Information report for BVRB_5g113380
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a MYC-like bHLH transcriptional activator that binds specifically to the MYC recognition sequences in the CBF3 promoter. Mutants are defective in cold-regulated gene expression. Cold stress triggers protein degradation of nuclear GFPICE1 protein, and the RING finger protein HOS1 is required. Sumoylation of ICE1 controls CBF3/DREB1A expression and freezing tolerance.
Homologous
- Malus domestica: MDP0000662999, MdICE1, MdCIbHLH1, MDP0000219146
- Manihot esculenta: MANES_14G045600, Manes.14G045600.1.p, MANES_06G125900, Manes.06G125900.1.p
- Populus trichocarpa: Potri.015G105200.1, POPTR_015G105200v3, POPTR_012G106000v3, Potri.012G106000.1, Potri.015G105200.2
- Prunus mume: XP_008239552.1
- Prunus persica: Prupe.5G143200.1.p
- Pyrus bretschneideri: Pbr010581.1, Pbr027099.1, Pbr010125.1
- Ricinus communis: 30147.m014419
Gene Resources
- Pfam: PF00010
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_5g113380
CTCACTAACAGCCAACTCTCTCTTTTTTTTTCACCCCAAATTCTTCTCTTCTTTCTTCTTTCTCCAAACCAAAAAAACCAAGAAAAAAAATGTTGTCAAGAGCAAATAGTGTTGCTTGGATGAGTGAGAGAGATGAAGAAAATTCATCAGTTACATGGAATCATAGAGATAGTTGTGTTGTTGGTGGTGTTAGTACTACTATTAATGGTGGCGAAGGTGAAAACAGAGAACATATTGTTGATAATGTTGATGTTGCTTCTCTATCTTCTTTTAAATCAATGTTAGAAGTTGAAAATGAGTGGTATGATACTATAACTAACCCAACTTCAATCCATTTTTCAACCACAAATGAGGGTCATCATACACATACTACTACTACTGATAATTTGATTTTAAATCCTATTGATTCATCTTCTTCTTGTTCACCTTCACCCTCTGTTTTTAATTCAGGTGGTATTGACCCAAATCATGTAGTACCTTCTTATATGTTTGCTTCCAAATCCACCATTTTTAACAACCCTTTAGCTCAAGGTCAGAGTTTTGGGTTTTTTCAGGACCAAATTGGTGGTTCCGTTTTAAGTGGGTTTACTGAATTTAGCCCTCAAAATGAAATGGGTAGTCCTAATTTGGGAAGTAATCCACAATTTGCAACTACCCATTTGGGGCAATTGGGTGATAATGATGGTGGTGGATTTGTTGGTGGTTCTTTAGGTGGAGGGTCTCGGTTTCGAGGTTTCGAAGAAGGGTTAGGGAATTCGATGTTTGTGAATCGAAGCTCGAAGATTTTGAAGCCTCTTGATAATTCAGCACCTGCTGGTGCACAACCTACTCTATTTCAAAAGAGAGCTGCACTTAGGAAGAATGGTTTTAGTGGTAATAATTCTGGGAATTTGCTAAATTCACCTGGGAATGGTAATGGTAATGGGTGTGATGAAGATAGTGGGAAGTTGAATTCTGGCTCTGGTGGTGAAACTGATAAGAAGAGAAAATTTGGTAATGTGGGTTTTTTAGACACTGTTAGTATGGATGGTTCTGCATTTAATTATGATTCAGATGATTTTACTGAGAATAACAATTTTAAGATAGGAGATGATGGAACTAAGAATGGTGGAACAAATTCTAATAACAATAGTACAATAACTGGTGGTGGTGGTGCTGCTGCTGCTGATTCCAAGGGTAAGAAGAAAGGACTACCAGCTAAGAATCTAATGGCGGAAAGGCGGCGTCGCAAGAAGCTCAATGATAGGCTATACATGTTGCGTTCCGTCGTCCCCAAGATCAGTAAGGTGAAAGAATTTCTTTATTTTCGCCTTTCTTTCTTTTCGATTTCTCGTGAATTTGTTCTTTGGTTTTTTGAATTCATTATTATGTTGTTGTTACCACTTAGAATTATCAATTATGGTATGTGCTAAAGTATATATTATCTCGTGAGTTTAGACAGTATACTTAGTTAGTAGTCTACCATGGATGCTGCAGAATTTCATTCAGCAAATCTTTTATTTGTCCTTGAATTAAGTTCCTTATTCTTTGTACATTACATCATTGGTTGCAACGTTCTTTTTGGGTGTTAATGCATATATGGGAGTTAGCATTAAATTAACTCACATGAATATGGTGGACTAGCTATTAAATGTCTTTACAAGTGGACCACTGTCCTAAAAGTTGGAGTTACATTAGAACGGCATCTCCTACTTCTCCTCTTGATTCTTGTAATGTTATCTAATTAAGATAAGATCTAATGTTAGTCTTCACTTCTATATTTTGAATGTTGATGTTTTGGTTCACTTTACTAAATTGGATACCATGTCTTCTAGGGAAACTATTTTGGTGTATATTCATACACATACTAGTTGTTTCTTTCAGTTATACCTTCACTGATGTTTACAGCTGTCCATTTACTGGTTACTCAATCTTTGCTTTTAACTCGCTAACGTAAGTTGGGTGGTTTGCTACTTAGTATAAAGTTGAAGACAACTACAATTAATCAAACTTCTTTAGGAGAGTTGATGAGGTGATTTTTGTACACACGTTACTTGGACTTGGGTACATGTCTAAGTGTTTGACTCGACAGTTTTATGAAAAAATATTCCATGATTTTGGCACAAAGAAGTGTCGAAGTATCCATATCATGTTGAAGTGTTAGAGGATCCGATACGGTACTTAAGGTAAAATGAATTTCCATGTTGTATAAATGTATAATTGAGGACTCGAGACGGATAAAATGACAAGGTCGAGTAACATAGTTCGTACTTAAATCAATACACTTCTAAAAAGTTGAATTGGAGTAGTCTTGTATGGAAATTTATGTCGATTAGTCCCAGAGGTTATACGATTGGCATGTAAAAAAGGCCTAGAGTGAGATGAAAACTCGCAAACTTTAGGATACTAGGATGAAAAGTACTCCTTTTTTCTAACTATATTGATGAAAAAACGATCAAGGGACATGTTCTTGTAGTGGAAACATTTAATCCAAAATCCAACATATCATCATAGTGCTGTTCAAATTTCAAATAATACATGTAGCTGGAATAATAAATGCTTACCAAATGTTTGGGAATTGCCTTGTTCCATTTTCTTTTCTTTTTCTTCTTTTTACCAGTACTTCATTCATATTAACACTGTAAAACTTTCAAAAACTTAACTGTCCTGGTTGTGTCAGAGTTGTTATCAGTAAAACTATTTCTAGGAACAGGGAGTAATTATGCTGATTTTTTTGCGGATAGTAGTACTTCATAGTGATAAGGGCGTTCTGTGTCCATTGTTTGGAGCTGTAACTCAACGAAAAGATATGTATGTATGATGACCGTAATAGTTGCTGTTTACATTGAAGCTTCTTGCTTAGGTAGGAGTAGGATACTAGAATGAAGTGCTGAGTTATGGGAAAACTGCAGCCCCACTTTTTAGTTATTTGCTGATGTTAATAGACTTTAGATGTTGTTCATTTGATTGAGCAAAAGAAAGTACATAAATATTAACAAGAATTGATATTTCTAATTCATTTTACAGATGGATAGGGCTTCGATACTTGGGGATGCAATTGAATATCTAAAAGAGTTGCTGCAAAAGATTAATGATCTTCATAATGAACTGGAGTCGACCCCCCCTCCGTCGTTGACACAGACAACAAACTTCCATCCTTTAACTCCTACACTGCCGAACTTACCATCTCGAATCAAGGAAGAACTCTGCCCCAGCTCATTGCCAAGCCCTAATGGTCAACCTGCAAGGGTGAGTTTGTGATCTCTGTTCCTAAATTTTCCTGTACGTATCTACTCATCCAACTGAGTTACCCATCATACCTTCTTCATCTACACTAGATGTTTTAGATTATCTTTTTCCAATTTACGTAATTTGATTTTTGATTGTAGATGTCCCAAAAACTGACCGTGTATAGCTCTTGTGCAATGTTCTTCAATTCTATAAACAATTTGTTCAAATCTTTTCCTAAACGTATTATTTAAATACTAAGTTCAAAAGGCGGCATTAGTGAATCTCTTCAAACTACTTGATCTTTCATAGAAACAGCTCCCTTGCATCTACAATTTTTTCTTCATTAAGAGAGAATCTGCATACAACATTCTGATTTTCTGATTTTGTAGATTGAGGTAAGGTTAAGGGAGGGAAGAGCTGTCAACATCCACATGTTCTGTGGTCGCAGACCAGGTCTCTTGCTTTCGACTATGAGGGCTTTGGATGGTCTTGGTCTGGACATTCAGCAAGCCGTGATCAGCTGCTTCAATGGGTTTGCTATGGATATTTTCCGCGCTGAGGTTATTTTCCCTTCTTTCTTTTTGTATATCTACAAACACCTCTGCTGAGATGAATTTTGTTATCATTCAAACTAAAGCCTCCTCCAATAGAATAAGCAAATGAAAGCAGAGAAATGGCATTGTTAGATAGGTTTGCTTAAGAAGTTTACGTTTATATCTGTTAATCTGTTATTGGCGGAAAGATGTAACTAAGGAGCATTAGTGTGCGTTCTCTTCACTTTAAAAAAAAAGTTTTCAGGGATGATTAGGTATAATCAAGTGTAAACATATGGTGAAATCCGGGCTAATAAAATCCTTTGAGGTTTAAGAAGTTGAGTTCCAATAGTTTCATGCGAAGAGAACGCATGCTTAGTATGGTGCAATGAGCCAAGCTAACACTGCATACCTTGTGACATCTTGTGATGACATTTTGTCATGCATGGGCTTGTGATAACACAATAATTGTCATAATATAGATTGTTCAGAATAGCTGTCTTATCTCTGTGATGGCTTTGGTGTCACCCATTTTCAGCAATGCAAGGATGGGCAGGATCTGCACCCTGACCAAATCAAAGCTCTTCTCTTGGATTTAGCCACCTTCCATGGCTCAACAGTAATGGGTAATTGCAATATGTGACATTGCATTTGCATAGAAACTGCTGCTTCGAAATTTGGATGCAAGGAAGGAAGATGATAAAGGAGCTTGGATGATTTCATTTCAAAAAAAAATTGTCCCCCTTTTCATCAACTAATTTAGTGTAAGAGAGATGTGAAGTCAAGTTGTAATGGTCAGTTTGATGGCTTTTCTGAGTTTAAATTACCGTCATTACCAACGTAGGTGGTTCTATTTCCTGCATTTGCTATTCTGTAGCTTTTTATTTTCTTTTTTGCAACCTTTAATAAAAGTAATATTTATAC
CDS Sequence
- >BVRB_5g113380
ATGTTGTCAAGAGCAAATAGTGTTGCTTGGATGAGTGAGAGAGATGAAGAAAATTCATCAGTTACATGGAATCATAGAGATAGTTGTGTTGTTGGTGGTGTTAGTACTACTATTAATGGTGGCGAAGGTGAAAACAGAGAACATATTGTTGATAATGTTGATGTTGCTTCTCTATCTTCTTTTAAATCAATGTTAGAAGTTGAAAATGAGTGGTATGATACTATAACTAACCCAACTTCAATCCATTTTTCAACCACAAATGAGGGTCATCATACACATACTACTACTACTGATAATTTGATTTTAAATCCTATTGATTCATCTTCTTCTTGTTCACCTTCACCCTCTGTTTTTAATTCAGGTGGTATTGACCCAAATCATGTAGTACCTTCTTATATGTTTGCTTCCAAATCCACCATTTTTAACAACCCTTTAGCTCAAGGTCAGAGTTTTGGGTTTTTTCAGGACCAAATTGGTGGTTCCGTTTTAAGTGGGTTTACTGAATTTAGCCCTCAAAATGAAATGGGTAGTCCTAATTTGGGAAGTAATCCACAATTTGCAACTACCCATTTGGGGCAATTGGGTGATAATGATGGTGGTGGATTTGTTGGTGGTTCTTTAGGTGGAGGGTCTCGGTTTCGAGGTTTCGAAGAAGGGTTAGGGAATTCGATGTTTGTGAATCGAAGCTCGAAGATTTTGAAGCCTCTTGATAATTCAGCACCTGCTGGTGCACAACCTACTCTATTTCAAAAGAGAGCTGCACTTAGGAAGAATGGTTTTAGTGGTAATAATTCTGGGAATTTGCTAAATTCACCTGGGAATGGTAATGGTAATGGGTGTGATGAAGATAGTGGGAAGTTGAATTCTGGCTCTGGTGGTGAAACTGATAAGAAGAGAAAATTTGGTAATGTGGGTTTTTTAGACACTGTTAGTATGGATGGTTCTGCATTTAATTATGATTCAGATGATTTTACTGAGAATAACAATTTTAAGATAGGAGATGATGGAACTAAGAATGGTGGAACAAATTCTAATAACAATAGTACAATAACTGGTGGTGGTGGTGCTGCTGCTGCTGATTCCAAGGGTAAGAAGAAAGGACTACCAGCTAAGAATCTAATGGCGGAAAGGCGGCGTCGCAAGAAGCTCAATGATAGGCTATACATGTTGCGTTCCGTCGTCCCCAAGATCAGTAAGATGGATAGGGCTTCGATACTTGGGGATGCAATTGAATATCTAAAAGAGTTGCTGCAAAAGATTAATGATCTTCATAATGAACTGGAGTCGACCCCCCCTCCGTCGTTGACACAGACAACAAACTTCCATCCTTTAACTCCTACACTGCCGAACTTACCATCTCGAATCAAGGAAGAACTCTGCCCCAGCTCATTGCCAAGCCCTAATGGTCAACCTGCAAGGATTGAGGTAAGGTTAAGGGAGGGAAGAGCTGTCAACATCCACATGTTCTGTGGTCGCAGACCAGGTCTCTTGCTTTCGACTATGAGGGCTTTGGATGGTCTTGGTCTGGACATTCAGCAAGCCGTGATCAGCTGCTTCAATGGGTTTGCTATGGATATTTTCCGCGCTGAGCAATGCAAGGATGGGCAGGATCTGCACCCTGACCAAATCAAAGCTCTTCTCTTGGATTTAGCCACCTTCCATGGCTCAACAGTAATGGGTAATTGCAATATGTGA
Protein Sequence
- >BVRB_5g113380
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