATTTCTTTGATTGTTGTCTAATGCAAGTTTAGGGCTGCTGATATTGAATGCATTTTCAGCTTCGGATTTAGGCAACGTTGAAGATTGTTGCTTATTCGCGTCTCCATTTGCCGGACTCCATAGTTGTGCAGATACCATCCAATTGGCTTTATCAGAAATGTTTGTTGGTTTTTGATCAGAACCTTCTAAGTTTGAATGTTTTAAGGGCATAAATTCTTCAAGAATTGGTCTTCCTCCTTGATTTCCTTTGCAAGATTGTAACTGTTGTCTTGAGGACTCCATGGCTGATGAGCAAAAATTCCCCACAAAAGGAAAAAATAAAAGTTATTAATCTTTTCTTTTGATAGTTAATTTTGAAGAAAACTCTCAACCCTAGATAGAAACAAATTAAAGCTTTAATATTTTTTTTTCCCATCTGAATCAATTTATCTTTTCGGAATTAAGACTTTGACATTGTTGTTGTACGTTATATCATATATATACATGTTCCTTTTCGTGTTATTTTTGTTGGTAGATTTTGAAAAAATTAAAACAAAAGTTGTATGCAATAAATAAAAATAAAACCTTTTTAATTGTCCTCAATTTTTGTGATTAAGAGGTAAAAGAACAAAAGTGTAACCAAAATTTCACAAAGAAAAAGAACGATAACCTTTTTATATATTATTGCTAGGTTTAACATTTTGATTTAAGGAAAATGATATACATAGCCCTAAAATGGAAATAAAATATTGAATCAAGCATTTATTATCTCAGTTGATGTGAAAATGTGTCTTGAATTCTTAAACTGTTTTCATTTAAATAAATGTATTTAATGCTTATATTTACCGCTTAGGGCTAAATATTTTGATTTAATGGTTGTTGTTAACCTTTTATTTAATGCTCAAAATGCAATGTTGAAAAACATGCAAAAAAATGAGGAAAAGGAGACAAAAAGAAGAGAATAACATGCTTATATGCATATTGAGGTTCATTGTCTATACCATTGGTAAGAAGTTGCATGCAAAGAGGTAGCTCACGCTTGAAAGCATCAATCTTAAGGCGTTCTTCTTCGAGACGATTAAGGTATTCTTCAAGCTTGTGTGTTGTTTGTATGTCTGATGAGTTATTGTGATCGCCGGCGAATGATTTAAGGAGCATAGAGTAGCTTTGAGGTTTACACTCAAGGCTTAGTTCTGAAGGAGAAGCCATCATTTCACTTATGATAACAAAAACCCTAAAGTTGTACTTGTAATATAATTAAGATGAGTACAATTAGTACTTGTTGTTCTTCAACGTTGATGAAATAAGATATATGTATGTATGTATATATAAGTTTGATTTTGTGCAATAACTTTTATGTTGTGAAATGTTGAAACTCTTATAGAAATTAGAGTGAAGGAGGGGTGGTCTTCTCCTTTTGAGGTTAAG
CDS Sequence
- >BVRB_8g195490
ATGATGGCTTCTCCTTCAGAACTAAGCCTTGAGTGTAAACCTCAAAGCTACTCTATGCTCCTTAAATCATTCGCCGGCGATCACAATAACTCATCAGACATACAAACAACACACAAGCTTGAAGAATACCTTAATCGTCTCGAAGAAGAACGCCTTAAGATTGATGCTTTCAAGCGTGAGCTACCTCTTTGCATGCAACTTCTTACCAATGCCATGGAGTCCTCAAGACAACAGTTACAATCTTGCAAAGGAAATCAAGGAGGAAGACCAATTCTTGAAGAATTTATGCCCTTAAAACATTCAAACTTAGAAGGTTCTGATCAAAAACCAACAAACATTTCTGATAAAGCCAATTGGATGGTATCTGCACAACTATGGAGTCCGGCAAATGGAGACGCGAATAAGCAACAATCTTCAACGTTGCCTAAATCCGAAGCTGAAAATGCATTCAATATCAGCAGCCCTAAACTTGCATTAGACAACAATCAAAGAAATGGAGGAGCTTTTCTTCCATTTGCAAAAGAACGAAATTCGGTCCTTGATAATTCAAGCTTAAGGTCACTTCCTGATTTGGCTCTAGCATCTAGTGAAAGAGATGTAGAAGATAATAACAGATTAGAGAGTGAAAATGGATTAAGTGGATCAAGGAGTGATAATTCTAGTAAAGGAGGAAATGCCATGGTTGGTATGGCGGCTATAGATAGCCAACCACCTACCACGACAACCACTACCACCACCACTACCACCACCGCACAGGCGAATAGGAAGGCGAGGCGGTGTTGGTCACCGGACTTGCACCGACGATTTGTCAATGCTCTTCAAATGCTTGGTGGTTCTCAAGTGGCTACCCCTAAACAAATTAGGGAGTTAATGAAGGTTGATGGTCTCACCAATGATGAAGTGAAAAGTCATCTCCAGAAATATAGACTTCACACAAGAAGGCCAAGCCCAAGTCCCCAAACAGCAGGAGGGCCACCACCACAGCTGGTTGTGTTAGGAGGAATATGGGTCCCACCAGAATACGCCACGGCAGCGGCCGCGGCGCATGGAGGTGGACCCACAATCTATAGTACTCACCCAACAAGTCAAGTATCATCACACTATTGTTCACCAACAGTGCCACCAGATTTTTACCCACAACTATCAGCACCACCACAAGCTCACCCTCAAGCACTGCACCACCCAGCCCTACATCACCATCACCACCACCACCAGCTCCATGTTTACAAAACCGCCTCGCACACACAGACTCGTAGCTCACCGGAATCAGATGCTCAGGGAGCCGGTGCTGGCCGGTCCGAGAGCATCGAAGACGGCAAGTCTGAGAGCAGTAGCTGGAAAGGTGAAAGTGGGGAAGACGAAGAGAGAAAGAAGCTTGCAGCATTTAGAGATGATGGTGATCAAGAGAGTAATGGCAGTGAGATTACTCTTAAGTTCTAG
Protein Sequence
- >BVRB_8g195490
MMASPSELSLECKPQSYSMLLKSFAGDHNNSSDIQTTHKLEEYLNRLEEERLKIDAFKRELPLCMQLLTNAMESSRQQLQSCKGNQGGRPILEEFMPLKHSNLEGSDQKPTNISDKANWMVSAQLWSPANGDANKQQSSTLPKSEAENAFNISSPKLALDNNQRNGGAFLPFAKERNSVLDNSSLRSLPDLALASSERDVEDNNRLESENGLSGSRSDNSSKGGNAMVGMAAIDSQPPTTTTTTTTTTTTAQANRKARRCWSPDLHRRFVNALQMLGGSQVATPKQIRELMKVDGLTNDEVKSHLQKYRLHTRRPSPSPQTAGGPPPQLVVLGGIWVPPEYATAAAAAHGGGPTIYSTHPTSQVSSHYCSPTVPPDFYPQLSAPPQAHPQALHHPALHHHHHHHQLHVYKTASHTQTRSSPESDAQGAGAGRSESIEDGKSESSSWKGESGEDEERKKLAAFRDDGDQESNGSEITLKF