Information report for BVRB_6g151970
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a MYC-like bHLH transcriptional activator that binds specifically to the MYC recognition sequences in the CBF3 promoter. Mutants are defective in cold-regulated gene expression. Cold stress triggers protein degradation of nuclear GFPICE1 protein, and the RING finger protein HOS1 is required. Sumoylation of ICE1 controls CBF3/DREB1A expression and freezing tolerance.
Homologous
- Gossypium arboreum: Cotton_A_22712_BGI-A2_v1.0
- Gossypium hirsutum: Gohir.A07G232300
- Lotus japonicus: Lj1g3v1452960.1
- Manihot esculenta: MANES_04G092400, Manes.04G092400.1.p, MANES_06G125900, Manes.06G125900.1.p
- Prunus avium: Pav_sc0001080.1_g350.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_3G312800, Prupe.3G312800.1.p
- Vitis vinifera: GSVIVT01032998001
Gene Resources
- Pfam: PF00010
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_6g151970
CGAACGTTTCCTTTTCATTTCCAAGAAGGAATTGATACAATACATAATCTATCAGATGATAAGCTAGACGAACAACTTGCTAGTAATCAAACATTAAATGGCAGTGAAAGGAAACAAATTACGTACAGATCTACTAGAACGAAAGTCTTTATACCGAGGTTTTCATCAGTGAGCGTGAACAATTCTATATCACCCCATGGAAGCCAGCCGAATCCAACAGCACAGCTTTGATCTGTTCAGGCAACACTTCATTTCCTTCCCTGCATTGCTGATTAAAGACAATTGAAACATGAATTTCAGTCCTCATTTTCCTTATAAGTTGTATATTTATAAATTATAAGTTCCCAAAGAGAATGAATGCATTGCATATTGCAAGTTAAGCGAACACCCGCGATGTTTTTGCTGATCAAGCTGGACTTTTGAGTTATGCATATCAAAACAGAAGAAAACTGATTCAATAATGTTTGTGCTAACTGATTCTTACTAATCAAAATGGATTTACACTCATCAAAACTGATTTTCCTTATATGAATCAACATTTATTGAAACTCGCATTCTACAAAATGAGAGGATTAAGTTCTAGACTTAAAAGCATCTCAAGCAAGGTGACAAGGAATGTGGACAATCCAAATACAATTATGTGCTACAATACAAACACAATAAAAAACGAATACAACAAGACCAAGATAGATGCATTCGATAGACGACTTATTACAACTTTCTAGCATTTCACATAAAAGTTAACCATGAAAAGTCAATTTTTCGATGCACAACAAACAAGCAAGTCTACATGCATATGCACATGAATGCAGTATATGCAGATGAGACTGTCTAGTCTCTAGAATACTTCCATGAATACTTGCAAGGACATGATTCAAGCAATGAAAACAACCACTCTCGGTTTAAACAGCGAAGTTGACTAATGCTTTTGTAATTTTCTTAAAGGATATCTATTTTCTTACCTCTGCTTGGAATATATCTAAAGCAAACCCATTAAAACAGCTTATCACAGCTTGCTGAATATCCAGCCCAAGATTGTCCAAAGCTCTTAAAGTAGATAGCAACAGACCAGGTCTACGAGCACAAAACATGTGGATATTGACTGCTCTTCCCTCTTTGTTTCTAACTTCAATCTATACACAGTGAAAAGAAAATTGCATGAGTTTCCTTCACAAAAATTAATACAAAACAGAAGCAACAAATAATTGATTAGGTGTAAGACAAAAGTAGCTTGATAAAGCAGACATGGGCAGTTTAGAGGAACGGGGTTCACCAATTCGATCAGATTATCTACAGAAGGTATTTTGCTCTACATGCCTATATGGATATAATTCTCCTGAATTTCATCTCCCTTCACCAAATAAGAAAATCGTAGCATGGACACTCTTATTTACCGAGCCAGTTGTATAGCCAACATATCATTTTCTTTCTCTCACTATTTGCAAGCCTTATTTGTAGTGACACTGAATTAGCCAAGATTCACAACTGAGGCTTACACCAACCCGACATGAAAACTGATTAACCTCCCAACTTTTTTAGAGTGATAAGCTGTCTATGGCATCAATCATAAAACTTCAGTCTTCAGATCAAAACAAAAGTTTGACGCCTGATTCCCAAATTTCCTGCAGAGGATCCTTGCAAAAAAAAATTAACTTAAGGAATCTAAGGAGGAATTATGAGCAGCCGAAAGCTAAGGCAGTACGACATGATCATTTATTAATAGCAGCATTTCCTGGTAGTAGGTTATAAAGGCTTATGTGTTTCTACTGTTACATGGTTTATCTACTTGACAGAATCAAGTTCATGGGAGTTATGAATTTATCAGACCATTAAAGGAGGCAATGTAATTGTTAGTCAATTAGATTAACTATGGTACATGAAAATAATGACAACTTCCACATTTTCCTGGCAGAGTGGGCACATAAAAAAAAAAAAACCGGGCCAATGGACCTTATGCCATCCCAGGGATTGAGCCTTTCCCTTCCTAAGGTGCTTGTTGCATTACACATGTAAACATGACATCTCAATGATTTCACATCTTCAAGTTGCATGCTTATTTGGACTGAGAAAATCTCTTAGATGTTAACATTCCATGTGAAAAAGATGCATTTTCAGCACCTTACAGTATGAGGTTCCATTGAAGTCAAAATCCCGACATTAGCTTGTCGGACCTCTGTCAAAGCTCCAAAGCAAACAAACGAGTTATGTCAATGGAGATTCTAAAGAGGCTACCACTGCCTACACAGCTTAAACAGACAAAGGAGCTCCTGGTGTGATAATCAAATGAACCGCACATTTCTAAATCAAGTGATTCAATTAACAACCTACTATTCCCACAAGCTTCTCTTCCTCACTTTGCTTCGATTACATTGATACATTGATACATTGATACCATTATCATCCCAAAATGTTAGGCATAAAAAAATATGGATAGCCCACTTCCAACTCCAGATATCAAACTCAAAAGTGGCATATACAAGTCAGGGCACTCAAATTTCAAAAATGGCAACAACTCAACTGACACTGGACTTATTAGTGGTGTGTGCCTATTTTCTCTTCTGTTTACCTTCCGTCCTTTGATTGCTTCCAAACTCCTATTCTAGTCCCTGATTGCTTCAGAGTTCAGATTTCCTAGGCCGTTCCTTTTGCTCACTGCTTCACCAAAACTCTACCAGAGGATCTATAAAATTTGTTGATACCCACTGTGCTAGCTTAATATATAAATGCTTAATAATAAATTTATACAAGAGATTTCTATATCTAGGAACACATGCCTACGTGCATTGCGATCAGTAACCTAAGAAAATTGTTCAATTCCTTTCTTTTACGTGCAGTTATATTTCATATCCAGTGTCTATAAGAAAGTAAAATTACCACCAGTAGAATCAGAAGTTAGCCACGACCATCGTTTACAACGGCAATAACCAAGAGCCACTGGAACCTTTTTTCTTTTCCTCCTCTTCCCTAAAATCATAGCCTCCATTGTTGGTCATTGTAGGGACTTCCATTGGTTCTTAGTTCTTACTAATGGTGATCCCTTAGATGGTTCTTAGTTCTTACTCAAGAAACACAGAATCAGCATGCTACTTAGATGTTGACATGTGATCAAGACATGAGCATATAGCATAAGAGGTCAATGTATTTTCTGATATTGAAAAGTTCTTATTAGACTTGCTTGTAAAGATTATAATTTAAAGTAACCTAAAATTCATCAAGGGTCAATCAACTGCATAACCTTTACCCACGAATGACAGAAACGTTGGACAATTAGTAGTAGGGAGGGGGGCCGAATGCCATGATAGAAACACTTTTGTGGGTCACTAACTACCTTAAGCATTAGGTCTTAAGTAGTCAAGTATTCAGAGTCACAAACAAAAGGGAAAGAAAGATAAAAGTTATTGGTAGGATTCCAGTACATGTAAAACTTAGCCCTGCATGTCATGTTAGTGTTGAAAGGTACAGACAACTATGCAAGGAAAAACATATGATCAGAAAAATGCCAAGCTAAACCAACATGAAAACGGAAACTGAGGGCCACAAGAATGAAGAACCAACAAGATATTCTATGGTCGTTTGTAAAGTTACCCTAGCAGGCTGATTCTTGGGTGGCAGAGAATTTGGCGAAAGTTCCTCCTTCACACGACATGGGAAAGAGTGGGTGATTGGTGTCGGAGGCTGAGAGCTTGGTGGCATCATAGAGCTATGGTTACTAGACTCCAATTCATTGTGAAGGTCACTGATCCTTTGCAAGAGCTCCTTCATATAATCAATAGCATCTCCAAGTATAGAAGCTCTGTCCATCTGCAGGTCAATTTGAGTGATTAGATATACTCTTAAAAGTAATAGAGACCTACTCAATTCCCCAATCAACCACTCCACCCTTTCCAAAAAGGAAAAACTAAAGAAGAGAGAATTCTTGTGTAAATAACATTGTTGTAAATGCATCTTTAAATGTGCAAGAAATAAGACAAGAGAAGCATGAAATAGTGATAGCAAGAGCATACAAAAGCAACACACAACAAGTTCAATAAGGCACACTAACGGTACAAAGGCATTCCAACTCTTTCTAAAAGCATTAAAAAATAACAACACATAGCCAGGAGAGCAACCAATCCACCCATGCACTACAAATTTTCCTAACTAAATCAAAACTAATACTTCCTCCGTTTTTTTTTTACATGTTACACTTTTCAATCACGAACTCCTAGGCAATTTTTGGATAGGAGAGAGATAGAGAGAAAGAAAACAAAAGGGTCCCATGTGAACATGTGATAGGAGAGAGATAGAGAGAAGTTATTACTCAAAATAAAAATGTAACATCTAATTTGAAACTTCCTAAATTAAAAAGTGTAACATAAAAAAAAAAAACGGAGGAAGTATTACAAAATGGAAAGGATGCGCCTGACCTTTTGTCAGTAATGATAAAAGAACCTTACAAAGGAAGTATAAAAGAAAACAGTGGAACGTATGAGAAGAAGTTACTCTACATGTAATGCTAATCTCGGAGTCCAAAAGCACTTCGAAATACTTGAAAACCTAGCTTTGGCATGTTTTCCTAGAACAAGGAAGCTTTTGAAATTTTGTTCAGTGTATCTATATAACTTGCTTTTAGCTTATTTCAGTCAAAATAAGTCCGTTCTAATAAGTTCTATTCAAAAACAGCAAAAGTTACAATAAGTTCATATAAGTCGAATTCAAGTGAATAGAACACACCCTTAATAAAGGATTCCTTAACCATCCGTAATTATTCTCATTCATGTCATTCCTTTCTCTAGAACGATAAGGCTTCGAATCTAAAACAATCAAATCTCTAGAACAACATTACAACAACCCAATTTGTTAATAGTGTGTTTGATATCCAACTCAAACCTACTTTGATCCACGTCCGGTGCCCTTAACATCATAAGCTCAAAGTTCCATTCATATATTAGCATAGTTAAAAAGATCTTATATTTCCTTGACATATAAGCAACTCAAAAATTTTGAATCCTAATTATGCTATCACTATTCACTATTAGCACAACTTTCCAATCATATTCTTATAATGTACCCTTTTTCCTCCTGTTTACTTTAAAGTTTAAGCCACAAAATTTATCAACCTCTACTAACATCTACTATCAACTCAGAACAATTCTCACAAAACACAAAAACAATAGTGATCAACCACACAAGATTAAAAAAAAAAAAACCACTTTTACCTAATTCACTAATTTCCCTGCAAGTTCAAATTAAGACTAGCAAATTATGATCGGTTTTGAGTTTATGTTTGTCCCATTTTAGTCGCATTGCAAATTCAAAAGGCGAATCAGATAACACTAATGAAAACACAAAAGGCAGCTAAGGTAAGCTAACCTTGCTAATCTTAGGCACAACAGACCTAAGCATATAAAGCCGATCATTAAGCTTCTTCCGCCTCCGCCTCTCTGCCATCAAATTCTTCGCCGGCAACCCCTTCTTCTTCCCTTTCCCTCCTCCGCCACCACCACTACCACCACCTGTTCCTAAACTATTCAAAAATTTCTCATCATCAACATTACTATTACTATTATTATTATTACTATTACTATTATTATTATTATTATAATTATCACAACCATCATCATTTAATTCATCAGAATCATAATTCACCATTGAAACACCAAAACTTCCTTCAACCTCATCTTCATCTTCCTCATCATTACTCCTCTTTCTCTTTCCTCTTCCCCAACAAATCCCACCACCACCACCACCACCACCACTACCACCCAATTTGTCAGGCCCATTTCGGTTCATGGCCCATTTCTGAAACAAGGTGGGCTCAACCGGAACCGGCCCAAATGAACTAGGCCCACGGTTGTTGAAAAAAACCAAATCTTGACTACTAGGGTCCAAACCCTCTAAACCGGAAGACCCAAACCCGGATAACTCCAAACCCGAACCGGGTTGAACCGGGTTAAGAAAACCCGGGTCAGGTGAGAAATTATTAAAAGTGGAGAAAGGGAAAAACGAAGACGACGACGTCGTTTGAAGAGTTGAAGGAAGGACTAAATTGTCATTTCCAACTTCTAATGGTGGTGGGTTGATAATGTTACTGCCGGTGAGAAACCAGTCACCACCGCCACCGTCAATTGACGGTACTTGACGAGTAGTACTACTCCATGAAACGGTGTCGTTTTGATCTGTAACGTCGTTGTCCAACCAAACGACGCCGTCTGGTCTCGACAGCATTTCTTTAAGTATTTTTTTTTTTG
CDS Sequence
- >BVRB_6g151970
ATGCTGTCGAGACCAGACGGCGTCGTTTGGTTGGACAACGACGTTACAGATCAAAACGACACCGTTTCATGGAGTAGTACTACTCGTCAAGTACCGTCAATTGACGGTGGCGGTGGTGACTGGTTTCTCACCGGCAGTAACATTATCAACCCACCACCATTAGAAGTTGGAAATGACAATTTAGTCCTTCCTTCAACTCTTCAAACGACGTCGTCGTCTTCGTTTTTCCCTTTCTCCACTTTTAATAATTTCTCACCTGACCCGGGTTTTCTTAACCCGGTTCAACCCGGTTCGGGTTTGGAGTTATCCGGGTTTGGGTCTTCCGGTTTAGAGGGTTTGGACCCTAGTAGTCAAGATTTGGTTTTTTTCAACAACCGTGGGCCTAGTTCATTTGGGCCGGTTCCGGTTGAGCCCACCTTGTTTCAGAAATGGGCCATGAACCGAAATGGGCCTGACAAATTGGGTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGATTTGTTGGGGAAGAGGAAAGAGAAAGAGGAGTAATGATGAGGAAGATGAAGATGAGGTTGAAGGAAGTTTTGGTGTTTCAATGGTGAATTATGATTCTGATGAATTAAATGATGATGGTTGTGATAATTATAATAATAATAATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAGTAATAGTAATGTTGATGATGAGAAATTTTTGAATAGTTTAGGAACAGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGCGGAGGAGGGAAAGGGAAGAAGAAGGGGTTGCCGGCGAAGAATTTGATGGCAGAGAGGCGGAGGCGGAAGAAGCTTAATGATCGGCTTTATATGCTTAGGTCTGTTGTGCCTAAGATTAGCAAGATGGACAGAGCTTCTATACTTGGAGATGCTATTGATTATATGAAGGAGCTCTTGCAAAGGATCAGTGACCTTCACAATGAATTGGAGTCTAGTAACCATAGCTCTATGATGCCACCAAGCTCTCAGCCTCCGACACCAATCACCCACTCTTTCCCATGTCGTGTGAAGGAGGAACTTTCGCCAAATTCTCTGCCACCCAAGAATCAGCCTGCTAGGATTGAAGTTAGAAACAAAGAGGGAAGAGCAGTCAATATCCACATGTTTTGTGCTCGTAGACCTGGTCTGTTGCTATCTACTTTAAGAGCTTTGGACAATCTTGGGCTGGATATTCAGCAAGCTGTGATAAGCTGTTTTAATGGGTTTGCTTTAGATATATTCCAAGCAGAGCAATGCAGGGAAGGAAATGAAGTGTTGCCTGAACAGATCAAAGCTGTGCTGTTGGATTCGGCTGGCTTCCATGGGGTGATATAG
Protein Sequence
- >BVRB_6g151970
MLSRPDGVVWLDNDVTDQNDTVSWSSTTRQVPSIDGGGGDWFLTGSNIINPPPLEVGNDNLVLPSTLQTTSSSSFFPFSTFNNFSPDPGFLNPVQPGSGLELSGFGSSGLEGLDPSSQDLVFFNNRGPSSFGPVPVEPTLFQKWAMNRNGPDKLGGSGGGGGGGGICWGRGKRKRSNDEEDEDEVEGSFGVSMVNYDSDELNDDGCDNYNNNNNSNSNNNNSNSNVDDEKFLNSLGTGGGSGGGGGGKGKKKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIDYMKELLQRISDLHNELESSNHSSMMPPSSQPPTPITHSFPCRVKEELSPNSLPPKNQPARIEVRNKEGRAVNIHMFCARRPGLLLSTLRALDNLGLDIQQAVISCFNGFALDIFQAEQCREGNEVLPEQIKAVLLDSAGFHGVI